DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Piezo and Piezo2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001303314.1 Gene:Piezo / 34112 FlyBaseID:FBgn0264953 Length:2973 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063133397.1 Gene:Piezo2 / 307380 RGDID:1582973 Length:2855 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3296 Identity:870/3296 - (26%)
Similarity:1392/3296 - (42%) Gaps:797/3296 - (24%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVFSYACMVLQRIVVPAVLVLAALMRPVGISFVYLLMFFVSPFVPLATRRNFKGSVTAFFIILLT 65
            |.....|.::.|:::|..|.:|...|..|:|||||:...:.|.....|:...:|........|..
  Rat     1 MASEVVCGLIFRLLLPICLAVACAFRYNGLSFVYLIYLLLIPLFSEPTKATMQGHTGRLLQSLCI 65

  Fly    66 LSTLVLLGHITLQILAVSL-----TLPIYNCSFSERLLRHIGFVSFIDLQPFAIIEWLVPEVLVF 125
            .|...||.||...|...||     ..|.||||..|:..|.|||.|.........|...||::.:|
  Rat    66 TSLSFLLLHIIFHITLASLEAQHRIAPAYNCSTWEKTFRQIGFESLKGADAGNGIRVFVPDIGMF 130

  Fly   126 ATSLGSYLTVKRVASQPVGAE------QLENGEVVDGQ---AENAQTSSQPSAADANG-----GD 176
            ..||..:|..:.:..:|...|      :.||.|:..|:   :|.|....:    |.:|     |:
  Rat   131 IASLTIWLVCRTIVKKPDTEEVAQFNSECENEELAGGEKMDSEEALIYEE----DLDGEEGMEGE 191

  Fly   177 VQQATVTTPLQQQQQQLRKRVSMISQHIHFEGLVKISPLFCLATLFFAAVLRPSVPGGFYFLIFL 241
            ::::|.....::......|....|...|...|.|.::.|     |..:.::.||:....||.:||
  Rat   192 LEESTKLKMFRRLASVASKLKEFIGNMITTAGKVVVTIL-----LGSSGMMLPSLTSAVYFFVFL 251

  Fly   242 LSGTYWATCQTLQRGFALLLRCVMVVLVL----HSLSIVSYQTPWMQSHLNHTTLTARLIGLEPL 302
            ...|:|:.|:|..   .||..|:.|:|.:    |.:.:..||..:.|..:......|||.|::.:
  Rat   252 GLCTWWSWCRTFD---PLLFGCLCVLLAIFTAGHLIGLYLYQFQFFQEAVPPNDYYARLFGIKSV 313

  Fly   303 IESYCSPDIRVFLYNNKLSLDSYLNPFALFFAYFALALTTKHLIKPRLVR--------------- 352
            |::.||...:: :.|..||...:.||..|...|:.||...:..::..||:               
  Rat   314 IQTDCSSTWKI-IVNPDLSWYHHANPILLLVMYYTLATLIRIWLQEPLVQEEMSKEEEGALDGCS 377

  Fly   353 -QSTRKAR------TPQPLESGSSVA-------PS----VTQRGNDMQL---------------- 383
             |:|.:.|      |..|.:....::       ||    ||..||.:..                
  Rat   378 NQNTAERRRSLWYATQYPTDERKLLSMTQDDYKPSDGLLVTVNGNPVDYHTIHPSLPIENGPAKT 442

  Fly   384 --------------ESMEQRSEQENTTTSILDQIS---------YGFVSVGGFIYQNSYIFTNIL 425
                          ||.|::.|:|:.......:.|         :..|:|..||.:.|||...|.
  Rat   443 DLYTTPQYRWEPSEESSEKKEEEEDKREDSEGEGSQEEKRSVRIHAMVAVFQFIMKQSYICALIA 507

  Fly   426 MMAWSIVYHSWLTFVLLLSANVLWMIPNQRKAMMRSSPFIVLYAEALLIAQYIYGMDLNNEELP- 489
            ||||||.||||||||||:.:..||||.|:||..|.||||:|:||..||:.|||:..     ||| 
  Rat   508 MMAWSITYHSWLTFVLLIWSCTLWMIRNRRKYAMISSPFMVVYANLLLVLQYIWSF-----ELPE 567

  Fly   490 -TSVPTAGINLQQIGF---ERPIENQMRPCVPLIVKTAFVLMFWVTSRQFFKEKRDRRRDSTLAD 550
             ..||         ||   :.|.|        |..|..|.:.||:..||...|::..:....|..
  Rat   568 IKKVP---------GFLEKKEPGE--------LASKILFTITFWLLLRQHLTEQKALQEKEALLS 615

