DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and MRP

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061509603.1 Gene:MRP / 1279254 VectorBaseID:AGAMI1_005212 Length:1521 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1550 Identity:994/1550 - (64%)
Similarity:1226/1550 - (79%) Gaps:44/1550 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 PMDRFCGSTFWNATETWYTNDPDFTPCFEQTALVWTPCAFYWAFVIFDFYYLKASLDRNIPWNKL 72
            |||.||||.||:...||||:|||.||||:||.|||.||||.|.|...:.|||:.|.::::||:.:
Mosquito     5 PMDEFCGSRFWDLNLTWYTDDPDLTPCFQQTVLVWAPCAFLWLFSFLELYYLRKSANKDVPWSFV 69

  Fly    73 NVSKALVNLGLLVITALDLIMALVKKGGDSELPLYDLDVWGPIIKFATFLLLFIFIPLNRKYGVQ 137
            ||||.||...|:|:|.:||..|:...|..:.|..|.     |:||.|:|:.:.|.|.||:.||::
Mosquito    70 NVSKLLVIGSLIVLTIVDLANAISTDGISAPLFYYT-----PVIKLASFIFVAILIYLNKHYGMR 129

  Fly   138 TTGCQFIFWFLLTVLSIPRCRTEVRLDAERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSFFIFFTFTSIML 202
            |:|..|:|||||||.||||.|||||  |...:::..        ||.|||||||.|||:.|.||.
Mosquito   130 TSGLLFLFWFLLTVCSIPRVRTEVR--AYEARVVED--------SWAEYQFVSFLIFFSLTCIMF 184

  Fly   203 ILNCFADGMPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCS 267
            :||.|.|..|||:||:..:.:.|||:|||.|||.:.|||::|..|:|.|||..|||.::|:||..
Mosquito   185 LLNFFVDKPPRQSKYEITDKDCPELAASFPSRIFFAWFDRLAWVGFRKPLEVDDLWKMKPEDSSK 249

  Fly   268 EVMPIFAHHWNQNVRKNYKNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGE-----KNGRKKGMASIMPPIYK 327
            ||.|.|.||||:.:.|.|:::.        ::.:|||:.....     :..:.|.:|||:|.:.|
Mosquito   250 EVSPAFLHHWNETLEKTYQSRE--------TSNDVTFKKLGNSARVDFRTTKAKNIASILPALIK 306

  Fly   328 SFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILGQ 392
            :|||.||.|:.:||..|.||||.||:|.|||.||..:  ||.|||::||:.|||:|..||.:|||
Mosquito   307 TFGGTFLLGSFLKLGQDLLTFASPQILKLIIGFVGGE--EPMWKGLMYAITLFVVAGTQTLLLGQ 369

  Fly   393 YFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAP 457
            ||:|||.||||||||||:|||||||.||||.:|.||||||||||||||||||:||||:|||||||
Mosquito   370 YFNRMFFVGLRIRTALISAIYRKALIISNSARKGSTVGEIVNLMAVDAQRFMDLTTYINMIWSAP 434

  Fly   458 LQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIK 522
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||:.|||.||:|||.||||||||||||||||
Mosquito   435 LQIGLALYFLWQILGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIANMIKTLQIKQMKNKDERVKLMNEVLSGIK 499

  Fly   523 VLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLS 587
            ||||||||||||:|:|.|||||:..|:|.|||||||||:||||||||||||||||||..|.|.|.
Mosquito   500 VLKLYAWEPSFEQQILKIRDKEVKVLKSAAYLNAGTSFIWSCAPFLVSLVTFATYVLVDENNVLD 564

  Fly   588 VEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKPHPMSIE 652
            .....||::||::::.||::||||..::.:|.|||||||.|||.|||||::|.||..:..|:.||
Mosquito   565 ASTAFVSLSLFNILRFPLSMLPMLISNMVQTSVSVNRINTFLNQEELDPDNVQHDEKESSPLLIE 629

  Fly   653 NGEFSW-GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAYVPQ 716
            ||.||| |:|.||:|||:.|:|..:||:||||||||||::.||||||:|::|.|||:|::|||.|
Mosquito   630 NGVFSWGGEETTLKNINVRVEKNQIVAVVGTVGSGKSSLLSAFLGEMDKISGRVNTLGRIAYVSQ 694

