DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG7806 and Abcc10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609207.1 Gene:CG7806 / 34140 FlyBaseID:FBgn0032018 Length:1487 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001101671.1 Gene:Abcc10 / 316231 RGDID:1306696 Length:1494 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1511 Identity:573/1511 - (37%)
Similarity:857/1511 - (56%) Gaps:130/1511 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    35 CFQEILLQLPVYTLFAAISAYNFGN-QSRHVVR---NGLQLRMLSIRTFLAMV---LALLPVAKV 92
            ||.:::|.:..:.|.|.:||.:.|. ::.::::   .|.:||:.:  :||..|   |.||||...
  Rat    28 CFTQLVLSVLPHALLAVLSACHLGTPRTNNIIQPFNPGWRLRLTA--SFLLSVFPLLDLLPVVLP 90

  Fly    93 FAFHQQGVELFAADLLVVSAECIMWVVHSGFLLTARQYGELSH-RGSL-LINVVWLTVVVLDAVW 155
            ...|...:.|   ::|......:.|..|| ..|.|..:....| ||.| |....:|....|....
  Rat    91 PVSHPGPLWL---EVLAGCVTAVAWFTHS-LALWALVHSPHGHSRGPLALALAAFLPTPALVLTL 151

  Fly   156 LRTSRHFSWWPWSLATLVCDLLFGVTLIPKGSAVYSSLPRSGVSA-----------REDEGLLSQ 209
            |        |.....|.:..||.|    |.|......|..:.|.|           ||.      
  Rat   152 L--------WHCQRGTFLPPLLPG----PLGRVCLLILQLAAVLAYGLGWAAPGGPREP------ 198

  Fly   210 RYTYFQFDLNESHLGH-AQDEANLGSRFLFHWVQPLILKGVAGKLRKIEDLFDLPDALNITRLSE 273
             :|:..|...||.... |:|..:..|||.:.|:.||:.:||.|:||:.:|...||..|:...|:.
  Rat   199 -WTHDPFLSPESQEREVAEDGESWLSRFSYAWLAPLLARGVRGELRQPQDTCRLPRRLHPAYLAR 262

  Fly   274 KLHLALSQSQSLWRALHRCFGVEFYLIGILRLIADLSGFAGPLLLG---GLLRQDHADPNQVYYY 335
            .......:...|||||:..||..:..:|:|:::..:.||:|||||.   |.|.:.....:....|
  Rat   263 AFQAHWKEGAQLWRALYGAFGCCYIALGLLKMVGTMLGFSGPLLLSLLVGFLEEGQEPLSHGLLY 327

  Fly   336 ALGLFGSTLLSAVCATHFDWRMAMVSMKMRVGVVNSIYRKALEARGLKESKP---DLLNLMSTDT 397
            .|||...:::|||....:.:.:..|:::.||.|::.:|||.|:   |..|:|   ::|||:.||:
  Rat   328 VLGLASGSVISAVLQNQYGYEVRKVTLQARVAVLSILYRKTLK---LGPSRPPTGEVLNLLGTDS 389

  Fly   398 DRIVNSCISFHFFWSIPFKLFTTLYLLYLQLGAAFLAGVIFAALLIPINRWLAKRIGIFSSGLMT 462
            :|::|...|||..|.:|.:|..||||||.|:|.|||||::.|.||:|:|:.:|.||...:..::.
  Rat   390 ERLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYEQVGVAFLAGLVLALLLVPVNKVIATRIMANNQEMLR 454

  Fly   463 AKDARLSATTETMQGAKQIKINAWEDIFITKIRGLRQEELRFLSKRKYLDAMCVYFWATTPVLMC 527
            .||||:...||.:.|.:.:|...||.....:::..|.:||..|...|||||.|||.||..||::|
  Rat   455 HKDARVKLMTELLSGIRVLKFFRWEQALGDRVKACRTQELGRLRVIKYLDAACVYLWAALPVVIC 519

  Fly   528 LLTFGVSVLMGNPLIASTTYTSVALLYMLIGPLNAFPWVLNGLIEAWVSIKRVQQLMDVPNLDYS 592
            ::.|...||:|:.|.|:..:|::||::|||.|||.||||:|||:|:.||:.|:|:.:|:|:....
  Rat   520 IVIFITYVLLGHQLTATKVFTALALVHMLILPLNNFPWVINGLLESKVSLDRIQRFLDLPSYSPE 584

  Fly   593 SYYNPIMRGSGGSGAGDDAPLDAPKASVLQMKCASFCHDSDEQTSPTPFRMKDI--NVDIKAGQL 655
            :||:|            |.|.:  .::||::..|.|..|      ||....|..  ::.:|.|.|
  Rat   585 AYYSP------------DPPTE--PSTVLELHEALFSWD------PTGTSQKTFISHLQVKKGML 629

  Fly   656 VCIEGPVGGGKSSFLSAIVANLQCTDGEVCVQELTTGFGYVPQSPWLQRGTIRDNIVWGAQFDEQ 720
            |.|.|.||.||||.|:||...|....|.|.|.:|:.|||...|.||:|..|||||:::|..||.|
  Rat   630 VGIVGKVGCGKSSLLAAITGELHRLCGWVAVSDLSKGFGLATQEPWIQCATIRDNVLFGKTFDAQ 694

