Protein Alignment Ufd4 and hyd

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609369.1
• Gene: Ufd4 / 34378
• FlyBaseID: FBgn0032208
• Length: 2727
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001287262.1
• Gene: hyd / 41181
• FlyBaseID: FBgn0002431
• Length: 2887
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 3013
• Identity: 551/3013 - (18%)
• Similarity: 939/3013 - (31%)
• Gaps: 1024/3013 - (33%)

  Fly   150 FIRDCGSQVHKDTLHSAMSVVS-------------------RLCTKVEPNTPCIQNCVESLSTLL 195
            ||.|..::::..:|::.:...|                   :..||.:.....:...:...:.::
  Fly   458 FISDSITKIYVCSLYTVVKTESNNIYWWGVLPFDQRRFLWDKFRTKTKKPFKVVATDINVGAQVI 522

  Fly   196 QHEDPMVSDGALKCFAS-----VADRFTRKW--VDPAPLAEYGLTTEL-LKRLQSVGGNTHS-SL 251
            ..:.||...|::....|     |.......|  .|...:....:.|.. :.:.|:.|.|.:: .:
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  Fly   252 TAAGTQPTSSSQPAATTNSDAINENVAGTATISNSTKVKSSDAAASPQSISTTISLLSTLCRGSP 316
            |.....|.|::.|:..::.:.        .:.|||.  :|:|....|...|..    |:.|..:.
  Fly   588 TPDKDLPKSTAMPSTGSSKNG--------QSFSNSK--ESTDRIDMPPPPSPA----SSTCSDTG 638

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            |:| |.  |::.|...|                                 .||.|.:|:
  Fly   639 SVTSHK--RTKRATTKE---------------------------------DSNAPQEGR------ 662

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                               ||.|.                        |     .::.|.::.:|
  Fly   663 -------------------KDEEL------------------------W-----EVKDVVFVEDK 679

  Fly   446 GADVNKGQRSSSLHYAACFGRPAI-AKILLKFGAYPDLRDEDGKTPLDKARERLDDG------HR 503
            ...|.|..:......|..|  ||| |..:....|..........|..::.:|  ||.      .|
  Fly   680 VGPVGKVLKVDGDFVAVRF--PAINAAAVAAAAAATSSTSNTASTSKEEGKE--DDWQQCRLLRR 740

  Fly   504 EVAAILQSPGEWMSPDHSLLNKDGKKYTLMEPRGDPEMAPIYLKVLLPIFCRTFLGSMLGSVRRA 568
            |...|.::......||  .|.|..||..:   .||...|.|                :..:|...
  Fly   741 EDVQIFRTAMSTRGPD--WLQKQPKKINV---GGDAAGAQI----------------LTLAVDSR 784

  Fly   569 SLALIKKI---VQYAYPTVLQSLSETS--FSEDAASTSGQNGGNLLIEVIASVLDNED------- 621
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  Fly   785 GIHVIKKVLGKIHYSLYNLYNCKQEQNCLFPTDCNSFIGSTPGNILMAC------NDDCSGNSST 843

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                ||:|.|                        |.::.|           :..:|.|     .:
  Fly   844 IVLRDGNGALYPLAKDCLGSIKDPQWFDLPPVKSITMSTISLPAMLSGVNLKSKVCMTALLFDTQ 908

  Fly   643 EFLDHFARLGV---FAKVQALMDTDAEELYVQLPGTVEEPAAAQRS---STSVVVAPRPTSDDPM 701
            :.:.|..|..|   ||.:..|...|..:..:    .|||.....|:   :..::.||....|.|.
  Fly   909 KLMPHILRCDVKNSFAALGRLEREDQADTAL----VVEERCDGARNIFHACVIMCAPSSNKDSPP 969

  Fly   702 ED-----AKEILQGKPYHWREWSICRG----RDCLYVWSDSVALELSNGSNGWFRFIIDGKLATM 757
            :.     .|:.|.|       .|:.|.    ....||  .|:|...|..|:.     .:...|||
  Fly   970 DSPSGGVEKKSLVG-------LSVARSIPTVSTSAYV--SSIAFGASASSSN-----ENSSFATM 1020

