DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Myo31DF and Myo1g

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523538.1 Gene:Myo31DF / 34445 FlyBaseID:FBgn0086347 Length:1011 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001423969.1 Gene:Myo1g / 289785 RGDID:1306016 Length:1018 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1010 Identity:503/1010 - (49%)
Similarity:686/1010 - (67%) Gaps:32/1010 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 EAGVQDFVLLDQVSMEKFMDNLRKRFQNGSIYTYIGEVCVSMNPYRQMNIYGPETIRKYKGRELF 70
            |.|..|||||||::||:||.||:.||:.|.||||||||.||:|||:::.:||||.|.||:||||:
  Rat     8 EYGKPDFVLLDQLTMEEFMKNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGPEAIAKYQGRELY 72

  Fly    71 ENAPHLFAIADSAYRVLKQRQQDTCILISGESGAGKTEASKIIMKYIAAVTNAQGQNEIERVKNV 135
            |..|||:|:|::||:.:|:|.:||||:||||||||||||||.||:|||||||...:.|:||||:|
  Rat    73 ERPPHLYAVANAAYKAMKRRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIAAVTNPSQRAEVERVKDV 137

  Fly   136 LIQSNAILETFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDIEFDYKADPVGGIITNYLLEKSRVVQQQPGERNFH 200
            |::|..:||.||||:||||.|||||||||||.||:|.|||||.|.:||||||||::|..||||||
  Rat   138 LLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPVGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFH 202

  Fly   201 SFYQLLRGANDNELRQYELQKETGKYHY------LNQGSMDIL-TEKSDYKGTCNAFKTLGFSTD 258
            :|||||||:.|.||::..|::....|::      ||.|..:.| :::..::|...|.|.:|||.:
  Rat   203 AFYQLLRGSEDQELQELHLERNPAVYNFTRQGAGLNMGVHNALGSDEKSHQGVMEAMKIIGFSPE 267

  Fly   259 EVQTIWRTIAAVLHLGNVEFQTIEDE------LVISNKQHLKSTAKLLQV-TETELSTALTKRVI 316
            ||::|.|.:||:|||||:||...|:.      |.::::..:...|||... ::..|.|.|.:.|.
  Rat   268 EVESIHRILAAILHLGNIEFVETEENGPQKGGLEVADEALVGYVAKLTATPSDLVLRTLLARTVA 332

  Fly   317 AAGGNVMQKDHNATQAEYGKDALAKAIYDRLFTWIISRINRAILFRGSKTQAR--FNSVIGVLDI 379
            :.|..|::|.|...:|.|.:||.|||:|.|||.|::::|| :|:....:...|  .::|||||||
  Rat   333 SGGREVIEKSHTVAEASYARDACAKAMYQRLFEWVVNKIN-SIMEPRDRDPRRDGKDTVIGVLDI 396

  Fly   380 YGFEIFDSNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELVLKQEQEEYQREGIEWTNIEYFNNKIICDLVEQPH 444
            ||||:|..||||||||||||||||||||:|:||||||||:||||.|.:||||||..|.:|||||.
  Rat   397 YGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSIEYFNNATIVELVEQPR 461

  Fly   445 KGIIAIMDEACLSVGKVTDDTLLGAMDKNLSKHPHYTSRQLKPTDKELKHREDFRITHYAGDVIY 509
            :||:|::||||.:.|.:||...|..:|.:...||||:||||.||||.::...||:|.||||||.|
  Rat   462 RGILAVLDEACSTAGPITDRIFLQTLDTHHRHHPHYSSRQLCPTDKTMEFGRDFQIKHYAGDVTY 526

  Fly   510 NINGFIEKNKDTLYQDFKRLLHNSKDANLSEMWPEGAQDIKKTTKRPLTAGTLFQRSMADLVVTL 574
            ::.|||:||:|:|:|||||||:||.|..|..|||:|.|||.:.|||||||||||:.||..||..|
  Rat   527 SVEGFIDKNRDSLFQDFKRLLYNSMDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMIALVENL 591

  Fly   575 LKKEPFYVRCIKPNDLKSSTVFDEERVEHQVRYLGLLENLRVRRAGFVHRQRYDKFLLRYKMISQ 639
            ..||||||||||||:.|.....||....|||.|||||||:|||||||..||.|.:|||||||..:
  Rat   592 ASKEPFYVRCIKPNEDKVPGRLDEAHCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFASRQPYPRFLLRYKMTCE 656

  Fly   640 YTWPNFRAGSDRDGVRVLIEEKKFAQDVKYGHTKIFIRSPRTLFALEHQRNEMIPHIVTLLQKRV 704
            |||||...||||:.|..|:|:.....||.:||:|:||||||||..||..|..:||.||.||||..
  Rat   657 YTWPNHLLGSDREAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRAHLIPIIVLLLQKAW 721

  Fly   705 RGWIVRRNFKKMKAAITIVRAYKAYKLRSYVQELANRLRKAKQMRDYGKSIQWPQPPLAGRKVEA 769
            ||.:.|...::::|..||:..::.:|:|:::.||..|.:.|:|...||:.:.||.||...:..:.
  Rat   722 RGTLARWRCRRLRAIYTIMGWFRRHKVRAHLIELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPTPPAVLQPFQD 786

  Fly   770 KLHRMFDFWRANMILHKYPRSEWPQLRLQIIAATALAGRRPYWGQARRWVGDYLANSQEN-SGYE 833
            ..|.:|..|||..::...|.|:..|::.::.|..||.|.|..||..|.|..|||::..:| :...
  Rat   787 TCHILFSRWRARQLVKNIPPSDMTQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCQRAWARDYLSSDTDNPTASH 851

  Fly   834 AYNGSIKNIRNHPADGETFQQVLFSSFVKKFNHFNKQANRAFIVSDSTIHKLDGIKNKFKDMKRT 898
            .:...:|.:|.  .||  |..|||||.|:|.|.|.|:.:||.:::|..::||:. ..:::.| |.
  Rat   852 LFAEQLKALRE--KDG--FGTVLFSSHVRKVNRFRKRRDRALLLTDRHLYKLEP-GRQYRVM-RA 910

  Fly   899 IKIRELTSISVSPGRDQLIVFHSSKNKDLVFSLESEYTPLKEDRIGEVVGIV---CKKYHDLTGT 960
            :.:..:|.:||:.|||||:|.|:..:.|||..|.....|| ::||||:||::   |:.    .|.
  Rat   911 VPLDAVTGLSVTSGRDQLVVLHAQGHDDLVVCLHRSQPPL-DNRIGELVGMLVSHCQG----EGR 970

  Fly   961 ELRVNVTTNISCRLDGKARIITVEAASNVEVPNFR 995
            .|.:.|:..|.....|..|:|:||.......|:|:
  Rat   971 TLEIRVSDCIPLSQRGARRLISVEPRPEQTEPDFQ 1005

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Myo31DFNP_523538.1 MYSc_Myo1 21..677 CDD:276829 379/671 (56%)
Myosin_TH1 801..977 CDD:461801 62/179 (35%)
Myo1gNP_001423969.1 None

Return to query results.
Submit another query.