DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Tep2 and A2ml1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523506.1 Gene:Tep2 / 34044 FlyBaseID:FBgn0041182 Length:1420 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001418713.1 Gene:A2ml1 / 362442 RGDID:1565709 Length:1458 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1526 Identity:372/1526 - (24%)
Similarity:672/1526 - (44%) Gaps:204/1526 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 IFLTGIILQYALLVNATGIYSVVGPGTLRSNSKYNVVVSVHKADGPSQIKVSLNGPSYNETKQIE 68
            |.|:.::|....:|.:...|.:.....::..|.....:.:...:.|..:.|.|.....|.|    
  Rat     5 IVLSALVLHLTNVVASEPRYLLWVSAVVQRFSSEKACLHLVNLNEPVSLSVILEYAGVNTT---- 65

  Fly    69 LPPMSTQNVEFEVPKLATGNYNLSAEG------VSGVVFKNSTKLN------YADKKPSVFVQTD 121
               :..|.|: |....|..|:.:|...      |:.:|.:|:..::      .|.::.:.|||||
  Rat    66 ---IFDQRVK-EGNFYACANFKVSHVSPEQLAFVTLLVQQNTLIISERRAVAVAAEENATFVQTD 126

  Fly   122 KATYKPADLVQFRILFLDENTRPAKIEKPISVIIIDGAQ-NRIKQLSDVKLTKGVFSGELQLSEQ 185
            ...:||.|.|.||::.|:...:|  :::...:|.:...| |.|.|..:|...:.:.....||:.:
  Rat   127 TPVHKPGDTVHFRVVTLNTWLKP--VDELYPLITVQNPQGNVIFQWINVTTFRNITQLSFQLTPE 189

  Fly   186 PVLGTWKISVSVDGDNRETKSFEVDKYVLPKFEVIVDTPKAVVIADKVIKATIRAKYTYGKPVKG 250
            ||||.:.|.:...........|.|::.|||:|||.:..|:.:.|||......:.|||.||:||:|
  Rat   190 PVLGDYMIVIKKQSGMTVVDHFTVNQDVLPRFEVELTAPETITIADNQFPVVMCAKYIYGQPVRG 254

  Fly   251 KATVSMER---SYGYFGDLNANGNKQEKTIDV-DGKGH--VEFDIIHWAQRGQYLPPIKLFAVVT 309
            ||.:.:.|   |.||. :.|.|...::.|:.: ||...  |...:....:.|.:: .:.:..|:|
  Rat   255 KAQIKVCRELFSPGYC-ESNENEICEQFTLQLKDGCASYIVNTKVFQLYRSGLFM-TLNINGVIT 317

  Fly   310 EELTGNKQNATATVVLHQQRYSIE------------PYERPEHFEA--NKSFIYQVVVKNVDGSP 360
            |..||.:.:.|.:|.:.....::.            ||.....|..  |...:.:::...:||.|
  Rat   318 ESGTGVQISKTHSVFITSVLGTVSFENMDSFYRRGIPYFGTLKFSGPNNTPMVNKLLQLELDGKP 382

  Fly   361 VTNSAKNVK--IGFDKSYSYFHEPSPKTRINFEAPVNENGIATFNVRLPD---SDSRYYRIFASF 420
            :.|...:.|  ..|..:.|...|.....:..:..|.:.:..:..:....|   |.||:|...:||
  Rat   383 LGNYTTDEKGEAQFSINTSEIFEAQMSLKATYVRPRSCHRSSWLDPEYLDAYFSASRFYSQTSSF 447

  Fly   421 DGSENTIGSISKFEPTPMSREPLKIQVNTKKPRLGEQVSFDVVSIEDLPYFVYTIVARGNVILSD 485
                  :..|.:.:|.|..:|.:...:.:..|.:.::.|        ...|.|.::.||:::||.
  Rat   448 ------MKIILEPKPLPCDQEKMVSVLYSLNPEVYKEAS--------KVTFFYLVMVRGSILLSG 498

  Fly   486 YVDV----PDGQKTYTVKFTPTFSMVPKATIYVYYV-VNNDLQFEEKTIDFEKEFSNSIDVS-AP 544
            ..:|    .:|..::.:  ..|..:.|.|.::||.: .:.::..:...:..||.|.|.:.:. :.
  Rat   499 QTEVKVQAQNGNFSFPI--IVTADLAPAADLFVYTLHPSGEIVADSVKLQTEKCFKNKVSIKFSK 561

  Fly   545 TNAKPSEEVKLRIKTDADSFVGLLGVDQSVLLLKSGNDLSQDDIFNSLNIYQTSTPWMNGYGRY- 608
            ....|.....|.::....||..|..||:|.|||..|.:::.:.::|.|       |:::.||.: 
  Rat   562 EQDLPGSNTSLHLQAAPGSFCALRAVDKSALLLNHGQEMTPESVYNML-------PYVHQYGYFY 619

  Fly   609 ---------------------------------PGQTSGLV------TLTNANY-------PYNT 627
                                             .|..|.||      ..||..|       ....
  Rat   620 NGLNLDDERADPCIPQKDLFHNGLYYKPTSNVWDGDLSNLVRNMALKIFTNIRYRKPEVCSSQEN 684

  Fly   628 GPLVMSYVFEGSRHPWITRPRYRVGIRGDSGDRISFLSQSLNDR----NLKEILLKQTPQRTTIR 688
            .||:.::          ..|..|:.:.|..|...:..:.:.:|.    :..::.:|:     |:|
  Rat   685 QPLLRTF----------NDPNERIMMYGGGGGGGAPAASAFHDAPDSISHAKVAIKE-----TVR 734

