Protein Alignment Cog4 and cog4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609413.1
• Gene: Cog4 / 34442
• FlyBaseID: FBgn0032258
• Length: 776
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_588155.1
• Gene: cog4 / 2539017
• PomBaseID: SPCC338.13
• Length: 738
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 778
• Identity: 164/778 - (21%)
• Similarity: 322/778 - (41%)
• Gaps: 141/778 - (18%)

  Fly    10 LDIGTNE--QVDETLQRIAD---EEAKVNEKLESLLAKQCQIEAKMSGIGRSLSLLHTVDSDSNK 69
            :||..|:  .:.:..||..|   |..:.:||||.||:.....|...|.|......|........:
pombe     1 MDISINDCTDISQIKQRFHDLQVESQRTDEKLERLLSDAQPTEKFNSLIKNMAERLVLFVGQIEE 65

  Fly    70 LNDQIVNTAQLAESVSAKVRRLDLARCRASECQQRVHDLIDLHLCSQGVVKAIGEEDYEKSATHI 134
            |.|...||..::|.|..:::.:|..:.|..||...|..:.|...|.|.:.:|:..:.:||:|..:
pombe    66 LKDAFCNTTIVSEEVIERIKSVDREQNRIKECLLFVRQVRDFKECLQDLNRAMHHQQWEKAADLV 130

  Fly   135 ARFLAMDQQLLR-RTADDVQGSITSVSDAVKTLEDATEKTRVLIAKRFDEAVKADDLASVERFFK 198
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pombe   131 HRASSTSPAIIEGKFAHAVVPTAEQPLAPMDTLKEITESLHTLFWREFHKAARNQDQKEITRYFK 195

  Fly   199 IFPLVGCHRTGIEKFSLYICQKLANKAQKELRNAQDIAKAESRLQLAYADRLTAILENFARVVEV 263
            :|||:|..:.|:|.:..:....:|:||:..|......|       |.:|...|.::|:.|.::..
pombe   196 LFPLIGKEKEGLEAYWHFFGGIIASKARATLDEPPTHA-------LFFAQAFTGLVEHVASIIRA 253

  Fly   264 NQPIIEAFYGQASSSLIDMVSILQHECDTE-------------VKNLLMEFNKNRQIQYRSKQVN 315
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pombe   254 HTPLVQKYY--KAKNTITVIEKLQGDCDRQGSIIVNTMFDVRRIDNLVSSIASYKYILLHAKLKN 316

  Fly   316 ESTQRSAGGGNLGSNSIQALGHYRKPSGGSVDKLNP--KEIDAIIAEITVMHARVELYFRFMRRR 378
            .:                .:...::....|:..|:|  .|:.||:::..:.    :::...:..|
pombe   317 RA----------------FVSDQKELERVSLQTLHPILNEMSAIVSKWNIS----KIFISRLVLR 361

  Fly   379 LQVHVETCVPEKEQFDIM-------ERYEKIMKNSDLRRQMQEILSTYLLLERYFMEESVLKAIG 436
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pombe   362 LSQSDGTSNDPSVQDNLICASIFNSSKMELLLK--------KQLLPSLLQLETYYFRRSIETSLE 418

  Fly   437 LDTY--ESGQQCSSMVDDVFFILRKSIRRALTTQSINGTCAVINNVAACLDGDFVNALKAP-LKS 498
            |:.|  :.....||:||||.::.::..:||..|            |::.....|||....| |::
pombe   419 LEEYYTKVSPWMSSIVDDVMYVTKQVFQRAFFT------------VSSLFFTRFVNESLIPILRN 471

  Fly   499 GYPSGYI----DLAQAYNAIQTSLQQGKLHSSDADRGRANFLVQLNNADISTEYIETLCQTMEQE 559
            .|   |:    :|....|.|:...|:.|..:|...:...|::..:|:|.:|.:|::::
pombe   472 DY---YVYLSHNLLTVCNIIKAQFQRLKNANSIPAKQVENYITLVNSASLSKQYLKSI------- 526

  Fly   560 IAGTFPQTTQVERQMLDSCLTELKAVRDALKATVDFGMQQLRSSVIKPRLNPW------------ 612
            :.|...:..:|.....|..|.: |::.:.|:.||:|      .::.|...|.:
pombe   527 VDGVSSRLEEVFAFAKDQKLVK-KSIDNFLQLTVNF------ENLCKTSFNMYFPIFLLPRIEQC 584

  Fly   613 -------INQFLNYSHNLNEEELAAYEAGETFVQFFIVQLDG------LLNSFKNSLSPRNYDAL 664
                   ||..|:|.....|.|   :|      :..:.:|..      ||..|    :|.|..:|
pombe   585 IDDSFDGINYVLSYEDYTKETE---HE------RLVVTRLRSVWDRVLLLEQF----TPENQLSL 636

  Fly   665 VSILATEVTIQLERAI-KKISFNRLGGLVLDQEVRALGSYLTGATSWSVRDKMTRISQIATLL 726
            .|:...:....:|..| .||.:|..|.:.|:.::.:|.:..:...: ::|....|:.:|..||
pombe   637 RSMACEKAASYIENLILYKIQWNDYGAMALENDISSLITIFSNDQA-NLRHSFERLQEILILL 698

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cog4	NP_609413.1	Cog4	166..497	CDD:214809	72/355 (20%)
cog4	NP_588155.1	Cog4	163..481	CDD:214809	75/369 (20%)