DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ziz and Dock11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001260200.1 Gene:Ziz / 34030 FlyBaseID:FBgn0260486 Length:2298 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001420976.1 Gene:Dock11 / 313438 RGDID:1564707 Length:2086 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2331 Identity:887/2331 - (38%)
Similarity:1300/2331 - (55%) Gaps:325/2331 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 RKFTRGLNKLGSAVQMRENVSQLVRESAVLNKPLVVEPIDFEAFIAKNKTVIQNDPQRELLIYPT 67
            ||||:.|:|.|:|.::|::||:.||.|.||.|..:|||:|:|..|.:.||.|.:||.|:||::|.
  Rat     5 RKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRGSVVLEKAKLVEPLDYENVITQRKTQIYSDPLRDLLMFPM 69

  Fly    68 DDVSEIIMPRKQRTNAKSVADRFDPPNEAIVCPLHGPSMITNGNGHSQVSRQGSIQSNGSHHNGN 132
            :|:|..::.|:.||...:|                                              
  Rat    70 EDISLSVIGRQLRTVQSTV---------------------------------------------- 88

  Fly   133 GNGHTSSSSSSSLNNSNGHGQLSRKSSQCSNGSSSQKDSSYESALSSITLRSNLAQPEEVDEFAD 197
                                                                    ||:.::   
  Rat    89 --------------------------------------------------------PEDAEK--- 94

  Fly   198 DGNAEDLVDGQPHGSRAECTRFTRQALYTYRAKNHLIHYKYNAYGGNCHDLP--SISPAEELVEE 260
                           ||: :.|.::.:.||....|:::|||..:.|:...||  |:.| |::...
  Rat    95 ---------------RAQ-SLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRP-EKIPNH 142

  Fly   261 IYEIDADQDRIDEQMTR--SQADTITKQGYLLKGPDSASDRMFANIGN------KSFKRRYCYLR 317
            ::|||.|.:: ||..:.  ||...:.|||:|.|          ||:.:      |.|||||.||.
  Rat   143 VFEIDEDCEK-DEDSSSLCSQKGGVIKQGWLHK----------ANVNSTITVTMKVFKRRYFYLT 196

  Fly   318 QEIDGTYILELHKDEKQG-EAKATIVMDFCTDVVQNPKRGRFCFELRMTTGHKSFTLAAENEQDF 381
            |..||:|||..:||||.. |:|..|.:|.|.||||.||..|..|||:|...:..: ||||.||:.
  Rat   197 QLPDGSYILNSYKDEKNSKESKGCIYLDACIDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHY-LAAETEQEM 260

  Fly   382 KDW---LSKISSVLAQNRAQEEKRNASLERHPSIGSNPSPQLQPPAMDPPTFGTLKGLDQSLHPQ 443
            ::|   |.||..:...:..||:|......:.....|....:           ..:..|::|:||:
  Rat   261 EEWLITLKKIIQINTDSLVQEKKETVEAIQEEETSSQGKAE-----------NIMASLERSMHPE 314

  Fly   444 LMKYGRETDHSIALARREQRRRLFACYQSPVKG---SGSD-NVEQYREHFGTRLLLTCHNLRFRL 504
            ||||||||:....|:|.:.|:.||: :.|.|:.   ||.: :|:.:.|....|.|:.||:|.|.:
  Rat   315 LMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNLFS-FDSEVQRLDFSGIEPDVKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNI 378

  Fly   505 QCIPQDESSAGGVEQQVEPYITSLALFDAKANRKLSENFYFNVNEQWAAQLLPNTPVPSSVAGCG 569
              :.....:|.|....|||:..:|||||.|.|.|:|.:|:.::|.....::|           .|
  Rat   379 --LGHIGDNAKGPPTNVEPFFITLALFDVKNNCKISADFHVDLNPPSVREML-----------WG 430

  Fly   570 VPRKSAEGDERSTACQAPHSLFDGVSAELLRSNRQQFQQLRQCLLSVTAPHADIYLVVRIEKILQ 634
            :..:.|  ::.:|...:|.||..|::       ..:...:||.:.|||.||.:|:|||||||:||
  Rat   431 MSTQLA--NDGNTKGSSPESLIHGIA-------ESRLCYIRQGIFSVTNPHPEIFLVVRIEKVLQ 486

