Protein Alignment CG6230 and SERCA

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609490.1
• Gene: CG6230 / 34546
• FlyBaseID: FBgn0027582
• Length: 1225
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_726381.1
• Gene: SERCA / 49297
• FlyBaseID: FBgn0263006
• Length: 1020
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1051
• Identity: 225/1051 - (21%)
• Similarity: 373/1051 - (35%)
• Gaps: 305/1051 - (29%)

  Fly   213 RGLETEEDIKRATQTYGNNEM---------EMVVPEFHELFIE---RATAPFFVFQVFSVGLWCM 265
            ||| |.:.||...:.||.||:         ::|:.:|.:|.::   .|....||..:|..
  Fly    22 RGL-TLDQIKANQKKYGPNELPTEEGKSIWQLVLEQFDDLLVKILLLAAIISFVLALFEE----- 80

  Fly   266 DDYWYYSLFTLF--------MLIAFECTIVKQQLRNMSEIRKMGN-KPYLIYAFRQNK--WRHLG 319
                :...||.|        :|||.....|.|:....|.|..:.. :|.:....||:|  .:.:.
  Fly    81 ----HEETFTAFVEPLVILLILIANAVVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVVRQDKSGIQKVR 141

  Fly   320 SDELLPGDLVSITRSQNDNIVPCDLVI-------LRGSCIVDESMLTGESVPLMKESLESLDNLD 377
            :.|::|||||.:  |..|.| |.|:.|       ||    :|:|:||||||.::|.:....|...
  Fly   142 AKEIVPGDLVEV--SVGDKI-PADIRITHIYSTTLR----IDQSILTGESVSVIKHTDAIPDPRA 199

  Fly   378 VEMDAEGDGKLFVLFGGTKVVQHTAPTKESLRAPDGGCIGYVIRTGFNTSQGKL---------LR 433
            |..|     |..:||.||.|..             |...|.||.||.:|:.||:         ::
  Fly   200 VNQD-----KKNILFSGTNVAA-------------GKARGVVIGTGLSTAIGKIRTEMSETEEIK 246

  Fly   434 TIL------FGANRATENNVETFAFIAFLMVFAVAAASY-------VWVKGSEDPERNRYKLFLE 485
            |.|      ||      ..:.....:..:.|:|:....:       .|:||:       ...|..
  Fly   247 TPLQQKLDEFG------EQLSKVISVICVAVWAINIGHFNDPAHGGSWIKGA-------IYYFKI 298

  Fly   486 CTLILTSIIPPDLPIELTLAVNTSLIQLTKLFVFCTEPFRIPFAGKVQICCFDKTGTLTTDNLMV 550
            ...:..:.||..||..:|..:.....::.|..........:...|...:.|.||||||||:.:.|
  Fly   299 AVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSV 363

  Fly   551 --------------------------EGIAGLAPNGACVPIEKAEGNTVQVLA--C--CHSLALL 585
                                      |.|..:..||.  .|:.|:.:|:|.|:  |  |:..|:.
  Fly   364 SRMFIFDKVEGNDSSFLEFEMTGSTYEPIGEVFLNGQ--RIKAADYDTLQELSTICIMCNDSAID 426

  Fly   586 DDGL------VGDPLEKATLAAVDWT---------LTKMDSVIPKRPQFKPLKIIQRY--HFSSA 633
            .:..      ||:..|.|.:...:..         |.:..:.|..|.:.: .|..:.:  .||..
  Fly   427 YNEFKQAFEKVGEATETALIVLAEKLNSFSVNKSGLDRRSAAIACRGEIE-TKWKKEFTLEFSRD 490

  Fly   634 LKRMSVLAGHLIPYSNEVK--HIGA-----VKGAPEVIQKMLREVPADYEKVYLEYARRGARVLA 691
            .|.||       .|...:|  .:|.     ||||||.:.:..........||.|..|.: |::||
  Fly   491 RKSMS-------SYCTPLKASRLGTGPKLFVKGAPEGVLERCTHARVGTTKVPLTSALK-AKILA 547

  Fly   692 LGIKDLGTLGAQRVR---------EMKREEV-----------ECDLTFAGFLIISCPMKPDSKSV 736
            | ....|| |...:|         .||.:|:           |.:|||.|.:.:   :.|..|.|
  Fly   548 L-TGQYGT-GRDTLRCLALAVADSPMKPDEMDLGDSTKFYQYEVNLTFVGVVGM---LDPPRKEV 607

  Fly   737 IKELIQ---SSHKVVMITGDSPLTACHVARELRFTRKKLIILTPPEEDRKNNWSWVSIDGDQSYE 798
            ...:::   :..:|::||||:..||..:.|       ::.:....|:....::|....|
  Fly   608 FDSIVRCRAAGIRVIVITGDNKATAEAICR-------RIGVFAEDEDTTGKSYSGREFD------ 659

  Fly   799 LDTKPGSKKLSHLLATHDLCITGEGLQYLQQNQPQYMRQLLPQITVCARFAPKQKELVITQLKQL 863
             |..|..:|.:                             :.:..:.:|..|:.|..::..|:.:
  Fly   660 -DLSPTEQKAA-----------------------------VARSRLFSRVEPQHKSKIVEFLQSM 694

  Fly   864 GYCTLMCGDGTNDVGALKHANVGVSLLTSAPVKRKRTEEEQQQAAANAAAIAAQAQ--------- 919
            ...:.|.|||.||..|||.|.:|:::.:...|  .::..|...|..|.::|.:..:
  Fly   695 NEISAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAV--AKSAAEMVLADDNFSSIVSAVEEGRAIYNNM 757

  Fly   920 ---------ANANQQLTTRERALRRRQEHLNQTQARLQNALRDMEEQTMVKLGDASIAAPFTSKS 975
                     :|..:.::....|.....|.|...|....|.:.|         |..:.|..|....
  Fly   758 KQFIRYLISSNIGEVVSIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTD---------GLPATALGFNPPD 813

  Fly   976 SSIMCVNHIIKQGRCT---LVTTLQMFKILALNALIQA--------------------YCQSVLY 1017
            ..||     .|..|..   |::....|:.:|:...:.|                    |.|...:
  Fly   814 LDIM-----EKPPRKADEGLISGWLFFRYMAIGFYVGAATVGAAAWWFVFSDEGPKLSYWQLTHH 873

  Fly  1018 I------DGIK------FSDTQATMQGIFIAACFLFITRAKPLKTLSKVAPLPNIFNFYTISTIL 1070
            :      |..|      |||..|....:.:......:.....|.....:..:|...|.:.|.::.
  Fly   874 LSCLGGGDEFKGVDCKIFSDPHAMTMALSVLVTIEMLNAMNSLSENQSLITMPPWCNLWLIGSMA 938

  Fly  1071 SQFAVHFGTLY 1081
            ..|.:||..||
  Fly   939 LSFTLHFVILY 949

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG6230	NP_609490.1	P-type_ATPase_cation	220..1152	CDD:319843	221/1044 (21%)
SERCA	NP_726381.1	P-type_ATPase_SERCA	5..989	CDD:319778	225/1051 (21%)