DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Tep3 and Mug6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523507.2 Gene:Tep3 / 34045 FlyBaseID:FBgn0041181 Length:1469 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038963368.1 Gene:Mug6 / 297572 RGDID:1566313 Length:1493 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1558 Identity:396/1558 - (25%)
Similarity:665/1558 - (42%) Gaps:250/1558 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    14 LILVTACLLCQTSA---QGLYSIIAPNTLRPNSQFHVAVSLHNAPESATFKVGILGSSYT----D 71
            |..|...||...|:   ...|.::.|:.|..::...:.:.|::..|:.|....::....|    |
  Rat    11 LFSVLLALLPSASSFNGNSKYMVLVPSQLYTDTPEKICLHLYHLNETVTVTASLISQRGTRKLFD 75

  Fly    72 FKTVELRPFSTQLLHFEIPAL----RTDRYRLTAEGLGGVQFTNETQLHFESKQHTVLVQTDKSI 132
            ...|:...|  ..|.|.||.|    ..:...:..|| ...:|:....:..::|:..|.|||||.:
  Rat    76 ELVVDKDLF--HCLSFTIPRLPSSEEEESLDINIEG-AKHKFSKRRVVLVKNKESVVFVQTDKPV 137

  Fly   133 YKPGDLVHYRVLILDANLKPAR-----GYGRVHVDIKDSGDNIIRSYKDIRLTNSIYSNELRLSD 192
            ||||..|.:|::.:|.||.|..     .|      |:|...|.|..::||:..|.:......||.
  Rat   138 YKPGQSVKFRIVSMDKNLHPLNELFPLAY------IEDPKINRIMQWQDIKTENGLKQLSFSLSA 196

  Fly   193 SPRFGTWSIVV-DVSDQEHTQTFEILDHILPKFVVDIDTPKHAIYKDGKIAATVRAHYAFGQPIV 256
            .|..|.:.||: ..|..:...:|.:::.:||:|.||:..|......|..|:.|..|.|.:|:|:.
  Rat   197 EPIQGPYKIVILKQSGVKEEHSFTVMEFVLPRFGVDVKVPNAISVYDEIISVTACATYTYGKPVP 261

  Fly   257 GEATLSI---YPTFFGSLQPFVNDLITRKVVPIDGNAYFEFDIE-NELHLKQDY---ERQYLLDA 314
            |...:|:   .|:|....:....:    :...:|.|.....::. .|..||::|   .:.:.::|
  Rat   262 GRVKISLCHGNPSFRSQTKSACKE----EDSELDNNGCSTQEVNITEFRLKENYLKVRQAFHVNA 322

  Fly   315 LVEEKSTGSVQNYSTVLTLHLNHYRVEAVKVPSYYIPGVPFEATARIARNDGGQLRDFNPQI--- 376
            .|.|:.|||..:.|..:.:.....:...:|..|::..|:||....|:....|..:.  |.|:   
  Rat   323 TVTEEGTGSEFSGSGRIEVKRTRNKFLFLKADSHFRHGIPFFVKVRLVNIKGDPIP--NQQVFIK 385

  Fly   377 --TAYLTNVYGSSEMYNRTAYSLDASGEIKMKFTVPIGDRDE----------------------F 417
              .|..||. .:::.:....:|:|.||..:....:.:..::|                      .
  Rat   386 AQGAGFTNA-TTTDQHGLAKFSIDTSGISRYILNIKVYHKEENSCIHSSCTAERHAEAHHTAYAV 449

  Fly   418 HSIIVDYQGVISEVGKIPSKHLHSKN---YITAKVLNDRPTVNQEISVVVRSFAPIKYFMYQVVG 479
            :|:...|..:.:|.|.:|....|:..   .:..:||...|.:               .|.|.|:.
  Rat   450 YSLSKSYIYLDTEAGVLPCNQSHTVQAHFILKGQVLGVLPQI---------------VFHYLVMA 499

