DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ufd4 and hectd1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_609369.1 Gene:Ufd4 / 34378 FlyBaseID:FBgn0032208 Length:2727 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_009291386.1 Gene:hectd1 / 100002034 ZFINID:ZDB-GENE-030616-153 Length:2585 Species:Danio rerio


Alignment Length:2890 Identity:1401/2890 - (48%)
Similarity:1795/2890 - (62%) Gaps:468/2890 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MGDVDPETLLEWLSMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFESCPPRTFLPALCKIFLDEL 65
            |.||||:||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||.
Zfish     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65

  Fly    66 APENVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVSIDGAIKAICNHLVVADLSSRTSRDLAEQCIKVLELI 130
            ||:|||||||||||||||||||||||||.:||||||:||.|||.:|::||||||||||:||||||
Zfish    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130

  Fly   131 CTREAGAVFEGGGLNCVLSFIRDCGSQVHKDTLHSAMSVVSRLCTKVEPNTPCIQNCVESLSTLL 195
            ||||:|||||.||||||||||||.|..||||||||||:||||||:|:||....::.||||||:||
Zfish   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLSFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCSKMEPQDSSLETCVESLSSLL 195

  Fly   196 QHEDPMVSDGALKCFASVADRFTRKWVDPAPLAEYGLTTELLKRLQSVGGNTHSSLTAAGTQPTS 260
            :|||..||||||:||||:||||||:.|||||||::|||.|||.|:.:.||      ||:|  |:|
Zfish   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGG------TASG--PSS 252

  Fly   261 SSQPAATTNSDAINENVAGTATISNSTKVKSSDAAASPQSISTTISLLSTLCRGSPSITHDILRS 325
            :.:|..|::..|.:   |..:.:||              .:||.:|||||||||||.:|||:|||
Zfish   253 TCKPGRTSSGAAPS---AADSKLSN--------------QVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRS 300

  Fly   326 QLADALERALQGDERCVLDCMRFADLLLLLLFEGRQALNRGSNNPNQGQLAPRPRRNNTNTDRTH 390
            :|.|::|.|||||||||||.||..||||:||||||:||.: |...:.|:: |..||.:::.:|:|
Zfish   301 ELPDSMESALQGDERCVLDTMRLVDLLLVLLFEGRKALPK-STAGSTGRI-PGLRRLDSSGERSH 363

  Fly   391 RQLIDCIRSKDSEALREAIESGGIDVNCMDDVGQTLLNWASAFGTLEMVEYLCEKGADVNKGQRS 455
            |||||||||||::||.:||::|..:||.|||||||||||||||||.||||:|||:|||||:||||
Zfish   364 RQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVNFMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRS 428

  Fly   456 SSLHYAACFGRPAIAKILLKFGAYPDLRDEDGKTPLDKARERLDDGHREVAAILQSPGEWMSPDH 520
            ||||||||||||.:||.||:.||.||||||||||||||||||   ||.||.|||||||:||.|  
Zfish   429 SSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDLRDEDGKTPLDKARER---GHSEVVAILQSPGDWMCP-- 488

  Fly   521 SLLNK--DGKKYTL-------MEPRGDPEMAPIYLKVLLPIFCRTFLGSMLGSVRRASLALIKKI 576
              :||  |.||..:       .||:|||||||||||.|||:|.:||..:||.|:|:||||||:|:
Zfish   489 --VNKGDDKKKKDVNKEEEEGSEPKGDPEMAPIYLKRLLPVFAQTFQQTMLPSIRKASLALIRKM 551

  Fly   577 VQYAYPTVLQSLSETSFSEDAASTSGQNGGNLLIEVIASVLDNEDDGDGHLIVLNIIEEIMCKTQ 641
            |.|:        ||....|...|.:|.|...:|:|:.|:|||.|||.||||:.|.||.:::.|..
Zfish   552 VHYS--------SEVLLKEVCDSDAGHNLPTVLVEITATVLDQEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGG 608

