DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG6230 and Atp13a1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609490.1 Gene:CG6230 / 34546 FlyBaseID:FBgn0027582 Length:1225 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001099549.2 Gene:Atp13a1 / 290673 RGDID:1306033 Length:1197 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1228 Identity:639/1228 - (52%)
Similarity:832/1228 - (67%) Gaps:75/1228 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 PGGAAGDAESYGKEMALQSGRP---KEPTKL---DDLVQYVSLHVRIPTPLTGVVLPFVPLYLSA 68
            ||||.|....       |.|||   ..|..:   |:||..|..:.|:.......||||..|...|
  Rat    14 PGGARGSGSP-------QPGRPGLAAGPALIASGDELVAAVWPYRRLALLRRLTVLPFAGLLYPA 71

  Fly    69 FYLWINVTG----GQENDTTNNDVITADNQTTTDNITTWNDVGFIGVLAIAFL---HILTLLFCY 126
               |:....    |..|                    :|..:....:||:|.:   |.||:|..:
  Rat    72 ---WLGAAASGCWGWGN--------------------SWTQIPEAALLALATICLAHALTILSGH 113

  Fly   127 WSVHVLAFLTCRRVKLPGANVLAKVVPTPNNGNSKIVPIRSSKLEDGSTQYYFVFQKTKYVWNE- 190
            ||||....|||.....|......|||||||||::::|.:...|.|||.....|.|||.||.::. 
  Rat   114 WSVHAHCALTCTPEHDPNKVTFVKVVPTPNNGSTELVALHRDKGEDGLEVLSFEFQKIKYSYDAL 178

  Fly   191 DRKTFRAVEFPVNGLLSTYSSSRGLETEEDIKRATQTYGNNEMEMVVPEFHELFIERATAPFFVF 255
            ::|.|..|.|||....|.|.|:||.:.:.||:.|.:.:|:|:.||.||:|.|||.||||||||||
  Rat   179 EKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQEDSDIRAAEKKFGSNKAEMAVPDFSELFKERATAPFFVF 243

  Fly   256 QVFSVGLWCMDDYWYYSLFTLFMLIAFECTIVKQQLRNMSEIRKMGNKPYLIYAFRQNKWRHLGS 320
            |||.|||||:|:|||||:|||.||:|||.::|:||:|||||||||||||::|..:|..|||.:.|
  Rat   244 QVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIAS 308

  Fly   321 DELLPGDLVSITRSQNDNIVPCDLVILRGSCIVDESMLTGESVPLMKESLESLDNLDVEMDAEGD 385
            |:::|||:|||.||..:|:||||:::|||.|||||:||||||||.|||.:|.| :.|..:|.:.|
  Rat   309 DDIVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQMKEPIEDL-SPDRVLDLQAD 372

  Fly   386 GKLFVLFGGTKVVQHTAPTK--ESLRAPDGGCIGYVIRTGFNTSQGKLLRTILFGANRATENNVE 448
            .:|.|:|||||||||..|.|  ..|:..|.||:.:|:||||||||||||||||||..|.|.||:|
  Rat   373 ARLHVIFGGTKVVQHIPPQKATSGLKPVDNGCVAFVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLE 437

  Fly   449 TFAFIAFLMVFAVAAASYVWVKGSEDPERNRYKLFLECTLILTSIIPPDLPIELTLAVNTSLIQL 513
            ||.||.||:|||:|||:|||::|::||.||||||||||||||||::||:|||||:||||||||.|
  Rat   438 TFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIAL 502

  Fly   514 TKLFVFCTEPFRIPFAGKVQICCFDKTGTLTTDNLMVEGIAGLAPNGACVPIEKAEGNTVQVLAC 578
            .||:::|||||||||||||::||||||||||:|:|:|.|:|||.......|:......|.:.||.
  Rat   503 AKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPVSSIPIETHRALAS 567

