DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG7806 and Abcc3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609207.1 Gene:CG7806 / 34140 FlyBaseID:FBgn0032018 Length:1487 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_542148.2 Gene:Abcc3 / 140668 RGDID:71101 Length:1523 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1623 Identity:473/1623 - (29%)
Similarity:754/1623 - (46%) Gaps:275/1623 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    15 TQFCPTGLKPFANETNDLLPCFQEILLQ-LPVYTLFAAISAYNFGNQSRHVVRNGLQLRMLS-IR 77
            ::|..:.|..:.| |.||.||||..||. :|...|:||:..|.|  ..||.....:.|..|| ::
  Rat    12 SKFWDSNLTVYTN-TPDLTPCFQNSLLAWVPCIYLWAALPCYLF--YLRHHRLGYIVLSCLSRLK 73

  Fly    78 TFLAMVLALLPVAKVF-AFH-----------------QQGVELFAADLLVVSAECIMWVVHSGFL 124
            |.|.::|..:....:| :||                 ..|:.:..|.||:               
  Rat    74 TALGVLLWCISWVDLFYSFHGLVHGSSPAPVFFITPLLVGITMLLATLLI--------------- 123

  Fly   125 LTARQYGEL-SHRGSLLINVVWLTVVVLDAVWLRTSRHFSWWPWSLATLVCDLLFGVTLIPKGSA 188
                ||..| ..|.|.::.:.||..|                       :|      .:||..|.
  Rat   124 ----QYERLRGVRSSGVLIIFWLLCV-----------------------IC------AIIPFRSK 155

  Fly   189 VYSSLPRSGVSAREDEGLLSQRYTYFQFDLNESHLGHAQD----------------EANLG--SR 235
            :..:|....:.   |....:..|.||...|....|...|:                ||:.|  ||
  Rat   156 ILLALAEGKIL---DPFRFTTFYIYFALVLCAFILSCFQEKPPLFSPENLDTNPCPEASAGFFSR 217

  Fly   236 FLFHWVQPLILKGVAGKLRKIE--DLFDLPDALNITRLSEKLHLALSQSQ--------------- 283
            ..|.|...|   .:.|..|.:|  ||:.|.:.....::.::|..|..:.|               
  Rat   218 LSFWWFTKL---AILGYRRPLEDSDLWSLSEEDCSHKVVQRLLEAWQKQQTQASGPQTAALEPKI 279

  Fly   284 -----------------SLWRALHRCFGVEFYLIGILRLIADLSGFAGPLLLGGLLR--QDHADP 329
                             |..|||.|.|.....:....:||.||..|..|.||..|:|  .|...|
  Rat   280 AGEDEVLLKARPKTKKPSFLRALVRTFTSSLLMGACFKLIQDLLSFINPQLLSILIRFISDPTAP 344

  Fly   330 NQVYYYALGLF--GSTLLSAVCATHFDWRMAMVSMKMRVGVVNSIYRKALE-ARGLKE--SKPDL 389
            ....:...||.  .||:.:.:...|:.....| ::::|..::..||||||. ...:|.  :..::
  Rat   345 TWWGFLLAGLMFVSSTMQTLILHQHYHCIFVM-ALRIRTAIIGVIYRKALTITNSVKREYTVGEM 408

  Fly   390 LNLMSTDTDRIVNSCISFHFFWSIPFKLFTTLYLLYLQLGAAFLAGVIFAALLIPINRWLAKRIG 454
            :||||.|..|.::.....:..||.|.::...:|.|:..||.:.||||....||||:|..::.::.
  Rat   409 VNLMSVDAQRFMDVSPFINLLWSAPLQVILAIYFLWQILGPSALAGVAVIVLLIPLNGAVSMKMK 473

