DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ufd4 and Ufd4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609369.1 Gene:Ufd4 / 34378 FlyBaseID:FBgn0032208 Length:2727 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061518162.1 Gene:Ufd4 / 1271399 VectorBaseID:AGAMI1_002817 Length:3192 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:3247 Identity:1780/3247 - (54%)
Similarity:2130/3247 - (65%) Gaps:576/3247 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MGDVDPETLLEWLSMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFESCPPRTFLPALCKIFLDEL 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito     2 MGDVDPETLLEWLSMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFESCPPRTFLPALCKIFLDEL 66

  Fly    66 APENVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVSIDGAIKAICNHLVVADLSSRTSRDLAEQCIKVLELI 130
            ||||||||||||||||||||:|||||||:|||||:||||.|.||||.||||||||||||||||||
Mosquito    67 APENVLEVTARAITYYLDVSSECTRRIVAIDGAIRAICNRLEVADLESRTSRDLAEQCIKVLELI 131

  Fly   131 CTREAGAVFEGGGLNCVLSFIRDCGSQVHKDTLHSAMSVVSRLCTKVEPNTPCIQNCVESLSTLL 195
            ||||||||||||||:|||:||||.|||:|||||||||:|||||||||||:...:|.|||||||||
Mosquito   132 CTREAGAVFEGGGLSCVLAFIRDSGSQIHKDTLHSAMAVVSRLCTKVEPSGANVQTCVESLSTLL 196

  Fly   196 QHEDPMVSDGALKCFASVADRFTRKWVDPAPLAEYGLTTELLKRLQSVGGNTHSSLTAAGTQPTS 260
            |||||:|:|||||||||||||||||.|||||||||||..|||:||.:..|....|.:..|.....
Mosquito   197 QHEDPLVADGALKCFASVADRFTRKGVDPAPLAEYGLVRELLQRLSNAAGGPQISSSGGGGSAAI 261

  Fly   261 SSQPAATTNSDAINENVAGTATISNSTKVKSS----DAAASPQSISTTISLLSTLCRGSPSITHD 321
            ||  :..|||....|:....|.:|:|.. ||:    :|..|.|||:|||||||||||||||||||
Mosquito   262 SS--SLGTNSSTHPESSPSAAQLSSSAP-KSAQGAMEAGRSSQSIATTISLLSTLCRGSPSITHD 323

  Fly   322 ILRSQLADALERALQGDERCVLDCMRFADLLLLLLFEGRQALNR--GSNNPNQGQLAPRPRRNNT 384
            :|||.|.:|:|||.:|||||||||||.|||:|||||||||||.|  ||    |||||||.||.::
Mosquito   324 LLRSNLLEAMERAFKGDERCVLDCMRLADLILLLLFEGRQALGRVGGS----QGQLAPRVRRADS 384

  Fly   385 NTDRTHRQLIDCIRSKDSEALREAIESGGIDVNCMDDVGQTLLNWASAFGTLEMVEYLCEKGADV 449
            :|:||||||||||||||:|||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||
Mosquito   385 STERTHRQLIDCIRSKDTEALIESIESGGIDVNCMDDVGQTLLNWASAFGTLEMVEFLCDKGADV 449

  Fly   450 NKGQRSSSLHYAACFGRPAIAKILLKFGAYPDLRDEDGKTPLDKARERLDDGHREVAAILQSPGE 514
            ||||||||||||||||||.|||:|||.||.||||||||||||||||||.|:||||||:|||||||
Mosquito   450 NKGQRSSSLHYAACFGRPGIAKVLLKHGANPDLRDEDGKTPLDKARERPDEGHREVASILQSPGE 514

  Fly   515 WM------------SPDHSLLNKDGKKYTLMEPRGDPEMAPIYLKVLLPIFCRTFLGSMLGSVRR 567
            ||            |.|.:     |....:.||||||||||:|||..||.||:||..:||.||||
Mosquito   515 WMMAATRSDVKCGDSGDET-----GGAGGVGEPRGDPEMAPVYLKFFLPTFCKTFQSTMLASVRR 574

  Fly   568 ASLALIKKIVQYAYPTVLQSLSETSFSEDAASTSGQNGGNLLIEVIASVLDNE------------ 620
            :||.||||::||..|.||..|.    |.:...:..|:.|.||:||||||||||            
Mosquito   575 SSLGLIKKMIQYVQPEVLSKLC----SSEGLQSYEQSLGTLLVEVIASVLDNEISYSWPPLSQPS 635

