DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LManIV and LManVI

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609251.2 Gene:LManIV / 34204 FlyBaseID:FBgn0032067 Length:978 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609253.1 Gene:LManVI / 34206 FlyBaseID:FBgn0032069 Length:1007 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1009 Identity:661/1009 - (65%)
Similarity:812/1009 - (80%) Gaps:33/1009 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MTYL-GRILFLSILLVLFAKQSEAVCGYESCPETKANMVNIHLVPHSHNDVGWLKTVDQSYYGYK 64
            |.|| |.:||:: ||.:..:.||..||||:||:||.||:|||:|||||:||||||||||.:||::
  Fly     1 MKYLCGIVLFVA-LLAISVRPSEEACGYEACPKTKTNMINIHMVPHSHDDVGWLKTVDQYFYGHR 64

  Fly    65 NKIHHAGVQYILDSVVSQLLQDPKRRFIQVETAFFAKWWNVQSESMKKVVTKLVNEGRFEFTGGA 129
            :.|.|||||||:|:|:::|::||.||||||||:||||||..|||:.|:||.|||||||.||||||
  Fly    65 SNIQHAGVQYIIDTVIAELIKDPARRFIQVETSFFAKWWAEQSETAKQVVRKLVNEGRLEFTGGA 129

  Fly   130 WSMNDEANVNYQGVIDQFTVGLKFLNETFGSCGRPRVGWQIDTFGHSREQAAIFAHMGYDGQFFS 194
            |||||||.||||.||||||:|||||::|||||.|||:|||||.||||||||:|||.|||||:||:
  Fly   130 WSMNDEAAVNYQSVIDQFTLGLKFLDDTFGSCARPRIGWQIDPFGHSREQASIFAQMGYDGEFFA 194

  Fly   195 RMDHNDKDTRMNDLTMEMIWDASESMSGVSLFSGMLYNFYSDTPGFCFDILCTDQPIIDGDSEEN 259
            ||||.||:.|:::|.||||||||:|:|...:|:|:||..||..||:|||:.|.|.||||..|.:|
  Fly   195 RMDHRDKNDRIDNLGMEMIWDASDSLSNDEIFTGLLYRHYSAPPGYCFDVHCGDDPIIDTKSYDN 259

  Fly   260 NVKQRVDDFISYAKNVSEVYITNHIMVPMGGDFQYEDAKVNYKNMDKLIKYINERQASGSKYNIF 324
            |||.|||||:||..:|::.|.:||||:|||.|||||||:||:|||||||||:|||||.||.:|:|
  Fly   260 NVKSRVDDFLSYVTSVAQHYRSNHIMIPMGDDFQYEDAQVNFKNMDKLIKYVNERQAEGSTFNLF 324

  Fly   325 YSTPSCYLNSLHQSLESWPNKTQDFFPYAHEKNSFWTGFFTSRPTQKRFERDGNHMLQVAKQLSV 389
            ||||:|||||||:.|::|||||||||||..:.||:|||:||||||||||||||||:|||||||||
  Fly   325 YSTPACYLNSLHEGLQTWPNKTQDFFPYGSDDNSYWTGYFTSRPTQKRFERDGNHILQVAKQLSV 389

  Fly   390 LANLTSEEHKIDLDYLRQVMGVMQHHDAITGTEKQAVSDDYDRMMYEAIVGASNNARDALRLLTN 454
            .|.|.:::.|.||:|||::||||||||||||||||.|||||||::|:||:|..|.|||.||.|||
  Fly   390 FAELNTKQQKEDLEYLREIMGVMQHHDAITGTEKQHVSDDYDRILYDAILGGVNTARDGLRKLTN 454

  Fly   455 MPYGEFESCLRLNISECAFTKDGADNVLVTLYNPLAHSSTQYVRIPVKEENYQVTDEKGRTVPSE 519
            :|.|||||||:|||||||||||.||||:|||||||||:||||||:|||.|||:|||||||.|.||
  Fly   455 LPNGEFESCLQLNISECAFTKDDADNVVVTLYNPLAHTSTQYVRVPVKNENYEVTDEKGRVVASE 519

