DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRP and abcc6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002932264.3 Gene:abcc6 / 100493037 XenbaseID:XB-GENE-6465366 Length:1500 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1557 Identity:647/1557 - (41%)
Similarity:974/1557 - (62%) Gaps:93/1557 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    17 FWNATETWYTNDPDFTPCFEQTALVWTPCAFYWAFVIFDFY--YLKASLDRNIPWNKLNVSKALV 79
            ||:..:||:|::|||:.||..:.|.|.|..|  .|:...||  ||:......|..:.|:.:|..:
 Frog    13 FWDINQTWHTDNPDFSQCFHNSVLNWIPSIF--LFICSPFYVLYLRRHGRGYIRMSALSKAKTCL 75

  Fly    80 NLGLLVITALDLIMALVKKGGD-SELPLYDLDVWGPIIKFATFLLLFIFIPLNRKYGVQTTGCQF 143
            ...|:::...:|...:.....: .:.|::   :..|:|..::.||....|...|..||:::....
 Frog    76 GALLVLVCYTELFYTVWNMTHNVRQAPVF---LISPLILGSSMLLATCIIQYERMQGVRSSALLL 137

  Fly   144 IFWFLLTVLSIPRCRTEVRLDAERQKILNSQQPSEQDFSWEEYQFVSFFIFFTFTSIMLILNCFA 208
            .||.|..:.:..:.||::....       |:.|     ..::.::..|.::|.|.....:|..|.
 Frog   138 FFWLLALLCATFQLRTKITTAI-------SEAP-----QIDKLRYTLFVLYFVFVLAQSVLCTFN 190

  Fly   209 DGMPRQTKYQRGENEIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRPQDSCSEVMPIF 273
            |..|..:..::..|..|...:||||::|:.||.::..:||:.||:.:|:|.||..|:..|::.:|
 Frog   191 DDPPFFSNLKKESNPCPVSESSFLSKVTFSWFTEIMFRGYKQPLKAEDVWSLRKSDTAEEILTLF 255

  Fly   274 AHHWNQNVRKN--YKNKARVEP----------KAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIY 326
            :....:..:|.  .|...|..|          :.:.|...:..:|.|.:.:.:     :::..|.
 Frog   256 SKGVEKECKKANLLKEPTRFSPSTLDNDMWISQTEKSEIELLLKNQHIQLSQK-----TLLKVIM 315

  Fly   327 KSFGGVFLFGALMKLFTDTLTFAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEWKGILYAVLLFVLAAAQTFILG 391
            :|||..||..||:..|.....|..|.::.|::..::...| |.|:|.|.||.||:....|:..|.
 Frog   316 RSFGLYFLLSALLMTFYTAFLFISPLLVRLLLQLLKDPSA-PSWQGFLVAVFLFICPCCQSLFLH 379

  Fly   392 QYFHRMFIVGLRIRTALINAIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSA 456
            |:.:..:::|:|:|.|::..:|:|||.||::.:|||:.||||||::.|.|:.|:|.|.:|.:|||
 Frog   380 QHDYICYVIGMRLRAAIVGTVYKKALMISSAGRKESSAGEIVNLISTDVQKLMDLATCVNYMWSA 444

  Fly   457 PLQIGLALYFLWQQLGPSVLAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGI 521
            |:.|.:|:|||||.||.:||||:||.|:.:|...|.|..||..|.:|||.||.|:|:::|:|.||
 Frog   445 PVTIIVAMYFLWQTLGIAVLAGVAVFILNLPFMTVFAVIIKRVQEQQMKQKDGRIKIISEILQGI 509

  Fly   522 KVLKLYAWEPSFEKQVLDIRDKEIATLRSTAYLNAGTSFLWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQL 586
            |||||||||.:|.|:|.:.|..|:..:::.|.|.:|...::..:||.|||..|..::...|.|.|
 Frog   510 KVLKLYAWENAFMKKVTEFRLMELKAVKTGALLLSGALAVFVASPFWVSLTMFGVFLALDEKNIL 574

  Fly   587 SVEKVLVSIALFDLMKLPLTILPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSV-LHDSSKPHPMS 650
            ..||..|:|.|.:::::||.:.||.....|::.||:.|:.||.::|||:|.|| ::||...|.::
 Frog   575 DAEKAFVTIILLNILRIPLRMFPMAITLFAQSSVSLKRMVKFFSAEELEPESVDINDSLSKHAIT 639

  Fly   651 IENGEFSW--GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGKLAY 713
            |.:|.|:|  .:...|::|||.:.:|:|||:||.||.||:|::.|.||||||:.|.|:.:..:||
 Frog   640 IRHGTFTWSSSEPPCLQSINIGIPQGTLVAVVGQVGCGKTSLLSALLGEMEKVEGQVSLMSSVAY 704

