DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG7806 and Abcc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609207.1 Gene:CG7806 / 34140 FlyBaseID:FBgn0032018 Length:1487 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_071617.2 Gene:Abcc1 / 24565 RGDID:3112 Length:1532 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1624 Identity:498/1624 - (30%)
Similarity:770/1624 - (47%) Gaps:257/1624 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 DWGDFAWNWTQFCPTGLKPFANETNDLLPCFQE-ILLQLPVYTLFAAISAYNFGNQSRHVVRNGL 69
            |..|..|:|.....|       ...|...|||. :|..:|.:.|::....| |...||| .|..:
  Rat    10 DGSDPLWDWNVTWHT-------SNPDFTKCFQNTVLTWVPCFYLWSCFPLY-FLYLSRH-DRGYI 65

  Fly    70 QLRMLS-IRTFLAMVLALLPVAKVF-AFHQQGVELFAADLLVVSAECI-MWVVHSGFLLTARQYG 131
            |:..|: .:|.|...|.::..|.:| :|.::...:..|.:|:||...: :.::.:.||:...:..
  Rat    66 QMTHLNKAKTALGFFLWIICWADLFYSFWERSQGMLLAPVLLVSPTLLGITMLLATFLIQFERRK 130

  Fly   132 ELSHRGSLLINVVWLTVVVLDAVWLRTSRHFSWWPWSLATLVCDLLFGVTLIPKGSAVYSSLPRS 196
            .:...|.:|                      ::|   |..|:|.|..      ..|.:.|:|.: 
  Rat   131 GVQSSGIML----------------------TFW---LVALLCALAI------LRSKIISALKK- 163

  Fly   197 GVSAREDEGLLSQRYTYFQFDLNESHLGHAQD------------------EANLGSRFLFHWVQP 243
              .|:.|....|..|.||.....:..|....|                  .|:..||..|.|:..
  Rat   164 --DAQVDMFRDSAFYLYFTLVFIQLVLSCFSDSSPLFSETVRDPNPCPESSASFLSRITFWWITG 226

  Fly   244 LILKGVAGKLRKIEDLFDL-----------------------------------------PDALN 267
            ::::|....| |..||:.|                                         |...:
  Rat   227 MMVQGYRQPL-KSSDLWSLNKEDTSEEVVPVLVNNWKKECVKSRKQPVRIVYAPPKDPTKPKGSS 290

  Fly   268 ITRLSEKLHLALSQSQ------SLWRALHRCFGVEFYLIGILRLIADLSGFAGPLLLGGLLR--Q 324
            ...::|::...:.:|.      ||::.|::.||..|.:..:.:.:.||..||||.:|..::.  .
  Rat   291 QLDVNEEVEALIVKSSHKDRDPSLFKVLYKTFGPYFLMSFLYKALHDLMMFAGPEILELIINFVN 355

  Fly   325 DHADPN-QVYYYALGLFGSTLLSAVCATHFDWRMAMVS-MKMRVGVVNSIYRKAL----EARGLK 383
            |...|: |.|.|...||.|..|..: |.|..:.:..|: |:::..||.::|||||    .||  |
  Rat   356 DREAPDWQGYLYTALLFVSACLQTL-ALHQYFHICFVTGMRIKTAVVGAVYRKALVITNSAR--K 417

  Fly   384 ESK-PDLLNLMSTDTDRIVNSCISFHFFWSIPFKLFTTLYLLYLQLGAAFLAGVIFAALLIPINR 447
            .|. .:::||||.|..|.::.....:..||.|.::...||.|:|.||.:.||||....|::|.|.
  Rat   418 SSTVGEIVNLMSVDAQRFMDLATYINMIWSAPLQVTLALYFLWLNLGPSVLAGVAVMILMVPFNA 482

