DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and Abcc3

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_542148.2 Gene:Abcc3 / 140668 RGDID:71101 Length:1523 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1570 Identity:770/1570 - (49%)
Similarity:1049/1570 - (66%) Gaps:78/1570 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 MDRFC-----GSTFWNATETWYTNDPDFTPCFEQTALVWTPCAFYWAFVIFDFYYLKASLDRNIP 68
            |||.|     ||.||::..|.|||.||.||||:.:.|.|.||.:.||.:....:||:......|.
  Rat     1 MDRLCGSGELGSKFWDSNLTVYTNTPDLTPCFQNSLLAWVPCIYLWAALPCYLFYLRHHRLGYIV 65

  Fly    69 WNKLNVSKALVNLGLLVITALDLIMA---LVKKGGDSELPLYDLDVWGPIIKFATFLLLFIFIPL 130
            .:.|:..|..:.:.|..|:.:||..:   ||.  |.|..|::.:.   |::...|.||..:.|..
  Rat    66 LSCLSRLKTALGVLLWCISWVDLFYSFHGLVH--GSSPAPVFFIT---PLLVGITMLLATLLIQY 125

  Fly   131 NRKYGVQTTGCQFIFWFLLTVLSIPRCRTEVRLDAERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSFFIFF 195
            .|..||:::|...|||.|..:.:|...|:::.|.....|||            :.::|.:|:|:|
  Rat   126 ERLRGVRSSGVLIIFWLLCVICAIIPFRSKILLALAEGKIL------------DPFRFTTFYIYF 178

  Fly   196 TFTSIMLILNCFADGMPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDL 260
            .......||:||.:..|..:......|..||.||.|.||:::.||.|:|:.|||.|||:.|||.|
  Rat   179 ALVLCAFILSCFQEKPPLFSPENLDTNPCPEASAGFFSRLSFWWFTKLAILGYRRPLEDSDLWSL 243

  Fly   261 RPQDSCSEVMPIFAHHW-NQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPP 324
            ..:|...:|:......| .|..:.:....|.:|||....:..:....|..:|       .|.:..
  Rat   244 SEEDCSHKVVQRLLEAWQKQQTQASGPQTAALEPKIAGEDEVLLKARPKTKK-------PSFLRA 301

  Fly   325 IYKSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFI 389
            :.::|....|.||..||..|.|:|..||:||::|.|:....| |.|.|.|.|.|:||.:..||.|
  Rat   302 LVRTFTSSLLMGACFKLIQDLLSFINPQLLSILIRFISDPTA-PTWWGFLLAGLMFVSSTMQTLI 365

  Fly   390 LGQYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIW 454
            |.|::|.:|::.||||||:|..||||||.|:||.|:|.||||:||||:|||||||:::.::|::|
  Rat   366 LHQHYHCIFVMALRIRTAIIGVIYRKALTITNSVKREYTVGEMVNLMSVDAQRFMDVSPFINLLW 430

  Fly   455 SAPLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLS 519
            |||||:.||:|||||.||||.|||:||:::|||:||.::.::||||::|||:||.|:|||:|:|:
  Rat   431 SAPLQVILAIYFLWQILGPSALAGVAVIVLLIPLNGAVSMKMKTYQVQQMKFKDSRIKLMSEILN 495

  Fly   520 GIKVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEAN 584
            ||||||||||||:|.:||..||..|:..||..|||.|.::|:|.|.||:|:|:|...||...:.|
  Rat   496 GIKVLKLYAWEPTFLEQVEGIRQSELQLLRKGAYLQAISTFIWVCTPFMVTLITLGVYVCVDKNN 560

  Fly   585 QLSVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKP-HP 648
            .|..||..||::||:::|:||.:||.|...:.:|.||:.||..|||.:||||..|...:..| ..
  Rat   561 VLDAEKAFVSLSLFNILKIPLNLLPQLISGMTQTSVSLKRIQDFLNQDELDPQCVERKTISPGRA 625

  Fly   649 MSIENGEFSWGDEI--TLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKL 711
            ::|.||.|||..::  ||.::||::.||:|||:||.||.||||:|.|.|||||||.|.|:..|.:
  Rat   626 ITIHNGTFSWSKDLPPTLHSLNIQIPKGALVAVVGPVGCGKSSLVSALLGEMEKLEGAVSVKGSV 690

  Fly   712 AYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQK 776
            |||||||||||.|:::|:||||..:.|||.:.::.|||.||:|:|..||.||||||||||||||:
  Rat   691 AYVPQQAWIQNCTLQENVLFGQPMNPKRYQQALETCALLADLDVLPGGDQTEIGEKGINLSGGQR 755

  Fly   777 QRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSI 841
            ||:||||||||||:::||||||||||:||.||||::||||:|:||.|:|||||||::||||.|.|
  Rat   756 QRVSLARAVYSDANIFLLDDPLSAVDSHVAKHIFDQVIGPEGVLAGKTRVLVTHGISFLPQTDFI 820

