DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and cft-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_504463.1 Gene:cft-1 / 178939 WormBaseID:WBGene00000477 Length:1247 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1371 Identity:355/1371 - (25%)
Similarity:640/1371 - (46%) Gaps:176/1371 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   211 MPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIFAH 275
            :.:..:..:.|.|..:..:||.|::......|:..|...:.:...|| .:..:..||        
 Worm     9 LSKNARQIQNETENEQAKSSFASKLLELPVSKLLQKCRSSTITVDDL-PILEEKQCS-------- 64

  Fly   276 HWNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIYKSFGGVFLFGALMK 340
               ..|...:|.|.||                          :.||:...:|||.|.|.| .:..
 Worm    65 ---NRVMSGFKWKKRV--------------------------IFSILMKFWKSFAGAFAF-RMCA 99

  Fly   341 LFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVG---L 402
            :|.|   :|...:|..:|.  .|:.:...:...:.|||:......::.:||.:   .::||   :
 Worm   100 IFAD---YASILLLKYLID--SAEISATLFNFFIIAVLILFFMQLKSLLLGVH---TYLVGEDSV 156

  Fly   403 RIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFL 467
            .:.|.|.|.|.:|||.:: |...:....:|..|:...::.......|::...||.:::.:||:::
 Worm   157 EMVTVLNNIIVKKALHLT-SENTDWNRSKISKLLTTHSEAVSNGLAYVHHSCSALIELTIALFWI 220

  Fly   468 WQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIR-QMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEP 531
            |:.||...:..:.::.::..|..:|.|.:....:: |:|.:||||:....||:.::.:|:::|||
 Worm   221 WETLGTRTIIVVLIVALVYAVFNIIDSYVYKKSLKVQLKCRDERVEFEKTVLNSMETIKMFSWEP 285

  Fly   532 SFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIA 596
            .|.|::..:|.||::..|.|..:|:....|...:||:::.|:||.|.|..|.:.|..|...|.||
 Worm   286 HFWKKLKSMRGKELSVFRKTLSINSFMHSLNVTSPFVITFVSFAVYGLQYEISALRFEDAFVLIA 350

  Fly   597 LFDLMKLPL-TILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKPHP-------MSIEN 653
            :|:.|:.|| .|:|.|.: :.:...|...||:||..::   :..::..:.|.|       :.|.|
 Worm   351 IFNYMRRPLHVIIPSLEI-VDKALHSATIINQFLIVKQ---SPKINTKTAPQPPVEPDLDIKILN 411

  Fly   654 GEFSW-GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQQ 717
            ..||| |.:.||.::.:.||||...|.:|....||||::.:..||::...|.:.....:::.|..
 Worm   412 ANFSWNGKDDTLNDVCVHVKKGEKHAFIGFPLCGKSSLLFSITGELKMTKGNMWVSKGISFAPAS 476

  Fly   718 AWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISLA 782
            .:|.:.::::|||||..|.:.:|:|||.||.|:.||..|...:.|.:|:||..|:..||.:||||
 Worm   477 PYIFSQSLKENILFGNDYVKSKYDKVIMACDLKKDIFSLPRCEATVLGDKGYVLTSTQKAQISLA 541

  Fly   783 RAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKMG 847
            |.:|.|||:|.||.....:|......||..|:|..|.|..|:.:|.|:.:..:.....::|:|.|
 Worm   542 RCLYEDADIYALDKAFGPMDRTTSNKIFTRVLGENGYLRDKTVILATNNIELIKTFTMVHVLKNG 606

  Fly   848 EISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIKLART 912
            :|..||::||:::.....:|.              |||.:               ::|.|:    
 Worm   607 KIETSGSYDQILECSEIMSDL--------------LNQSR---------------IDKIIE---- 638

  Fly   913 ESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVEFA 977
            |..||  ......::|.....|::|.|:|...|:              ..:.|..         :
 Worm   639 EKYSD--EKPPRKTVMFDDKVLKKRKKKQSMEDT--------------APVFENR---------S 678

  Fly   978 VYKHYIKSVGIFLSVA----TLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWAND--QNVANDTGLRDMYLGVYG 1036
            ||..|.:| |.|:..|    .|:..|||||...   .||:.|.:.  :.|..:...:.:::....
 Worm   679 VYPFYFRS-GSFIFTAFYIVLLICRFVFQALAF---FWLSFWLDPVWKKVECENCPQYVFIQTMS 739

  Fly  1037 AFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGR--LLNSFSGDMDV 1099
            .|.....:....:.....|...|.::.::..:.:.|.  :|...| ::|..:  |:|..:.|:|:
 Worm   740 FFAISAIISTMLSYTFFVLTNVQTSRKLYQHITSAIF--AVPMIF-LSPTNKESLMNMITSDLDI 801

  Fly  1100 VDEELPATMDSFMTFIF----MVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFA--QRFYVATSRQLM 1158
            ||.:.|.    |..|.|    .:|....::.::.|:| |:.| :|||.:..  .|:::....::.
 Worm   802 VDTQFPL----FFKFSFECTLHILMIFAIVCVNVPVF-AIFV-VAFLIFLVGLLRYFLPALHKIS 860

  Fly  1159 RLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMV 1223
            .||...|........|.......:|.:....:.:.::....|....|:.......||:::|.|.:
 Worm   861 SLEEQKRDLFLCGSIEDFEARIMVRTFGKTRQTLAKTSVNADILTRCRMARYSTLRWISLRTEFI 925

  Fly  1224 GNLIILFASLFAVLGGQTNPGLVG-----LSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEY 1283
            .||:|......|.:..:.:  .:|     |||:..|.:::.::..:|.:..:|:....|:||...
 Worm   926 SNLMICMCFFIASICLKVD--YIGNAQFALSVASILCISELVSTFIRTTCILESLTPHVQRISNV 988

  Fly  1284 GETKQEAPWELEQDKNKPK-NWPQEGRVEFQNFQV---RYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVG 1344
                :|.|.|...||...: :||.:|::|.:|..|   :||.    |::.||..|:..||:||:|
 Worm   989 ----REYPKEPMIDKCTIRDSWPDDGKIEIKNLNVFANKYRH----VIKDVSLVIEEREKLGIIG 1045

  Fly  1345 RTGAGKSSLTLALFRIIEA-AGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPF 1408
            :.|:|||.|...|..:..| ....|.:|.:||..|.:..||||:|:|||...:||.:||.|:||.
 Worm  1046 KVGSGKSQLAKTLVMMSSADKESHIVVDDLDIFEMSVKTLRSRITVIPQKAKIFSDTLRSNIDPC 1110

  Fly  1409 EIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEA 1473
            ....|.:||.|:|...|:.:||||..||:..::.  |.:|..|:..|.:.||||:..::.|:|::
 Worm  1111 CQFADSDIWLAIEACQLREYVKSLPDGLHQMVSP--EKMSNEQKCQVNVCRALLKGGQIFVIDQS 1173

  Fly  1474 TAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPKSA 1538
            |..:......|:.:.||...|:.|.:.|....:.:...|:|:|::.|.|:...:|..|:    |.
 Worm  1174 TKMMKEPIKSLVNEAIRNSLKQSTTIWIGEDFSDVEHCDRVVVIENGVILTTDTPQNLI----SE 1234

  Fly  1539 FYSMAK 1544
            |.|:.|
 Worm  1235 FGSLQK 1240

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 355/1371 (26%)
cft-1NP_504463.1 MRP_assoc_pro 67..1236 CDD:188098 341/1295 (26%)

Return to query results.
Submit another query.