  Fly   448 WLAKRIGIFSSGLMTAKDARLSATTETMQGAKQIKINAWEDIFITKIRGLRQEELRFLSKRKYLD 512
            .:|.:...:....|.:||.|:....|.:.|.|.:|:.|||..|..|:..:|||||:.|.|..||.
  Rat   483 VMAMKTKTYQVAHMKSKDNRIKLMNEILNGIKVLKLYAWELAFQDKVMNIRQEELKVLKKSAYLA 547

  Fly   513 AMCVYFWATTPVLMCLLTFGVSVLMG--NPLIASTTYTSVALLYMLIGPLNAFPWVLNGLIEAWV 575
            |:..:.|..||.|:.|.||.|.|.:.  |.|.|...:.|:||..:|..|||..|.|::.:::|.|
  Rat   548 AVGTFTWVCTPFLVALSTFAVFVTVDEKNILDAKKAFVSLALFNILRFPLNILPMVISSIVQASV 612

  Fly   576 SIKRVQQLMDVPNLDYSSYYNPIMRGSGGSGAGDDAPLDAPKASVLQMKCASFCHDSDEQTSPTP 640
            |:||::..:....|:..|.....::..||..:             :.:|.|:|....||     |
  Rat   613 SLKRLRIFLSHEELEPDSIERWSIKDGGGMNS-------------ITVKNATFTWARDE-----P 659

  Fly   641 FRMKDINVDIKAGQLVCIEGPVGGGKSSFLSAIVANLQCTDGEVCVQELTTGFGYVPQSPWLQRG 705
            ..:..|...|..|.||.:.|.||.||||.|||::|.:...:|.|   .|.....||||..|:|..
  Rat   660 PTLNGITFAIPDGALVAVVGQVGCGKSSLLSALLAEMDKVEGHV---TLKGSVAYVPQQAWIQND 721

  Fly   706 TIRDNIVWGAQFDEQWYKTVLHACALEEDLQIL-GGDLVGVGENGRTLSGGQRARVALARAVYQD 769
            ::|:||::|....|..||.|:.||||..||:|| .|||..:||.|..|||||:.||:||||||.:
  Rat   722 SLRENILFGRPLQEHCYKAVMEACALLPDLEILPSGDLTEIGEKGVNLSGGQKQRVSLARAVYCN 786

  Fly   770 KKVYLLDDVLSSLDAHVARHIIKHCI--LRLLKHKTRIVVTRNIQLFFHANQILQVKDG------ 826
            ..:|||||.||::||||.:||.:..:  :.|||:||||:||..|......:.|:.:..|      
  Rat   787 SDIYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEKVVGPMGLLKNKTRILVTHGISYLPQVDVIIVMSGGKISEMG 851

  Fly   827 ---QLLPSE---------YMTQSIELSLDEDA---------------------DDEQEPTVRRRS 858
               :||..:         |.....:|:.::|:                     |...:|..|..|
  Rat   852 SYQELLDRDGAFAEFVRTYANTEQDLASEDDSKNGVSGLGKESKPVENGILVTDAVGKPLQRHLS 916

  Fly   859 ----------------VELSNQYDKKSLDSLLLEELREYGHLSGNVFTCYWKAVTSPLAFTVLLS 907
                            .||.....|:....|:..:..:.|.:..:|:..|.||:...::|..:..
  Rat   917 NSSSHSVVTNQQHSSTAELQKSGVKEETWKLMEADKAQTGQVKLSVYWNYMKAIGLCISFLSIFL 981

  Fly   908 VVLMQLTRNLSDAWLAYWVTETTLDPHKNDTSLDHILMRPTVGNETESGHTTKFYLSIFTAIAVS 972
            .:...::...|:.||:.|..:                 ||.|....|:   ..|.||::.|:.:.
  Rat   982 FLCNHVSALASNYWLSLWTDD-----------------RPAVNGTQEN---RNFRLSVYGALGIL 1026