  Fly   551 FIAPLQITVGS-----------------------AGSSYLINDGKKTSK-------------FLK 579
                 ::.:||                       .....:..|..:..|             .:|
  Rat   616 -----EVKIGSQELDEKDEELQDIQVEGEPIEKEEEEEEIKEDRHEVKKEEEEEEEDDDDQDIMK 675

  Fly   580 KAGDVIKNLLVRLWIWLLVLVIFLCAITGENMTGFRICYMALFLFFLLVFQSSSKAWVKIMYGFW 644
            ..|:::..|.::.||::...:.|..:..|: :..::|.||.||||.:.::|...:.|.||:..||
  Rat   676 VLGNLVVALFIKYWIYVCGGMFFFVSFEGK-IVMYKIIYMVLFLFCVALYQVHYEWWRKILKYFW 739

  Fly   645 LFLIFYAMSILILIYTYQFDKFDTYWSDYLNVSATLQKDIGLKRYQTKDLFLHLVSPTIIVILTV 709
            :.::.|.|.:||.||||||:.|...|.:...:.....:|:|||::...:||..:..||..:::.:
  Rat   740 MSVVIYTMLVLIFIYTYQFENFPGLWQNMTGLKKEKLEDLGLKQFTVAELFTRIFIPTSFLLVCI 804

  Fly   710 IQVHYFHKRFI-------------------------------------------------ASL-- 723
            :.:||||.||:                                                 |||  
  Rat   805 LHLHYFHDRFLELTDLKSIPSKEDNTIYSHAKVNGRVYLIINRLAHPEGSLPDLAIMNMTASLDK 869

  Fly   724 -QQQPLAGGSAQQKPTETTALEPAPSKRRGSAG----SLRKSQGPSAEAAPGATTDFETS---VR 780
             ::|.||      :|.|....|.|....:|.||    ...:.:|...|:....::|....   |.
  Rat   870 PERQKLA------EPGEERTEECAKKAEKGEAGKDSDESEEEEGEEEESEEEESSDLRNKWHLVI 928

  Fly   781 DLVRISFRKIKNKSEYIFKNFKDVFWRFLELHIMKAVYIAAFVCSVSEVCVLHIIFV---GFCVL 842
            |.:.:.|.|.   .|| |...:...|..|||||:|.|.......:|.||.:.:.:|:   .|.:.
  Rat   929 DRLTVLFLKF---LEY-FHKLQVFMWWILELHIIKIVSSYIIWVTVKEVSLFNYVFLISWAFALP 989

  Fly   843 GATSRKAVQVVISRLISFIVTVIVLSKMIYQIEYLSHSQHNVVCS---DNRT------------- 891
            .|..|:    |.|.:.:....||::.||:||::.:.....:|.||   :|:|             
  Rat   990 YAKLRR----VASSVCTVWTCVIIVCKMLYQLQTIKPENFSVNCSLPNENQTNIPLNELNKSLLY 1050

  Fly   892 ---ANNAEWIGLTKADKVTGGLMSLLRTYIIYMVIVTMHAVISLRQLQMRVKIGALNAPPTKLLF 953
               .:..||:||.|:..    |:..||..::.:.|:.....:...|...|.: ..|.||.:|.:|
  Rat  1051 SAPVDPTEWVGLRKSSP----LLVYLRNNLLMLAILAFEVTVYRHQEYYRGR-NNLTAPVSKTIF 1110

  Fly   954 PNIIRADAEKDLVGLVKYLLNFGFYKFGIEISLIALVSTITYRQDIVAVVYALWLV-VLLLLRRS 1017
            .:|.|...:..|:...||.:|:.|||||:|...:..|:.|..|.|..|:::|.||: ||...||.
  Rat  1111 HDITRLHLDDGLINCAKYFVNYFFYKFGLETCFLMSVNVIGQRMDFYAMIHACWLIGVLYRRRRK 1175

  Fly  1018 QCAKIWGVFQAFFAISILTQYIVLVGLPPSSCLVFPW--DEGPFGEGIQRWAMLPGALHFNHVPK 1080
            ..|::|..:..|.|..|..||.|.:|:||:.|..:||  ....|.:.|.:|...|..:...:...
  Rat  1176 AIAEVWPKYCCFLACIITFQYFVCIGIPPAPCRDYPWRFKGANFNDNIIKWLYFPDFIVRPNPVF 1240

