Protein Alignment Ufd4 and CG3356

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609369.1
• Gene: Ufd4 / 34378
• FlyBaseID: FBgn0032208
• Length: 2727
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_611896.1
• Gene: CG3356 / 37876
• FlyBaseID: FBgn0034989
• Length: 1122
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1433
• Identity: 275/1433 - (19%)
• Similarity: 473/1433 - (33%)
• Gaps: 475/1433 - (33%)

  Fly  1443 GASNQTVSADNLAWKQTVETIAEN----------VFASAKTQIISNQLAMNTSSSREARAKHKES 1497
            |.::.|...|.:..|..:|....|          |..|.....|..|        |..||:.:..
  Fly    17 GGASHTCDRDTVIRKAALERQKRNELRQKENGAVVLQSYARSFIHRQ--------RRKRAEREVF 73

  Fly  1498 GTNQM-HKDNISGPSPLSRELEHISDLSAINNSMPAINSSNVSDL--------ATISENLSLTEL 1553
            ....| |||.|.....|:..|..::...:|..   |.:|..:.::        |.:.::.|...|
  Fly    74 DIYLMGHKDGIVEDESLTFLLRRLNFFYSIRE---AKDSERLIEVCQQILRQPARLLQHSSPDSL 135

  Fly  1554 SKENICRVLTPSYKPAESVTASQSSSHPDVQSSSPRENDIKNISNIEENNKMNA--NNSVNK--- 1613
            ....:|::|       ::.....|.||...............:|::::..|..|  ...:.:
  Fly   136 WLLRLCKLL-------DTCLLQLSLSHTAQAIPLRMLETFTTVSSVQQYMKDEAVLFQYMERVFG 193

  Fly  1614 --ISKDLLANLRTSNIAGCPP---------------VTQLSTEALEMIDKMRDGVDM-------I 1654
              |:::....||......|||               :.||....||:..:...|..|       .
  Fly   194 FLIARNYFVRLRRLLDDKCPPLDGETLHAPSPLAEALLQLLLRPLEVAKRASAGGQMSSMSMAVC 258

  Fly  1655 RNMSNSILSTD------TFPVPCTNVPVGGKKTPKAQALINPDNANQKQIIVTSEEFPTKSSKKP 1713
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  Fly   259 RNFTRDILATPHTDPLRYFVLPCFALNV---------------------------DFPFDLLMR- 295

  Fly  1714 SVTLKPAQQPNAVLSIVDIKEQPISNENVSVPSQMS-----ISVPNLTTTSASEVPSTSEVATHT 1773
                          |:.|..|.....|:.|..|:.|     :...:.||...|...|.
  Fly   296 --------------SLYDALESAGPAESDSTSSRRSFLFYGVETGHKTTRMDSIFSSF------- 339

  Fly  1774 GLLETFAAIARRRTSQGTNIQDNQIMNAEANVNEHGDQNASGSFLGHSVTSLVKLALSSNFHSGL 1838
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  Fly   340 -LLNSLMVLDRRQLAT----------------------------LHQSPLLVIYVRLIAEMMPNI 375

  Fly  1839 L----STAQSYPSLSSNNSENIAPSNPSNTSAGQQSASTINHTLTMSLTSTSSDSEQVSLED--- 1896
            |    ||.:.:.:....:.:.   .:.|..|..:........||...:..|...|.::|:::
  Fly   376 LQLPKSTLRGHANAPHRHRDG---DDDSEESEDEDEELPAARTLDYDMEQTCRTSGELSVKEREC 437

  Fly  1897 FLESCRAPALLGDLDDEDDMDEDNDEEENEDEYEEVGNT-LLQVM--VSRNLLTFMDDEAMENRL 1958
            .|||.   |:|.:.:..|.:.:..|        ..:.|| |:..:  :..||:.:......|.:|
  Fly   438 LLESI---AILNETERVDFIVQQLD--------PHIENTHLIYALCEICHNLMIYNKHAVFEYKL 491

  Fly  1959 VGVTKRKSWDDEFVLKRQFSALIPAFDPRPGR----------TNVNQTSDLEISPLGAELPKPQQ 2013
            :           :.|         ||.|:..|          |.:..::.|.:...|. :||.|
  Fly   492 L-----------YTL---------AFTPKFIRAVWFKLAAESTQLGFSAPLTLISKGV-VPKHQ- 534

  Fly  2014 SGGPETIEQPLLG--LKLRGPGIGGIPEVEID----LSNTDWTIFR------AVQELLQCSQLNK 2066
             |...||  |||.  ..|.|..:..:.:||..    |.....||..      ::.|::|.|:
  Fly   535 -GVDRTI--PLLATFCMLFGRLLPTLHDVEFVENKLLLQVHSTINHVRLMPFSIAEIIQMSK--- 593