  Fly   689 KEFPETWFFENVGEEEFTLTK---KIPDTITSWVVTGFSLNPTSGIALTKNPSKIRVFQPFFVST 750
            ..||:||.:..:..:....|.   .:|||||.|..:.|.:|..:|..::...| :::.||||:..
  Rat   735 TNFPKTWLWNLISVDSSGSTNVSFLVPDTITQWQASTFCVNGNAGFGISPKVS-LQISQPFFMEV 798

  Fly   751 NLPYSVKRGEVIAIPVVIFNYLDKTLDADVVMDNSDQEYEFTEATNEVLEKAIDEVRRVKRVTIP 815
            ..|:||.|.|...:.|.:|||....::..|.::.| :.||.:..|....:..:          :|
  Rat   799 TSPFSVVRSEQSDLIVTVFNYRTTCVEISVQLEAS-ENYEASINTQSNTDSEV----------LP 852

  Fly   816 ANSGKSVSFMIRPKNVGFTTLKITATSALAG---------------DAIHQKLKVEPEGVTLFEN 865
            |...|:..:.:.||.:|...:.:.|||..:.               |.:.:.|.|||||:.. |:
  Rat   853 AGEQKTYVWTVTPKTLGKVNITVVATSKQSSACPNDAHEEQDVNWKDTVVKTLLVEPEGIEK-ES 916

  Fly   866 RAVFINLKDQPEMSQSLDADIPNEVVPQS--EFIEFSVVGDLLGPTLQNLDNLVRMPYGCGEQNM 928
            ...|:......:.|:.:..::||:||..|  .|:.|  |||:||..:|||::|::.||||||||:
  Rat   917 TQSFLICPKGTKASKQITLELPNDVVEGSARSFVTF--VGDILGVAMQNLESLLQTPYGCGEQNI 979

  Fly   929 VNFVPNILVLKYLEVTGRKLPSVESKARKFLEIGYQRELTYKHDDGSYSAFGKSDASGSTWLTAY 993
            .....:|.:|.||..|.:....|.|||...|..|||:.|::|:.||||..|..::..||.||:|.
  Rat   980 AQLAADIYILDYLNATKQLTEEVRSKALLLLSKGYQKHLSFKNYDGSYDVFCHNNQEGSVWLSAL 1044

  Fly   994 VMRSFHQAGTYTDIDPKVITAGLDFLVSKQKESGEFPEVGKLFDNA----NQNPLALTSFVLLAF 1054
            ..::|.:...|..|:..|....|.:||.|||.:|.|.:...|.:||    :::.:|||::|:.||
  Rat  1045 SFKTFEKMKEYIFIEETVPKQTLIWLVKKQKSNGCFRKNENLVNNAQEDSDEDDIALTAYVVGAF 1109

  Fly  1055 FEN--HELIPKYQSAIKKAVRYVAEEA--DKTDDQYSLAIAAVALQLA-KHPQSEKVIAKLESVA 1114
            .|.  :...|..::.:     |..|||  ....|.::.||.|....|| |..|.:.::..|:..|
  Rat  1110 LEGGLNSSFPALRNGL-----YCLEEAFSSSVTDDHTQAIMAYVFTLAGKQQQVKSLLPILDRSA 1169

  Fly  1115 RKENDRMWWSKATESTGEDGRVFHWKPRSNDVEITSYVLLALLEKD--PAEKALPIIKWLISQRN 1177
            .|.|:.::|.|..:...:....|.....|.:.|.|.|||||:|.:|  ..:.|..|::||..:.|
  Rat  1170 TKTNNMIYWEKDEKPKADSSPSFIPSALSGETEKTCYVLLAVLSQDTPDLDYASKIVQWLAQRMN 1234

  Fly  1178 SNGGFSSTQDTVIGLQALTKFAYKTGSG-SGTMDIEFSSAGESKNTIKVNPENSLVLQTHDLPKS 1241
            |:||||:.|||.:.|.|||::...|||. ..|:.:   |..||:....:|.:|.|::|...:.:.
  Rat  1235 SHGGFSAVQDTTVCLLALTRYMKLTGSNPQNTITL---STEESEEVFHINRDNRLLVQHSKVSEG 1296

  Fly  1242 TRKVDFTAKGTGSAMVQLSYRYNLAEKEKKPSFKVTPTVKDTPNQLLIVDVCAEYVPLEDADKDK 1306
            .|:.....:|.|.:..|.:.|||:...::...|.::...:.:.:...:.......|.|......:
  Rat  1297 HRRYTVDVEGDGCSFTQATLRYNVPLPKEASGFSLSVKTRKSNSSDELQTKFDLMVTLTYTGAHE 1361

  Fly  1307 DSNMAVMEIALPSGFVGDSTSLGKIQAVDRVKRVETKNSDSTVVVYFDSLTPGDVRCLPLEASKA 1371
            .|...::::.:.|||....:|:.:::...:..:.:.||..   |:::....|...........:.
  Rat  1362 SSGTVLVDVRMLSGFTPVFSSIEELKFNGQAMKTDIKNGH---VLFYLKNVPKAATSFTFSIEQT 1423

  Fly  1372 HAVAKQKPASVSLYDYYDTERKATEYYQVKS 1402
            :.|...:||.|:::. |:.:..|.:.|.:.|
  Rat  1424 NLVVNIQPAPVTVHS-YEKDEYAFDSYNINS 1453

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Tep2NP_523506.1 YfaS <72..1395 CDD:441940 358/1449 (25%)
A2M_2 909..1198 CDD:239227 106/299 (35%)
A2ml1NP_001418713.1 A2M_2 960..1255 CDD:239227 106/299 (35%)
A2M_recep 1361..1450 CDD:462226 15/92 (16%)
YfaS <122..1379 CDD:441940 338/1321 (26%)

Return to query results.
Submit another query.