  Fly  1081 LIFDFIVLVILNRQKSIFCIEQRYASNDDYPGGSNRSVI--ADIAQLGRVPFDNPTHDFCSYIRN 1143
            |::||::|:..:.|:.||..|.:.|..  ...|.|..:.  .|.|...:   .||..||. :.|:
  Rat  1241 LVYDFMLLLCASLQRQIFEDENKAAVR--IMAGDNVEICMNLDAASFSQ---HNPVPDFI-HCRS 1299

  Fly  1144 YSDILKNGVLCGFYWFTLAVVFLAGTNIADLLALGYLIGAFIFLWQGSDFYLRPIHTIIFRWKWL 1208
            |.|:.|..:....:||.|.::|:.||....:..:|||:..|.||..|.|..|:||.:|:..|.||
  Rat  1300 YLDMSKVIIFSYLFWFVLTIIFITGTTRISIFCMGYLVACFYFLLFGGDLLLKPIKSILRYWDWL 1364

  Fly  1209 LAFNVANILIKTSFQMAGCLFMTQLTKDCCWLVHMLGITCTSNVLTEQIMLPEEAELALKPGECP 1273
            :|:||..|.:|....:..|.::..|.::.|||:....:.||    .:...:||:      ...|.
  Rat  1365 IAYNVFVITMKNILSIGACGYIGALVRNSCWLIQAFSLACT----VKGYKMPED------DSRCK 1419

  Fly  1274 KITHQVVLLWDTICFAFIIFQLRIFKSHYFCHIITDTKANNILASRGADIIESLRHKQIAHRHDH 1338
            ..:.:..::||:|||||::.|.|:|.|:||.|::.|.||:.|||||||::.::...|.:..|.:.
  Rat  1420 LPSGEAGIIWDSICFAFLLLQRRVFMSYYFLHVVADIKASQILASRGAELFQATIVKAVKARIEE 1484

  Fly  1339 EKQVLHKIKRKMERIRATQQK-------ML---------RPLDKQTHFDGRRTPSEHAMSDV--- 1384
            ||:.:.::||:|:||:|.|||       ||         :.:.|.:..|..|...:......   
  Rat  1485 EKKSMDQLKRQMDRIKARQQKYKKGKERMLSLTQESGEGQDIQKVSEEDDEREADKQKAKGKKKQ 1549

  Fly  1385 --APLVHNSSFTSCQGSGYL-----TPDEHSSATSGTSSPARASILSSSGGSVESVDSADAAVII 1442
              .|.|.::|... .|..||     ..:|..........|.|.|....:.|...|      |::.
  Rat  1550 WWRPWVDHASMVR-SGDYYLFETDSEEEEEEELKKEDEEPPRKSAFQRAIGKFAS------AILA 1607

  Fly  1443 EPEINVMPCDEITDYVDVQSVSEEETTVAMPKKDLSCQSKECVFKSPEPSKPTTPSTDALSTLLT 1507
            .|:..:.....|..|:...:....:..:..||..|..:.||....:.|..|              
  Rat  1608 LPKSVIKLPKTILQYLIRAAKFVYQAWITDPKTALRQRRKEKKKMAREEQK-------------- 1658

  Fly  1508 EGFLEPKRISLGLAPPEL----SPPVGMQCLAPP--------LAAYATAMASSAASSVLSTNLTP 1560
                 .:|...|..|.|.    ..|:..:...|.        :..:...:..:...|.  |....
  Rat  1659 -----GRRKGSGEGPVEWEDREDEPIKKKSDGPDNIIKRIFNILKFTWVLFLATVDSF--TTWLN 1716

  Fly  1561 NLRREHRRQSSTNAAVSWNETVSIKRSPMKKQMSADKEEVVTMRHKSLHRRHQS-MGNASY---- 1620
            ::.|||         :..:..:.|:|..:.:::.  |..|.|  .:|:|..:|: |.|.|.    
  Rat  1717 SISREH---------IDISTVLRIERCMLTREIK--KGNVPT--RESIHMYYQNHMMNLSRESGL 1768

  Fly  1621 -SLDEASQSQRKRLSSNLSGARDEAALRSAQRPHSWGPVGTSSYMESLMCAFYEPALLHGPSTRA 1684
             ::||.|.          :|:|.:||.|                |:||                 
  Rat  1769 DTIDEHSG----------AGSRAQAAHR----------------MDSL----------------- 1790

  Fly  1685 GDYYMFEEMDDKFELDLIHDEIDFLEEENITESEMKMQRRKTLYDVWKDLNDAEYRRHFYMRERS 1749
                      |.      ||.|    ....||:.:.:.|:.||.|                    
  Rat  1791 ----------DS------HDSI----SSCYTEATLLISRQSTLDD-------------------- 1815