  Fly   621 ----------------------------------------------------------------- 620
                                                                             
Mosquito   636 AALPAYLPPLPPPPPPILTVARHSSSSVSHSLLTKHSCAERLSKFVQAKRQRRNSSSYIIPPPPP 700

  Fly   621 ---------------------------------------------------------------DD 622
                                                                           ||
Mosquito   701 LLPLTPPPRGTTSARANDSDEDADDEWAGAAAGSKSNNNSSDRTTTTNPRNRTQSNWSDLSIADD 765

  Fly   623 GDGHLIVLNIIEEIMCKTQEEFLDHFARLGVFAKVQALM------DTDAEELYVQLPGTVEEPAA 681
            .||||:||.|::|:|.|||.:||||||||||:.||||||      .:|..::........:..||
Mosquito   766 EDGHLVVLTIVQELMSKTQNDFLDHFARLGVYTKVQALMGEPSFDGSDNNDVIKSTSDDAKSAAA 830

  Fly   682 AQRSSTS----VVVAP-RPT----------SDDPMEDAKEILQGKPYHWREWSICRGRDCLYVWS 731
            |..|||.    |.|.| .||          :...:|||||||.||.|||.:||||||||||||||
Mosquito   831 AACSSTDASGVVTVTPGAPTVTTASGGTASAAVAVEDAKEILHGKAYHWHDWSICRGRDCLYVWS 895

  Fly   732 DSVALELSNGSNGWFRFIIDGKLATMYSSGSPENGNDSS--------------ENRGEFLEKLMR 782
            ||.|||||||||||||||:||||||||||||||||:||:              ||||||||||.|
Mosquito   896 DSAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPENGSDSTGREKVSSDPNVPNEENRGEFLEKLQR 960

  Fly   783 ARSCVIAGVVSQPILPTASALRLVVGNWVLQSQKTNQLQIHNTEGHQVTVLQDDLPGFIFESNRG 847
            ||:.|..|.||||||...|..|:.||||||||||.:||.|:|:||||||:|||:|||||||||||
Mosquito   961 ARAAVRQGTVSQPILSAPSLARIAVGNWVLQSQKEHQLHINNSEGHQVTILQDELPGFIFESNRG 1025

  Fly   848 TKHTFSAETVLGPDFASGWSTAKKKRNKSKTEGQKFQVRNLSREIYNKYFKSAQIIPRGAVAILT 912
            |||||:|||.||||||:||...|||:.:.|.|.||:|:..|:|::||:|||:||.|||||||.|:
Mosquito  1026 TKHTFTAETTLGPDFAAGWINTKKKKMRCKAEAQKYQLHKLARDLYNRYFKAAQAIPRGAVAKLS 1090

  Fly   913 DIVKQIELSFEEQHMAPNG-----------------NWETTLTDALMKLSQLIHEDGVVSAYEMH 960
            .||.|||::.|||......                 :|:..|.:||.:|..|::||||:|||||:
Mosquito  1091 KIVHQIEIALEEQQSTSKAALISSTTQQITPPSAGVSWQEKLYNALTELVHLLNEDGVISAYEMY 1155

  Fly   961 SSGLVQALVAVLSVNHWETNSPRCKRNKMQKQRVSVFKKCILEDNVESATNKPRTKSTASILIQK 1025
            |||||||||||||.|:|:....|.|.||.||||:|:||||:....:::.      |:||:||:||
Mosquito  1156 SSGLVQALVAVLSPNYWDLGMNRTKANKYQKQRLSIFKKCMYGGELKTG------KNTAAILVQK 1214

  Fly  1026 LVSVLESTEKLPVYLYDSPCTGYSLQILQKRLRFRLERAECESTLFDRSGRTLKMEPLATIGQLS 1090
            ||:||||.||||||:||||...|.||||.|:|.||||||.||.|||||:||.||||||||:|.|:
Mosquito  1215 LVAVLESIEKLPVYMYDSPGGSYGLQILTKKLSFRLERAACEQTLFDRTGRNLKMEPLATVGHLN 1279

  Fly  1091 KYLLKMVAKQWYDLDRSTYFYLKKIREHRTATV-FTHSFDFDEEGLLFYIGSNAKTCDWVNPAQY 1154
            |||||||||||||::||::.||:|::|.::.|: |.|..||||.||::|||:|.:|.:|||||||
Mosquito  1280 KYLLKMVAKQWYDMERSSFLYLRKMKEAKSGTMQFRHRHDFDENGLIYYIGTNGRTLEWVNPAQY 1344