  Fly   721 WYKTVLHACALEEDLQIL-GGDLVGVGENGRTLSGGQRARVALARAVYQDKKVYLLDDVLSSLDA 784
            .|:.||.||||.:||.|| .||...|||.|.|||||||||:||||||||:|.:|||||.|:::||
  Rat   695 LYREVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLSGGQRARIALARAVYQEKTLYLLDDPLAAVDA 759

  Fly   785 HVARHIIKHCILRLLKHKTRIVVTRNIQLFFHANQILQVKDGQLL----PSEY--MTQSIELSL- 842
            .||.|::..|||.:|.|.||::.|...:....|:.:|.::.|:|:    |||.  :.|:...:| 
  Rat   760 DVANHLLHRCILGVLGHTTRLLCTHRTEYLERADLVLLMEAGRLVRAGPPSEILPLVQAAPTALA 824

  Fly   843 --DEDADDEQEPTVRRRSVELSNQYD--KKSLDSLLLEELREYGHLSGNVFTCYWKAVTSPLAFT 903
              ::..|..|.|:|.... :.:.:.|  :.:...|:.||.:..|.::.:|:..||:|:.|.||..
  Rat   825 DKEQVTDSGQSPSVHNLE-KTTEELDVAQNTSGRLVQEESKSEGAVALHVYRAYWRAMGSGLATA 888

  Fly   904 VLLSVVLMQLTRNLSDAWLAYWVTETTLDPHKNDT---------------SLDHILMRPTVGN-- 951
            :|:|::|||.|||.:|.|||:|:::  |...:|.:               |...:|..|  ||  
  Rat   889 ILISLLLMQATRNGADWWLAHWLSQ--LKAGRNSSEERPASSSPRSMGFFSPRLLLFSP--GNLY 949

  Fly   952 -----ETESGHT-TKFYLSIFTAIAVSNSLVTLARAFLFAYAGIKAAIFMHEKLLKKVMFAKFNF 1010
                 .|.:|.: ..|||:::..||..|||.||.||.|||...::||..:|.:||.:::.|...|
  Rat   950 IPLHKATSNGSSDVHFYLTVYATIAGVNSLCTLLRAVLFAAGALQAAASLHHRLLHRLLMAPVTF 1014

  Fly  1011 FDITSVGRILNRFSSDTNTVDDSLPFILNILLAQLAGLVGALCVSLYAMPWLGLVIIPMVPIYLS 1075
            :|.|..||:|||||||...|||||||:||||||...||:|.|.|....:|||.|::.|:..||..
  Rat  1015 YDSTPSGRVLNRFSSDVACVDDSLPFLLNILLANSVGLLGLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSFIYYG 1079

  Fly  1076 LQQRYRHASRDIKRLSSNAMSPLYTHFTETLQGLTTIRSMRASPRFQRDFQVKLEESIKAQLTQS 1140
            :|:|||.:.|:::||.|..:||||:|..:||.||..:|:..|:.||:.:.|..||.:.:.|....
  Rat  1080 VQRRYRASFRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLPVLRAAGATYRFEEENQRLLELNQRCQFASY 1144

  Fly  1141 AAQQWLALRLQLLGTLLVGG-AGLLAAITASHTTNPGLVGLCISYALSITGQLGDLLHAVAETEQ 1204
            |..|||.:||||:|..:|.. ||:..........|||||||.:|||||:||.|..|:.:..:||.
  Rat  1145 ATMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLVLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEA 1209

  Fly  1205 ELVAVERIDQY-LQLEEEQNASGSAEPP------FGWPTQGVLSFREVQLSYREHLAPALRGITF 1262
            .:|:|||:::| ..:.:|.:    .:||      ..|.|||.:.|::|.|.||..|..||.|:||
  Rat  1210 MMVSVERLEEYSCDIPQEPH----GQPPQSPHQRVSWLTQGSVEFQDVVLVYRPGLPNALDGVTF 1270

  Fly  1263 QTEAFERIGIVGRTGAGKTSVLAALLRVAPLTHGEIRLDQVNLKTLPLSVLRERIGVITQEPFLF 1327
            :.|..|::|||||||:||:|:...|.|:...:.|::.||.|:...|.|:.||.::.||.||||||
  Rat  1271 RVEPGEKLGIVGRTGSGKSSLFLVLFRLLEPSAGQVLLDGVDTSQLELAELRSQLAVIPQEPFLF 1335

  Fly  1328 EGTVRENLDPRHGFYDSEIWHAIKNSAAATLLVQQLGGLDGKVETCGNNLSAGQRQLLCLARALL 1392
            .|||||||||:....|..:|.|::....:. :...:|||||::...|.:||.|||||||||||||
  Rat  1336 SGTVRENLDPQGLHEDRALWQALEQCHLSE-VAMAIGGLDGELGERGRDLSLGQRQLLCLARALL 1399

  Fly  1393 KNAKVVAIDEGTSNLDDESDLSIQQALRNAFKSCTLLFIAHRLRGLHAMDRIIVLDDGRICEEGN 1457
            .:||::.|||.|:::|.::|..:||.:...|.:.|:|.|||||..:...||::||..||:.|..:
  Rat  1400 TDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICRRFANKTVLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDS 1464

  Fly  1458 PQSLASDSSTIFYGML 1473
            |.:|.:...::|..:|
  Rat  1465 PSALRNQPHSLFRQLL 1480

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG7806NP_609207.1 MRP_assoc_pro 6..1472 CDD:188098 572/1508 (38%)
Abcc10NP_001101671.1 MRP_assoc_pro 201..1471 CDD:188098 523/1302 (40%)

Return to query results.
Submit another query.