Protein Alignment Sema1a and sema4ga

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001260265.1
• Gene: Sema1a / 34192
• FlyBaseID: FBgn0011259
• Length: 1131
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073776800.1
• Gene: sema4ga / 563785
• ZFINID: ZDB-GENE-060503-381
• Length: 863
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 939
• Identity: 246/939 - (26%)
• Similarity: 388/939 - (41%)
• Gaps: 223/939 - (23%)

  Fly    36 IMKHKLSKFYGYGWMQVFLLLTVLVIGNQSAWQENIRPKLYVELGPEDVLKFVG----------- 89
            :|.|:       .|: :||||..:|   .|.|....:|.|.:::.|...:.|.|
Zfish     4 MMNHR-------AWL-LFLLLLYVV---SSVWGYPFKPPLDLDVTPRTTVLFKGLLGCRRFRGLT 57

  Fly    90 -NESVVDHFKLVTKDGNSLLIGARNTVFNLSIHDLVEQ--QRLVWTSPEDDTKMCLVKGKDEEA- 150
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Zfish    58 LNYSLL----LLEEDADLLYVGARGALFALQASDVSSSLAQTIDWEASDDQMQQCWNKGKDNQTE 118

  Fly   151 CQNYIRIMVVPSPGRLFVCGTNSFRPMCNTYIISDSNYTLEATKNGQAVCPYDPRHNSTSVLADN 215
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Zfish   119 CFNHIRFLQRFNSTHLYTCGTHAFSPLC-AYIDGREFKISSVFEEGREKCPYDPSKGYTGLLIDQ 182

  Fly   216 ELYSGTVADFSGSDPIIYREP---LQTEQYDSLSLNAPNFV----------SSFTQGDFVYFFFR 267
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Zfish   183 QMYTASQYEFRSFPDIRRNSPNPILKTEEAPTQWLQEADFVGSALVRESLSSSAGDDDKIYFFFT 247

  Fly   268 ETAVE---FINCGKAIYSRVARVCKWDKGGPHRFRNRWTSFLKSRLNCSIPGDYPFYFNEIQSAS 329
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Zfish   248 EKSQELSPYFSHSRV--ARVARVCKRDRGGLLTLQKKWTSFLKARLVCSLP-DYEFHFNVLRSVF 309

  Fly   330 NLVEGQYGSMSSKLIYGVFNTPSNSIPGSAVCAFALQDIADTFEGQFKE-QTGINSNWLPVNNAK 393
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Zfish   310 -FLEG--SSSQDSAFYGIFGLEWKNVKASAICQYSVSDIQWAFDGPYMESKEDSNSKWTQY-TGK 370

  Fly   394 VPDPRPGSC----H-----NDSRALPDPTLNFIKTHSLMDENVPAFFSQPILVRTSTIYRFTQIA 449
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Zfish   371 VPEPRPGSCITDQHRAKGINSSINLPDDVLHFVRRHPLMYRQILPQGQRPLLFRRNVDY--TKIA 433

  Fly   450 VDAQIKTPGGKTYDVIFVGTDHGKIIKSVNAESADSADKVTSVVIEEIDVLTKSEPIRNLEIVRT 514
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Zfish   434 VHT-VTGLDGQIYHILFIGTDEGWLQRAVKVE-----DHLH--IIEELQLFEEPQPVDSIVISKK 490

  Fly   515 MQYDQPKDGSYDDGKLIIVTDSQVVAIQLHRCHNDKITSCSECVALQDPYCAWDKIAGKC---RS 576
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Zfish   491 QM------------SVYVGSPTSVVQLPLSTC--TRYSSCFDCVMARDPFCAWDGL--ECVDITS 539

  Fly   577 HGAPRWLEENYFYQNVATGQHAACPSGKINSKDANAGEQKGFRNDMDLLDSRRQSKDQEIIDNID 641
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Zfish   540 HNSRANLT-----QDIQNG---------------NQGCDKSTADDQVLHRSRSVMAGDDVLLQC- 583

  Fly   642 KNFEGPQISADIINAQYTVETLVMAVLAGSIFSLLVGFFTGYFCGRRCHKDEDDNL------PYP 700
                  ::|:::...::|:..   ..|.|  :.|..||..|           .|.|      ||.
Zfish   584 ------ELSSNLATPEWTLNG---NELKG--YGLDSGFRVG-----------TDGLLVIEAQPYQ 626

  Fly   701 DTEYEYF--EQRQNVNSFPSSCRIQQEPKLLPQVEEVTYAEPVLLPQPPPPNKMHSPKNTLRKPP 763
            ..:|..|  |....|.....|..::||                 ||.|||. |...|:.|..
Zfish   627 SGDYCCFAIENSVRVPVLIYSLTVRQE-----------------LPVPPPV-KPTQPRFTTE--- 670

  Fly   764 MHQMHQGPNSETLFQFQPDGYNTQQSYRGRDNFGTLRSHQVMGDNY------------------- 809
            ::...|...|::...|.|    |..|  .|..|.::|:.:.|   |
Zfish   671 IYWTSQSSQSDSEEDFDP----TPMS--PRFEFLSVRNMEAM---YLSLITILGGLCFVLTVVLL 726

  Fly   810 --------RRGDGFSTTRSVKKAVNNTNTRNRSLGRARRQPPRHGIVTQHRSNSPQQQQQQSQQP 866
                    |||.  .:.|:.||...|...:.               ::.|.:..........|..
Zfish   727 YVGFCLQGRRGK--YSLRAEKKRGGNMELKT---------------ISSHCNGKSDAHDGLLQIV 774

  Fly   867 HSSSGSSPVMSNSSSSPAPPSSSPSPQES 895
            ...:.:||   .....||||  .|.|.||
Zfish   775 PGEASTSP---TKDLPPAPP--LPPPPES 798

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Sema1a	NP_001260265.1	Sema_1A	91..546	CDD:200498	149/483 (31%)
		PSI	545..601	CDD:396154	17/58 (29%)
sema4ga	XP_073776800.1	None