  Fly   642 EEFLDHFARLGVFAKVQALMDTDAEELYVQLPGTVEEPAAAQRSSTSVVVAPRPTSDDPMEDAKE 706
            :.|||..|||||..||..|....:::       ..||.|..::            .|:|.|||||
Zfish   609 DVFLDQLARLGVINKVSTLAGPTSDD-------ENEEEAKPEK------------DDEPQEDAKE 654

  Fly   707 ILQGKPYHWREWSICRGRDCLYVWSDSVALELSNGSNGWFRFIIDGKLATMYSSGSPENGNDSSE 771
            |.||||||||:|||.|||||||:|||:.|||||||||||||||:||||||||||||||.|:||||
Zfish   655 IQQGKPYHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGSDSSE 719

  Fly   772 NRGEFLEKLMRARSCVIAGVVSQPILPTASALRLVVGNWVLQSQKTNQLQIHNTEGHQVTVLQDD 836
            :|.||||||.||||.|.....|||||.|....:|.||||.|...|..::.|||::|.|.|:|::|
Zfish   720 SRSEFLEKLQRARSQVKPVTASQPILSTQGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATILKED 784

  Fly   837 LPGFIFESNRGTKHTFSAETVLGPDFASGWSTAKKKRNKSKTEGQKFQVRNLSREIYNKYFKSAQ 901
            ||||:|||||||||:|:|||.||.:|.:||:..:.::.|||.|..|.:|:.::|::|:.:||:.:
Zfish   785 LPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVKTMARDLYDDHFKAVE 849

  Fly   902 IIPRGAVAILTDIVKQIELSFE----EQHMAPNGNWETTLTDALMKLSQLIHEDGVVSAYEMHSS 962
            .:|||.|..|.:|..|:|.::|    .|.:.....|...:..||..|..::.::..:|.|||.||
Zfish   850 SMPRGVVVTLRNIATQLESAWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVVLKDENTISPYEMCSS 914

  Fly   963 GLVQALVAVLS------VNHWETNSPRCKRNKMQKQRVSVFKKCILEDNVESATNKPRTKSTASI 1021
            ||||||..|||      :.|      .|   |...:|::|||....|:  |...::|     |..
Zfish   915 GLVQALFTVLSNSVELDIKH------DC---KPLMERINVFKTAFTEN--EDDESRP-----AVA 963

  Fly  1022 LIQKLVSVLESTEKLPVYLYDSPCTGYSLQILQKRLRFRLERAECESTLFDRSGRTLKMEPLATI 1086
            ||:||::||||.|:||::|||:|.:.|:||||.:|||||||||..|:.|.||:||.||||||||:
Zfish   964 LIRKLIAVLESIERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATV 1028

  Fly  1087 GQLSKYLLKMVAKQWYDLDRSTYFYLKKIREHRTATVFTHSFDFDEEGLLFYIGSNAKTC-DWVN 1150
            ..|.:||||||||||||.|||::.:::|:||.:..| |.|..||||.|::::||:||||. :|||
Zfish  1029 ESLEQYLLKMVAKQWYDFDRSSFIFVRKLREGQNFT-FRHQHDFDENGIVYWIGTNAKTAYEWVN 1092

  Fly  1151 PAQYGLVQVTSSEGKTLPYGKLEDILSRDSISLNCHTKDNKKAWFAIDLGVYIIPTAYTLRHARG 1215
            ||.||||.||||||:.||||:|||||||||.:|||||.|:|.||||||||::.:|:|||||||||
Zfish  1093 PAAYGLVVVTSSEGRNLPYGRLEDILSRDSSALNCHTNDDKNAWFAIDLGLWFVPSAYTLRHARG 1157

  Fly  1216 YGRSALRNWLLQGSKDGSTWTTLSTHVDDKSLVEPGSTATWPINCATDDSVWYRHIRIQQNGRNA 1280
            |||||||||:.|.||||..|.||.|||||.||.|||||||||::.:.|:...:|||||:|.|:||
Zfish  1158 YGRSALRNWVFQVSKDGQNWMTLYTHVDDSSLNEPGSTATWPLDPSKDEKQGWRHIRIKQMGKNA 1222