  Fly  1155 GLVQVTSSEGKTLPYGKLEDILSRDSISLNCHTKDNKKAWFAIDLGVYIIPTAYTLRHARGYGRS 1219
            |||.|||||||.||||||||||||||:|:|||||||||:|||||||::|:|||||||||||||||
Mosquito  1345 GLVTVTSSEGKQLPYGKLEDILSRDSVSVNCHTKDNKKSWFAIDLGIFILPTAYTLRHARGYGRS 1409

  Fly  1220 ALRNWLLQGSKDGSTWTTLSTHVDDKSLVEPGSTATWPINCATDDSVWYRHIRIQQNGRNASGQT 1284
            ||||||.|.||||.:|.||.||.|||||.|||||.||||:|..|:...|||:||.||||||||||
Mosquito  1410 ALRNWLFQMSKDGVSWVTLLTHTDDKSLAEPGSTCTWPIDCPADEQQGYRHVRIHQNGRNASGQT 1474

  Fly  1285 HYLSLSGFEIYGRVVGVADDIGK-SVKEAEAKTRRERRQIRAQLKHMTTGARVIRGVDWRWEEQD 1348
            ||||||||||||:|:.|.:|:.| :.||.|||.|:||||||:|||::|.||||:|||||.|::||
Mosquito  1475 HYLSLSGFEIYGKVMSVCEDMDKTAAKENEAKLRKERRQIRSQLKYITDGARVVRGVDWHWDDQD 1539

  Fly  1349 GC--AEGTITGEIHNGWIDVKWDHGVRNSYRMGAEGKYDLKLADCEYLSA--FD----------- 1398
            |.  .|||:..||||||||||||||:|||||||||||||||||:.:.|.|  :|           
Mosquito  1540 GSPPGEGTVIAEIHNGWIDVKWDHGMRNSYRMGAEGKYDLKLANVDGLMAGGYDLHSSGISVTTA 1604

  Fly  1399 -----GNQSMGSA----------STAA---KPSEKGGNTLTSRKSSSTPSLPEATEKNQNPEGAS 1445
                 .||...:|          |||:   |..:|..|.|||||||||||||:||.:|::...::
Mosquito  1605 GGGANNNQFASTANVQCELADGGSTASGKKKVYDKSLNVLTSRKSSSTPSLPDATTENRSSVAST 1669

  Fly  1446 NQTVSADNLAWKQTVETIAENVFASAKTQII-------SNQLAMNTSSSREARAKHKESGTNQMH 1503
            .|..|||||:|||.||.|.|||.:||::.:.       ||.|:.:..:|..|     .:|.||  
Mosquito  1670 EQATSADNLSWKQAVEVITENVLSSARSDLATVGSGGSSNDLSSSVVTSSTA-----TTGNNQ-- 1727

  Fly  1504 KDNISGPSPLSRELEHISDLSAINNSMPAINSSNVSDLATISENLSLTELSKENICRVLTPSYKP 1568
            :.:::..|.||....:|.|||.||:|    .|..|||||||:|||||::.|.:........|...
Mosquito  1728 EVSVTVHSSLSERGNNIPDLSQINSS----TSMLVSDLATITENLSLSDGSAKQSGTATASSAGG 1788

  Fly  1569 AESVTASQSSSHPDVQSSSPRENDIKNISNIEENNKMN----ANNSVNKISKDLLANLRTSNIA- 1628
            .:.|:....:..|.:..||   :...:.|:.|||||.|    .||.:|..|....:::.:.:.| 
Mosquito  1789 QQFVSNISGTGVPVLMGSS---SSSSSSSSTEENNKTNNINETNNKINLTSGSGASSVASGSSAS 1850

  Fly  1629 -GCPPVTQLSTEALEMIDKMRDGVDMIRNMSNSILSTDTF--------------PVPCTNVPVGG 1678
             |...::.|.|. |:|:.|||:||||:||.:|:.||::..              |:|..|...|.
Mosquito  1851 SGKAGLSYLQTR-LDMMGKMREGVDMLRNNTNNFLSSELLTQSNLLSSVKIAFPPIPPANATTGS 1914

  Fly  1679 KKTPKAQALINPDNANQ-KQIIVTS-------------------EEFPTKSSKKPSV-TLKP--- 1719
            ..:..|..:  |.:|:. ..|.|.|                   ::|..|.:...:. |.|.   
Mosquito  1915 SSSTTATTI--PGSASYGSSIFVASTSTGTNPAASSGTGAKTPTDKFDVKFNNTATANTFKKVLN 1977

