DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RnrL and rnr-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_477027.1 Gene:RnrL / 34392 FlyBaseID:FBgn0011703 Length:812 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001369835.1 Gene:rnr-1 / 176301 WormBaseID:WBGene00004391 Length:788 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:798 Identity:537/798 - (67%)
Similarity:651/798 - (81%) Gaps:19/798 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 YVIKRDGRQEEVHFDKITSRIQKLCYNLNMDFVDPVTITLQVINGLYCGVTTQELDNLAAEIAAG 77
            ||:|||||:|:|||||||||||||.|.|||||||||.:.::||:|||.||||.||||||||.||.
 Worm     8 YVVKRDGRKEDVHFDKITSRIQKLSYGLNMDFVDPVAVAIKVISGLYKGVTTVELDNLAAETAAS 72

  Fly    78 LTCNHPDYAILAARIAVSNLHKETKKAFSDVFEDLYNHVNKETNQKVPLVSEFHYNVVKKNATRL 142
            :|..||:||:||||||||||||:|.|.||:|.:.|:...:..|.:..|::|:..:.:::|||.:|
 Worm    73 MTTQHPEYALLAARIAVSNLHKKTNKVFSEVMKTLHEFHHPHTGKHAPMISDETWAIIEKNADKL 137

  Fly   143 NSSIIYDRDFGYNYFGFKTLERSYLLKRNGKIAERPQHMLMRVAIGIHGEDIDAAVETYNLLSER 207
            ||:|:||||:.|.||||||||||||||.|.:|.||||.|||||:|||||:||.:|:|||||:|||
 Worm   138 NSAIVYDRDYSYTYFGFKTLERSYLLKINKEIVERPQQMLMRVSIGIHGDDITSAIETYNLMSER 202

  Fly   208 YFTHASPTLFAAATNRPQLSSCFLLTMTADSIEGIFKSVEQCAMISKSAGGIGLNVHCIRAKGTS 272
            |.||||||||.:.|.|||:||||||||:.|||.||:.:::|||:|||||||||||||.|||.|:.
 Worm   203 YMTHASPTLFNSGTCRPQMSSCFLLTMSEDSILGIYDTLKQCALISKSAGGIGLNVHKIRATGSV 267

  Fly   273 ICGTNGTSNGLVPMLRVFNNVARYVDQGGGKRPGAFAIYLEPWHSDVFEFLELKKNTGKEENRAR 337
            |.|||||||||:|||||:||.||||||||.||||||||||||||:|:|||:.|:||||.||.|||
 Worm   268 IAGTNGTSNGLIPMLRVYNNTARYVDQGGNKRPGAFAIYLEPWHADIFEFVSLRKNTGPEEERAR 332

  Fly   338 DLFYALWIPDLFMKRVEANGDWSLMCPHKCPGLHDVWGDEFEKLYEKYEQEGRANRTVKAQSLWF 402
            |||.|||||||||||||.:.:||||||.:||||.|.||:|||.||.|||.|||..:||||:.||.
 Worm   333 DLFLALWIPDLFMKRVEKDQEWSLMCPCECPGLDDCWGEEFEALYAKYEAEGRVRKTVKARKLWE 397

  Fly   403 AIIEAQVETGNPYMLFKDACNRKSNQQNVGTIKCSNLCTEIVEYSAPDEIAVCNLASIALNMFVT 467
            .|:..|:|||.||:.:|||.||||||||:||||||||||||:|||||||||||||||||||.:||
 Worm   398 HIVSNQIETGLPYITYKDAANRKSNQQNLGTIKCSNLCTEIIEYSAPDEIAVCNLASIALNRYVT 462

  Fly   468 PEKTYDFKKLKEVTKIVTKNLNKIIDINYYPLPEARKSNLRHRPVGIGIQGFADALILMRFPYES 532
            |||.:||.||.||||::|:|||||||:||||:.|||.||:||||:|:|:||.||..:|||:|:.|
 Worm   463 PEKKFDFVKLAEVTKVITRNLNKIIDVNYYPVEEARNSNMRHRPIGLGVQGLADCFMLMRYPFTS 527

  Fly   533 EEAGLLNQQIFETIYYGALEASCELAQTEGPYETYEGSPVSKGILQYDMWDKVPTNLWDWQKLKE 597
            .||..||::|||||||.|||||||||:..|||.||||||||||.||:|||...||:..||..|::
 Worm   528 AEARDLNKRIFETIYYAALEASCELAELNGPYSTYEGSPVSKGQLQFDMWGVTPTDQCDWATLRK 592

  Fly   598 SIRMHGVRNSLLVAPMPTASTAQIMGNNESFEPYTTNIYTRRVLSGEFQVVNHHLLRDLTELDLW 662
            .|..||:|||||:|||||||||||:|||||.||||:|||:||||||:||:||.|:|:||.|..||
 Worm   593 KIAKHGIRNSLLMAPMPTASTAQILGNNESIEPYTSNIYSRRVLSGDFQIVNPHMLKDLVERGLW 657

  Fly   663 DDDMKNQIISSRGSIQNIETIPPKVRDLYKTVWEISVKSTIKMAADRGAFIDQSQSFNIHVAEPN 727
            .|:|||::|::.||||||:.||..:::||:||||||.|..|:|||||||:||||||.|||:|:|:
 Worm   658 TDEMKNRLIANNGSIQNIDGIPSDIKELYRTVWEISQKDIIEMAADRGAYIDQSQSLNIHMAKPS 722

  Fly   728 YGKLTSIHFYSWKAGLKTGMYYLRTKPAANAIQFTVNKKQGAVSMNGQNGTAEGSPQKYEEDRER 792
            |..:||:|||.||.||||||||||||||.||:||||:|  .|:..|.|..|    |....|.:: 
 Worm   723 YAGITSMHFYGWKKGLKTGMYYLRTKPAVNAVQFTVDK--NALKTNQQAET----PATVAESQD- 780

  Fly   793 KMADMVCSLENKDACMSC 810
                        :.|:.|
 Worm   781 ------------EGCLMC 786

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RnrLNP_477027.1 PLN02437 12..812 CDD:178056 537/798 (67%)
rnr-1NP_001369835.1 PLN02437 8..787 CDD:178056 537/798 (67%)

Return to query results.
Submit another query.