  Fly   480 RGDIILSRN--VDVAPGTF-----HTIKFLASFAMMPRANLLVYTVI-DGEFVYDEQVIQLEENL 536
            :|.|:.:.|  ..|.||..     ..::....|:|:|.|.:|:||:: |||.:.|....|:|:.|
  Rat   500 QGSILQTGNHTHQVEPGESPVQGNFALEIPVEFSMVPMAKMLIYTILPDGEVIADSVKFQVEKCL 564

  Fly   537 LNAVQVD-APIRAPPGQDIDIGISTKPYSYVGLMLVDQNANDLRSGHDLTHKRLMDALRSYELSD 600
            .:.|.:. :|.::.|.....:.::..|.|..||..|||:...|:...:|:...:.|.        
  Rat   565 RHEVHLSFSPSQSLPASQTHMRVTASPQSLCGLRAVDQSVLLLKPEAELSPSLIYDL-------- 621

  Fly   601 VNTPMGSPG-KESGVITMSNTDYFIEKEAESNPALDR---------EVSTGPEEDKLTTVRKTDI 655
                   || :||..|..|:..:    |.|....:.|         .|..|.|:|....:|.|.:
  Rat   622 -------PGMQESKFIPRSHYPF----EDEDGCVIYRPRVIGKLTYSVPYGREKDVFRYMRDTGL 675

  Fly   656 GPAHKIEVNTLPPGKGRYAFSYTPKPF------------------WHNPRVHVM----------- 691
            .....:::.|       :.|.|...|.                  |.:.||..:           
  Rat   676 TALTNLKLRT-------FCFDYDMVPLAVPAARSSDLFNSDGYGSWRSARVKSLPPKKAPHKDPP 733

  Fly   692 -RDPA---------DTWLFLNISASSDGRNSIHRRIPSEMTSWVVSAFALDPVNGLGLSPPNGKL 746
             :||.         :||::..::.:|.|...:...:|..:|.|...|..|....|||||.. ..|
  Rat   734 PKDPVIETIRNYFPETWVWDLVTVNSSGAAELEMTVPDTITEWKAGALCLSNDTGLGLSSV-ATL 797

  Fly   747 EAYKEFYISTELPYSIKRDELIAIPFVVHNNRDSDLNVEVTFYNSALDFDFPQLDPKATNQPKVE 811
            :|::.|::...:|||:.|.|...:...|.|...:.|.:.|....|.   ||..: |...:|... 
  Rat   798 QAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVMNYLPTSLPMAVQLEASP---DFTAV-PVGNDQDSY- 857

  Fly   812 LYRRRSLQVPGRSARSVSFIVTPKRVGPLLVKAMAASSQA----------------GDTVEQNLL 860
                 .|...||  .:.|::||||.:|.:.....|.:.|:                .|||.:.|:
  Rat   858 -----CLGANGR--HTSSWLVTPKSLGNVNFSVSAEAQQSPEPCGSEVATVPETGRKDTVVKVLI 915

  Fly   861 VEHPGAMERINRGFLFE---LNSNAQNRRNVTIAVPRNAIPESTRIEVSAVGDLIGSLVGNLDSL 922
            ||..|    |.|...|.   ..|:|:....:::.:|...:.:|.|...|.:||::.|.:.|..:|
  Rat   916 VEPEG----IKREHTFSSLLCASDAELSETLSLLLPPTVVKDSARAHFSVMGDILSSAIKNTQNL 976

  Fly   923 ILLPTGCGEQTMVNFVPNLIVLRYLGRLRQLTPEVELRATNNLAIGYQRILYYRHENGAFSAFG- 986
            |.:|.|||||.||.|.|::.||:||...:|||.:::.:|...|..||||.|.|:|::|::|||| 
  Rat   977 IQMPYGCGEQNMVLFAPSIYVLKYLNETQQLTEKIKSKALGYLRAGYQRELNYKHKDGSYSAFGD 1041

