DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and Cftr

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006236159.2 Gene:Cftr / 24255 RGDID:2332 Length:1665 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1507 Identity:391/1507 - (25%)
Similarity:691/1507 - (45%) Gaps:246/1507 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   214 QTKYQRGE--NEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAHH 276
            ||....|:  .:.|...|||:|::.:.|...:..||||:.||..|::.....||...:.......
  Rat   181 QTLVHHGDIMQKSPLEKASFISKLFFSWTTPILRKGYRHHLELSDIYQAPSSDSADHLSEKLERE 245

  Fly   277 WNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSFGGVFLFGALMKL 341
            |::                              |:..:||  ..::..:.:.|...|:|..::..
  Rat   246 WDR------------------------------EQASKKK--PQLIHALRRCFVWRFVFYGVLLY 278

  Fly   342 FTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRT 406
            ..:.....||.:|..||:..:..:.|.....|...:.|.:|...:|.:|......:..:|:::|.
  Rat   279 LGEVTKAVQPVLLGRIIASYDPDNTEERSIAIYLGIGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRI 343

  Fly   407 ALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQL 471
            |:.:.||:|.|::|:....:.::|::::|::.:..:|.|.....:.||.||||:.|.:..||..|
  Rat   344 AMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLISLLSNNLNKFDEGLALAHFIWIAPLQVVLLMGLLWDLL 408

  Fly   472 GPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQ 536
            ..|...||.::|:|:....::...:..|:.::....:||:.:.:||:..|..:|.|.||.:.||.
  Rat   409 QFSAFCGLGLLIVLVIFQAILGKMMVKYRDKRAAKINERLVITSEVIDNIYSVKAYCWESAMEKI 473

  Fly   537 VLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLM 601
            :..:|::|:...|.:||:...||..:..:.|.|..::...|.:   .|.:.:.|:..:|:...::
  Rat   474 IESLREEELKMTRRSAYMRFFTSSAFFFSGFFVVFLSVLPYTV---INGIVLRKIFTTISFCIVL 535

  Fly   602 KLPLTILPMLSVDI-AETQVSVNRINKFLNSEE-----------------------------LDP 636
            ::.:|.....:|.| .::...:.:|..||.::|                             |:.
  Rat   536 RMSVTRQFPTAVQIWYDSLGMIRKIQDFLQTQEYKVLEYNLMFTGLVMENVTAFWEEGFQELLEK 600

  Fly   637 NSVLHDSSKPHPMSIENGE----FSW----GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQA 693
            ..:.:|..|     ..|||    ||.    |:.: |:|||:.:|||.::|:.|:.|:||:|::..
  Rat   601 VQLNNDDRK-----TSNGENHLSFSHLCLVGNPV-LKNINLNIKKGEMLAITGSTGAGKTSLLML 659

  Fly   694 FLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSA 758
            .|||:|...|::...|::::..|.:||...|:::||:||.:||..||..|:.||.|:.||...:.
  Rat   660 ILGELEASEGIIKHSGRVSFSSQISWIMPGTIKENIIFGVSYDEYRYKSVVKACQLQEDITKFAE 724

  Fly   759 GDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARK 823
            .|.|.:||.|:.|||||:.|||||||||.||||||||.|...:|....:.|||..:..  ::|.|
  Rat   725 QDNTVLGEGGVTLSGGQRARISLARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEEQIFESCVCK--LMASK 787

  Fly   824 SRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQH---------------- 872
            :|:|||..:..|.:.|.|.::..|.....|||.:|...:..|:..::.:                
  Rat   788 TRILVTSKMEQLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQSLRPDFSSKLMGYDTFDQFTEERRSSILT 852

  Fly   873 ----------------------LQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGT-----------VE 904
                                  .|.|...|:..|.|....||...:..:..|           .|
  Rat   853 ETLRRFSVDDASTTWNKAKQSFRQTGEFGEKRKNSILSSFSSVKKISIVQKTPLSIEGESDDLQE 917

