DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AlaRS and Aars1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523511.2 Gene:AlaRS / 34156 FlyBaseID:FBgn0027094 Length:966 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001093987.1 Gene:Aars1 / 292023 RGDID:1304832 Length:968 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:969 Identity:591/969 - (60%)
Similarity:725/969 - (74%) Gaps:17/969 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 LTAKEVRNAYLDFFKEQKHIYVHSSSTIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLGTADPNSEMSKWVRV 68
            |||:|:|..::::||..:|.|||||:||||||||||||||||||||||||.|.||:..|:|..|.
  Rat     5 LTAREIRERFINYFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTVDPSHPMAKLSRA 69

  Fly    69 ANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGNWSFGDYFKKEICSWAWEFLTQRLALPKDRLY 133
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:..|..|.|.|||...:|.:|||
  Rat    70 ANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALELLTQEFGIPVERLY 134

  Fly   134 VTYFGGDAASGLEPDLECKQMWLDLGLKPEHILPGSMKDNFWEMGETGPCGPCSELHFDRIGGRS 198
            |||||||.|:||||||||:|:|.:|||....||||:|||||||||:|||||||||:|:||||||.
  Rat   135 VTYFGGDEAAGLEPDLECRQIWQNLGLDEAKILPGNMKDNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDRIGGRD 199

  Fly   199 VPELVNMDDPDVLEIWNLVFIQYNRESDGSLKQLPKKHIDCGMGFERLVSVIQNKRSNYDTDLFV 263
            ...|||.|||:||||||||||||||||||.||.||||.||.|||.||||||:|||.|||||||||
  Rat   200 AAHLVNQDDPNVLEIWNLVFIQYNRESDGVLKPLPKKSIDTGMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFV 264

  Fly   264 PLFDAIQAGTGAPPYQGRVGADDVDGIDMAYRVLADHARTITIALADGGTPDNTGRGYVLRRILR 328
            |.|:|||.||||.||.|:|||:|.||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||
  Rat   265 PYFEAIQKGTGARPYTGKVGAEDTDGIDMAYRVLADHARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILR 329

  Fly   329 RAVRYATEKLNAKPGFFATLVNTVVDLLGDAFPEVKKDPQHIIDIINEEELQFLKTLTRGRNLLN 393
            |||||:.|||||..|||||||:.||..|||||||:||||..:.|||||||:||||||:|||.:|:
  Rat   330 RAVRYSHEKLNASRGFFATLVDVVVQSLGDAFPELKKDPDMVKDIINEEEVQFLKTLSRGRRILD 394

  Fly   394 RTIEKLGNQTTIPGDVAWRLYDTYGFPVDLTQLMAEEKSLKIDMDGYEAAKHNSYVLSQGKGASK 458
            |.|:.||:..|||||.||.||||||||||||.|:||||.|.:||||:|..:..:.:.||||||..
  Rat   395 RKIQSLGDCQTIPGDTAWLLYDTYGFPVDLTGLIAEEKGLVVDMDGFEEERKLAQLKSQGKGAGG 459

  Fly   459 IEEINLDVHAISQLQEQGVPPTNDTFKYKYEAVSDERDSAYNYGVCNSKIVALRFENQFVNEITS 523
            .:.|.||::||.:|:.:|:..|:|:.||.|.:   :...:|.:....:.::|||.|..||:|:.:
  Rat   460 EDLIMLDIYAIEELRAKGLEATDDSPKYNYHS---DSSGSYVFECTVATVLALRREKMFVDEVVT 521

  Fly   524 GQKAGIVLDKTNFYAESGGQIYDQGALVKVND---EANEFLVDRVYNRGGYILHIGVVEGTLKVG 585
            ||:.|:|||||.||||.||||:|:|.||||:|   :..||.|.....||||:||||.:.|.|:||
  Rat   522 GQECGVVLDKTCFYAEQGGQIFDEGYLVKVDDSSEDKTEFTVKNAQVRGGYVLHIGTIYGNLRVG 586

  Fly   586 DELELHIDVERRWLTMKNHSATHALNHCLLQVLGKDTEQKGSLVVPEKLRFDFNSKAAMTIEQVS 650
            |::.|.||..||...|.||:|||.||..|..||| |.:||||||.|::|||||.:|.||:.||:.
  Rat   587 DQVRLFIDEPRRRPVMSNHTATHILNFALRSVLG-DADQKGSLVAPDRLRFDFTAKGAMSTEQIK 650

  Fly   651 KTEQLTKEMVYKNVPIYAKESKLALAKKIRGLRSVFDEVYPDPVRVISFGVPVDELEQNPDSEAG 715
            |||::...|:....|:|..:..||.||.|:|||:||||.|||||||:|.||||.||..:|...||
  Rat   651 KTEEIVNGMIEAAKPVYTLDCPLAAAKAIQGLRAVFDETYPDPVRVVSIGVPVSELLDDPSGPAG 715

  Fly   716 EQTSVEFCGGTHLRRSGHIMDFVISSEEAIAKGIRRIVALTGPEALKALKKSEAFEQEI----VR 776
            ..||||||||||||.|.|...|||.:|||||||||||||:||.||.|||:|||..::.:    |:
  Rat   716 SLTSVEFCGGTHLRNSSHAGAFVIVTEEAIAKGIRRIVAVTGAEAQKALRKSETLKKSLSAMEVK 780

  Fly   777 LKATIDNDKSGKDSKSHVKEIVELTEQISHATIPYVKKDEMRNLLKGLKKTLDDKERALRAAVSV 841
            :||      ....:|...|||.:|.|.::.|.||..:|||.|..||.|||.:||.:||.:|.|..
  Rat   781 VKA------QSAPNKDVQKEIADLGEVLATAVIPQWQKDEQRETLKSLKKVMDDLDRASKADVQK 839

  Fly   842 TVVERAKTLCEANPNATVLVEQLEAFNNTKALDAALKQVRSQLPDAAAMFLSVDADSKKIFCLSS 906
            .|:|:.|.|.::|||..:::.::|:..:.|||:.|||..::..|..:||..:||.::.||.||..
  Rat   840 RVLEKTKQLIDSNPNQPLVILEMESGASAKALNEALKLFKTHSPQTSAMLFTVDNEAGKITCLCQ 904

  Fly   907 VPKSAVEKGLKANEWVQHVSATLGGKGGGKPESAQASGTNYEKVDEIVQLASKFAQSKL 965
            ||::|..:||||:||||.||..:.||||||..||||:|.|...:.|.:|||:.|||.:|
  Rat   905 VPQNAANRGLKASEWVQQVSGLMDGKGGGKDMSAQATGKNVGCLQEALQLATSFAQLRL 963

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AlaRSNP_523511.2 PLN02900 5..963 CDD:215487 588/964 (61%)
Aars1NP_001093987.1 PLN02900 6..961 CDD:215487 588/964 (61%)
Nuclear localization signal. /evidence=ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_03133 750..763 9/12 (75%)

Return to query results.
Submit another query.