  Fly   579 CHSLALLDDG-LVGDPLEKATLAAVDWTLTKMDSVIPKRPQFKPLKIIQRYHFSSALKRMSVLAG 642
            ||||..|||| |||||||||.|.||||||||.:.|.|:..:.:.|||.||:||:||||||||||.
  Rat   568 CHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLAS 632

  Fly   643 HLIPYSNEVKHIGAVKGAPEVIQKMLREVPADYEKVYLEYARRGARVLALGIKDLGTLGAQRVRE 707
            :....|.::.:|.|||||||.:..|..:.|.||..::.|.:|.||||||||.|:||.|..|:.||
  Rat   633 YEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQARE 697

  Fly   708 MKREEVECDLTFAGFLIISCPMKPDSKSVIKELIQSSHKVVMITGDSPLTACHVARELRFTRK-K 771
            :|||.:||.|.|.||:::|||:|.|||:||:|:..:||:|||||||:||||||||:||.|..| .
  Rat   698 VKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIDKAH 762

  Fly   772 LIILTPPEEDRKNNWSWVSIDGDQSYELDTKPGSKKLSHLLATHDLCITGEGLQYLQQNQPQYMR 836
            .:||.||.| :.....|.||  |.|..|....||.|.  |...|.||:||:||.:||...||.:.
  Rat   763 TLILHPPSE-KGQPCEWRSI--DNSIVLPLTLGSPKA--LALEHALCLTGDGLAHLQAVDPQQLL 822

  Fly   837 QLLPQITVCARFAPKQKELVITQLKQLGYCTLMCGDGTNDVGALKHANVGVSLLTSAP---VKRK 898
            .|:|.:.|.||.||||||.|||.||:|||.|||||||||||||||||:|||:||.:||   |:|:
  Rat   823 HLIPHVQVFARVAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERR 887

  Fly   899 RTEEEQQQAAANAAAIAAQAQANANQQLTTRERALRRRQEHLNQTQARLQNALRDMEEQT--MVK 961
            |...:....:.:...::         :.|.::.||...:|.....:.||...|||:|:::  :||
  Rat   888 RRPRDSPVLSNSGPRVS---------RSTKQKSALLSPEEPPASHRDRLSQVLRDLEDESTPIVK 943

  Fly   962 LGDASIAAPFTSKSSSIMCVNHIIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALIQAYCQSVLYIDGIKFSDT 1026
            |||||||||||||.|||.|:.|:||||||||||||||||||||||||.||.|||||::|:||||.
  Rat   944 LGDASIAAPFTSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDF 1008

  Fly  1027 QATMQGIFIAACFLFITRAKPLKTLSKVAPLPNIFNFYTISTILSQFAVHFGTLYYLTSQANILA 1091
            |||:||:.:|.|||||:|:|||||||:..|||||||.|||.|::.||:|||.:|.||..:|...:
  Rat  1009 QATLQGLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFSVHFLSLVYLYREAQARS 1073

  Fly  1092 PPREGKVKLYIDMDAEEKTKYDPNIVSSTVYIICLSLQVATIAVNYKGYPFMESLRSNRMLMYAI 1156
            |.::   :.::|:..|    ::|::|:|||||:.:::|:||.|:||||.||||||..|:.|::::
  Rat  1074 PEKQ---EQFVDLYKE----FEPSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSL 1131

  Fly  1157 GASAALVILLSTGLAPELTEFFEIIDFPTDFRKTLLGVLVLDIVGAFLLDRICSFLFG 1214
            ..|...::.|..|.:|:....|.::|.|.:|:..:..||.||...|.|.||:..|..|
  Rat  1132 AVSLMAIMGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIGQVLALDFGLALLADRVLQFFLG 1189

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG6230NP_609490.1 P-type_ATPase_cation 220..1152 CDD:319843 549/940 (58%)
Atp13a1NP_001099549.2 P-type_ATPase_cation 208..1127 CDD:319843 549/940 (58%)

Return to query results.
Submit another query.