  Fly   905 KAIKLA-------------------------RTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSH 944
            :.:.|.                         |.:|:.|.::.|.:..     .|..:||:.....
  Rat   918 RRLSLVPDSEHGEAALPRSNMITAGPTFPGRRRQSVLDLMTFTPSSV-----SSSLQRTRASIRK 977

  Fly   945 DSVASAASLKKKQEVEGKLIE------TEKSQTGGVEFAVYKHYIK----------------SVG 987
            .|:|...|||::.....:|.:      ||:.....::...:...:|                ..|
  Rat   978 ISLAPRISLKEEDIYSRRLSQDSTLNITEEINEEDLKECFFDDMVKIPTVTTWNTYLRYFTLHRG 1042

  Fly   988 IFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQ------WANDQNVANDTGLRDMYLGVYGAFGFGQGVLA 1046
            :|..:...||.|:.:.......|||.:      ..|...:||.:     |:.|..:..|      
  Rat  1043 LFAVLIWCVLVFLVEVAASLFVLWLLKNNPVNGGNNGTKIANTS-----YVVVITSSSF------ 1096

  Fly  1047 YFAVVIVYLGG-------------------FQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNS 1092
             :.:..:|:|.                   ..|:|.:|.::|..|:...:..|..: ..|.:||.
  Rat  1097 -YYIFYIYVGVADTLLALSLFRGLPLVHTLITASKILHRKMLHSILHAPMSTFNKL-KAGGILNR 1159

  Fly  1093 FSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTP-IFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQ 1156
            ||.|:.::|:.||.|:..|:..:|:|:..|:|:|...| ||||.:..:| ::...:.:::.||:|
  Rat  1160 FSKDIAILDDFLPLTIFDFIQLLFIVVGAIIVVSALQPYIFLATVPGLA-VFILLRAYFLHTSQQ 1223

  Fly  1157 LMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIAN-RWLAIRL 1220
            |.:|||..||||::|...::.|..|:||:. ...:.|....|........:...:|. ||..:|:
  Rat  1224 LKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFR-RQTYFETLFHKALNLHTANWFMYLATLRWFQMRI 1287

  Fly  1221 EMVGNLIILFASLFAVLGGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGE 1285
            :|:..|..:..:..::|......|..|:.::.|:.:..||.|.|..|.|.::.:.||.|:.::.:
  Rat  1288 DMIFVLFFIVVTFISILTTGEGEGTTGIILTLAMNIMSTLQWAVNSSIDTDSLMRSVSRVFKFID 1352

  Fly  1286 TKQEAP------WELEQD--------KN----KPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSF 1332
            .:.|..      .||..:        ||    |...||..|.:..::..|:|.:..:.:|..:||
  Rat  1353 IQTEESICTKIMKELHSEDSPNALVIKNEHVKKCDTWPSGGEMVVKDLTVKYVDDGNAILENISF 1417

  Fly  1333 NIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLF 1397
            :|..|::||::||||:|||:|..|..|::... |.|.||||...||.|...|....:|.|...:|
  Rat  1418 SISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRMLNIK-GEIQIDGVSWNSMTLQEWRKAFGVITQKVFIF 1481

  Fly  1398 SGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALL 1462
            ||:.|.||||.....|:||||..:...|||.::.....||..:.:||..||.|.:||:||||::|
  Rat  1482 SGTFRQNLDPNGKWRDEEIWKVADQVGLKSVIEQFPGQLNFTLVDGGYVLSHGHKQLMCLARSVL 1546

  Fly  1463 RKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFAS 1527
            .|.|:::|||.:|.:|..|..:|::.:|..|..|||:...||:..:||..:.:|:::|.:.::.|
  Rat  1547 SKAKIILLDEPSANLDPITYQVIRRVLRQAFAGCTVVLCEHRIEAMLDCQRFLVIEQGNVWQYES 1611

  Fly  1528 PTELLDNPKSAF 1539
            ...|| :.||.|
  Rat  1612 LQALL-SEKSVF 1622

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 391/1507 (26%)
CftrXP_006236159.2 None

Return to query results.
Submit another query.