  Fly  1281 SGQTHYLSLSGFEIYGRVVGVADD-IGKSVKEAEAKTRRERRQIRAQ-LKHMTTGARVIRGVDWR 1343
            |||||||||||.||||.|.||.:| :||:||||||..||:||..|:| :|::..||||:||:||:
Zfish  1223 SGQTHYLSLSGLEIYGTVTGVCEDQLGKAVKEAEANLRRQRRLFRSQVMKYIVPGARVVRGIDWK 1287

  Fly  1344 WEEQDG--CAEGTITGEIHNGWIDVKWDHGVRNSYRMGAEGKYDLKLADCEYLSAFDGNQSMGSA 1406
            |.:|||  ..|||:|||.|||||||.||.|..||||||||||:|||||     ..:|...:    
Zfish  1288 WRDQDGNPAGEGTVTGEAHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLA-----PGYDPESA---- 1343

  Fly  1407 STAAKPSEKGGNTLTSRKSSSTPSLPEATEKNQNPE-GASNQTVSADNLAWKQTVETIAENVFAS 1470
                 ||.|.    .|...:.||....:..||..|: |.|:.|..|                   
Zfish  1344 -----PSPKP----VSSTVAGTPQSWSSLVKNNCPDKGGSSSTAGA------------------- 1380

  Fly  1471 AKTQIISNQLAMNTSSSREARAKHKESGTNQMHKDNISGPSPLSRELEHISDLSAINNSMPAINS 1535
                         :||||:.                                             
Zfish  1381 -------------SSSSRKG--------------------------------------------- 1387

  Fly  1536 SNVSDLATISENLSLTELSKENICRVLTPSYKPAESVTASQSSSHPDVQSSSPRENDIKNISNIE 1600
                              |..::|.|                :|..|:..||.|..  :.:.::.
Zfish  1388 ------------------SSSSVCSV----------------ASSSDISLSSTRVE--RRVESLF 1416

  Fly  1601 ENNKMNANNSVNKISKDLLANLRTSNIAGCPPVTQLSTEALEMIDKMRDGVDMIRNMSNSILSTD 1665
            |..                     ..:.|.||..: ..|.:.::.....|    ...|.|.|:.|
Zfish  1417 EQG---------------------VGVIGGPPGAE-GQEPIVVLSSAEAG----SASSTSTLTAD 1455

  Fly  1666 TFPVPCTNVPVGG---KKTPKAQALINPDNANQKQ---------IIVTSEEFP--TKSSKKPSVT 1716
            |          |.   :|||      .||...|..         :.|:|.:..  ::||.|.:.:
Zfish  1456 T----------GSESERKTP------GPDGTRQSAESTAISMGIVSVSSPDVSSVSESSSKDAAS 1504

  Fly  1717 LKP-AQQPNAVLSIVDIKEQPISNENVSVPSQMSISVPNLTTTSASEVPSTSEVATHTGLLETFA 1780
            .:| ....:|.||:..:..       ...|...|.|||||::..||             |:|:| 
Zfish  1505 QRPLCSATSARLSVSSLLA-------AGAPMSSSASVPNLSSREAS-------------LMESF- 1548

  Fly  1781 AIARRRTSQGTNIQDNQIMNAEANVNEHGDQNASGSFLGHSVTSLVKLALSSNFHSGLLSTAQSY 1845
             :.|......||..:|.      |::.....|.:.: ||.:|.|..         :..|..|||:
Zfish  1549 -VRRAPNMSRTNATNNM------NLSRSSSDNNTNT-LGRNVMSTA---------TSPLMGAQSF 1596

  Fly  1846 PSLSSNN-------SENIAPS--NPSNTSAGQQSASTINHTLTMSLTSTSSDSE-----QVSLED 1896
            |:|::..       |.:|..|  |.:..:.|......:::|||.|||||||:|:     :.||.|
Zfish  1597 PNLTTTGTTSTVTMSTSIVTSSNNVATATTGLSVGQLLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEFSLYD 1661