  Fly   717 QAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQRISL 781
            ||||||||::||||||:..|::||.:||:||||:.||::|..||:|||||||||||||||||:||
Mosquito   695 QAWIQNATLKDNILFGKPMDQRRYARVIEACALKPDIEMLPGGDMTEIGEKGINLSGGQKQRVSL 759

  Fly   782 ARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYVIKM 846
            |||||:|||:|.|||||||||:||||||||:||||.|:||:|:|||||||:|:||..|.|:|::.
Mosquito   760 ARAVYNDADVYFLDDPLSAVDSHVGKHIFEQVIGPSGLLAKKTRVLVTHGITYLPNTDKIFVLRE 824

  Fly   847 GEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKA-IKLA 910
            ||||||||:.:|:..|||||:|:||||||.:||||:|::||:|:.::....|||..:::: .|.:
Mosquito   825 GEISESGTYQELMDKKGAFAEFLIQHLQEVSEEEEDLDEIKQQLENSVGGEELLNQLKRSNSKRS 889

  Fly   911 RTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEKSQTGGVE 975
            |:||.|::.||.          .:.|:....||:.|:....|.|..:..:.||||||||:||.|:
Mosquito   890 RSESTSETGSVK----------DISRQNSTTDSNTSLRRRTSEKAPEVAKTKLIETEKSETGSVK 944

  Fly   976 FAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWANDQNVANDTGLRDMYLGVYGAFGF 1040
            :.|||||:||:|:.|||||::||.:||.|.|||||||::|:.|....|||..||||||||||||.
Mosquito   945 WEVYKHYLKSIGLTLSVATVILNMIFQGFSIGSNLWLSRWSTDDTAGNDTSRRDMYLGVYGAFGA 1009

  Fly  1041 GQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVCRFFDITPIGRLLNSFSGDMDVVDEELP 1105
            ||.:..:.:.:.:|:|..:|::|:|..||..::...:..||||||:||:||.||.|:|..|.:||
Mosquito  1010 GQVLSTFLSTLFLYIGALEASRTLHKTLLRRVLHAPLTSFFDITPVGRVLNRFSKDIDTTDSDLP 1074

  Fly  1106 ATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESVSRSPIYS 1170
            ||:.::....|.|:||:||||:|||||.||||||..|||..|||||||||||.||||||||||||
Mosquito  1075 ATLRAWSACFFGVVATLVVISISTPIFAAVIVPIGILYYAVQRFYVATSRQLKRLESVSRSPIYS 1139

  Fly  1171 HFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLIILFASLFA 1235
            ||.||:.|..|||||:|.||||.|||.|||.||:|..||:|||||||:|||||||||||||:|||
Mosquito  1140 HFGETIQGVQTIRAYSVQDRFILESDEKVDGNQLCYCPSIIANRWLAVRLEMVGNLIILFAALFA 1204

  Fly  1236 VLGGQT-NPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPWELEQDKN 1299
            |||.:| |.||||||||||||:||||||||||:||:|||||:||||||||||||||.||| .:..
Mosquito  1205 VLGRETMNAGLVGLSVSYALQITQTLNWLVRMTSDVETNIVAVERIKEYGETKQEAAWEL-PNST 1268

  Fly  1300 KPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAA 1364
            .|::||::|.|||::|||||||||:|||||:||.:.|||||||||||||||||||||||||||:|
Mosquito  1269 LPRDWPEQGMVEFRDFQVRYREGLELVLRGISFTVNGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLALFRIIESA 1333

  Fly  1365 GGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALELSHLKSFV 1429
            ||.|.|||.||:.:|||.|||||||||||||||||:||||||||..::||:||||||.:|||:||
Mosquito  1334 GGSIVIDGQDISQLGLHALRSRLTIIPQDPVLFSGTLRINLDPFNAQSDDDIWKALEHAHLKTFV 1398

  Fly  1430 KSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQKTIRTEFK 1494
            |.|.||:|||:.|||||||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||:|||||||
Mosquito  1399 KGLTAGINHEVTEGGENLSVGQRQLICLARALLRKTKVLILDEATAAVDLETDDLIQRTIRTEFK 1463

  Fly  1495 ECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPKSAFYSMAKDANLV 1549
            :|||||||||||||:|||||||||||||:|||.|.|||.:..||||||||||.||
Mosquito  1464 DCTVLTIAHRLNTIMDSDKVIVLDKGQIVEFAPPAELLQSKNSAFYSMAKDAGLV 1518

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 987/1541 (64%)
MRPXP_061509603.1 None

Return to query results.
Submit another query.