DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Cand1 and cand-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609389.1 Gene:Cand1 / 34403 FlyBaseID:FBgn0027568 Length:1248 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_507244.1 Gene:cand-1 / 180125 WormBaseID:WBGene00013606 Length:1274 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1299 Identity:479/1299 - (36%)
Similarity:744/1299 - (57%) Gaps:92/1299 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 YHQIANLLEKMTSTDKDFRFMATNDLMTELQKDSIILDDESEKKVVRMVLKLLEDKNGEVQNLAV 70
            || :..|::||::.||||||||.||||.:||..:|.|:|:|..||:|.::|||.|.||||||||:
 Worm     4 YH-VGQLVDKMSNPDKDFRFMACNDLMKDLQTGTIALEDDSTAKVIRALIKLLSDSNGEVQNLAI 67

  Fly    71 KCLGPLV--NKVKEIQVETIVDSLCANMMSNTEQLRDISSIGLKTVIAEL-PQSSNSLAPNVCQR 132
            ||:|.|.  :|:|...:|.:|:.|..::.|..||.|||.|:.||.:|..| |.:|::....|.:|
 Worm    68 KCIGLLAQPSKIKTHHLEYLVEELTPHVFSKAEQSRDIHSLTLKAMILNLAPSASSNATTTVVKR 132

  Fly   133 ITGKL--STAIEKEDVSVKLESLDILADLLSRFGEFLVPFHSTILKALMPQLASSRQAVRKRTIV 195
            :..|.  |.::...|.:.:::.||::.::|.|||:.:...|...||.::..|.|.|.|:||:.|.
 Worm   133 MLPKFVDSLSLCAPDDAARVDVLDLIGEVLLRFGDVVPEMHKGSLKVMVDHLYSFRSAIRKKAIT 197

  Fly   196 ALSFLLIQANSNAYNGVIDHLLDGL--ENPPNPAA----IRTYIQCLASICRQAGHRLCNHIDRS 254
            .:..|....|...|:.::..||..|  .:||:.||    :||.:..|:::.|.:|.|...|..:.
 Worm   198 GIGHLASVINGELYDELVQDLLKELAQRSPPSSAAQNVQLRTLVIALSTVARASGSRFSKHTPKV 262

  Fly   255 MLLLSQYSQRD------DDELREFCLQACEAFVMRCPDAINPHIPMILELCLNYITYDPNYNYET 313
            :..|.||.|.|      .|:|||..:|..|.|:.|.|..:......:::...:.:.|||||.|..
 Worm   263 VPFLLQYLQIDPGTESEHDDLREASIQGLEVFLYRNPQEVVAFEKEVIQQLTDALAYDPNYEYGD 327

  Fly   314 DDGDTGNAMDTEDDEYVDSEEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLEVLISTRQELVEDFYRSLSPALIAR 378
            ||.|.    ..||||..|.:|||||:|::|||||||||.:|.:||:.:|.:.:..:.:.|.:|.|
 Worm   328 DDEDE----QMEDDEDDDEDEYSDDEDVTWKVRRAAAKAIEAMISSHRESLLNLSQKIGPVVIGR 388

  Fly   379 FKEREENVKSDIFHAYVALLKN-TRLTDD-----VANDHDSMDQ----VSGPTSL---------- 423
            ||||||.|:::|...|:|||.. :.|..|     ||.|.||::.    |.|.|..          
 Worm   389 FKEREETVRTEIISVYIALLNQISILVPDLQKAVVAADEDSIETDDIVVIGGTKFSTNYLSRSQL 453

  Fly   424 -----LIEQLPLIVKAIQPLMREKSMKTRQDCFLLLRELLNSLPGALGPYLDSIVPGISYSLNDK 483
                 |.:|..::::.|...|: |..||...|..||..|:.:.|..|...||.|:|.:|..|.||
 Worm   454 AIIQSLADQKDVLLRTITKSMK-KHPKTGPKCIELLSALIRTYPSGLEDSLDDIIPAVSNILTDK 517

  Fly   484 SSTSNMKIESLGFLYSLLQGHPPHVFHPHIPLLVPLVVTSVFDPFYKIATEALLVLQQLVKVIRP 548
            ::::..|:..|.|:.:.|..:.|..|...:..|..::..|:.:||||::.|.|.|..:.:.|:|.
 Worm   518 NASAQGKMTVLSFISNALTLNNPKRFKNLLSPLTTIMTHSISEPFYKVSAEGLAVCCKYIDVLRE 582

  Fly   549 LEPNAAKSDFDAPSFVGQVYSCTLQKLKVTDVDQEVKERAIACMGQIIANMGDMLQNELAVCLPI 613
            |  :|...:.:|...:..|.    :|....|.||||:||||:.:..::|...|:|:||....|..
 Worm   583 L--SACGGNEEAKKLLVVVE----KKFMANDTDQEVRERAISAISMLLAAFKDVLKNETPAILEK 641

  Fly   614 FMERLKNEVTRLSSVKALTLIAASSLRIDLTPILHDVLPALGTFLRKNHRALKLHSLDLINKIVI 678
            ..||:..::|.|.:.:|.|.|..:.: |..:..|..:|..:..:::|..|:|::..|:.:.|::.
 Worm   642 MTERIGRDMTCLVAFRASTHIVEAGI-IFSSAQLQSILRHVVDYVKKIARSLRMTCLNFVEKLMK 705