  Fly  1897 FLESCRAPALLGDLDDEDDMDE-DNDEEENED------EYEEVGNTLLQVMVSRNLLTFMDDEAM 1954
            ||:||||..||.:||||:|:.| |:|::||||      |||||   |::..|:......:..|..
Zfish  1662 FLDSCRANTLLAELDDEEDLPEPDDDDDENEDDNQEEQEYEEV---LVRSRVNLGYHVHIHREEE 1723

  Fly  1955 ENRLVGVTKRKSWDDEFVLKRQFSALIPAFDPRPGRTNVNQTSDLEISPLGAELPKPQQSGGPET 2019
            |....| .:|::|||:||||||||||:||||||||||||.||:||||.|.|.  |:.:.....|.
Zfish  1724 EYETKG-GRRRTWDDDFVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGT--PRSEVQEEVEC 1785

  Fly  2020 IEQPLLGLKLRGPGIGGIPEVEIDLSNTDWTIFRAVQELLQ--CSQLNKLDKFRKIWEPTYTIVY 2082
            ...|.|.|.|:..|:|...|||:.|:|...|||..||:|||  |:...|.||.|:||||||||:|
Zfish  1786 APSPRLALILKVAGLGTTREVELPLTNYKSTIFYYVQKLLQLSCNGAIKPDKLRRIWEPTYTIMY 1850

  Fly  2083 REV--SPEAQES---TC---------LESEEFPQTPDV-------------------SSKS---- 2110
            ||:  |.:.:||   .|         |.::|.|:...:                   |:||    
Zfish  1851 RELKDSDKERESGKMGCWSVEHVEQYLGTDELPKNDLITYMQKNADSTFLRHWKLTGSNKSIRKN 1915

  Fly  2111 -----------------------GASTLSPNSPMHI------------GFNVADNNLCSVDDVLE 2140
                                   .:.|||......|            |   :..:.|||:|||:
Zfish  1916 RNCSQLIAAYKDFCERGCRSSGLSSGTLSTTQSCDILSAAREQAQAKAG---SGQSACSVEDVLQ 1977

  Fly  2141 LLT---QINGLNQS--EIDSDVKEHGVSVLSEDLFISKKITNKLQQQIQDPLVLASNALPNWCEN 2200
            ||.   .|.|...|  .:..||:|...:...|: |.|||||.|:.|||::||.|||.|||:|||.
Zfish  1978 LLRILFTIGGEPTSGRTLQEDVEELQFNASPEE-FTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQ 2041

  Fly  2201 LNQSCPFLFPFETRQLYFNCTSFGASRSIVCLQSQRDVTVERQRIPIMSPRRDD-HEFRIGRLKH 2264
            |...||||.|||||||||.||:|||||:||.||::|:.|:||.| |..:.|||| .|||:|||||
Zfish  2042 LTSKCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATMERSR-PSTTVRRDDPGEFRVGRLKH 2105

  Fly  2265 ERVKVPRNEDLLMWAMQVMKTHCNRKSVLEVEFLDEEGTGLGPTLEFYALVAAEIQRSDLCMWLC 2329
            |||||||.|.::.||..||:.|.:|||||||||..|||||||||||||||||||.||:.|.:|||
Zfish  2106 ERVKVPRGESMMEWAESVMQIHADRKSVLEVEFQGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTSLGIWLC 2170

  Fly  2330 DDDLGEDTENSTQSAEGNSKPVGYYVNRREHGIFPAPLPQNSEICENVLKYFWFFGVFVAKVLQD 2394
            |||..:| |:......|..||.|||| :|..|:||||.||:|:..|.:.|.|.|.|:|:||.:||
Zfish  2171 DDDFPDD-ESRQVDLGGGLKPPGYYV-QRSCGLFPAPFPQDSDELERITKLFLFLGIFLAKCIQD 2233