  Fly   758 YSSGSPENGNDSSENR---GEFLEKLMRARSCVIAGVVSQPILPTASALRLVVGN-------WVL 812
            .||.:....:.|.:||   .:.:.:|:.:.....:|  |||         :...|       |..
  Fly  1021 SSSAAGSASSTSRDNRTNLRDMMNRLINSDQAEQSG--SQP---------MATNNEDHAYIPWPA 1074

  Fly   813 QSQKTNQLQIHNTEGHQVTVLQDDL--------------------PGFIFESNRGTKHTFS---- 853
            ::...:.|...:::....:: :||:                    |.:.|:..:..:|..:
  Fly  1075 ETPAASNLSASSSQNVSDSI-EDDISKIIPSSSQSSMLSNIKLGSPTYTFDLAQRREHALTILQQ 1138

  Fly   854 --AETVLGPDFASGWSTAKKKRNKSKTEGQKFQVRNLSREIYNKYFKSAQIIPRGAVAILTDIVK 916
              ....|.|......||       ...:||...:.::|...|     .|.||....:.:|::...
  Fly  1139 MCVSPALRPYLCHMLST-------KDAQGQTPFMLSVSCRAY-----EAGIILLNTILMLSEQDP 1191

  Fly   917 QIELSFEEQHMAPNGN-------------------WETTLTDALMKLSQLIHEDGVVSAYEMHSS 962
            |:    :|..:.|||:                   |  |..|.:.:           :.:|..:.
  Fly  1192 QL----KEAMIFPNGSPADQSPLHVICYNDTCSFTW--TGADHINQ-----------NIFECKTC 1239

  Fly   963 GLVQALVAVLSVNHWETNSPR-CKRN---KMQKQRVSVFKKCILEDNVESATNKPRTKSTASILI 1023
            ||..:|...       |...| |.:.   |:::...:.:..|..:...::......||..|  |:
  Fly  1240 GLTGSLCCC-------TECARVCHKGHDCKLKRTAPTAYCDCWEKCKCKALIAGNLTKRFA--LL 1295

  Fly  1024 QKLVSVLESTEKLPVYLYDSPCTGYSLQILQKRLRFRLERAECESTLFDRSGRTLKMEPLATIGQ 1088
            .||||                ||..                   .|.|:..|.::.:..:.|:|:
  Fly  1296 CKLVS----------------CTDL-------------------VTKFNSKGESILLFLIQTVGR 1325

  Fly  1089 LSKYLLKMVAKQWYDLDRSTYFYLKKIREHRTATVFTHSFDFDEEGLLFYIGSNAKTCDWVNPAQ 1153
                  ::|.::.|..         .:|....:|..|.:...:.      :.||.||
  Fly  1326 ------QIVEQRQYRF---------SVRVRNVSTAATGATGNNS------VISNRKT-------- 1361

  Fly  1154 YGLVQVTSSE-GKTLPYGKLEDILSRDSISLNCHTKDNKKA-------WFAI--------DLGVY 1202
                  :::| ...:|...||.            .|..:||       |.|:        :.|..
  Fly  1362 ------SAAEIDNDMPDHDLEP------------PKFARKALERLLIDWNAVRSMIMSGAERGDV 1408

  Fly  1203 IIPTAYTLRHARGYGRSALRNWLLQGSKDGSTWTTLSTHVDDKSLVEPGSTATWPINCATD--DS 1265
            ..|......::...|    .|..:| ::.|||.....||    ||:         :.|.:|  |:
  Fly  1409 PNPAGSASENSNSEG----FNMFIQ-TQHGSTLLDKFTH----SLI---------VKCTSDHLDT 1455