  Fly  1720 ------AQQPNAV-------------------LSIVDIKEQPI---------------------- 1737
                  |:||.|.                   :.:|...|..:                      
Mosquito  1978 EAKQIGAEQPPAPPAPASSMGGRDATNNLKNNIVVVGSTETTVLGGGGGGGSSQDDPNAMDCLMG 2042

  Fly  1738 ---SNENVSV-------PSQMSISVPNLTTT---------------------------SASEVPS 1765
               .::.|:|       |:.||:||||||::                           |||:..:
Mosquito  2043 SVSGSDGVNVVPVVAPSPNSMSVSVPNLTSSGTGANNHSHNASHRTSSHHHHHHNHPDSASQTLA 2107

  Fly  1766 TSEVATHTGLLETFAAIARRRTS-QGTNIQDNQIMNAEAN----------------------VNE 1807
            ........||||||||||||||| .|:|...|...|.|.|                      :|.
Mosquito  2108 NDAQPPPPGLLETFAAIARRRTSGSGSNSNSNANNNNENNNAASHPSSSSSSSSQQTTAAVPINN 2172

  Fly  1808 HGDQNASGSFLG------------------HSVTSLVKLALSSNFHSGLLSTAQSYPSLSSNNSE 1854
            ....:.:|:.:|                  :||||||||||||  |:||||||||||||.|::|.
Mosquito  2173 QLISSGAGALVGGGGGGVLQNNSNFFPRGPNSVTSLVKLALSS--HTGLLSTAQSYPSLFSSSSN 2235

  Fly  1855 NIAP-------SNPSNTSAGQQSASTINHTLTMSLTSTSSDSEQVSLEDFLESCRAPALLGDLDD 1912
            |.|.       :|.:|...|....:.:|..||||||||||||||||||||||.||||.|||||:|
Mosquito  2236 NNAAAGQGAGNNNNANNMVGVGQVNPLNPALTMSLTSTSSDSEQVSLEDFLEQCRAPTLLGDLED 2300

  Fly  1913 EDDMDEDNDEEENEDEYEEVGNTLLQVMVSRNLLTFMDDEAMENRLVGVTKRKSWDDEFVLKRQF 1977
            ::|::::||::|||||||||||||||||||||||:||::...||||....|||||||||||||||
Mosquito  2301 DEDIEDENDDDENEDEYEEVGNTLLQVMVSRNLLSFMEERTFENRLPTAGKRKSWDDEFVLKRQF 2365

  Fly  1978 SALIPAFDPRPGRTNVNQTSDLEISPLGAE------------------LPKP---QQSGGPETIE 2021
            ||||||||||||:|||||||||:|...|:.                  ||:|   |.|....::.
Mosquito  2366 SALIPAFDPRPGKTNVNQTSDLDIPAPGSNSATDPTEQPQSSSSGRGALPEPGSGQSSTAISSLP 2430

  Fly  2022 QPLLGLKLRGPGIGGIPEVEIDLSNTDWTIFRAVQELLQCSQLNKLDKFRKIWEPTYTIVYREVS 2086
            ||.|.|.||||.|.|:.:||:||:.:|||||||||||:..:.:.|.|||||||:|||||:|||.|
Mosquito  2431 QPTLSLILRGPNINGVNDVEVDLTQSDWTIFRAVQELMLQTTMPKQDKFRKIWQPTYTIIYREAS 2495

  Fly  2087 PEAQESTC--------LESEEFPQTPDV---SSKSGASTLSPNSPM------------------- 2121
            |.:..|..        ...||...||.:   |.:|..|||||:||:                   
Mosquito  2496 PGSSSSLLGGGGKEDFSSGEEGRATPIISMYSQRSHGSTLSPSSPVPGTPSLSGGGGAGGTGASS 2560

  Fly  2122 ---------HIGFNVADNNLCSVDDVLELLTQINGLNQS----------EIDSDVKEHGVSVLSE 2167
                     ..|........|||:|||:||:|:|.:|||          .:..||:.|   .||.
Mosquito  2561 GGALSSAPGTGGNQQQQQQYCSVEDVLQLLSQLNSINQSLAATPTNNDKNLMPDVESH---YLSP 2622

  Fly  2168 DLFISKKITNKLQQQIQDPLVLASNALPNWCENLNQSCPFLFPFETRQLYFNCTSFGASRSIVCL 2232
            |:|:||||||||||||||||||:|.:||.|||..||:||||||||||||||:||:||||||||.|
Mosquito  2623 DVFMSKKITNKLQQQIQDPLVLSSGSLPKWCEEYNQTCPFLFPFETRQLYFSCTAFGASRSIVWL 2687