  Fly  1750 YASEPGSRILLKLDDEKEKIGPDLGLASDHDEDDDTIECDLGMRTSTLSEPLDFGRRSQTLLEVK 1814
                        ||.:                       |...:||..:.|        .|.:|.
  Rat  1816 ------------LDGQ-----------------------DPVPKTSERARP--------RLRKVF 1837

  Fly  1815 SKDAPTGEFPSTSKGISKERDAATASSSASPAPTRDVGDLPVIPPPSTGL----GREQTSKETSD 1875
            |.|..:              .:|.:.|.||..||:           .|.|    |..:|.:|...
  Rat  1838 SMDMSS--------------SSADSGSVASSEPTQ-----------CTMLYSRQGTTETIEEVEA 1877

  Fly  1876 SKSKMEVDSGEVTAKDSDEDFDTNPIIRLLEGFLVTLTIRLNRFSRNYRFVNRILAGEKKTLKES 1940
            ...:..|:|.|....|::|                      ..::.:|.      ||.::.    
  Rat  1878 EAEEEVVESLEPELHDAEE----------------------KEYAADYE------AGVEEV---- 1910

  Fly  1941 SSLNRLGLSSAAAMFHFLKSNLESDESEPPASSSTPRRVVIAPPNATEHSDPTSTTLNTNTTTTP 2005
                                :|..||..|  ..||....|.|||:   :|...|           
  Rat  1911 --------------------SLTPDEELP--QFSTDDGDVEAPPS---YSKAVS----------- 1939

  Fly  2006 LSPPEPLQPLQPLQPNTTSTPQQQHQHIRAAEEIIELPVDTVDGVAH--------RKQSINSS-- 2060
                                    .:|:..|.:      |...|..|        |...:.||  
  Rat  1940 ------------------------FEHLSFASQ------DDSGGKNHMVVSPDDSRTDKLESSIL 1974

  Fly  2061 PPAKGTMLSRKSDCGLPEIRIKAPSIERGAHYYHNHHSGGGSGSLSKHWSYEQVDSAGEFNLEEE 2125
            ||.                               .|........:||.:..::::.:.:|.:::.
  Rat  1975 PPL-------------------------------THELTASDLLMSKMFRDDELEESEKFYVDQP 2008

  Fly  2126 NFAQRDHHIIVEVLISSWY-ALLANTDLICYIVVFINQVVNASLISLPLPIMVFLWGTLSLPRPT 2189
            .|.         :|..:.| .|:|.::::||.|:.:|.:::||:|:|.|||::|||..||:|||:
  Rat  2009 RFL---------LLFYAMYNTLVARSEMVCYFVIILNHMISASIITLLLPILIFLWAMLSVPRPS 2064

  Fly  2190 KTFWVTLIAYTQAIVLIKCIFQFKLI-WSNYHQL-PNQPLTPAKIFGVENKAHYAIYDLILLLVL 2252
            :.||:..|.||:..:::|..|||... |:...:: .::|..|..|.|||.|..|.:||||.||.|
  Rat  2065 RRFWMMAIVYTEVAIVVKYFFQFGFFPWNKDLEIYKDRPYFPPNIIGVEKKEGYVLYDLIQLLAL 2129

  Fly  2253 FLHRYLLKSQGLWKSGYKDTDNQFTKPTASIDERDDSDNLSQPDSRQLNDDAAQKLSLQVSQASL 2317
            |.||.:||..|||     |.|:.....|   |:....|.||....|:.:.::.:.::|..|..|:
  Rat  2130 FFHRSILKCHGLW-----DEDDIVDSNT---DKEGSDDELSLGQGRRGSSESLKSINLAASVESV 2186

  Fly  2318 ----PGSP----------------------EFSKTG----------------INQLER------- 2333
                |..|                      ..||.|                |.|..:       
  Rat  2187 HVTFPEQPAAIRRKRSCSSSQISPRSSFSSNRSKRGSTSTRNSSQKGSSVLSIKQKSKRELYMEK 2251

  Fly  2334 ------------TKYTSSLY----KFFFSLVHKSRLA-TDVYALMFLCDFVNFFVLLFGFTAFGT 2381
                        .|.|..:|    :||:.|:|....| ||||.||||.|.|:|.:::|||.|||.
  Rat  2252 LQEHLIKAKAFTIKKTLQIYVPIRQFFYDLIHPDYSAVTDVYVLMFLADTVDFIIIVFGFWAFGK 2316