  Fly  1266 VWYRHIRIQQNGRNASGQTHYLSLSGFEIYGRVVGVADDIGKSVKEAEAKTRRERRQIRAQLKHM 1330
            :....:|..||.                          .:....||||...||..|.:
  Fly  1456 LLLTLVRELQNA--------------------------SVSNRSKEAEEVVRRFVRSV------- 1487

  Fly  1331 TTGARVIRGVDWRWEEQDGCAEGTITGEIHNGWIDVKWDHGVRNSYRMGA----EGKYDLKLAD- 1390
               |||.  |.:..|:|..              .:.:..|...|.|....    :..:.:.:.:
  Fly  1488 ---ARVF--VIFNLEKQPN--------------PEKRKSHSSCNKYVQSCVKVFQTLHKISIEEL 1533

  Fly  1391 CEYLSAFDGNQSMGSASTAAKPSEKGGNTLTSRKS----SSTPSLPEATEKNQNPEGASNQTVSA 1451
            ||...|......:|.....| |.....:.|..|.|    |..|..|      .|.|..|.|.:..
  Fly  1534 CEVSEALIAPVRLGVVRPTA-PFTMSSSNLDVRNSDDLFSVDPLAP------SNVESPSEQILVH 1591

  Fly  1452 D-------NLAWKQTVETIAENVF--ASAKTQIISNQLAMNTSSSREARAKHKESGTNQMHKDNI 1507
            |       |...:|..:.:|....  ||...::|:.:...:.........:..|.|......||
  Fly  1592 DAGNDQSANFNIQQNYDVVAMETIRDASESEEVINREANSHNQDDELIENQRNEDGMQDDESDN- 1655

  Fly  1508 SGPSPLSRELEHISDLSAINNSMPAINSSNVSDLATISEN-LSLTELSKENICRVLTPSYKPAES 1571
               .....:.|..|| |..|.|...:..|..:.....||| :.:..|..|
  Fly  1656 ---DFTFNDAETESD-SDDNQSNQEVQRSVQAGATVGSENDIGVLFLEDE--------------- 1701

  Fly  1572 VTASQSSSHPDVQSSSPRENDIKNISNIEENNKMNANNSVNKISKDLLANLRTSNIAGCPPVTQL 1636
               |..||..:...|...|:|       :::::.|.|.
  Fly  1702 ---SGDSSAQEEDGSEDGESD-------DQSDEFNFNE--------------------------- 1729

  Fly  1637 STEALEMIDKMRDGVDMIRNMSNSILSTDTFPVPCTNVPVGGKKTPKAQALINPDNANQKQIIVT 1701
              :.||            |..:||...:|..|            .....|:.:.|.|.      :
  Fly  1730 --QQLE------------RRSTNSNARSDLAP------------QTMQWAIRSRDTAR------S 1762

  Fly  1702 SEEFPTKSSKKPSVTLKPAQQPNAVLSIVDIKEQPISNENVSVPSQMSISVPNLTTTSASEVPST 1766
            |...||.|:                :..:|    |::....:||:..:::.|::.       |.|
  Fly  1763 SVRVPTGSN----------------MVFID----PMALRRSTVPASTTVTTPSIE-------PHT 1800

  Fly  1767 SEVATHTGLLETFAAIARRRTSQGTNIQDNQIMN-AEANVNEHGDQNASGSFLGHSVTSLVKLAL 1830
              :||....|.....|..|:.|:..:|....::| .|.::....|:       ..:|.:.|:..|
  Fly  1801 --MATTASNLARAFGITIRQISELISILSYNVLNDIETSLKIQNDE-------AIAVQAFVEKRL 1856

  Fly  1831 SSNFH------SGLLSTAQ-SYPSLSSNNSENIAPSNPSNTSAGQQSASTINHTLTMSLTSTSSD 1888
            .:.:.      .|  :.|| .:.:..:|.::...|.:|.|.||...|:.|     ....||:|.:
  Fly  1857 KATWDWMFTVMDG--TEAQLKFGAYLTNYTDPNHPLHPLNLSAQASSSQT-----PAPATSSSVN 1914