  Fly   635 SGIAQVTEPYLKAGKDPKLGQKVYKAAKSYAQHIGHYRQPFAWAARPLFKQYSHELDVDPKREFE 699
            ..|....|||:|.....|..|||::.||.....:|.||.||||||||:||.....||:|.|    
  Rat   487 GNITHCAEPYIKNSDPIKTAQKVHRTAKQVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDLQGSLDLDGK---- 547

  Fly   700 FSPIYRQEIPKLKDEELLKLLVDYRKPEKLSKLTIIPGSLKMQMQFLDQTTPCGLSKSLAPLSTF 764
            |||:|:|:..||.:|::||||.:|:|||| :||.||||.|.:.::.:....|..::.|..||..|
  Rat   548 FSPLYKQDSSKLSNEDILKLLSEYKKPEK-TKLQIIPGQLNITVECVPVDLPNCITSSYVPLKPF 611

  Fly   765 SPSSKQSPTVEVAEFQSQSERDAHPYTSFCNHLYVYPLSLQFDSQKLFSRARNITVVVELRDGDG 829
            ..:. |:.||||.||..:..:..:|:|.:.||||||||.|::||||.|::||||.|.||.||.|.
  Rat   612 EKNC-QNITVEVEEFVPEMTKYCYPFTIYKNHLYVYPLQLKYDSQKSFAKARNIAVCVEFRDSDE 675

  Fly   830 EYSKPLKCIYGRPGQDLLVSQIACPVLHHNVTPTWYEEIKLRLPLGLFPEHHLLFSFYHVSCNL- 893
            ..:..||||||:|...:..:.....|.|||..|.:|:|||:.||:.|..:|||||:||||||.: 
  Rat   676 SDTSALKCIYGKPAGSVFTTNAYAVVSHHNQNPEFYDEIKIELPIHLHQKHHLLFTFYHVSCEIN 740

  Fly   894 ----SKKRDANAAFETPIGYAWLPLLQKNRICLEEQQLPVAATLPVGYLSIQPLGWGKGNCGPDI 954
                :||:|   ..|||:|:||:|||:..|:...||||||:|.||.|||::.. ...:.....||
  Rat   741 TKGTTKKQD---TVETPVGFAWVPLLKDGRVTTLEQQLPVSANLPPGYLNVND-AESRRQSNADI 801

  Fly   955 QWIDNQRNLYTVGLRLDSTVLTADQHLHNFFGHCERLLEGGKTGAVPAETETCKILKAAHAIDMK 1019
            :|:|..:.|..:...|:||:.|.|.|:|.||.||:.:..|.|  .||.  |..|.||..||::::
  Rat   802 KWVDGAKPLLKIKTHLESTIYTQDLHVHKFFHHCQLIQSGSK--EVPG--ELIKYLKCLHAMEIQ 862

  Fly  1020 SLINYLPTVLNELFTLLVH-TQSEEIGLNVIRLITNIIHLISDQAKRSDLLGAYVKYVFHAPYYS 1083
            .:|.:||.:|.:||.:|.: |..:::.:|...::.:|:....::...| .|.:::||.|...  .
  Rat   863 VMIQFLPVILMQLFRVLTNMTHEDDVPINCTMVLLHIVSKCHEEGLES-YLRSFIKYSFRPE--K 924

  Fly  1084 QQTARQRTVHGELCRHLPYLLNPSNPDFLIVNKFMRYSSIFFDLIIKSMAQHLLATGRIRMLRNE 1148
            ..|.:.:.:|..|...:..:|..| .|||.:||.::||..||::|.||||.:||...:|::.|.:
  Rat   925 PSTLQAQLIHETLATTMIAILKQS-ADFLAINKLLKYSWFFFEIIAKSMATYLLEENKIKLPRGQ 988

  Fly  1149 RFPKEYGDRVEQLIKALMPYITTRFEDLSEETHLLNRSLAKFVRQCLSYMDRGFVFRLIRCYMGE 1213
            |||:.|...:..|:.|::|::|.|:.::.:|:..:|.|||.|:::||:.|||||||.||..|:..
  Rat   989 RFPEAYHHILHSLLLAIIPHVTIRYAEIPDESRNVNYSLASFLKRCLTLMDRGFVFNLINDYISG 1053