  Fly  2395 MRLVDIPLSTSFLQLLCHNKVLSRNLQKVISDRR-------------------NGDLSVVSEDSD 2440
            .||||:|:|..|.:|||...:.| |:.|::...|                   ....||.|.|.|
Zfish  2234 NRLVDLPISQPFFKLLCMGDIKS-NMSKLLYQTRGESDCHFSEIQSEASTEEGQDTYSVGSFDED 2297

  Fly  2441 IVETCTKLLRTDSNKSNA-FGGILSLENLKEIDPTRYQFLQEMQNLLLRKQSIEFDDTISAEKKH 2504
              .....:|.....|..| :.|||:.|:.:.::|.|..||:|::.|.::::.|..:.::|.::|:
Zfish  2298 --SKSEFILDPPKPKPPAWYHGILTWEDFELVNPHRALFLKELKALSVKRRQILGNKSLSEDEKN 2360

  Fly  2505 ELINELKLQTQ--NGLEVSLEDLALTFTYLPSSSIYGYTQAELLPNGSSVNVTIDNLEAYCELLM 2567
            ..:.:|.|:..  :|..:.:|||.|.|.:.|||.::|::..:|.|||....||:||.|.|.||:.
Zfish  2361 TRLQDLMLKNPMGSGPPLCVEDLGLNFQFCPSSKVHGFSSVDLKPNGEDEMVTMDNAEEYVELMF 2425

  Fly  2568 NFILQDGIAQQMKAFSDGFNEVFPLKKLAAFTPSEARMMICGEQFPHWSREDIISYTEPKLGYNK 2632
            :|.:..||.:||:||.:|||:|||::||::|:..|.:|::||.|.|.|:.|||::||||||||.:
Zfish  2426 DFCMHTGIQKQMEAFREGFNKVFPMEKLSSFSHKEVQMILCGNQSPSWTAEDIVNYTEPKLGYTR 2490

  Fly  2633 DSPGFQRFVNVLLSMSGDERKAFLQFTTGCSSLPPGGLANLHPRLTVVRKVDAGVGSYPSVNTCV 2697
            |||||.|||.||..||.||||||||||||||:||||||||||||||:||||||...|||||||||
Zfish  2491 DSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTIVRKVDATDASYPSVNTCV 2555

  Fly  2698 HYLKLPDYPTEEIMKERLLTATKEKGFHLN 2727
            ||||||:|.:||||:||||.||.|||||||
Zfish  2556 HYLKLPEYSSEEIMRERLLAATMEKGFHLN 2585

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Ufd4NP_609369.1 ANK repeat 393..420 CDD:293786 16/26 (62%)
ANK 396..509 CDD:238125 87/112 (78%)
ANK repeat 422..453 CDD:293786 26/30 (87%)
ANK repeat 455..484 CDD:293786 22/28 (79%)
F5_F8_type_C 1173..1298 CDD:329041 91/124 (73%)
MIB_HERC2 1333..1389 CDD:310955 41/57 (72%)
DamX 1576..>1725 CDD:330571 29/163 (18%)
HECTc 2265..2725 CDD:238033 246/481 (51%)
hectd1XP_009291386.1 Ank_2 366..457 CDD:289560 70/90 (78%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 16/26 (62%)
ANK 369..479 CDD:238125 87/112 (78%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 25/29 (86%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 22/28 (79%)
F5_F8_type_C 1107..1240 CDD:304887 96/132 (73%)
MIB_HERC2 1277..1335 CDD:284184 41/57 (72%)
HECTc 2106..2583 CDD:238033 246/481 (51%)
HECTc 2130..2582 CDD:214523 232/456 (51%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C170587059
Domainoid 1 1.000 633 1.000 Domainoid score I163
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H9115
Inparanoid 1 1.050 2247 1.000 Inparanoid score I35
OMA 1 1.010 - - QHG52632
OrthoDB 1 1.010 - - D10145at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006411
OrthoInspector 1 1.000 - - oto40488
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_107049
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45670
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R3704
SonicParanoid 1 1.000 - - X4675
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
ZFIN 00.000 Not matched by this tool.
1413.940

Return to query results.
Submit another query.