DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and mrp-7

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_507812.3 Gene:mrp-7 / 180289 WormBaseID:WBGene00003413 Length:1525 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1580 Identity:663/1580 - (41%)
Similarity:964/1580 - (61%) Gaps:105/1580 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 MDRFCGSTFWNATETWYTNDPDFTPCFEQTALVWTPCAFYWAFVIFDFY----YLKASLDRNIPW 69
            :..|||.     ...:.|..|:.:.|.:.|.|||.|.||:  .:...|.    :|.|.....:|:
 Worm     2 LSSFCGD-----GHPFSTGLPNVSICAQHTVLVWVPAAFF--LLTLPFLSAQCHLTAQRFARLPF 59

  Fly    70 NKLNVSKALVNLGLLVITALDLIMALVKKGGDSELPLYDLDVWGPIIKFATFLLLFIFIPLNRKY 134
            :...:.|.|:...|...:.......|..|...:........:| .::...|||:..|.:    :.
 Worm    60 SAHFIIKLLLVAFLAANSLATWCYVLFSKNSYAAAYYVYPGLW-VLVWTGTFLVHLIRL----RC 119

  Fly   135 GVQTTGCQFIFWFLLTVLSIPRCRTEVRLDAERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSF-------- 191
            |:.::|.|.:...:..:...|.....:|::       ||........:.:..||:|.        
 Worm   120 GLVSSGIQHVTSLIFLLCGAPEFYQWIRME-------NSNSFPNDLTTTDSAQFLSIAYLSWYSA 177

  Fly   192 FIFFTFTSIMLILNCFADGMPRQTKYQRGENE---IPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLE 253
            .|.:||:.      ||||....:|..::..::   .|||.:|||:|:|..||:.:...|.|..||
 Worm   178 LILYTFSL------CFADPRGAKTDDEKASSKSAASPELQSSFLNRLTLWWFNSIPWTGARRDLE 236

  Fly   254 EKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAHHWNQNVRKNYKNK----ARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGR 314
            ..|:::|..:.....:..::...|... |..|.:.    |:.:|..|..:..|            
 Worm   237 IDDIFELNERSGTEFLSELWESFWEPK-RLKYIHDTSIWAKKDPSEQEKDPVV------------ 288

  Fly   315 KKGMASIMPPIYKSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLL 379
               :.|::..::..|...||..:.:|..:||:.||.|.:|..:::|:.|::| |.|||:..::|:
 Worm   289 ---IPSVVSSLFMMFRWEFLLASTLKFVSDTMQFASPFLLHELLNFISAKNA-PFWKGMALSILM 349

  Fly   380 FVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFM 444
            |.::..::.||..||:.||.:|.:|:|:|..|:|:|.|.||||.:::.||||||||||:|.:||.
 Worm   350 FSVSELRSLILNGYFYIMFRMGTKIQTSLTAAVYKKTLLISNSARRDRTVGEIVNLMAIDVERFQ 414

  Fly   445 ELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDE 509
            .:|..:...||.|.||..||.:|:..||.|.|.|:.:|:|.:|:|.:.:..::.:||.|||.|||
 Worm   415 MITPQIQQFWSCPYQITFALVYLFITLGYSALPGVVIMVIFVPMNIISSMIVRKWQIEQMKLKDE 479

  Fly   510 RVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTF 574
            |.|::||||:||||:||||||...|..:.:||.||:|.::.:|.:........:.:||||:|.:|
 Worm   480 RTKMVNEVLNGIKVVKLYAWEVPMEAYIDEIRTKELALIKKSAMVRNILDSFNTASPFLVALFSF 544

  Fly   575 ATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSV 639
            .|:||::.::.|:.:...||:|||:.::.|:|::.:|.....:..||..|:.:||.:||||...|
 Worm   545 GTFVLSNPSHLLTPQIAFVSLALFNQLRSPMTMIALLINQAVQAVVSNKRLKEFLVAEELDEKCV 609

  Fly   640 ---LHDSSKPHPMSIENGEFSW-----GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLG 696
               ::.....:.:.:||...||     ..|.||:::::...:.||:|:||.|||||||::||.||
 Worm   610 DRSVNIERSHNAVRVENLTASWDPEEAAGEKTLQDVDLTAPRNSLIAVVGKVGSGKSSLLQALLG 674

  Fly   697 EMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDL 761
            ||.||.|.:...|::||||||.||||.|:||||.||:.:|||||::|:.||||:|||.||.|||.
 Worm   675 EMGKLRGRIGVNGRVAYVPQQPWIQNMTLRDNITFGRPFDRKRYDQVLYACALKADIKILPAGDQ 739

  Fly   762 TEIGEKGINLSGGQKQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRV 826
            |||||||||||||||.|:|||||||.:.|:|||||||||||||||:||||:||||.|:|..|:|:
 Worm   740 TEIGEKGINLSGGQKARVSLARAVYQNLDVYLLDDPLSAVDAHVGRHIFEKVIGPNGLLREKTRI 804