  Fly   842 YVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEE---------EEELNQIKRQISSTADVP 897
            .|:..|:|:|.|.:.:|:::.|:||:|:..:..:.|:|         .||:..::..:|:..|:.
  Rat   821 IVLADGQITEMGHYSELLQHDGSFANFLRNYAPDENQEANEGVLQHANEEVLLLEDTLSTHTDLT 885

  Fly   898 ELLGTVEKAIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKK----QE 958
            :    .|.||...|.:.:.:..|::|.     |.|..|...||..|        ||:|:    |.
  Rat   886 D----TEPAIYEVRKQFMREMSSLSSE-----GEGQNRPVLKRYTS--------SLEKEVPATQT 933

  Fly   959 VE-GKLIETEKSQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWAND---Q 1019
            .| |.||:.|.::||.|:.:||..|.||||:..::...:|.....|..||:|:||:.|.||   .
  Rat   934 KETGALIKEEIAETGNVKLSVYWDYAKSVGLCTTLFICLLYAGQNAVAIGANVWLSAWTNDVEEH 998

  Fly  1020 NVANDTGLRDMYLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDIT 1084
            ...|:|.:|   ||||...|..||:|...:...:.:|..|||:.:|..||...||... .|||.|
  Rat   999 GQQNNTSVR---LGVYATLGILQGLLVMLSAFTMVVGAIQAARLLHTALLHNQIRAPQ-SFFDTT 1059

  Fly  1085 PIGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRF 1149
            |.||:||.||.|:.|:||.|..|:.......:..::|||||..|||:|..|::|:|..|.|.|||
  Rat  1060 PSGRILNRFSKDIYVIDEVLAPTILMLFNSFYTSISTIVVIVASTPLFCVVVLPLAVFYGFVQRF 1124

  Fly  1150 YVATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANR 1214
            ||||||||.||||||||||:|||||||||.|.||||.....|...||||||.||...||.:.:||
  Rat  1125 YVATSRQLKRLESVSRSPIFSHFSETVTGTSVIRAYGRVQDFKVLSDAKVDSNQKTTYPYIASNR 1189

  Fly  1215 WLAIRLEMVGNLIILFASLFAVLG-GQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVE 1278
            ||.:.:|.|||.::||::||||:| ...||||||||||||||||.:|||::|..||:|:||::||
  Rat  1190 WLGVHVEFVGNCVVLFSALFAVIGRNSLNPGLVGLSVSYALQVTLSLNWMIRTLSDLESNIIAVE 1254

  Fly  1279 RIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIV 1343
            |:|||.:|:.||||.||.:: .|:.||:.|.|||:|:.||||.||:|||:.::.::|||||||||
  Rat  1255 RVKEYSKTETEAPWVLESNR-APEGWPRSGVVEFRNYSVRYRPGLELVLKNLTLHVQGGEKVGIV 1318

  Fly  1344 GRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPF 1408
            |||||||||:||.||||:|||.|.|.|||:::|.:|||.|||:||||||||:||||:||:|||||
  Rat  1319 GRTGAGKSSMTLCLFRILEAAEGEIFIDGLNVAHIGLHDLRSQLTIIPQDPILFSGTLRMNLDPF 1383

  Fly  1409 EIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEA 1473
            ...:|::||:.||||||.:||.|...||:.:.:|||:|||||||||||||||||||::|||||||
  Rat  1384 GRYSDEDIWRTLELSHLSAFVSSQPTGLDFQCSEGGDNLSVGQRQLVCLARALLRKSRVLVLDEA 1448

  Fly  1474 TAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPKSA 1538
            |||:|||||||||.||||:|::|||||||||||||:|.::|:|||||.:.||.||..|: .....
  Rat  1449 TAAIDLETDDLIQGTIRTQFEDCTVLTIAHRLNTIMDYNRVLVLDKGVVAEFDSPVNLI-AAGGI 1512

  Fly  1539 FYSMAKDANL 1548
            ||.|||||.|
  Rat  1513 FYGMAKDAGL 1522

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 765/1558 (49%)
ABC_membrane 338..601 CDD:279056 145/262 (55%)
ABCC_MRP_domain1 649..848 CDD:213217 128/200 (64%)
ABC_membrane 988..1260 CDD:279056 138/275 (50%)
ABCC_MRP_domain2 1308..1528 CDD:213211 154/219 (70%)
Abcc3NP_542148.2 MRP_assoc_pro 7..1522 CDD:188098 765/1562 (49%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166345000
Domainoid 1 1.000 250 1.000 Domainoid score I2044
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0054
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H68364
Inparanoid 1 1.050 1449 1.000 Inparanoid score I105
OMA 1 1.010 - - QHG51855
OrthoDB 1 1.010 - - D138195at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000087
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45770
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100026
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X177
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1514.670

Return to query results.
Submit another query.