DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LManI and LManIII

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609407.1 Gene:LManI / 34436 FlyBaseID:FBgn0032253 Length:950 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609250.2 Gene:LManIII / 34203 FlyBaseID:FBgn0032066 Length:1003 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:978 Identity:596/978 - (60%)
Similarity:747/978 - (76%) Gaps:42/978 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MINVHLVPHSHDDVGWLKTVDQYYYGSQNKIQHAGVQYILDTVVEELLKDSSRRFIQVETFFFAK 65
            |||:|||||||||:||||||||||||:::.|||||||||.||||.||.|||.||||||||.||||
  Fly    36 MINIHLVPHSHDDLGWLKTVDQYYYGNKHNIQHAGVQYIFDTVVAELSKDSRRRFIQVETGFFAK 100

  Fly    66 WYSEQTETVQRAVKKLVAQGRLEFAGGAWSMNDEATVHYQSVVDQFNLGLRYLKDTFGDCGRPTV 130
            |:.:|:||.::.||.||.:|||||.||||||||||.|:||||:|||.:||::|.|.||.||||.|
  Fly   101 WWEDQSETKKKLVKTLVNEGRLEFTGGAWSMNDEAAVNYQSVIDQFAVGLKFLNDNFGVCGRPRV 165

  Fly   131 GWQIDPFGHSREMASIFAQMAFNGEFFARMDYVDKKQRMLDLEMEMIWQSSESLKNSNIFTGMLY 195
            |||||.||||||.||:||||||:|:||||||..||.:|:.:|.:||:|.:||:|:..:.||||||
  Fly   166 GWQIDAFGHSREQASMFAQMAFDGQFFARMDQNDKNKRVDNLGLEMVWDASETLEEMDFFTGMLY 230

  Fly   196 NHYSAPPGFCFDINCEDAPIIDGESYDNNVDARVSEFIDYVKNMSKSYRSTHIMVPMGDDFQYED 260
            ||||||||||||..|:|.|||||:||||||.:||.:|::|..|::..|||.|||||||||||||:
  Fly   231 NHYSAPPGFCFDSLCQDDPIIDGKSYDNNVKSRVDDFLNYASNLAGYYRSNHIMVPMGDDFQYEN 295

  Fly   261 AAVNFKNMDKLIKYVNDRQSTGSQVNVFYSTPSCYLYELHQLKQTWPNKTEDFFPYSSDSHSYWT 325
            |.:|:|||||||||||:||::||:.|:||||..|||..||:..|::||||:||.|:|.::.|:||
  Fly   296 AYMNYKNMDKLIKYVNERQASGSKYNIFYSTAGCYLNSLHKSLQSFPNKTQDFLPHSHEAKSFWT 360

  Fly   326 GYFTSRPTQKRFHRDGNHFFQTVKQLSVLANLSGTQYSEDLDNLSQAMGIMQHHDAVTGTEKQAV 390
            |:||||||||||.|||||..|..|||||||:|||.:..:|||.|.|.|.:||||||:||||||.|
  Fly   361 GFFTSRPTQKRFERDGNHILQVAKQLSVLADLSGEEQHKDLDYLRQIMAVMQHHDAITGTEKQEV 425

  Fly   391 ASDYDRLLFKAIVGAENSARDALRSLTNLTSGEFESCLELNISVCAFTQDTANNVIVTLVNPLAH 455
            ::||||||:.||:|..|:||||||.|||..:|||:|||:||||.||||::.|::.:|||.|||||
  Fly   426 SNDYDRLLYDAILGGANTARDALRVLTNQPNGEFQSCLKLNISECAFTKENADDFMVTLYNPLAH 490