  Fly  1889 SEQV----SLEDFLESCRAPALLGDLDDEDDMDEDNDEEENEDEYEEVGNTLLQ---------VM 1940
            ...:    |..||...|.  :|:           .:...|:.|....:..|.|:         |.
  Fly  1915 GVNIMGSNSRRDFFTYCL--SLM-----------RSHTSEHRDALPVLDITALRHIAYVLDAFVY 1966

  Fly  1941 VSRNLLTFMDDE----AMENRLVGVTKRKSWDDEFVLKRQFSA-------LIPAFDPRPGRTNVN 1994
            ..||...|.|.:    ...|.|..:|:....|||.....:|:|       .:|:......|....
  Fly  1967 YMRNDSGFYDKQDTISGRINNLSPMTESYDTDDELANLEEFNADVQMSASSMPSGSQGTRRHAFF 2031

  Fly  1995 QTSDLEIS-----PLGAELP---------KPQQSGGPETIEQ------PLL--------GLKLRG 2031
            ..|:..:|     |.|.|||         ||... .|.:..|      |||        |....|
  Fly  2032 ARSESTLSLGCSAPEGFELPLDMAMPLADKPHLL-QPNSKRQELFANLPLLVTTNANNSGATNDG 2095

  Fly  2032 PGIGGI---------------------PEVEIDLS-------------NTDWTIFRAVQELLQCS 2062
            .| |.|                     ..|.||.|             :||..|:      :|..
  Fly  2096 DG-GSIFDYTPTRLGFSNSLKRNERVYETVPIDSSKTGDGNVTNKAEGSTDSNIY------VQLK 2153

  Fly  2063 QLNKLDKFRKIWE-----PTYTIVYREVSPEAQESTCLESEEFPQT-PDVSSKSGASTLSPNSPM 2121
            :....|.|:...|     ..|..|....:.::..||...:|....| |:|......:::||.:..
  Fly  2154 KKQGSDDFKSHKEADGNQSKYEKVVLMETDDSLPSTSKSTEALMATRPEVIIAPNKASVSPATAA 2218

  Fly  2122 HIGFNVADNNLCSVDDVLELLTQINGLNQSEIDSDVKEHGVSVLSEDLFISKKITNKLQQQIQDP 2186
            .                 .::....|.....||||:..:..|.||  .....|...:.|:...|.
  Fly  2219 R-----------------SVIVLAGGSCLKTIDSDINNYSASNLS--TAEQAKCDTQYQKSTSDH 2264

  Fly  2187 LVL---------ASN--ALPNWCENLNQSCPFLFPFETRQLYFNCTSFGASRSIVCL-------- 2232
            |:|         .||  .||:|                        :|..||..:.|
  Fly  2265 LLLFPARGSQFYQSNFSELPSW------------------------NFLLSRWKLTLDLFGRVFM 2305

  Fly  2233 ----QSQRDVTVERQRIPI--MSPRRDDHEFRIGRLKHERV--KVPRN-EDLLMWAMQVMKTHCN 2288
                .....|..|.:..|:  |..||...:.|.|: :.:.|  |:.|| |.|::...:.:.|...
  Fly  2306 DDVGMEHGSVLPELRGFPVKEMRFRRHMEKLRNGQ-QRDLVLCKLERNRESLIVQTFKELNTQFG 2369

  Fly  2289 RKS----------VLEVEFLDEEGTGLGPTLEFYALVA--------------------------- 2316
            .:|          .::|.|.||.|.|.|....||..:|
  Fly  2370 NQSRRIQPPITFNRVKVTFKDEPGEGSGVARSFYTSIAEALLASAKIPNLESVQVGTNHSKYVVP 2434

  Fly  2317 -AEIQRSDLCMWLCDDDLGEDTENSTQSAEGNSKPVGYYVNRREHGI----FPAPLPQNS----- 2371
             :.|.||....       |...:.||....|::..:.:...|....:    .|...|.:|
  Fly  2435 FSSILRSRTVS-------GSSRDQSTLQRRGSNSKILWRSARERKALNLDARPYTPPNSSDNATP 2492