  Fly   455 IFSSGLMTAKDARLSATTETMQGAKQIKINAWEDIFITKIRGLRQEELRFLSKRKYLDAMCVYFW 519
            .:....|..||:|:...:|.:.|.|.:|:.|||..|:.::.|:||.||:.|.|..||.|:..:.|
  Rat   474 TYQVQQMKFKDSRIKLMSEILNGIKVLKLYAWEPTFLEQVEGIRQSELQLLRKGAYLQAISTFIW 538

  Fly   520 ATTPVLMCLLTFGVSVLM--GNPLIASTTYTSVALLYMLIGPLNAFPWVLNGLIEAWVSIKRVQQ 582
            ..||.::.|:|.||.|.:  .|.|.|...:.|::|..:|..|||..|.:::|:.:..||:||:|.
  Rat   539 VCTPFMVTLITLGVYVCVDKNNVLDAEKAFVSLSLFNILKIPLNLLPQLISGMTQTSVSLKRIQD 603

  Fly   583 LMDVPNLDYSSYYNPIMRGSGGSGAGDDAPLDAPKASVLQMKCASFCHDSDEQTSPTPFRMKDIN 647
            .::...||                     |....:.::...:..:..:.:...:...|..:..:|
  Rat   604 FLNQDELD---------------------PQCVERKTISPGRAITIHNGTFSWSKDLPPTLHSLN 647

  Fly   648 VDIKAGQLVCIEGPVGGGKSSFLSAIVANLQCTDGEVCVQELTTGFGYVPQSPWLQRGTIRDNIV 712
            :.|..|.||.:.||||.||||.:||::..::..:|.|.|:   ....||||..|:|..|:::|::
  Rat   648 IQIPKGALVAVVGPVGCGKSSLVSALLGEMEKLEGAVSVK---GSVAYVPQQAWIQNCTLQENVL 709

  Fly   713 WGAQFDEQWYKTVLHACALEEDLQIL-GGDLVGVGENGRTLSGGQRARVALARAVYQDKKVYLLD 776
            :|...:.:.|:..|..|||..||.:| |||...:||.|..||||||.||:||||||.|..::|||
  Rat   710 FGQPMNPKRYQQALETCALLADLDVLPGGDQTEIGEKGINLSGGQRQRVSLARAVYSDANIFLLD 774

  Fly   777 DVLSSLDAHVARHIIKHCI--LRLLKHKTRIVVTRNIQLFFHANQILQVKDGQ------------ 827
            |.||::|:|||:||....|  ..:|..|||::||..|......:.|:.:.|||            
  Rat   775 DPLSAVDSHVAKHIFDQVIGPEGVLAGKTRVLVTHGISFLPQTDFIIVLADGQITEMGHYSELLQ 839

  Fly   828 --------------------------------LLPSEYMTQSIEL-------------------S 841
                                            ||..:.::...:|                   |
  Rat   840 HDGSFANFLRNYAPDENQEANEGVLQHANEEVLLLEDTLSTHTDLTDTEPAIYEVRKQFMREMSS 904

  Fly   842 LDEDADDEQEPTVRRRSVELSNQY---DKKSLDSLLLEELREYGHLSGNVFTCYWKAVTSPLAFT 903
            |..:.:.:..|.::|.:..|..:.   ..|...:|:.||:.|.|::..:|:..|.|:|    ...
  Rat   905 LSSEGEGQNRPVLKRYTSSLEKEVPATQTKETGALIKEEIAETGNVKLSVYWDYAKSV----GLC 965

  Fly   904 VLLSVVLMQLTRNL----SDAWLAYWVTETTLDPHKNDTSLDHILMRPTVGNETESGHTTKFYLS 964
            ..|.:.|:...:|.    ::.||:.|..:......:|:||:                     .|.
  Rat   966 TTLFICLLYAGQNAVAIGANVWLSAWTNDVEEHGQQNNTSV---------------------RLG 1009

