Protein Alignment Npc1a and ptr-11

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609357.2
• Gene: Npc1a / 34358
• FlyBaseID: FBgn0024320
• Length: 1287
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_490687.1
• Gene: ptr-11 / 171609
• WormBaseID: WBGene00004225
• Length: 820
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 959
• Identity: 192/959 - (20%)
• Similarity: 368/959 - (38%)
• Gaps: 236/959 - (24%)

  Fly   350 ASNPGLTLIAGASLVVILGYGINFIEITTDPVKLWASPNS----KSRLEREFFDTKFSPFYRLEQ 410
            |:.|..:::.....:::|..|:..|.:..|..|.::..:|    ::|:..|::.....|......
 Worm    15 AAYPVYSILLSILSILVLSSGLVHIRLEPDIRKAFSPDDSDAGYETRVWLEYYGLDIYPERAFCI 79

  Fly   411 IIIKAVNLPQIVHNTSNGPYTFGPVFDREFLTKVLDLQEGIKEINANGTQLKDICYAPLSDDGSE 475
            ...|..|...:........||   |.:|  |:..:..|:|....|.:          ||.|..|.
 Worm    80 FTAKRENSSILQEGALADIYT---VDNR--LSAAVGYQDGDGRKNCD----------PLCDLNSP 129

  Fly   476 IDVSQCVVQSIWGYFGDDRERLDDHDEDNGFN--VTYLDALYDCISNPYLCLAPYGGPVDPAIAL 538
            ..:...:.:                 .:||..  .||.|             .||.| :|..:.|
 Worm   130 FHLLANLTR-----------------RNNGTTSVFTYPD-------------MPYSG-LDIFLGL 163

  Fly   539 ----GGFLPPGDQLTGSTKFELANAIILTFLVKNHHNKTDLENALTWEKKFVEFMTNYTKNNMSQ 599
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 Worm   164 HLSNADFEPPTERISSKS------------LVLWYFSRSDTPEGKLAFKDAIDELFQLSKNS-SA 215

  Fly   600 YMDIAFT--SERSIEDELNRESQSDVLTILVSYLIMFMYIAISLGHVKEFKRVFIDSKITLGIGG 662
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 Worm   216 FEHVQFTIFSDQVANREMIRGAIEATTLMTIGFFLLLTQVIIVIVRLSSVKMAFY-----LVATS 275

  Fly   663 VIIVLASVVSSVGVFGYIGLPATLIIVEVIPFLVLAVGVDNIFILVQTHQRDQRKPNETLEQQVG 727
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 Worm   276 LLTPMAATVASFGAICWMGFP-SFSIQCVTPFLVLGIGVDDAFILL--HRWKHHIAITDTPRRLE 337

  Fly   728 RILGKVGPSMLLTSLSESFCFFLGGLSDMPAVRAFALYAGVALIIDFLLQITCFVSLFTL----D 788
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 Worm   338 QVIVDVGPSITITSLTNIIAFGIGFLTPTPQMSLFCLTASLALLLDYIFTYTILAPIVFLCNDPD 402

  Fly   789 TK------RREENRMD--------ICCFIKGKKPDSITSNEGLLYKFFSSVYVPFLMK------- 832
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 Worm   403 YKSIANETEPKISRADTWLSKYSSFVCSVKGR----VACIMVLLGMYALTTYGVVTMKTTFEPAK 463

  Fly   833 ------KIV--RASVMVIFFAWLCFSIAI--APRIDIGLDQELAMPQDSFVLHYFQSLNENLNIG 887
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 Worm   464 AFPSNSKLVDSLSNIKPVFNRYFPITVIVNNPPNIEIKAE------YDS-----FNNMMDRLEHV 517

  Fly   888 PPVYFVLKGDLAYTNSSDQNLVCAGQYCNDDSVLTQIYLASRHSNQTYIARPASSWIDDYFDWAA 952
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 Worm   518 PGI----RGD-------NRSLIFLPQYVNFDKTMNIL----------------STLVGE------ 549

  Fly   953 AASSCCKYRKDSGDFCPHQDTSCLRCNITKNSLLRPEEKEFVKYLPFFLK--DNPDDTCAKAGHA 1015
                  |||       |..|.                       ||.::.  .||.
 Worm   550 ------KYR-------PSYDN-----------------------LPTWMDAIGNPP--------- 569

  Fly  1016 AYGGAVRYSNSHERLNIEASYFMAYHTIL-KSSADYFLALESARKISANITQMLQGRLMSNGVPM 1079
                .|:|....:...|..::.:   |:| |..:::   .|.||.:. :|..:|......|
 Worm   570 ----LVKYHMGDDNKTIVTAFRL---TLLGKGMSEW---AERARAMQ-HIRTILHEESQFN---- 619

  Fly  1080 ASALTVEVFPYSVFYVFYEQYLTMWSDTLQSMGISVLSIFVVTFVLMGFDVHSALVVVITITMIV 1144
            |:....:....|:.       ||:.:|.:.|:.::|:.:.:|.||.:. :.::..|:...|..|.
 Worm   620 ATLFDCDSAILSII-------LTVGTDLIGSIAVTVVCMAIVCFVFIA-NFNAVAVITSVIASIC 676

  Fly  1145 VNLGGLMYYWNISLNAVSLVNLVMAVGISVEFCSHLVHSFATSKSVSQIDRAADSLSKMGSSIFS 1209
            ..|.|.:..|...|:.|..|::::|.|.||::.:|:.::|..::...| :|...||::|...:..
 Worm   677 YVLVGGLSLWGADLDPVIQVDVLLATGFSVDYTAHVAYNFFRARGTPQ-ERVYSSLAEMAMPMCE 740

  Fly  1210 GITLTKFAGILVLAFAKSQIFQVFYFRMYLGIVVIGAAHGLIFLPVLLS 1258
            . .|:.|..:|.|.|..:.....|...::| :|.||..|||..|||:|:
 Worm   741 A-GLSTFLCMLPLIFVPTYAIVCFAKTVFL-VVAIGLLHGLFILPVILA 787

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Npc1a	NP_609357.2	2A060601	33..1261	CDD:273337	192/959 (20%)
ptr-11	NP_490687.1	Patched	35..791	CDD:308203	189/939 (20%)