Protein Alignment Ufd4 and Ube3a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609369.1
• Gene: Ufd4 / 34378
• FlyBaseID: FBgn0032208
• Length: 2727
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_648452.1
• Gene: Ube3a / 39266
• FlyBaseID: FBgn0061469
• Length: 973
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1173
• Identity: 244/1173 - (20%)
• Similarity: 410/1173 - (34%)
• Gaps: 402/1173 - (34%)

  Fly  1719 PAQQPNAVLSIVDIK------EQPISNENVSVPSQMSISVPNLTTTSASEV-PST-SEVATHTGL 1775
            |..:.:||.|:  ||      :....|.|.|          |....|:.:| |.| :|||...
  Fly    33 PEMKRSAVRSL--IKRYFHQLQSGCGNANCS----------NANCASSGKVAPMTPNEVAARA-- 83

  Fly  1776 LETFAAIARRRTSQGTNIQDNQIMNA---EANVNEHGD----QNASGSFLGHSVTSLVKLALSSN 1833
            |:.|:             ||.|:..|   |||..:..|    .::|.|..|.|.:::...:.::.
  Fly    84 LQLFS-------------QDAQLCEAFTSEANSPQDVDMLSPNDSSSSSSGSSTSTITSASTTTT 135

  Fly  1834 FHSGLLST-------------AQSYPSL-------SSNNSE----NIAPSNPSNTSA-------- 1866
            ......||             .||.|.|       ||.:||    .:||.:..:.::
  Fly   136 TSRQSQSTPAAVVVPVSSPYLTQSVPQLDIAGAEHSSGDSEPCTPTLAPVHSLDANSLIALYEQC 200

  Fly  1867 -GQQSASTINHTLTMSLTS----------TSSDSEQVSLEDFLESCRAPALLG-----DLDDEDD 1915
             ...|...|.|.:.:..:|          ::..:...||::.|  ..:|..|.     .|:.|.|
  Fly   201 RAADSYDRICHAIGVVFSSVDRLGKSFIRSAEPAASSSLQELL--ANSPGALNKEQLRTLEGEHD 263

  Fly  1916 MDEDNDEEENEDEYEEVGNTLLQVMVSRNLLTFMDDEAMENRLVGVTKRKSWDDEFVLKRQFSAL 1980
            .|||:.::.:| :.|...|.....            |::|:.    .:.:..||:..
  Fly   264 KDEDSTQQVDE-QSESAANATATA------------ESVESE----AEPEEEDDDVC-------- 303

  Fly  1981 IPAFDPRPGRTNVNQTSDLEISPLGAELPKPQQSGGPETIEQPLLGLKLRGPGIGGIPE----VE 2041
                        .:|:||..:     :||      |...:::.|.|.::|     .|.|    ..
  Fly   304 ------------SSQSSDTLV-----DLP------GLRRVQRLLFGCQIR-----AITEKLTSSV 340

  Fly  2042 IDLSNTDWTIF------RAVQELLQCSQL-----------NKLD-------------------KF 2070
            |.||  ||.|:      |.:..|:.|..|           :.||                   :.
  Fly   341 IQLS--DWVIYMRTDWERVIHCLVICFDLATNTNNSVVDMDYLDRVLPKLCQAASAMPVPAQARL 403

  Fly  2071 RKIWEPTYTIVYREVSPEAQESTCLE---SEEFPQTPDVSSKSGASTLSPNSPMHIGF--NVADN 2130
            .:||....:.....:....|:...|:   .||       |.:...|.:|....:.|.|  |:..:
  Fly   404 ARIWAAHCSDQLHSLIAACQQQITLQVLLDEE-------SMRENESIISVTKVLKIVFYANILAS 461

  Fly  2131 NL----CSV--DDVLELLTQINGLNQSEIDSDVKEHGVSVLSEDLFI---------SKKITNKLQ 2180
            .|    |.|  :|..|..|               ..|.:.:.:|||:         .|...::.:
  Fly   462 ELERPSCRVPLEDRTEAAT---------------ASGSAAVEDDLFVYNSLLEPHMPKFAEDQFE 511

