DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LManVI and LManV

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609253.1 Gene:LManVI / 34206 FlyBaseID:FBgn0032069 Length:1007 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609252.1 Gene:LManV / 34205 FlyBaseID:FBgn0032068 Length:982 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1007 Identity:780/1007 - (77%)
Similarity:882/1007 - (87%) Gaps:25/1007 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MKYLCGIVLFVALLAISVRPSEEACGYEACPKTKTNMINIHMVPHSHDDVGWLKTVDQYFYGHRS 65
            ||:| ||||.||.||:..:.::..||||:|.:||:||||||:|||||||||||||||||:||||:
  Fly     1 MKFL-GIVLCVAFLALQAKSAQAVCGYESCHETKSNMINIHLVPHSHDDVGWLKTVDQYYYGHRN 64

  Fly    66 NIQHAGVQYIIDTVIAELIKDPARRFIQVETSFFAKWWAEQSETAKQVVRKLVNEGRLEFTGGAW 130
            |||||||||||||||:||||:|.|||||||||||:|||.|||||.:.||:.|||||||:|..|||
  Fly    65 NIQHAGVQYIIDTVISELIKNPDRRFIQVETSFFSKWWNEQSETMRAVVKMLVNEGRLQFINGAW 129

  Fly   131 SMNDEAAVNYQSVIDQFTLGLKFLDDTFGSCARPRIGWQIDPFGHSREQASIFAQMGYDGEFFAR 195
            ||||||||||||||||||:||||||||||.|.|||:||||||||||||||||:||||:|||||:|
  Fly   130 SMNDEAAVNYQSVIDQFTVGLKFLDDTFGVCGRPRVGWQIDPFGHSREQASIYAQMGFDGEFFSR 194

  Fly   196 MDHRDKNDRIDNLGMEMIWDASDSLSNDEIFTGLLYRHYSAPPGYCFDVHCGDDPIIDTKSYDNN 260
            |||.||..|:::|.:|||||||:|||..::||||||..|...||:||||||.||||||:.|||||
  Fly   195 MDHNDKGRRMNDLALEMIWDASESLSQVKLFTGLLYTFYWDTPGFCFDVHCSDDPIIDSDSYDNN 259

  Fly   261 VKSRVDDFLSYVTSVAQHYRSNHIMIPMGDDFQYEDAQVNFKNMDKLIKYVNERQAEGSTFNLFY 325
            ||||||||::|...||:.:|:||||||||.|||||||:||:||||||||||||||:.||.:|:.|
  Fly   260 VKSRVDDFIAYAAQVAEKFRTNHIMIPMGGDFQYEDAEVNYKNMDKLIKYVNERQSSGSKYNIIY 324

  Fly   326 STPACYLNSLHEGLQTWPNKTQDFFPYGSDDNSYWTGYFTSRPTQKRFERDGNHILQVAKQLSVF 390
            |||.|||||:|:.:|::||||.||||||||.||:||||:||||||||||||||||||||||||.|
  Fly   325 STPTCYLNSVHKSVQSYPNKTLDFFPYGSDTNSFWTGYYTSRPTQKRFERDGNHILQVAKQLSAF 389

  Fly   391 AELNTKQQKEDLEYLREIMGVMQHHDAITGTEKQHVSDDYDRILYDAILGGVNTARDGLRKLTNL 455
            |||::.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||.|.|||||||
  Fly   390 AELSSTQQKEDLEYLREIMGVMQHHDAITGTEKQHVSDDYDRILYDAIVGGVKTAGDALRKLTNL 454

  Fly   456 PNGEFESCLQLNISECAFTKDDADNVVVTLYNPLAHTSTQYVRVPVKNENYEVTDEKGRVVASEV 520
            |||||||||||||||||||||.||||||||||.||||:.||||||||||||:||||||||||||:
  Fly   455 PNGEFESCLQLNISECAFTKDGADNVVVTLYNALAHTTKQYVRVPVKNENYQVTDEKGRVVASEI 519

  Fly   521 VPVAWQVLALEFRNNDTQHELVFKASVDKIANYYIKKVASQETKNVAAHTKSKRSIKAEEANLEV 585
            |||..:|||||||::|||||||||||||||||||||||.|:|:.|      ..|.|...:||   
  Fly   520 VPVPAEVLALEFRDSDTQHELVFKASVDKIANYYIKKVDSKESSN------GVRVISQPKAN--- 575

  Fly   586 PKRFKKVHSLKNATETFDDDEGETVVQTSQVKLVIDNKTGLLKTVEMNGVSENIDQSYGVYRTYD 650
                         .||:||:  ||:||||.:|||:||||||||.||||||||||:||||:|||||
  Fly   576 -------------AETYDDE--ETIVQTSLIKLVLDNKTGLLKRVEMNGVSENIEQSYGLYRTYD 625

  Fly   651 SGAYVFRQYHQADFIVQYEGVEFTVYDGALVKEVHQQFSEYISQVIRIYEGKNLVEIEWQVGPIE 715
            |||||||||:|.||::|.:|||||||||||||||||:|||||||||||.|.|..||.||.||||.
  Fly   626 SGAYVFRQYNQGDFVIQEDGVEFTVYDGALVKEVHQRFSEYISQVIRISEDKPYVEFEWLVGPIP 690

  Fly   716 REEEFGREVVIIFNSTIASDGVSYTDSNGREMIKRVKDQRETFTPGLDRQPTAANYYPVTSRIAL 780
            .|||||.|||.||:|.|||:||.||||||||:|:|.||:||.|||.|..|||:.||||:||||||
  Fly   691 VEEEFGTEVVTIFSSEIASNGVFYTDSNGRELIRREKDKREDFTPELAVQPTSGNYYPITSRIAL 755

  Fly   781 QDSKKRIAVLNDRAQGGASMLNGQLELMLHRRLVRDDGYGVGEALNEEKYGQPMIARGKVYLILS 845
            |||.||:|:||||||||.||.:||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|||:
  Fly   756 QDSNKRLAILNDRAQGGTSMKDGQIELMLHRRLVRDDGYGVGEALNEEKYGQPLIARGKVFLILN 820

  Fly   846 PSDESTAAEREAEKEIHLPFWKFFSKNTGSTTAAAKSVPSFNDFPKSVHLLTLEPFNDDEVLLRV 910
            .:||||:||||||||.|||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||:||||
  Fly   821 AADESTSAEREAEKEFHLPLWKFFSKNTGSTTAAAKSVPSFDDFPKSVHLLTLEPFNDDEILLRV 885

  Fly   911 ENFLDHTEGQVVSFNIRPIFDYLNGVEIRETTLDGNLPLSDMKRFKFHHDSSGQKPDAVEYFTSA 975
            |||.||.||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.:.||.:....||:||:
  Fly   886 ENFKDHIEGKVVSFNIRPIFDYLNGVEIRETTLDGNLPLSDMKQFKFHAEGSGIRGSEPEYYTSS 950

  Fly   976 HKPLAAEQSQEASEFSVTLHPMQIRTFIIKTE 1007
            ||||:|.|:|:|:||:|||:||||||||||.|
  Fly   951 HKPLSANQTQDAAEFAVTLYPMQIRTFIIKHE 982

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LManVINP_609253.1 GH38N_AMII_LAM_like 38..312 CDD:212121 216/273 (79%)
PLN02701 40..898 CDD:178304 671/857 (78%)
LManVNP_609252.1 GH38N_AMII_LAM_like 37..311 CDD:212121 216/273 (79%)
PLN02701 39..873 CDD:178304 671/857 (78%)

Return to query results.
Submit another query.