  Fly   987 LDIK-RSSTWLTAYVARSLRQAAPFTQVDSNVLQKALTYLGSVQSANGGFEERGDVFE---RFG- 1046
            .|.| :.:|||||:|.:|..||..|..:|.:.:..|.|:|...|..:|.|...|.:|.   :.| 
  Rat  1042 HDGKGQGNTWLTAFVLKSFSQAQAFIFIDESHITDAFTWLSHQQKDSGCFRSSGSLFNNAMKGGV 1106

  Fly  1047 DDGISLTAFVTLALMENVDLYPEYRNN-INKAL-------DFITRGLDGSSNLHAMAIGTYVLSR 1103
            ||.|:|:|::|:||:|:  |.|:..:. ::|||       :.|.:|.:||. ::..|:..|..:.
  Rat  1107 DDEITLSAYITVALLES--LPPDTEHPVVSKALSCLESSWENIEQGGNGSF-VYTKALMAYAFAL 1168

  Fly  1104 A-NHNAKAAFLQRLDSMATNKD-GLKWWNKTAPAGEQQSPWYNATRSVNIEISAYAALALLENNL 1166
            | |...:...|:.||..|..:| .:.|.....|....:|.:.....|..:|::||..||    .|
  Rat  1169 AGNQEKRNEILKSLDKEAIKEDNSIHWERPQKPMKSARSLYKPQASSAEVEMNAYVILA----RL 1229

  Fly  1167 VGDALP----------VLNWLMDQRNPKGGFVASQDTVVGLQALLMF-AERFSSQGNNLQIGFHY 1220
            ...:.|          .:.||..|:|.:|||.::|||||.|.||..: |..||.......:....
  Rat  1230 TAQSAPSPKDLALSMGTIKWLTKQQNSRGGFSSTQDTVVALDALSKYGAATFSKSQKTPSVTVQS 1294

  Fly  1221 GEGAETIINVNAENSLALQTVELPNNLKNLSVSATGRGMALAQVSYTYNTNVTSAWPRFVLDP-- 1283
            .........|:..|.|.||.|.||:...|.:||.:|.|...||....||..:....|.|.|..  
  Rat  1295 SGSFFQKFQVDNSNRLLLQQVSLPDIPGNYTVSVSGEGCVYAQTMLRYNLPLEKQQPAFALKVQT 1359

  Fly  1284 ---TVNRNSHADYLHLSACASFVSVVGENEQRSNMAVMEVHLPSGFVVDRDTLPTLESSERIKKV 1345
               |.|.....:...:|...|:..    :...|||.:.:|.:.|||:..:.|:..||..|.:.:.
  Rat  1360 VPLTCNNPKGQNSFQISLEISYTG----SRPASNMVIADVKMLSGFIPLKPTVKKLERLEHVSRT 1420

  Fly  1346 ETQNRNTKVVIYFDYLDRREVCPTLHAYKTVKVTKHRPVAVVMYDYYDSARRARQFYRAPKSN 1408
            |....|  |::|.|.:..:.:..:....:.:.|...:|..|.:||||::...|...|.:|.|:
  Rat  1421 EVTTNN--VLLYLDQVTNQTLSFSFIIQQDIPVKNLQPAIVKVYDYYETDEVAFAEYSSPCSS 1481

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Tep3NP_523507.2 YfaS <128..1399 CDD:441940 365/1422 (26%)
A2M_2 918..1203 CDD:239227 109/310 (35%)
Mug6XP_038963368.1 YfaS <129..1352 CDD:441940 338/1300 (26%)
A2M 749..839 CDD:459711 26/90 (29%)
A2M_2 969..1276 CDD:239227 109/313 (35%)
A2M_recep 1386..1476 CDD:462226 24/91 (26%)

Return to query results.
Submit another query.