  Fly  2181 QQIQ-------DPLV----LASNALPNWCENLNQSCPFLFPFETRQL-------YFNCTSFGASR 2227
            :::|       .||:    ..:.||   .||:.....:| .::|..:       :.|..||....
  Fly   512 KELQVSAIDCRKPLIPLEEFYNEAL---SENIQMHHDYL-SYKTLAMESEIGSGHANYFSFMLYA 572

  Fly  2228 SIVCLQSQRDVTVERQRIPIMSPRRDD-HEF--RIGRLKHE-------RVKVPR----NEDLLMW 2278
            .|:...::.|......|:.:.|.|... |..  .||::..|       ::.|.|    |:.|:..
  Fly   573 FILTPSTKVDALYYDSRMRMYSERYSSLHSILNNIGQVGQEDNPRPDLKLTVRRDQLINDALIGL 637

  Fly  2279 AMQVMKTHCNRKSVLEVEFLDEEGTGL-GPTLEFYALVAAEIQRSDLCMWLCDDDLGEDTENSTQ 2342
            .|..|....:.|..|.|||:.|:|... |.:.||:.|:..||......|::..::......|:|.
  Fly   638 EMVAMSNPKDLKKQLVVEFVGEQGIDEGGVSKEFFQLIVEEIFNPAFGMFIQQEETNNMWFNATP 702

  Fly  2343 SAEGNSKPVGYYVNRREHGIFPAPLPQNSEICENVLKYFWFFGVFVAKVLQDMRLVDIPLSTSFL 2407
            ...|                                ..|...|:.:...:.:    ::.|:.:|
  Fly   703 FENG--------------------------------AQFTLIGIIIGLAIYN----NVTLAVNF- 730

  Fly  2408 QLLCHNKVLSRNLQKVISDRRNGDLSVVSEDSDIVETCTKLLRTDSNKSNAFGGILSLENLKEID 2472
            .::.:.|::                                           |...:..:|.:..
  Fly   731 PMVVYRKLI-------------------------------------------GYCGTFADLSDWS 752

  Fly  2473 PTRYQFLQEMQNLLLRKQSIEFDDTISAEKKHELINELKLQTQNGLEVSLEDLALTFTYLPSSSI 2537
            |..|:.|:.|                           |..|.|:..||..:...:::     |.:
  Fly   753 PALYKSLKSM---------------------------LDYQGQDMEEVFEQTFKISY-----SDV 785

  Fly  2538 YG-YTQAELLPNGSSVNVTIDNLEAYCELLMNFILQDGIAQQMKAFSDGFNEV---FPLKKLAAF 2598
            :| ..|.||:|||..|.|...|.|.:..|..:|:|...|.||..||..||..|   .|||.|  |
  Fly   786 FGDVVQHELVPNGQDVLVGQHNKELFVNLYSDFLLNTNIEQQFNAFRKGFEMVTDESPLKLL--F 848

  Fly  2599 TPSEARMMICGEQFPHWSRE----DIISYTEPKLGYNKDSPGFQRFVNVLLSMSGDERKAFLQFT 2659
            .|.|..|::||      |||    ::.:.|..:.||.:.|...|.|.:::.:|..:::...|:||
  Fly   849 RPEEIEMLVCG------SREFDFVELENSTVYEGGYTEKSQYIQDFWSIVHAMPSEDKHKLLEFT 907

  Fly  2660 TGCSSLPPGGLANLHPRLTVVRKVDAGVGS--YPSVNTCVHYLKLPDYPTEEIMKERLLTATK-E 2721
            ||.:.:|.|||..|  ||.:.|.   |..|  .|:.:||.:.|.||:|.:.|.::|||:.|.. .
  Fly   908 TGSARVPVGGLKCL--RLLITRH---GPDSDRLPTSHTCFNVLLLPEYSSREKLEERLMKAINYS 967

  Fly  2722 KGF 2724
            |||
  Fly   968 KGF 970

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ufd4	NP_609369.1	ANKYR	<375..>509	CDD:440430
		ANK repeat	393..420	CDD:293786
		ANK repeat	422..453	CDD:293786
		ANK repeat	455..484	CDD:293786
		Sad1_UNC	1173..1298	CDD:474037
		MIB_HERC2	1333..1390	CDD:461991
		HECTc	2265..2725	CDD:238033	113/483 (23%)
Ube3a	NP_648452.1	AZUL	40..94	CDD:465173	20/80 (25%)
		HECTc	620..971	CDD:238033	112/476 (24%)