  Fly  2067 LDKFRKIWEPTYTIVYREVSPEAQESTCLESEEFPQTPDVSSKSGASTLSPNSPMHIGFNVADN- 2130
                          ..:::|....|..      ||:|        .|.|: |....:|...||:
  Fly   594 --------------TLKDISMGLVELA------FPET--------RSNLA-NYRKVLGHTEADDK 629

  Fly  2131 ----------NLCSVDDVLELLTQINGLNQSEIDSDVKEHGVSVLSEDLFISKKITNKLQQQIQD 2185
                      ||.:|  |:.:|.||:          .::..:....||.:...::...|.:....
  Fly   630 KLRHQKQIWANLLNV--VVFVLNQIH----------TRDLRLGFCPEDHWTVTRLDLPLDRPTDL 682

  Fly  2186 PLVLAS--------------------NALPNWCENLN-----QSCPFLFPFETR----------- 2214
            ||..:|                    |..|...:.:.     :..||:.||..|
  Fly   683 PLTHSSRLRGIRPFQPIRDFTREDFENGPPMSTKQIRSITILREIPFVVPFNKRVSILQSLVAAS 747

  Fly  2215 --QLYFNCTSFGASRSIVCLQSQRDVTVERQRIPIMSPRRDDHEFRIGRLKHERVKVPRNEDLLM 2277
              ::..|..:|....|::       :||.|..:         :|....:|:      |.||..|.
  Fly   748 KMRVQGNMQAFLQGPSVL-------ITVRRSHL---------YEDAYDKLR------PDNEPDLR 790

  Fly  2278 WAMQVMKTHCNRKSVLEVEF-----LDEEG-TGLGPTLEFYALVAAEIQRSDLCMWLCDDDLGED 2336
            :..:             ::|     |||.| .|.|...||.         |:|.....|.:.
  Fly   791 FKFR-------------IQFVSSLGLDEAGIDGGGVFREFL---------SELIKTAFDPNR--- 830

  Fly  2337 TENSTQSAEGNSKPVGYYVNRREHGIFPAPLPQNSEICENVLKYFWFFGVFVAKVLQDMRLVDIP 2401
                           |:::...::.::|.  |..:::.|:..|:::|.|..:.|.:.:..||::|
  Fly   831 ---------------GFFMVTTDNKLYPN--PNVADLFEDYEKHYYFIGRILGKSIYENLLVELP 878

  Fly  2402 LSTSFLQLLCHNKVLSRNLQKVISDRRNGDLSVVSEDSDIVETCTKLLRTDSNKSNAFGGILSLE 2466
            |:..||                                      |||....|:        :.:.
  Fly   879 LAEFFL--------------------------------------TKLAGKYSD--------VDIH 897

  Fly  2467 NLKEIDPTRYQFLQEMQNLLLRKQSIEFDDTISAEKKHELINELKLQTQNGLEVSLEDLALTFTY 2531
            .|..:||..|      :|||..|   ::...:|                        :|.|.||.
  Fly   898 QLASLDPELY------RNLLYLK---DYSGDVS------------------------ELNLDFTV 929

  Fly  2532 LPSSSIYGYTQ-AELLPNGSSVNVTIDNLEAYCELLMNFILQDGIAQQMKAFSDGFNEVFPLKKL 2595
              :||..|.|| .||.|.|.|:.||..|...|.:|:.::.|...|.:...||..|.:.|.|::.|
  Fly   930 --ASSSLGQTQIVELKPQGQSIPVTNSNRIEYLQLIADYKLNVQIRRHCNAFRKGLSNVLPIEWL 992

  Fly  2596 AAFTPSEARMMICGEQFPHWSREDIISYTEPKLGYNKDSPGFQRFVNVLLSMSGDERKAFLQFTT 2660
            ..|:..|.:::|.|.:.| ...||:..:.|....::.:.|....|..||......:|:..|:|.|
  Fly   993 YMFSNKELQILISGAEIP-IDLEDLKKHCEYGGEFSPEHPSIVTFWEVLEGFDDMQRRQLLKFVT 1056

  Fly  2661 GCSSLPPGGLANLHPRLTVVRKVDAGVGSYPSVNTCVHYLKLPDYPTEEIMKERLLTATKE-KGF 2724
            .||..|..|..:|.|...:....|  :...|:.:||.:.||||.:.|.|.|:|:||.|.:. .||
  Fly  1057 SCSRPPLLGFKDLDPPFFIQNTGD--MERLPTASTCTNLLKLPPFKTVEQMREKLLYAIQSGAGF 1119

  Fly  2725 HLN 2727
            .|:
  Fly  1120 ELS 1122

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ufd4	NP_609369.1	ANKYR	<375..>509	CDD:440430
		ANK repeat	393..420	CDD:293786
		ANK repeat	422..453	CDD:293786
		ANK repeat	455..484	CDD:293786
		Sad1_UNC	1173..1298	CDD:474037
		MIB_HERC2	1333..1390	CDD:461991
		HECTc	2265..2725	CDD:238033	108/467 (23%)
CG3356	NP_611896.1	HECTc	766..1120	CDD:238033	113/494 (23%)