DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG7627 and rdog

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609215.3 Gene:CG7627 / 34148 FlyBaseID:FBgn0032026 Length:1355 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_651678.1 Gene:rdog / 43450 FlyBaseID:FBgn0039644 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1375 Identity:602/1375 - (43%)
Similarity:863/1375 - (62%) Gaps:69/1375 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 PENPREHCNFISAACFWYTMPTFIKGRKRTLDTKDLYRALKEHKSETLGNKLCASWELELEKTKG 74
            |:||....||.|...||:....|.:|.:..|..::||:..|...||.:.||....||.||:::  
  Fly    11 PKNPFTKANFFSQWSFWWMRDLFKRGLQGPLTDEELYQHRKTLDSERVTNKFAELWEDELKRS-- 73

  Fly    75 KPNLLRALLRVFGWYFALLGLVLFLLELGLRTLQPIFLLKLIAYYTHGSESI--ESAYYYAAGVI 137
            .|:::|.:||.:|..|..:||...:.|...::|.|:||..|:.|:......|  .:||.||.|::
  Fly    74 NPSVVRMILRAYGKIFVPMGLAFSISETICKSLMPLFLGGLVGYFATNQTDISENTAYLYAMGIV 138

  Fly   138 LCSALNVIIMHPYMLGTMHVGLKMRVGMCSMIYRKALRLSKSALGDTTAGHVVNLMSNDVGRLDL 202
            :|..:.||..||::.....||.|:|:.:..:||||.|::|||:..|...|..:|::|||:||.|:
  Fly   139 ICMLVPVITFHPFIFYIFQVGTKLRLALSGLIYRKVLQVSKSSSNDGLRGRAINILSNDLGRFDV 203

  Fly   203 ATIFVHYLWVGPLETLFITYLMYREIGIAAVFGVAFMLLFIPLQAYLGKRTSVLRLRTALRTDER 267
            |..|:|..|.||:|::.|.:||||||||:||.||:|||.||||||:..|:.:..|..||.|||.|
  Fly   204 ALCFLHDTWKGPMESILIGFLMYREIGISAVIGVSFMLSFIPLQAWAAKKAAYYRQMTAERTDMR 268

  Fly   268 VRMMNEIISGIQVIKMYAWELPFEHMVAFARKKEINAIRHVSYIRGILLSFIIFLTRVSIFLSLV 332
            |::|||||.|||||||||||..|..::|..|.||:.|||..:||.. .|.....::.:|:||:|.
  Fly   269 VKLMNEIIQGIQVIKMYAWEKSFARVIAEVRLKEVKAIRGTAYIHA-ALGCTSMISPLSVFLALC 332

  Fly   333 GYVLLGTFLTPEVAFLITAYYNILRTTMTVFFPQGISQMAETLVSIKRVQKYMQSDETNVMDMSV 397
            .||.||..||.:..:.:::|:|:|..:|..|:|..|:.:||.|||.||.:.::...:...:.:::
  Fly   333 SYVYLGDPLTAQKVYTVSSYFNMLNDSMVTFWPMSITFIAEALVSAKRCKDFLLDGDKAEVPINL 397

  Fly   398 DLTEDFQGSNQETVHADGDEERDEAEDKLLGPPIATVNEN------AKLSEAGISISGLMAKWDV 456
            :..:. .|.|:..:.....::..|....||..  ..|:.|      .:.::..:.:..:.|.||.
  Fly   398 EANQQ-TGKNKRKISKKDKQKNVELNGSLLSN--GQVHHNRLRDYDPEATKKCVVLKNVSASWDT 459

  Fly   457 NS-------PDYSLNGVNLRVQPGTMLGIVGRTGSGKSSLIQAILGELPAESGEIKVNGSMSYAS 514
            :.       .|:|.:     ::..|:..:||..|:||||.:..:|||:..:.||..|:|.:||||
  Fly   460 SDGHANCAIEDFSTD-----IKDQTLAAVVGPVGAGKSSFLNVLLGEVGIDKGEAMVHGKISYAS 519

  Fly   515 QEPWLFSGTVRQNILFGQPMDRRRYAKVVKKCALERDFELLPFKDKTIVGERGASLSGGQKARIS 579
            ||.|:|.||:|.||:|.:..:.|||.||||.|.||||.||||..|.|:|||||.|||||||||:|
  Fly   520 QESWVFEGTIRDNIVFVEDYNERRYKKVVKVCGLERDMELLPRGDLTVVGERGVSLSGGQKARVS 584

  Fly   580 LARAVYRETSIYLLDDPLSAVDTHVARHLFEQCMRGYLRERIVILATHQLQFLQHADQIVIMDKG 644
            |||||||:..|||||||||||||||.:|:|::|:|.:|..:|.||.|||:|:|...:.:::|..|
  Fly   585 LARAVYRKADIYLLDDPLSAVDTHVGKHIFDRCIRDFLSNKIRILVTHQVQYLFDVEHLLLMGSG 649