  Fly   456 SSTQYVRVPAKNENYIVTDEKGREVFSEVVPVPWQVLALEHRPNDTQHELVFEASVDKIANFLIR 520
            :||||||||.|.::|.||||||..|.||:|||||:||:||.|.|||||||||:|||:|||.:.|:
  Fly   491 TSTQYVRVPVKEDSYQVTDEKGGLVASELVPVPWEVLSLEFRNNDTQHELVFKASVNKIATYFIK 555

  Fly   521 VLPSPK--------------NIAEDQVQFP------------VERSQDELT-VETSLVKLTFDTT 558
            .:....              |..|..|:.|            :|...|:.| |:.||:||..|..
  Fly   556 KIDKTTEVDITVNTQTEQSVNEEESNVKVPKRFKKVHSLKTDLETLDDQETIVQNSLIKLVIDNN 620

  Fly   559 TGGLKTVKMNGFTENIQQTFGIYKGYRGNNGESKNRSSGAYVFRPYGDIEIVNNKVELSFYNGTK 623
            ||.||||:|||.:|:|.||||:||..|          |..|:||...|:|:|.:..:.:.|:|..
  Fly   621 TGRLKTVEMNGVSEDIDQTFGMYKTAR----------SCHYIFRQDADLELVEDAFDFTVYDGES 675

  Fly   624 VKEVHQHVNEWISQVIRIYEDVNRVEFEWLVGPIPTDDDVGKEIITRFSSNISSKGKFYTDSNGR 688
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||:|.||::||||:|.|.|.|||.|.||||||||
  Fly   676 VKEVHQHVNEWISQVIRIYEGVNRVEFEWLVGPVPIDDELGKEIVTIFKSGISSGGVFYTDSNGR 740

  Fly   689 EILERERNQREHFTPDMSE-AISGNYYPVTGQISLQDDEKRITLLNDRAQGGTSLKDGELELMLH 752
            |::.||:::||.|:||:|| .:||||||||.:::|||..||:.|||||:|||.||:||.||:|||
  Fly   741 EMMRREKDKREDFSPDLSEQPVSGNYYPVTSRMALQDSSKRMVLLNDRSQGGASLEDGRLEMMLH 805

  Fly   753 RRLLNDDAFGVGEALNETQYGTGLIARGKIYLILDAV-DG-KPNQRLLQHQLDQHFWKFFSKSNG 815
            ||.:..|..|..||:||.|:|.|||||||::|.|:|: || ..::|:.:.::...|||||||||.
  Fly   806 RRHIFADGSGAAEAINEQQFGKGLIARGKLFLYLNAIEDGATASERVAEKEIHLPFWKFFSKSNN 870

  Fly   816 VASVNRNMIPDFFGIPESVELLSLEPYSKDQILIRLENF--NTEGNVVSFNIYPLFESLDGYQIW 878
            :.|.....:.||..:|:||.||:|||||||:||:|||||  .||||||||:|..:|:.|.|.:|.
  Fly   871 IQSDVTKTLSDFNDLPQSVHLLTLEPYSKDEILLRLENFLDQTEGNVVSFSIRQIFDDLGGLEIR 935

  Fly   879 ETTLDGNMLLEDVKRFKFAQDGTGSIPSSVEYYHAPHNPLTANSTMNASGFVVTLVPMQIRTFII 943
            |||||||:.|.|:||.||..||:|...|..||:.:.|.||.|:.|.:||.|.|||.|||||||||
  Fly   936 ETTLDGNLPLSDMKRLKFHHDGSGPSHSVPEYFTSLHKPLAADKTQDASEFSVTLKPMQIRTFII 1000

  Fly   944 QQK 946
            :::
  Fly  1001 KKE 1003

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LManINP_609407.1 GH38N_AMII_LAM_like 2..276 CDD:212121 194/273 (71%)
PLN02701 4..765 CDD:178304 491/788 (62%)
LManIIINP_609250.2 PLN02701 20..820 CDD:178304 495/793 (62%)
GH38N_AMII_LAM_like 37..311 CDD:212121 194/273 (71%)

Return to query results.
Submit another query.