DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KCNT2 and Kcnt2

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_006711357.1 Gene:KCNT2 / 343450 HGNCID:18866 Length:1142 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017454291.1 Gene:Kcnt2 / 304827 RGDID:735074 Length:1167 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1167 Identity:1113/1167 - (95%)
Similarity:1129/1167 - (96%) Gaps:25/1167 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVDLESEVPPLPPRYRFRDLLLGDQGWQNDDRVQVEFYMNENTFKERLKLFFIKNQRSSLRIRLF 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MVDLESEVPPLPPRYRFRDLLLGDQGWQNDDRVQVEFYMNENTFKERLKLFFIKNQRSSLRIRLF 65

Human    66 NFSLKLLSCLLYIIRVLLENPSQGNEWSHIFWVNRSLPLWGLQVSVALISLFETILLGYLSYKGN 130
            |||||||||||||||||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 NFSLKLLSCLLYIIRVLLEKPSQGNDWSHIFWVNRSLPLWGLQVSVALISLFETILLGYLSYKGN 130

Human   131 IWEQILRIPFILEIINAVPFIISIFWPSLRNLFVPVFLNCWLAKHALENMINDLHRAIQRTQSAM 195
            |||||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 IWEQILRVPFILEIINAVPFIISIFWPTLRNLFVPVFLNCWLAKHALENMINDLHRAIQRTQSAM 195

Human   196 FNQVLILISTLLCLIFTC-------------------------ICGIQHLERIGKKLNLFDSLYF 235
            ||||||||||||||||||                         ||||||||||||||||||||||
  Rat   196 FNQVLILISTLLCLIFTCFTDKTREHMYHVTLGFTETLTFSQSICGIQHLERIGKKLNLFDSLYF 260

Human   236 CIVTFSTVGFGDVTPETWSSKLFVVAMICVALVVLPIQFEQLAYLWMERQKSGGNYSRHRAQTEK 300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 CIVTFSTVGFGDVTPETWSSKLFVVAMICVALVVLPIQFEQLAYLWMERQKSGGNYSRHRAQTEK 325

Human   301 HVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILCPTEMDVQVRRVLQIPMWSQRVIYLQGSAL 365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 HVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILCPTEMDVQVRRVLQIPMWSQRVIYLQGSAL 390

Human   366 KDQDLLRAKMDDAEACFILSSRCEVDRTSSDHQTILRAWAVKDFAPNCPLYVQILKPENKFHIKF 430
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 KDQDLLRAKMDNAEACFILSSRCEVDRTSSDHQTILRAWAVKDFAPNCPLYVQILKPENKFHIKF 455

Human   431 ADHVVCEEEFKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSRGQEGQQSPEQWQKMYGRCSGNEVYHIVLE 495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat   456 ADHVVCEEEFKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSRGQEGQQSPEQWQKTYGRCSGNEVYHIVLE 520

Human   496 ESTFFAEYEGKSFTYASFHAHKKFGVCLIGVRREDNKNILLNPGPRYIMNSTDICFYINITKEEN 560
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||::|||||||||||||
  Rat   521 ESTFFAEYEGKSFTYASFHAHKKFGVCLVGVRREDNKNILLNPGPRYIMNASDICFYINITKEEN 585

Human   561 SAFKNQDQQRKSNVSRSFYHGPSRLPVHSIIASMGTVAIDLQDTSCRSASGPTLSLPTEGSKEIR 625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||:||.||:|
  Rat   586 SAFKNQDQQRKSNVSRSFYHGPSRLPVHSIIASMGTVAIDLQDTSCRAASGPTLALPSEGGKELR 650

Human   626 RPSIAPVLEVADTSSIQTCDLLSDQSEDETTPDEEMSSNLEYAKGYPPYSPYIGSSPTFCHLLHE 690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat   651 RPSIAPVLEVADTSSIQTCDLLSDQSEDETTPDEETSSNLEYAKGYPPYSPYIGSSPTFCHLLQE 715

Human   691 KVPFCCLRLDKSCQHNYYEDAKAYGFKNKLIIVAAETAGNGLYNFIVPLRAYYRPKKELNPIVLL 755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 KVPFCCLRLDKSCQHNYYEDAKAYGFKNKLIIVAAETAGNGLYNFIVPLRAYYRPKKELNPIVLL 780

Human   756 LDNPPDMHFLDAICWFPMVYYMVGSIDNLDDLLRCGVTFAANMVVVDKESTMSAEEDYMADAKTI 820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 LDNPPDMHFLDAICWFPMVYYMVGSIDNLDDLLRCGVTFAANMVVVDKESTMSAEEDYMADAKTI 845

Human   821 VNVQTLFRLFSSLSIITELTHPANMRFMQFRAKDCYSLALSKLEKKERERGSNLAFMFRLPFAAG 885
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 VNVQTLFRLFSSLSIITELTHPANMRFMQFRAKDCYSLALSKLEKKERERGSNLAFMFRLPFAAG 910

Human   886 RVFSISMLDTLLYQSFVKDYMISITRLLLGLDTTPGSGFLCSMKITADDLWIRTYARLYQKLCSS 950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   911 RVFSISMLDTLLYQSFVKDYMISITRLLLGLDTIPGSGFLCSMKITEDDLWIRTYARLYQKLCSS 975

Human   951 TGDVPIGIYRTESQKLTTSESRKIASQSQISISVEEWEDTKDSKEQGHHRSNHRNSTSSDQSDHP 1015
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|:.|||||.|||||||||||||
  Rat   976 TGDVPIGIYRTESQKLTTSESREIASQSQISISVEEWEDTKDVKDPGHHRSIHRNSTSSDQSDHP 1040

Human  1016 LLRRKSMQWARRLSRKGPKHSGKTAEKITQQRLNLYRRSERQELAELVKNRMKHLGLSTVGYDEM 1080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 LLRRKSMQWARRLSRKGPKHSGKTAEKITQQRLNLYRRSERQELAELVKNRMKHLGLSTVGYDEM 1105

Human  1081 NDHQSTLSYILINPSPDTRIELNDVVYLIRPDPLAYLPNSEPSRRNSICNVTGQDSREETQL 1142
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||:|||||||||:|||||...|||||||||
  Rat  1106 NDHQSTLSYILINPSPDTRLELNDVVYLIRPDPLSYLPNSEPSRKNSICNAAVQDSREETQL 1167

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KCNT2XP_006711357.1 Ion_trans_2 <226..272 CDD:285168 45/45 (100%)
BK_channel_a 431..526 CDD:281490 92/94 (98%)
Kcnt2XP_017454291.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83686343
Domainoid 1 1.000 1189 1.000 Domainoid score I1033
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG3193
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H16121
Inparanoid 1 1.050 2240 1.000 Inparanoid score I1078
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG48024
OrthoDB 1 1.010 - - D14192at9347
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002662
OrthoInspector 1 1.000 - - oto142497
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103731
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10027
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1773
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1717.310

Return to query results.
Submit another query.