  Fly  2372 ------------EICENVLKYFWFFGVFVAKVLQDMRLVDIPLSTSFLQLLCHNKVLSRNLQ--- 2421
                        :|.|.:...........|..:..| |::|| :...|.::..::.|.:.:.
  Fly  2493 ESLNDHLSVHLQQIGERLYPKIHSINQTHAPKITGM-LLEIP-TPQLLSVISSDETLRQKVNEAI 2555

  Fly  2422 KVISDRRNGDLSVVSEDS---------DIVETCTKLLRTDSNKS---------------NAFG-- 2460
            ::|:.::..:.|..|...         |.|:...:.|.....|.               |||.
  Fly  2556 EIITFKQKSETSAQSSQPKKSPSVVVVDPVDDDNEPLFYSPGKRGFYTPRQGFASFERINAFRNI 2620

  Fly  2461 ----GILSLENLKEIDPTRYQFLQE--MQNLLLRK---QSIEFDDTISAEKKHELINELKLQTQN 2516
                |:..|:|  |:.|.   |||.  ::.:|.||   ..:.|.|....|...::|.  ..||:.
  Fly  2621 GRLIGLCLLQN--ELLPL---FLQRHVLKYILGRKIKFHDLAFFDPALYESFRQIIQ--NAQTKE 2678

  Fly  2517 GLEVSLEDLALTFTYLPSSSIYGYTQAELLPNGSSVNVTIDNLEAYCELLMNFILQDGIAQQMKA 2581
            | |.::..:.|.|. :......|....||:|.|..|.||..|:..|......:.|.....:.::|
  Fly  2679 G-EETINRMELCFV-IDLMKEEGCGNRELIPGGRDVAVTSSNIFEYVRRYTEYRLIKSQEKALEA 2741

  Fly  2582 FSDGFNEVFPLKKLAAFTPSEARMMICGEQFPHWSREDIISYTEPKLGYNKDSP-------GFQR 2639
            ..||..:|.|...:...|..:.|:::.|....:.|  .:||||.    :|.:|.       .|::
  Fly  2742 LKDGVFDVLPDNSMINLTAEDLRLLLNGVGDINVS--TLISYTT----FNDESSEGPDKLLKFKK 2800

  Fly  2640 -FVNVLLSMSGDERKAFLQFTTGCSSLPPG--GLANLHPRLTVVRKVDAGVGSYPSVNTCVHYLK 2701
             |.:::..|:..||:..:.|.||..:||..  |...| |.:|:....|:.:   |:.|||:..|.
  Fly  2801 WFWSIVEKMNIMERQDLVYFWTGSPALPASEEGFQPL-PSVTIRPADDSHL---PTANTCISRLY 2861

  Fly  2702 LPDYPTEEIMKERLLTATKEKGF 2724
            :|.|.::.|::.::|.|.|.|.|
  Fly  2862 IPLYSSKSILRSKMLMAIKSKNF 2884

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ufd4	NP_609369.1	ANKYR	<375..>509	CDD:440430	21/140 (15%)
		ANK repeat	393..420	CDD:293786	3/26 (12%)
		ANK repeat	422..453	CDD:293786	5/30 (17%)
		ANK repeat	455..484	CDD:293786	7/29 (24%)
		Sad1_UNC	1173..1298	CDD:474037	24/141 (17%)
		MIB_HERC2	1333..1390	CDD:461991	9/60 (15%)
		HECTc	2265..2725	CDD:238033	123/570 (22%)
hyd	NP_001287262.1	UBA_like_SF	150..196	CDD:473871
		UBR-box_UBR5	1211..1286	CDD:439073	12/94 (13%)
		MDN1	<1551..>1724	CDD:444083	41/209 (20%)
		PolyA	2498..2561	CDD:197769	10/64 (16%)
		HECTc	2589..2884	CDD:214523	79/313 (25%)