  Fly   645 RVSAVGTYESLRESGLDFASMLADPERDEQSEERSRSRSGSYTHSHSD--QRRNSEQSL------ 701
            ::.|.|:|:.|:.|           .:.:..|:.....||..|||.|.  .|.:||:|:      
  Fly   650 KIMAQGSYQELQRS-----------RQFQFLEQTQHDESGIDTHSVSSYLSRSDSEKSMEHQHNQ 703

  Fly   702 LSMADSCMDDLEAEQANNQERQEAGQIGLRLYSKYFKAGGGFFAFFVMMGFCVLSQGLASLGDYF 766
            |...|..::|:      |||:|..|.|.:.:|:.|.||....|...:::...|.::.:.:..|||
  Fly   704 LLRPDEHVEDV------NQEQQTVGSIKMHVYASYIKALDSTFLLGIVISLFVCARIMLTGVDYF 762

  Fly   767 LSYWVTKKGNVAYRADN-----------NDTTRSEELEPRLSTWL-RDIGLSVDAEMLDTYIFTV 819
            ||.||..:..:|.....           |||......:|.::..| .||...:..|::  ..:..
  Fly   763 LSRWVIWEEQIAVNRTTTLLNETDTTIANDTLPINATDPYIAPLLASDIQAGIRQELV--LFYAT 825

  Fly   820 ITVLTILVTVARSFLFFNLAMKASIRLHNSMFRGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDMGQVDEI 884
            |...|::|.:.|:|.||.:.::.|:.||:.:|||||||:|||||||.|||||||||||:..||..
  Fly   826 ILGATLIVYLIRTFGFFKMCLRISLHLHDRLFRGITRASMYFFNTNSSGRILNRFSKDIRTVDTD 890

  Fly   885 LPAVMMDVIQIFLALAGIVIVIAVVNPLFLIPTVVLGIIFYQLRTFYLKTSRDVKRMEAITRSPV 949
            ||..::|.:...:.::|:||::|:.|...|||..::|:|...:|..|:.|||.|||:|:|:||||
  Fly   891 LPHTLLDCLAFIIDVSGVVIIVAIANYWLLIPAAIIGVILGMIRYLYVNTSRSVKRLESISRSPV 955

  Fly   950 YSHLAASLTGLSTIRAFGAQRVLEAEFDNYQDMHSSAFYMFISTSRAFGYWLDCFCVIYIAIITL 1014
            :|....:..||:||||..||..||.||..||:.::||:::|:|.:|||..|.|..|::|:..:|.
  Fly   956 FSLTNQTFQGLTTIRALQAQSALEQEFHEYQNTNTSAWFLFLSCTRAFALWSDVLCIVYMTAVTF 1020

  Fly  1015 SFFIFPPA-NGGDVGLAITQAMGMTGMVQWGMRQSAELENTMTAVERVVEYEDIEPEGALEAPAD 1078
            ||.:.... :.|||||||..:..||||.||||||:|||||.||:||||:||.:...|..||.|..
  Fly  1021 SFLLLKDEFDSGDVGLAILHSTTMTGMCQWGMRQTAELENQMTSVERVLEYTEQPSEALLETPEK 1085

  Fly  1079 KKPPKSWPEQGKIVFDELSLRYTPDPKSENVLKSLSFVIKPKEKVGIVGRTGAGKSSLINALFRL 1143
            .||...||.:|:|.|....|||:  ||...|||.|:|.|:|:||:||||||||||||:|.::|||
  Fly  1086 FKPKSEWPSKGRIEFINFKLRYS--PKEAPVLKDLNFTIEPREKIGIVGRTGAGKSSIIQSIFRL 1148

  Fly  1144 SYNDGSVLIDKRDTSEMGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSDDKLWRSLEEVKLK 1208
            :.|:|.:.||..|...:|||||||::|||||:|||||||:||||||.||.||:::|::|.:|:|:
  Fly  1149 ACNEGMIRIDDVDIEHIGLHDLRSQVSIIPQDPVLFSGTLRYNLDPMDERSDEEMWKALGDVELR 1213

  Fly  1209 EVVADLPSGLQSKITEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDGLIQTTIRN 1273
            ..|:.|..||..::.:||:||||||||||||||||||.|:||:||||||||||:||.|||.|||:
  Fly  1214 SYVSTLIGGLNCRMYDGGSNFSVGQRQLVCLARAILRHNKILIMDEATANVDPETDKLIQQTIRS 1278

  Fly  1274 KFKECTVLTIAHRLHTIMDSDKVLVMDAGRAVEFGTPYELLTLADSKVFHGMVKQTGHATYESLL 1338
            ||..||||||||||||:||||:|||||||...|.|.|||||..... ....:|..||.||..:|.
  Fly  1279 KFAHCTVLTIAHRLHTVMDSDRVLVMDAGEVRELGHPYELLQRTGG-YLRQLVDNTGAATSFALQ 1342

  Fly  1339 KIAQKAFENR 1348
            :.|::::..:
  Fly  1343 QAAEQSYSKQ 1352

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG7627NP_609215.3 PLN03130 13..1348 CDD:215595 600/1370 (44%)
rdogNP_651678.1 MRP_assoc_pro 14..1323 CDD:188098 593/1340 (44%)

Return to query results.
Submit another query.