  Fly  2233 QSQRDVTVERQRIPIMSPRR-DDHEFRIGRLKHERVKVPRNEDLLMWAMQVMKTHCNRKSVLEVE 2296
            ||||||::||||.|.:|||. |..|||:||||||||||||.|:||.||.||||.|||||||||||
Mosquito  2688 QSQRDVSLERQRAPGLSPRHADQQEFRVGRLKHERVKVPRGENLLDWAQQVMKVHCNRKSVLEVE 2752

  Fly  2297 FLDEEGTGLGPTLEFYALVAAEIQRSDLCMWLCDDDLGEDTENSTQSAEGNSKPVGYYVNRREHG 2361
            |:.|||||||||||||||||||:|||||.||||||:..:..|:.....|| |||||||| ||..|
Mosquito  2753 FVGEEGTGLGPTLEFYALVAAELQRSDLGMWLCDDEEPKLIEDEIDLGEG-SKPVGYYV-RRSTG 2815

  Fly  2362 IFPAPLPQNSEICENVLKYFWFFGVFVAKVLQDMRLVDIPLSTSFLQLLCHNKVLSRNLQKVISD 2426
            :|||||||:|:|.|:|..||||.|||:||||||.||||:|||.||||||.|::.::|.     :.
Mosquito  2816 LFPAPLPQDSDISEDVSGYFWFLGVFLAKVLQDNRLVDLPLSNSFLQLLSHSRSMARG-----AT 2875

  Fly  2427 RRNGDL-------------SVVSEDSDIVETCTKLLRTDSNKSNA--------FGGILSLENLKE 2470
            .:.|.|             |::|||||    ..:.|..||.:|..        :.|||:.|||:|
Mosquito  2876 SQTGSLLGKSGVSDDIMMSSILSEDSD----RDRDLLVDSYQSKMAMASDGAWYDGILTQENLQE 2936

  Fly  2471 IDPTRYQFLQEMQNLLLRKQSIEFDDTISAEKKHELINELKLQTQNGLEVSLEDLALTFTYLPSS 2535
            |||.|||||:|:|.|:.:||:||.:|.:|:|:|.:.|:||||.|:.|. |:||||||||||||||
Mosquito  2937 IDPIRYQFLRELQELVQQKQAIEQNDALSSEEKLQQISELKLNTKTGC-VALEDLALTFTYLPSS 3000

  Fly  2536 SIYGYTQAELLPNGSSVNVTIDNLEAYCELLMNFILQDGIAQQMKAFSDGFNEVFPLKKLAAFTP 2600
            ..|||..|:|||||::::|||:|:|.||.|.:.|.||:|||:|:.||..||.|||.|.|||||||
Mosquito  3001 RNYGYASADLLPNGANIDVTINNVEEYCNLTVAFCLQEGIAKQLAAFHRGFCEVFALNKLAAFTP 3065

  Fly  2601 SEARMMICGEQFPHWSREDIISYTEPKLGYNKDSPGFQRFVNVLLSMSGDERKAFLQFTTGCSSL 2665
            .|.|.|:||||.|.|:||||::||||||||.|:||||.||||||:.|:|.|||||||||||||||
Mosquito  3066 DEIRKMLCGEQNPEWTREDIMTYTEPKLGYTKESPGFLRFVNVLMGMNGSERKAFLQFTTGCSSL 3130

  Fly  2666 PPGGLANLHPRLTVVRKVDAGVGSYPSVNTCVHYLKLPDYPTEEIMKERLLTATKEKGFHLN 2727
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|:|::|||||||||||||||
Mosquito  3131 PPGGLANLHPRLTVVRKVDAGEGSYPSVNTCVHYLKLPDYPNEQILRERLLTATKEKGFHLN 3192

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Ufd4NP_609369.1 ANKYR <375..>509 CDD:440430 115/133 (86%)
ANK repeat 393..420 CDD:293786 23/26 (88%)
ANK repeat 422..453 CDD:293786 28/30 (93%)
ANK repeat 455..484 CDD:293786 24/28 (86%)
Sad1_UNC 1173..1298 CDD:474037 100/124 (81%)
MIB_HERC2 1333..1390 CDD:461991 46/58 (79%)
HECTc 2265..2725 CDD:238033 312/480 (65%)
Ufd4XP_061518162.1 None

Return to query results.
Submit another query.