  Fly   714 VPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQKQR 778
            ||||.||.|||.::|:|||:..::..|::|:.||||..|:.|||.|:.|||||||:|||||||||
 Frog   705 VPQQTWIPNATFKENVLFGRKMEKCWYDQVVQACALLPDLKILSGGENTEIGEKGVNLSGGQKQR 769

  Fly   779 ISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDSIYV 843
            ||:|||||.:.|:|||||||||||||||:|:||:||||.|:|..|:||||||||:||||:|.|.|
 Frog   770 ISIARAVYRNCDVYLLDDPLSAVDAHVGQHLFEQVIGPSGLLKDKTRVLVTHGVSFLPQMDMIIV 834

  Fly   844 IKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEKAIK 908
            :..|.:||.||:::|::..|||::|:..:.::....||...:            :...:::.|:|
 Frog   835 MSDGRVSEVGTYNELLQKNGAFSEFLNTYARKSVVFEESYEE------------QTPNSIQGAMK 887

  Fly   909 LARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTKRQDSHDSVASAASLKKKQEVE---GKLIETEKSQ 970
                               |.|..|.|..|..:.  |.||:        |:|   |||.|.:.:.
 Frog   888 -------------------MKGKHSARNDTDNET--DDVAN--------EIEADAGKLTEADVAL 923

  Fly   971 TGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVFQAFQIGSNLWLTQWANDQNVANDTGLRDMYLGVY 1035
            ||.|:.:||..|.|.:|.:..:.:.:...|.||..:..|.|:..||:|..|........:.||||
 Frog   924 TGRVKLSVYLEYCKIMGKWYLLISALFFIVQQAASLSYNYWIGLWADDPPVNGTQQHTSLRLGVY 988

  Fly  1036 GAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGGFQAAKTIHNELLAVIIRGSVC--RFFDITPIGRLLNSFSGDMD 1098
            ...|..|.:..:.|...:.:||...::.:|:.||..|:|   |  .||:.||.|.|.|.|:.:||
 Frog   989 SFLGVMQALSIFAASSTIIVGGVSVSRQLHSRLLYSILR---CPLSFFERTPSGNLTNRFAKEMD 1050

  Fly  1099 VVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFYVATSRQLMRLESV 1163
            ::|..:|..:..|:..:..:...::|||::||:.....:|:..||:|.||||||:||||.||::|
 Frog  1051 IIDNTVPQVLMLFIIMMLTIAEILLVISIATPLAAVAFIPLGLLYFFLQRFYVASSRQLKRLDAV 1115

  Fly  1164 SRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRWLAIRLEMVGNLII 1228
            |:||:|:||:|::.|...|||:...:|||::::.:::.||...:.|.:|||||::|.:.:.|.|:
 Frog  1116 SKSPLYTHFNESLQGVYVIRAFREQERFIQDNNMRLNMNQRFYFCSFVANRWLSVRCDFLSNFIV 1180

  Fly  1229 LFASLFAVL-GGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVERIKEYGETKQEAPW 1292
            ...::..|| .....||||||:|..:|::|..|...|.:::|:|||.|||||:|||.:.:.||||
 Frog  1181 FTVAIVGVLFRDNITPGLVGLAVVNSLRLTGVLKEAVHVATDMETNSVSVERVKEYCDAEPEAPW 1245

  Fly  1293 ELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREGLDLVLRGVSFNIQGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLAL 1357
             ...:.:...|||.:|::||||:.:|||..|||.|:.|:.:||.|||||||||||||||||||.|
 Frog  1246 -TSDNASDLSNWPSKGKIEFQNYGLRYRPDLDLALKNVTASIQQGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGL 1309

  Fly  1358 FRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLDPFEIKTDDEIWKALEL 1422
            |||:|.|.|||.||..||:.:|||.|||::||||||||||||:||:|||||:..:|::||.||:|
 Frog  1310 FRILEPATGRICIDEKDISELGLHELRSKITIIPQDPVLFSGTLRMNLDPFDNYSDNDIWVALQL 1374

  Fly  1423 SHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLDEATAAVDLETDDLIQK 1487
            :|||.|...|..||::...|||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.
 Frog  1375 AHLKVFASGLPEGLSYICTEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILVLDEATAAVDLETDDLIQN 1439

  Fly  1488 TIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPKSAFYSMAKDANLV 1549
            |||.||::||::|||||||||:|..:|:|.|||:|:||.:|..||:| |..|||||:|||::
 Frog  1440 TIRKEFEDCTIITIAHRLNTIMDYTRVVVFDKGEIVEFDTPATLLEN-KGLFYSMARDANII 1500

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 646/1554 (42%)
abcc6XP_002932264.3 MRP_assoc_pro 5..1499 CDD:188098 646/1554 (42%)

Return to query results.
Submit another query.