  Fly   965 IFTAIAVSNSLVTLARAFLFAYAGIKAAIFMHEKLLKKVMFAKFNFFDITSVGRILNRFSSDTNT 1029
            ::..:.:...|:.:..||......|:||..:|..||...:.|..:|||.|..||||||||.|...
  Rat  1010 VYATLGILQGLLVMLSAFTMVVGAIQAARLLHTALLHNQIRAPQSFFDTTPSGRILNRFSKDIYV 1074

  Fly  1030 VDDSLPFILNILLAQLAGLVGALCVSLYAMPWLGLVIIPMVPIYLSLQQRYRHASRDIKRLSSNA 1094
            :|:.|...:.:|.......:..:.|.:.:.|...:|::|:...|..:|:.|...||.:|||.|.:
  Rat  1075 IDEVLAPTILMLFNSFYTSISTIVVIVASTPLFCVVVLPLAVFYGFVQRFYVATSRQLKRLESVS 1139

  Fly  1095 MSPLYTHFTETLQGLTTIRSMRASPRFQRDFQV----KLEESIKAQLTQSAAQQWLALRLQLLGT 1155
            .||:::||:||:.|.:.|   ||..|.| ||:|    |::.:.|......|:.:||.:.::.:|.
  Rat  1140 RSPIFSHFSETVTGTSVI---RAYGRVQ-DFKVLSDAKVDSNQKTTYPYIASNRWLGVHVEFVGN 1200

  Fly  1156 LLVGGAGLLAAITASHTTNPGLVGLCISYALSITGQLGDLLHAVAETEQELVAVERIDQYLQLEE 1220
            .:|..:.|.|.| ..::.|||||||.:||||.:|..|..::..:::.|..::||||:.:|.:.|.
  Rat  1201 CVVLFSALFAVI-GRNSLNPGLVGLSVSYALQVTLSLNWMIRTLSDLESNIIAVERVKEYSKTET 1264

  Fly  1221 EQN-ASGSAEPPFGWPTQGVLSFREVQLSYREHLAPALRGITFQTEAFERIGIVGRTGAGKTSVL 1284
            |.. ...|...|.|||..||:.||...:.||..|...|:.:|...:..|::||||||||||:|:.
  Rat  1265 EAPWVLESNRAPEGWPRSGVVEFRNYSVRYRPGLELVLKNLTLHVQGGEKVGIVGRTGAGKSSMT 1329

  Fly  1285 AALLRVAPLTHGEIRLDQVNLKTLPLSVLRERIGVITQEPFLFEGTVRENLDPRHGFYDSEIWHA 1349
            ..|.|:.....|||.:|.:|:..:.|..||.::.:|.|:|.||.||:|.||||...:.|.:||..
  Rat  1330 LCLFRILEAAEGEIFIDGLNVAHIGLHDLRSQLTIIPQDPILFSGTLRMNLDPFGRYSDEDIWRT 1394

  Fly  1350 IKNSAAATLLVQQLGGLDGKVETCGNNLSAGQRQLLCLARALLKNAKVVAIDEGTSNLDDESDLS 1414
            ::.|..:..:..|..|||.:....|:|||.|||||:|||||||:.::|:.:||.|:.:|.|:|..
  Rat  1395 LELSHLSAFVSSQPTGLDFQCSEGGDNLSVGQRQLVCLARALLRKSRVLVLDEATAAIDLETDDL 1459

  Fly  1415 IQQALRNAFKSCTLLFIAHRLRGLHAMDRIIVLDDGRICEEGNPQSLASDSSTIFYGMLLAQD 1477
            ||..:|..|:.||:|.|||||..:...:|::|||.|.:.|..:|.:|.: :..|||||  |:|
  Rat  1460 IQGTIRTQFEDCTVLTIAHRLNTIMDYNRVLVLDKGVVAEFDSPVNLIA-AGGIFYGM--AKD 1519

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG7806NP_609207.1 MRP_assoc_pro 6..1472 CDD:188098 469/1616 (29%)
Abcc3NP_542148.2 MRP_assoc_pro 7..1522 CDD:188098 473/1623 (29%)

Return to query results.
Submit another query.