DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RapGAP1 and Rap1gap2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097114.2 Gene:RapGAP1 / 34032 FlyBaseID:FBgn0264895 Length:959 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017452778.1 Gene:Rap1gap2 / 303298 RGDID:1304590 Length:808 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:840 Identity:299/840 - (35%)
Similarity:432/840 - (51%) Gaps:120/840 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   122 PAGGGSGSGSVTHSPERLRGATTATQDLFELLE-RVQCSRLDDQRCVLPAY---FSQNHHRGSNA 182
            |...|:.|.:...:.:.:.|.....::.::|:. .:|..|...:...|.|:   :|...||..:.
  Rat    20 PTAAGAASAAQGAAGQGMAGRRAPGENRWQLVRWYIQEGRFRIEERTLTAFQWLYSPQQHRILSR 84

  Fly   183 SEERVPQPHSPHDSHAHPHNGGLQHSGSRATLRHSMNHSSSSTVSGSACSSTPASPQLSG---VV 244
            ::...|   |..|.   ....||:      ..:..:.:||..|:     ...|.||.|:.   :.
  Rat    85 ADLESP---SRIDK---TMLAGLK------VKKQELANSSDVTL-----PDRPLSPPLTAPPTMK 132

  Fly   245 SASGCQLLS--NGHHYQSQ-SSVSSNSSIVSAIPASQRLLEEALAKPAPYPMILLPLHGGYWMD- 305
            ||...::|.  .|...:.| .....|.......|:    :||.:.|..|||.|:||..||||:: 
  Rat   133 SAEFFEMLEKMQGIKLEEQRPGPQKNKEDYIPYPS----IEEVVEKGGPYPQIILPQFGGYWIED 193

  Fly   306 ----GTEHECG---YDARGNPLLPQTTWMAKFETDDTAKCYRRFYAAREHSNLIGLDEQLGPILL 363
                ||....|   |:......|...|:..|.|....|:.|||.:..::|.|.......||.::|
  Rat   194 PENVGTPTSLGSSVYEEEEEDSLSPNTFGYKLECRGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLIL 258

  Fly   364 SIKTENVANQEHMRILMRLRTGTMHELLPVSCLLPQPSPAKMAHTLNENITVEHFMPILCPKASQ 428
            |||.|.....|::||::|.:..|:||.:|::.|...||..::|....::.....|.|:|.|||||
  Rat   259 SIKCEEAEGIEYLRIILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLKFNPVLYPKASQ 323

  Fly   429 LISVYDEHVLVSHFKFGVLYQRYGQTTEEELFGNQQTSPAFDEFLDVLGQRIRLKDHKGYRGGLD 493
            :|..||||.:.:.|||||:||:..||.|||||||.:.||||.||||:||..|.|:|.||:|||||
  Rat   324 MIVSYDEHDVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLD 388

  Fly   494 IQNGHTGDTAVYEVFKEREIMFHVSTLLPHTEGDPQQLQRKRHIGNDIVAIVFQETNTPFSPDMI 558
            :.:|.||..:||..|::|||||||||.||.|:||.||||||||||||||||:|||.||||.||||
  Rat   389 VTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDTQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMI 453

  Fly   559 ASHFLHAFIVVQPIEPNTPHTRYKVSVTARDDVPFFGPTLPNPAVFRKGQEFKEFILTKLINAEN 623
            ||:||||:||||.....|....||||||||:|||.|||.||:|.||:||.||:||:||||.||||
  Rat   454 ASNFLHAYIVVQAESTGTETPSYKVSVTAREDVPAFGPPLPSPPVFQKGTEFREFLLTKLTNAEN 518

  Fly   624 ACYKAEKFAKLEQRTRTSLLQNLCEELREKTRDFLGTDLSQTSAGSPTPETPKAESGSGGNAGSR 688
            ||.|::||||||.|||.:||.||.:||...|:..||..          ||..|.|:|..|.    
  Rat   519 ACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHTHTQVMLGMG----------PEEDKFENGGHGG---- 569

  Fly   689 FIDTVKKALIMRVRSQSVDTGNG-----HG---PGQTD-------------KFSVNTKLGTLNSK 732
            |:::.|:|:  ||||.|::|..|     ||   ||...             .||......|:.::
  Rat   570 FLESFKRAI--RVRSHSMETMVGSQRKLHGGNIPGSLSGGIVHNSMEVTKTTFSPPVAAATVKNQ 632

  Fly   733 KETHPEMQT---PNLNT------CSRTASKSSSKSKSSNESTSSSPDITSRQANNNNTNSIGGH- 787
            ..:..:.::   |.|::      .|||...|:|.:..:.:...||.:|.|..::|.::..|..: 
  Rat   633 SRSPIKRRSGLFPRLHSGSEGQGDSRTRCDSASSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEICPNK 697

  Fly   788 ------LPQNGTGGGVVAAAVSAAQNGVVAVATMSETSDDSSLNSVDLDPMMAHLDGGATYIDSD 846
                  |.:||      .|.:|.:.:   :.::.|.|:.:..        .|...|.|::...:.
  Rat   698 EKPFIKLKENG------RANISRSSS---STSSFSSTAGEGE--------AMEECDSGSSQPSTT 745

  Fly   847 TGLES---MSSAEATTKACSLCLDGVQST--IMGSSPSNETIVKIENLRQEVTRLKCDKL 901
            :..:.   :.|...::::.||   |..:|  ||..||   |..|..|..:...:.:.|||
  Rat   746 SPFKQEVFVYSPSPSSESPSL---GAAATPIIMSRSP---TDAKSRNSPRSNLKFRFDKL 799

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RapGAP1NP_001097114.2 GoLoco 147..168 CDD:460481 3/21 (14%)
Rap_GAP 460..639 CDD:460463 124/178 (70%)
Rap1gap2XP_017452778.1 Rap_GAP 355..534 CDD:460463 124/178 (70%)

Return to query results.
Submit another query.