  Fly  2382 QQTESDEGVQTYLAENKVPIPFLIMLLVQFLLIVIDRALYLRKALVNKIIFHFFSVIGIHIWMFF 2446
            ....:|  :.:.|:|::||.|||:|:|:||..:|:||||||||.::.|:||....|.|||.||||
  Rat  2317 HSAAAD--ITSSLSEDQVPGPFLVMVLIQFGTMVVDRALYLRKTVLGKVIFQVILVFGIHFWMFF 2379

  Fly  2447 VVPAVTERTFNSLAPPIIFYVIKCFYMLLSSYQIKSGYPKRILGNFFTKGFSMVNMIAFKVYMQI 2511
            ::|:||||.|:......::|.:||.|..||:|||:.|||.|:||||.||.::.||:..|:.:..:
  Rat  2380 ILPSVTERKFSQNLVAQLWYFVKCVYFGLSAYQIRCGYPTRVLGNFLTKSYNYVNLFLFQGFRLV 2444

  Fly  2512 PFLYELRTILDWVCIDSTMTIFDWLKMEDIFSNIYLIRCTRQSETDFPAMRAQKKASLSKLIMGG 2576
            |||.|||.::|||..|:|:::..|:.:|||:::|::::|.|:||..:|..|.|||....|..|||
  Rat  2445 PFLTELRAVMDWVWTDTTLSLSSWICVEDIYAHIFILKCWRESEKRYPQPRGQKKKKAVKYGMGG 2509

  Fly  2577 TIVLLIVICIWGPLCLFALGNAV-GTSNVPFHVSLSIRIGPYDPIYTTNNYDSIFEI-NPEMYSQ 2639
            .|::|::..:|.||...:|..:| |..|.|..||::|.:|.|.||:|.:...|..:: :...|::
  Rat  2510 MIIVLLICIVWFPLLFMSLIKSVAGVINQPLDVSVTITLGGYQPIFTMSAQQSQLKVMDGTKYNE 2574

  Fly  2640 MTNAYIKEKQALTFIAGYDATDVAAVRLAGNSPSLWNIAPPDRQRLLNDLRN-NHTLKARFSYSL 2703
            ...::.....|:.|:..|:..|:....|.|||.|||.|:||.:|:::.:|.: |......||:|:
  Rat  2575 FIKSFGPNSGAMQFLENYERQDITVAELEGNSNSLWTISPPSKQKMIQELTDPNSCFSVVFSWSI 2639

  Fly  2704 TRKAPAKGLKENVGDEHAISLDESFEGRAALIHMLSETHDVEPIYSNGTTNGTTPEVEEVVVIPG 2768
            .|........|...|:.:..|.::  .|:::..|::         .|.|.:..||     |.|..
  Rat  2640 QRNMTLGAKAEIATDKLSFPLTDA--TRSSIAKMIA---------GNDTESSNTP-----VTIEK 2688

  Fly  2769 MIPKFIKVLNSGDAAVVSVLSPKHYDYRPLVIKMHRDNET--NGLWWEIRDYCNDTFYNETLSKF 2831
            :.|.::|..:..::..:..|..:: ::..:.|.:.|||.|  |..||.:         |.|.|:.
  Rat  2689 IYPYYVKAPSDSNSKPIKQLLSEN-NFMNITIILFRDNVTKSNSEWWVL---------NLTGSRI 2743

  Fly  2832 AYSNCTSGIVMYTFNDKKFPSTFSFLTAGGIIGLYTTFVLLASRFMKSFIGGQNRKIMFEDLPYV 2896
             ::..:..:.:..||||..|.:..||...||:|||.:.||:..:|::.|..|.:..||||:||.|
  Rat  2744 -FNQGSQALELVVFNDKVSPPSLGFLAGYGIMGLYASVVLVIGKFVREFFSGISHSIMFEELPNV 2807

  Fly  2897 DRVLQLCLDIYLVREALEFALEEDLFAKLLFLYRSPETLIKWTRPK 2942
            ||:|:||.||:||||..|..|||||:|||:||||||||:|||||.|
  Rat  2808 DRILKLCTDIFLVRETGELELEEDLYAKLIFLYRSPETMIKWTREK 2853

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PiezoNP_001303314.1 PIEZO 1226..>1386 CDD:464941 52/180 (29%)
Piezo_RRas_bdg 2511..2941 CDD:463481 151/434 (35%)
Piezo2XP_063133397.1 None

Return to query results.
Submit another query.