DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KCNT2 and kcnt2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_006711357.1 Gene:KCNT2 / 343450 HGNCID:18866 Length:1142 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031756908.1 Gene:kcnt2 / 100491762 XenbaseID:XB-GENE-6042495 Length:1157 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1117 Identity:992/1117 - (88%)
Similarity:1054/1117 - (94%) Gaps:1/1117 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    27 WQNDDRVQVEFYMNENTFKERLKLFFIKNQRSSLRIRLFNFSLKLLSCLLYIIRVLLENPSQGNE 91
            :.|..|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||:|||:|:.
 Frog    41 FDNGHRVQVEFYVNENTFKERLKLFFIKNQRSSLRIRLFNFSLKLLSCMLYIVRVLLDNPSKGDG 105

Human    92 WSHIFWVNRSLPLWGLQVSVALISLFETILLGYLSYKGNIWEQILRIPFILEIINAVPFIISIFW 156
            ||.|.|||||||:||:||:||||||||||||.|||||||||||:||||||||:||.|||||:|||
 Frog   106 WSSIIWVNRSLPVWGMQVTVALISLFETILLSYLSYKGNIWEQVLRIPFILEMINTVPFIITIFW 170

Human   157 PSLRNLFVPVFLNCWLAKHALENMINDLHRAIQRTQSAMFNQVLILISTLLCLIFTCICGIQHLE 221
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
 Frog   171 PPLRNLFVPVFLNCWLAKHALENMINDLHRAIQRTQSAMFNQVLILISTLLCLIFTCICGFQHLE 235

Human   222 RIGKKLNLFDSLYFCIVTFSTVGFGDVTPETWSSKLFVVAMICVALVVLPIQFEQLAYLWMERQK 286
            |.|.:|..|||||||||||||||||||||:.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||
 Frog   236 RAGNQLTFFDSLYFCIVTFSTVGFGDVTPKIWPSKLLVVIMICVALVVLPIQFEQLAYLWMERQK 300

Human   287 SGGNYSRHRAQTEKHVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILCPTEMDVQVRRVLQIP 351
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
 Frog   301 SGGNYSRHRAQTEKHVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILCPAEMDVQVRRVLQIP 365

Human   352 MWSQRVIYLQGSALKDQDLLRAKMDDAEACFILSSRCEVDRTSSDHQTILRAWAVKDFAPNCPLY 416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||::|||||||||||||||||||||
 Frog   366 MWSQRVIYLQGSALKDQDLLRAKMDDAEACFILSNRCEVDRTAADHQTILRAWAVKDFAPNCPLY 430

Human   417 VQILKPENKFHIKFADHVVCEEEFKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSRGQEGQQSPEQWQKMY 481
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   431 VQILKPENKFHVKFADHVVCEEEFKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSRGQEGQQSPEQWQKMY 495

Human   482 GRCSGNEVYHIVLEESTFFAEYEGKSFTYASFHAHKKFGVCLIGVRREDNKNILLNPGPRYIMNS 546
            |||||||||||.:|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:
 Frog   496 GRCSGNEVYHIKMEESIFFAEYEGKSFTYASFHAHKKFGVCLTGVRREDNKNILLNPGPRYIMNA 560

Human   547 TDICFYINITKEENSAFKNQDQQRKSNVSRSFYHGPSRLPVHSIIASMGTVAIDLQDTSCRSASG 611
            ||.||||::|||||||||.|::..|.:..:|.||||||||||||||||||||||||||:|.|:||
 Frog   561 TDTCFYIHVTKEENSAFKMQERVEKLSKYKSSYHGPSRLPVHSIIASMGTVAIDLQDTTCHSSSG 625

Human   612 PTLSLPTEGSKEIRRPSIAPVLEVADTSSIQTCDLLSDQSEDETTP-DEEMSSNLEYAKGYPPYS 675
            |||:||:|.|||.|||||||||||||.::||.||||||||||||.| |:|.|...||.|||||.|
 Frog   626 PTLTLPSECSKEGRRPSIAPVLEVADNAAIQPCDLLSDQSEDETNPEDDECSEAKEYLKGYPPNS 690

Human   676 PYIGSSPTFCHLLHEKVPFCCLRLDKSCQHNYYEDAKAYGFKNKLIIVAAETAGNGLYNFIVPLR 740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||||:||:||||||||||||||||||||
 Frog   691 PYIGSSPTFCHLLHEKVPFCCLRLDKGCQHNYYEDARAYGFRNKIIIVAAETAGNGLYNFIVPLR 755

Human   741 AYYRPKKELNPIVLLLDNPPDMHFLDAICWFPMVYYMVGSIDNLDDLLRCGVTFAANMVVVDKES 805
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||||||||:||||||||||||||||
 Frog   756 AYYRPKKELNPIILLLDNPPDMHFLDAICWFPMVYYMVGCIDNLDDLLKCGVTFAANMVVVDKES 820

Human   806 TMSAEEDYMADAKTIVNVQTLFRLFSSLSIITELTHPANMRFMQFRAKDCYSLALSKLEKKERER 870
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
 Frog   821 TMSAEEDYMADAKTIVNVQTLFRLFSSLSIITELTHPANMRFMQFRAKDCYSLALSKLEQKERER 885

Human   871 GSNLAFMFRLPFAAGRVFSISMLDTLLYQSFVKDYMISITRLLLGLDTTPGSGFLCSMKITADDL 935
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
 Frog   886 GSNLAFMFRLPFAAGRVFSISMLDTLLYQSFVKDYMISITRLLLGLDTTPGSGFLCSMKITEDDL 950

Human   936 WIRTYARLYQKLCSSTGDVPIGIYRTESQKLTTSESRKIASQSQISISVEEWEDTKDSKEQGHHR 1000
            |||||.|||||||||:||:||||||||.|||||||||::|||||||||||||||||:.|:|..::
 Frog   951 WIRTYGRLYQKLCSSSGDIPIGIYRTECQKLTTSESREMASQSQISISVEEWEDTKEMKDQTANK 1015

Human  1001 SNHRNSTSSDQSDHPLLRRKSMQWARRLSRKGPKHSGKTAEKITQQRLNLYRRSERQELAELVKN 1065
            :||||||||||||||||||||||||||||||.|:||.||||:|:|||:.|.||||||||||||||
 Frog  1016 NNHRNSTSSDQSDHPLLRRKSMQWARRLSRKVPRHSNKTAERISQQRMTLCRRSERQELAELVKN 1080

Human  1066 RMKHLGLSTVGYDEMNDHQSTLSYILINPSPDTRIELNDVVYLIRPDPLAYLPNSEPSRRNSICN 1130
            |||||||||.|||||||.|:||||||||||||||:||:|||||||||||:|:|.:.|||::|.||
 Frog  1081 RMKHLGLSTTGYDEMNDQQNTLSYILINPSPDTRLELSDVVYLIRPDPLSYVPANAPSRKSSFCN 1145

Human  1131 VTGQDSREETQL 1142
            .||.|||:||.|
 Frog  1146 TTGPDSRDETLL 1157

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KCNT2XP_006711357.1 Ion_trans 63..270 CDD:459842 178/206 (86%)
Ion_trans_2 206..272 CDD:462301 54/65 (83%)
BK_channel_a 432..526 CDD:460947 89/93 (96%)
kcnt2XP_031756908.1 Ion_trans <154..284 CDD:459842 114/129 (88%)
Ion_trans_2 220..286 CDD:462301 54/65 (83%)
BK_channel_a 446..540 CDD:460947 89/93 (96%)

Return to query results.
Submit another query.