  Fly   520 VVPVPWQVLALEYRSNDTQHELVFKATVNKVSSYSIKKVESSEVKH------------------- 565
            ||||.|||||||:|:|||||||||||:|:|:::|.||||.|.|.|:                   
  Fly   520 VVPVAWQVLALEFRNNDTQHELVFKASVDKIANYYIKKVASQETKNVAAHTKSKRSIKAEEANLE 584

  Fly   566 --SSIKKINPR-------EDNNSETVVENSVVKLVMDNHTGRLKSVEMNGVSEKIVQNFGVYKSH 621
              ...||::..       :|:..||||:.|.||||:||.||.||:||||||||.|.|::|||:::
  Fly   585 VPKRFKKVHSLKNATETFDDDEGETVVQTSQVKLVIDNKTGLLKTVEMNGVSENIDQSYGVYRTY 649

  Fly   622 TSCAYTFRQ--DGDIELFENDFEFTVYEGSLVKEVHQHVNDWISQVIRIYEGVSRVELEWMVGPI 684
            .|.||.|||  ..|..:.....|||||:|:|||||||..:::||||||||||.:.||:||.||||
  Fly   650 DSGAYVFRQYHQADFIVQYEGVEFTVYDGALVKEVHQQFSEYISQVIRIYEGKNLVEIEWQVGPI 714

  Fly   685 PIDDKLGSEFVTNFKSEISSNGVFYTDSNGRELMKRVKDKREDFVSDLSRQPVSGNFYPVTSRIA 749
            ..:::.|.|.|..|.|.|:|:||.||||||||::|||||:||.|...|.|||.:.|:||||||||
  Fly   715 EREEEFGREVVIIFNSTIASDGVSYTDSNGREMIKRVKDQRETFTPGLDRQPTAANYYPVTSRIA 779

  Fly   750 LQDDTKRLVLLNDRSQGGASLEDGALEMLIHRRHLFNDGGGVGEALNETQYGKGLIARGKLYLIL 814
            |||..||:.:||||:|||||:.:|.||:::|||.:.:||.||||||||.:||:.:|||||:||||
  Fly   780 LQDSKKRIAVLNDRAQGGASMLNGQLELMLHRRLVRDDGYGVGEALNEEKYGQPMIARGKVYLIL 844

  Fly   815 DSATDGDTVTERKTEKELFLPFWKFFSKTGGVEITPSKSLPDFNDLPQSVHLLTLEFFSEQEILI 879
             |.:|..|..||:.|||:.|||||||||..|.....:||:|.|||.|:||||||||.|::.|:|:
  Fly   845 -SPSDESTAAEREAEKEIHLPFWKFFSKNTGSTTAAAKSVPSFNDFPKSVHLLTLEPFNDDEVLL 908

  Fly   880 RFEHFLDKSEGRVISFNIRDIFDSLGGLAIRETTLDGNMPLSDMKRFKFHAQESGTKPSSVEYST 944
            |.|:|||.:||:|:|||||.|||.|.|:.|||||||||:|||||||||||...||.||.:|||.|
  Fly   909 RVENFLDHTEGQVVSFNIRPIFDYLNGVEIRETTLDGNLPLSDMKRFKFHHDSSGQKPDAVEYFT 973

  Fly   945 AQHKPLEAVKSDEASLFAVTLYPMQIRTFIIKTE 978
            :.||||.|.:|.|||.|:|||:||||||||||||
  Fly   974 SAHKPLAAEQSQEASEFSVTLHPMQIRTFIIKTE 1007

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LManIVNP_609251.2 PLN02701 31..793 CDD:178304 522/791 (66%)
GH38N_AMII_LAM_like 39..312 CDD:212121 193/272 (71%)
LManVINP_609253.1 GH38N_AMII_LAM_like 38..312 CDD:212121 193/273 (71%)
PLN02701 40..898 CDD:178304 563/858 (66%)

Return to query results.
Submit another query.