DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KCNT2 and Kcnt2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_006711357.1 Gene:KCNT2 / 343450 HGNCID:18866 Length:1142 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017175995.1 Gene:Kcnt2 / 240776 MGIID:3036273 Length:1174 Species:Mus musculus


Alignment Length:1174 Identity:1112/1174 - (94%)
Similarity:1127/1174 - (95%) Gaps:32/1174 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVDLESEVPPLPPRYRFRDLLLGDQGWQNDDRVQVEFYMNENTFKERLKLFFIKNQRSSLRIRLF 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MVDLESEVPPLPPRYRFRDLLLGDQGWQNDDRVQVEFYMNENTFKERLKLFFIKNQRSSLRIRLF 65

Human    66 NFSLKLLSCLLYIIRVLLENPSQGNEWSHIFWVNRSLPLWGLQVSVALISLFETILLGYLSYKGN 130
            |||||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 NFSLKLLSCLLYIIRVLLEKPSQGSEWSHIFWVNRSLPLWGLQVSVALISLFETILLGYLSYKGN 130

Human   131 IWEQILRIPFILEIINAVPFIISIFWPSLRNLFVPVFLNCWLAKHALENMINDLHRAIQRTQSAM 195
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 IWEQILRIPFILEIINAVPFIISIFWPTLRNLFVPVFLNCWLAKHALENMINDLHRAIQRTQSAM 195

Human   196 FNQVLILISTLLCLIFTC-------------------------ICGIQHLERIGKKLNLFDSLYF 235
            ||||||||||||||||||                         ||||||||||||||||||||||
Mouse   196 FNQVLILISTLLCLIFTCFTDKTRKHMYHVTLGFTETLTFSQSICGIQHLERIGKKLNLFDSLYF 260

Human   236 CIVTFSTVGFGDVTPETWSSKLFVVAMICVALVVLPIQFEQLAYLWMERQKSGGNYSRHRAQTEK 300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 CIVTFSTVGFGDVTPETWSSKLFVVAMICVALVVLPIQFEQLAYLWMERQKSGGNYSRHRAQTEK 325

Human   301 HVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILCPTEMDVQVRRVLQIPMWSQRVIYLQGSAL 365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 HVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILCPTEMDVQVRRVLQIPMWSQRVIYLQGSAL 390

Human   366 KDQDLLRAKMDDAEACFILSSRCEVDRTSSDHQTILRAWAVKDFAPNCPLYVQILKPENKFHIKF 430
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 KDQDLLRAKMDNAEACFILSSRCEVDRTSSDHQTILRAWAVKDFAPNCPLYVQILKPENKFHIKF 455

Human   431 ADHVVCEEEFKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSRGQ-------EGQQSPEQWQKMYGRCSGNE 488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||.||||||||
Mouse   456 ADHVVCEEEFKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSRGQCVCLCCREGQQSPEQWQKTYGRCSGNE 520

Human   489 VYHIVLEESTFFAEYEGKSFTYASFHAHKKFGVCLIGVRREDNKNILLNPGPRYIMNSTDICFYI 553
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||::||||||
Mouse   521 VYHIVLEESTFFAEYEGKSFTYASFHAHKKFGVCLVGVRREDNKNILLNPGPRYIMNASDICFYI 585

Human   554 NITKEENSAFKNQDQQRKSNVSRSFYHGPSRLPVHSIIASMGTVAIDLQDTSCRSASGPTLSLPT 618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||||:||:
Mouse   586 NITKEENSAFKNQDQQRKSNVSRSFYHGPSRLPVHSIIASMGTVAIDLQDTSCRATSGPTLALPS 650

Human   619 EGSKEIRRPSIAPVLEVADTSSIQTCDLLSDQSEDETTPDEEMSSNLEYAKGYPPYSPYIGSSPT 683
            ||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Mouse   651 EGGKELRRPSIAPVLEVADTSSIQTCDLLSDQSEDETTPDEETSSNLEYAKGYPPYSPYIGSSPT 715

Human   684 FCHLLHEKVPFCCLRLDKSCQHNYYEDAKAYGFKNKLIIVAAETAGNGLYNFIVPLRAYYRPKKE 748
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 FCHLLQEKVPFCCLRLDKSCQHNYYEDAKAYGFKNKLIIVAAETAGNGLYNFIVPLRAYYRPKKE 780

Human   749 LNPIVLLLDNPPDMHFLDAICWFPMVYYMVGSIDNLDDLLRCGVTFAANMVVVDKESTMSAEEDY 813
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 LNPIVLLLDNPPDMHFLDAICWFPMVYYMVGSIDNLDDLLRCGVTFAANMVVVDKESTMSAEEDY 845

Human   814 MADAKTIVNVQTLFRLFSSLSIITELTHPANMRFMQFRAKDCYSLALSKLEKKERERGSNLAFMF 878
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 MADAKTIVNVQTLFRLFSSLSIITELTHPANMRFMQFRAKDCYSLALSKLEKKERERGSNLAFMF 910

Human   879 RLPFAAGRVFSISMLDTLLYQSFVKDYMISITRLLLGLDTTPGSGFLCSMKITADDLWIRTYARL 943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||
Mouse   911 RLPFAAGRVFSISMLDTLLYQSFVKDYMISITRLLLGLDTIPGSGFLCSMKITEDDLWIRTYARL 975

Human   944 YQKLCSSTGDVPIGIYRTESQKLTTSESRKIASQSQISISVEEWEDTKDSKEQGHHRSNHRNSTS 1008
            |||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||.|:.|||||.||||||
Mouse   976 YQKLCSSTGDVPIGIYRTESQKLTTSESREIGSQSQISISVEEWEDTKDVKDPGHHRSLHRNSTS 1040

Human  1009 SDQSDHPLLRRKSMQWARRLSRKGPKHSGKTAEKITQQRLNLYRRSERQELAELVKNRMKHLGLS 1073
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1041 SDQSDHPLLRRKSMQWARRLSRKGPKHSGKTAEKITQQRLNLYRRSERQELAELVKNRMKHLGLS 1105

Human  1074 TVGYDEMNDHQSTLSYILINPSPDTRIELNDVVYLIRPDPLAYLPNSEPSRRNSICNVTGQDSRE 1138
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||:|||||||||:|||||...|||||
Mouse  1106 TVGYDEMNDHQSTLSYILINPSPDTRLELNDVVYLIRPDPLSYLPNSEPSRKNSICNAAVQDSRE 1170

Human  1139 ETQL 1142
            ||||
Mouse  1171 ETQL 1174

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KCNT2XP_006711357.1 Ion_trans 63..270 CDD:459842 203/231 (88%)
Ion_trans_2 206..272 CDD:462301 65/90 (72%)
BK_channel_a 432..526 CDD:460947 91/100 (91%)
Kcnt2XP_017175995.1 Ion_trans 63..295 CDD:459842 203/231 (88%)
Ion_trans_2 232..297 CDD:462301 57/64 (89%)
BK_channel_a 457..558 CDD:460947 91/100 (91%)

Return to query results.
Submit another query.