  Fly   973 NSLVTLARAFLFAYAGIKAAIFMHEKLLKKVMFAKFNFFDITSVGRILNRFSSDTNTVDDSLPFI 1037
            ..:.....:...:..||.|:..:|..||:.|:.:..:||:.|..|.::||||.:.:|||..:|.:
  Rat  1027 QGVAVFGYSMAVSIGGIFASRRLHLDLLQNVLRSPMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPQV 1091

  Fly  1038 LNILLAQLAGLVGALCVSLYAMPWLGLVIIPMVPIYLSLQQRYRHASRDIKRLSSNAMSPLYTHF 1102
            :.:.:..|..::||:.:.|.|.|...::|.|:..:|..:|:.|..:||.:|||.|.:.||:|:||
  Rat  1092 IKMFMGSLFSVIGAVIIILLATPIAAVIIPPLGLVYFFVQRFYVASSRQLKRLESVSRSPVYSHF 1156

  Fly  1103 TETLQGLTTIRSMRASPRFQRDFQVKLEESIKAQLTQSAAQQWLALRLQLLGTLLVGGAGLLAAI 1167
            .|||.|::.||:.....||.|...:|::|:.||......|.:|||:||:.:|..:|..|.|.|.|
  Rat  1157 NETLLGVSVIRAFEEQERFIRQSDLKVDENQKAYYPSIVANRWLAVRLECVGNCIVLFAALFAVI 1221

  Fly  1168 TASHTTNPGLVGLCISYALSITGQLGDLLHAVAETEQELVAVERIDQYLQLEEEQNASGSAE--- 1229
             :.|:.:.|||||.:||:|.||..|..|:...:|.|..:|||||:.:|.:.|:|  ||...:   
  Rat  1222 -SRHSLSAGLVGLSVSYSLQITAYLNWLVRMSSEMETNIVAVERLKEYSETEKE--ASWQIQETA 1283

  Fly  1230 PPFGWPTQGVLSFREVQLSYREHLAPALRGITFQTEAFERIGIVGRTGAGKTSVLAALLRVAPLT 1294
            ||..||..|.:.||:..|.|||.|...|:.|....|..|::||||||||||:|:...|.|:....
  Rat  1284 PPSTWPHSGRVEFRDYCLRYREDLDLVLKHINVTIEGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGLFRINESA 1348

  Fly  1295 HGEIRLDQVNLKTLPLSVLRERIGVITQEPFLFEGTVRENLDPRHGFYDSEIWHAIKNSAAATLL 1359
            .|||.:|.:|:..:.|..||.:|.:|.|:|.||.|::|.||||...:.|.|:|.|:         
  Rat  1349 EGEIIIDGINIAKIGLHNLRFKITIIPQDPVLFSGSLRMNLDPFSQYSDEEVWMAL--------- 1404

  Fly  1360 VQQLGGLDGKVET--------C---GNNLSAGQRQLLCLARALLKNAKVVAIDEGTSNLDDESDL 1413
              :|..|.|.|..        |   |.|||.|||||:|||||||:..|::.:||.|:.:|.|:|.
  Rat  1405 --ELAHLKGFVSALPDKLNHECAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILVLDEATAAVDLETDD 1467

  Fly  1414 SIQQALRNAFKSCTLLFIAHRLRGLHAMDRIIVLDDGRICEEGNPQSLASDSSTIFYGMLLAQD 1477
            .||..:|..|:..|:|.|||||..:....|:||||.|.|.|.|.|..|..... :||.|  |:|
  Rat  1468 LIQSTIRTQFEDSTVLTIAHRLNTIMDYTRVIVLDKGEIRECGAPSELLQQRG-VFYSM--AKD 1528

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG7806NP_609207.1 MRP_assoc_pro 6..1472 CDD:188098 495/1617 (31%)
Abcc1NP_071617.2 MRP_assoc_pro 7..1531 CDD:188098 498/1624 (31%)

Return to query results.
Submit another query.