  Fly   827 LVTHGVTFLPQVDSIYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQH-------LQEGNEEEEELN 884
            |||||:|:....|.|.|:..|:|.|||||:.|:|.:|.|.||:.::       .:.|..::::..
 Worm   805 LVTHGLTYTKMADEILVMLEGKIEESGTFEHLIKRRGLFFDFMEEYKSGSDNSSEAGGSQDDDFE 869

  Fly   885 QIKRQISSTADVPELLGTVEKAI-KLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVA 948
            .|..:|....:..:::.||...: :..||..|:..||..|:             .::..:..|.|
 Worm   870 AIGGEIQDYMNPEDVVLTVTNDLDETIRTPELTTQISTMSS-------------PEKPPTGTSPA 921

  Fly   949 SAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWLT 1013
            :|.      |.:.|||:.|....|.||.|.|:.|:|:.|..||:|.:....|:...||..:.||:
 Worm   922 AAT------ESQNKLIKKEGIAQGKVEIATYQLYVKAAGYLLSIAFIGFFIVYMTLQILRSFWLS 980

  Fly  1014 QWANDQNVANDTG---LRDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRG 1075
            .|:::.:..:.:.   .:...||||||.||.:....:.|::.:...|.:|:|.:|..|:..::| 
 Worm   981 AWSDEYDPDSPSAHPMAKGWRLGVYGALGFSETACFFVALLALVFVGQRASKNLHGPLIHNLMR- 1044

  Fly  1076 SVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIA 1140
            |...|:|.||:||:||..:.|::.:|..||......:..:..|..|::||.:|||:|..||:|:|
 Worm  1045 SPMSFYDTTPLGRILNRCAKDIETIDMMLPMNFRYLVMCVLQVAFTLIVIIISTPLFAVVILPLA 1109

  Fly  1141 FLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVC 1205
            .:|....|:||.|||||.|||||.||||||||.||:.||::|||:...|.|.::|...:|....|
 Worm  1110 LIYLIFLRYYVPTSRQLKRLESVHRSPIYSHFGETIQGAASIRAFGKVDEFRQDSGRILDTFIRC 1174

  Fly  1206 KYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFAVL----GGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRM 1266
            :|.|:::|||||:|||.|||.||.||:|||||    |..|:||::|:||||||.:|:.||:.||.
 Worm  1175 RYSSLVSNRWLAVRLEFVGNCIIFFAALFAVLSKEFGWITSPGVIGVSVSYALNITEVLNFAVRQ 1239

  Fly  1267 SSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVS 1331
            .|:||.|||||||:.||..|..||||.:|..:..| .||..|.|:|..:..||||||||||..:|
 Worm  1240 VSEIEANIVSVERVNEYTNTPNEAPWRIEGREPAP-GWPSRGVVKFDGYSTRYREGLDLVLHDIS 1303

  Fly  1332 FNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVL 1396
            .::..|||:||||||||||||..|||||:||||||||.||.|:::.:|||.|||.:|||||||||
 Worm  1304 ADVAAGEKIGIVGRTGAGKSSFALALFRMIEAAGGRIVIDDVEVSQIGLHDLRSNITIIPQDPVL 1368

  Fly  1397 FSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARAL 1461
            |||:||.|||||...:||:||:||||:|||.|...|..||.::|:|.||||||||||||.|||||
 Worm  1369 FSGTLRFNLDPFFTYSDDQIWRALELAHLKHFAAGLPDGLLYKISEAGENLSVGQRQLVALARAL 1433

  Fly  1462 LRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFA 1526
            ||.|:||||||||||||:.||.|||:|||.|||||||.|||||||||:|.|:::|||||.|:||.
 Worm  1434 LRHTRVLVLDEATAAVDVATDALIQETIREEFKECTVFTIAHRLNTIMDYDRIMVLDKGSILEFD 1498

  Fly  1527 SPTELLDNPKSAFYSMAKDA 1546
            :|..|:.:..|||..|..||
 Worm  1499 TPDALMADKNSAFAKMVADA 1518

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 661/1575 (42%)
ABC_membrane 338..601 CDD:279056 111/262 (42%)
ABCC_MRP_domain1 649..848 CDD:213217 124/203 (61%)
ABC_membrane 988..1260 CDD:279056 117/278 (42%)
ABCC_MRP_domain2 1308..1528 CDD:213211 153/219 (70%)
mrp-7NP_507812.3 MRP_assoc_pro 14..1518 CDD:188098 658/1561 (42%)
ABC_membrane 310..575 CDD:294371 111/265 (42%)
ABCC_MRP_domain1 622..826 CDD:213217 124/203 (61%)
ABC_membrane 976..1227 CDD:279056 108/251 (43%)
ABCC_MRP_domain2 1280..1500 CDD:213211 153/219 (70%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 184 1.000 Domainoid score I2038
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0054
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 1 1.000 - - H68364
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG51855
OrthoDB 1 1.010 - - D138195at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000087
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100026
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24223
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X177
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1110.790

Return to query results.
Submit another query.