  Fly   679 NY-SSNFEANLLQTAIVEIPPLISDSDLHVAQYSLTLLSTVARRQPQALVGIHEQ-FLRSVLILV 741
            :. :.:.....|...:.|:..|||::||.:...:...|:......| ..|.:|.| .|.|::.|:
 Worm   706 HSPAGSIPVEELTCVLGEMSNLISETDLQITNQAFCCLTYAFLNFP-TCVSLHMQPILDSIIRLL 769

  Fly   742 RSPLLQGSALNCTLELFQALVQTQL-SGLDYHSLVSKLMAPVLGGNGDVKSRATAGAPSEVVQLH 805
            .|||:||.|||..|.||.|:|:|.. ....:.||:..:.:||.                :.|.|.
 Worm   770 TSPLIQGLALNSLLNLFTAIVKTDFPEKPTFESLLDSVTSPVY----------------DNVALS 818

  Fly   806 KQAYHSSAKCIAALTQ--QCPQVATPLATKLITDLQKRN--DTEIIFCLLTIGEIGRHF-DLSS- 864
            :.|:.:.|.|.|.:|:  |..:.:..||.||...||..|  |:..:|.::|:||:||.. |..| 
 Worm   819 RHAHMAIASCAAVITESTQNLEKSRSLAKKLAQQLQTANMSDSIRLFAMITLGELGRRVPDTYSP 883

  Fly   865 -IQVLPQTI-IECFGATSEDVKAAASHALGAVSVGSLQTYLPLILHEIEVQPKRQYLLLHSLKEV 927
             ..|.|:.: |:.|....||:|:||:.||||::||:|..|||.||.:|..|||:||||||:||||
 Worm   884 DFPVKPEDLAIKAFNHHHEDLKSAAAQALGALAVGNLNVYLPFILEQIRTQPKKQYLLLHALKEV 948

  Fly   928 I---SSLSVSPSGLAQLLPSVPSIWDQLFKHCECSEEGSRNVVAECLGKLVLVNPDELLPQLQQA 989
            |   ||...|.........::..||..|..:...:|:|:|:|||||||:|...:|:.|||:|:::
 Worm   949 IVWESSSEESTKSTDLFRSAIVDIWGMLMANAGGNEDGTRSVVAECLGRLCSFDPESLLPKLKES 1013

  Fly   990 LRSESATMRTVVVSSVKFTISDQPQPIDVLLKQNIGEFLFALRDPEPQVRRVALVAFNSAVHNKP 1054
            :||....:|:..||::|:.|:|:.:.:|:.|::.||:||.|:||.:.:|||||||..|||.||||
 Worm  1014 MRSSDPAIRSSAVSAIKYMINDEKRIVDITLQKQIGDFLAAVRDEDLKVRRVALVVLNSAAHNKP 1078

  Fly  1055 SLVRDLLPTLLPWLYSETKVKSELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLEQGLDRVDVM 1119
            :|||||||.|||.:|.|||::.|||:|||||||||.||:|||:||.|||||:||||..:|::|:.
 Worm  1079 ALVRDLLPDLLPAVYEETKLRKELIKEVEMGPFKHQVDEGLDLRKCAFECMFTLLESCVDKIDIT 1143

  Fly  1120 QFLDHVQAGLCD-HYDIKMLTYLMTARLAILCPDKVLLRLDQFIQQLRDTCTHKVKANSVKQEYE 1183
            ||...::.||.| ::|:|:|.||...|:|.|.|.:||.|:|:..:.|:.....:.:.|:||||.|
 Worm  1144 QFSSVMEVGLSDQNHDVKLLNYLTLQRVANLAPGQVLQRIDRVCEPLKTQLNVRPRGNAVKQEVE 1208

  Fly  1184 KQDELKRSALRAVSALS-QIPKANKNQQLVDFLKSIKETPELNKIFEYIQKDSITGSSDIIVMD 1246
            |.:|||::.:|.|..|. ::|:..:|.|.:|...:||.|.||    |.:..|.:..|...:|.|
 Worm  1209 KLEELKKAVIRVVYGLKLKLPEVERNPQFLDLYNTIKHTKEL----EALANDVLKESQRAVVYD 1268

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Cand1NP_609389.1 HEAT repeat 9..33 CDD:293787 14/23 (61%)
HEAT repeat 50..78 CDD:293787 18/29 (62%)
HEAT repeat 87..118 CDD:293787 12/30 (40%)
HEAT repeat 132..158 CDD:293787 6/27 (22%)
HEAT_EZ 147..200 CDD:463906 16/52 (31%)
HEAT repeat 171..200 CDD:293787 10/28 (36%)
HEAT repeat 212..242 CDD:293787 10/35 (29%)
HEAT repeat 253..277 CDD:293787 10/29 (34%)
HEAT repeat 513..538 CDD:293787 8/24 (33%)
HEAT repeat 545..569 CDD:293787 6/23 (26%)
HEAT repeat 609..636 CDD:293787 8/26 (31%)
HEAT repeat 647..676 CDD:293787 6/28 (21%)
HEAT repeat 982..1011 CDD:293787 11/28 (39%)
HEAT repeat 1022..1050 CDD:293787 16/27 (59%)
TIP120 1056..1210 CDD:430111 78/155 (50%)
cand-1NP_507244.1 HEAT <988..1070 CDD:441023 38/81 (47%)
HEAT repeat 1005..1031 CDD:293787 9/25 (36%)
HEAT repeat 1044..1072 CDD:293787 15/27 (56%)
TIP120 1080..1244 CDD:430111 80/163 (49%)

Return to query results.
Submit another query.