  Fly  1214 FSPGNPRILHEYKFNFLQEICQHEHYVPLNLPFVL-NPK-NRPPEMMQ-------------HFTL 1263
            |||.:|::|.||||.|||.||.||||:|||||... .|| .|..:...             .::|
  Rat  1054 FSPKDPKVLAEYKFEFLQTICNHEHYIPLNLPMAFAKPKLQRVQDFFSFAVDRLTSVDSNLEYSL 1118

  Fly  1264 SEQFCRQHFLSGLLLQELKSSLNEVGHVRRHALGIFKDLLAKHELDNRYQQKGQLSRIALLYVPW 1328
            |:::|:.|||.||||:|...:|.:...:|..|:.:.|:||.||..|.|||.|.|.::||.||:|:
  Rat  1119 SDEYCKHHFLVGLLLRETSIALQDNYEIRYTAISVIKNLLIKHAFDTRYQHKNQQAKIAQLYLPF 1183

  Fly  1329 LGVVMDNIHRI--DDLSESGACTPNGHVYADSASYTKRLSCSSSYVFSKDSSTFGSLTSTPRSKN 1391
            :|::::||.|:  .|...|.|..||      ||              |:|....|.::.|.|.  
  Rat  1184 VGLLLENIQRLAGRDTLYSCAAMPN------SA--------------SRDEFPCGFVSPTSRG-- 1226

  Fly  1392 RLTMHCDQASPYRTSVHMKEHNYLAAIAGQPISNGISNLSLNSNTDSGHSQDTTTIGAYTNGDTD 1456
              ::..|           ||..|.:...|..|....|..||.....:|.....:|          
  Rat  1227 --SLATD-----------KEPAYGSFQNGHGIKREDSRGSLIPEGATGFPDPGST---------- 1268

  Fly  1457 VALRNGHN--RSVSVTHAQILSRCDKFSSVESKDLLLGFLFIIKHLSQEQMIGWWQNCNESETLQ 1519
                 |.|  :|.|.|.....:|.|::   |.::||:.:|:|:|.:|::.::.:|...:..|.:.
  Rat  1269 -----GENTRQSSSRTSVSQYNRLDQY---EIRNLLMCYLYIVKMISEDTLLTYWNKVSPQELIN 1325

  Fly  1520 FLSILDLCLLQFRYVGKKSVVITTETRQGRLAKANTLPARTQPPTGLENGSQEQQPSSGTLNQTR 1584
            .|.:|::||..|||:||:::   .......|:|...:..::|....|.|       .||.:....
  Rat  1326 ILVLLEVCLFHFRYMGKRNI---ARVHDAWLSKHFGIDRKSQTMPALRN-------RSGVMQARL 1380

  Fly  1585 EHL--LEDIDTLARNQL---------ALYESNLATEVGMIILDCLGLYVLQFR-QLL---ADSLV 1634
            :||  ||...||..:..         ||.|.|.||||.:.:||.:..:...|: |||   ..:.:
  Rat  1381 QHLSSLESSFTLNHSSATTEADIFHQALLEGNTATEVSLTVLDTISFFTQCFKSQLLNNDGHNPL 1445

  Fly  1635 LPKVARVYLRFLQLGQSERLSKHVFAALRAFINNYAVALFKGNAMLCGQMVYELLKACDSRLVEI 1699
            :.||..::|.||:.||||...|||||:||:||:.:..|.|||...:|....||:||.|.|::...
  Rat  1446 MKKVFDIHLAFLKNGQSEVSLKHVFASLRSFISKFPSAFFKGRVNMCAAFCYEVLKCCTSKISST 1510

  Fly  1700 RHESCAVLYLLMRSNFEFSGRKALTRVHLQVIISVSQMIGNVIGLNNARFQESLSIINSYANSDK 1764
            |:|:.|:||||||:|||::.||...|.|||:||:|||:|.:|.....:||||||.|||::||||:
  Rat  1511 RNEASALLYLLMRNNFEYTKRKTFLRTHLQIIIAVSQLIADVALSGGSRFQESLFIINNFANSDR 1575

  Fly  1765 AMKGTGFPMEVKDLTRRVRTVLMATAQMQAHHMDPERLLELQYSLANSYASTPELRHTWLVTMAR 1829
            .||.|.||.||||||:|:||||||||||:.|..|||.|::||||||.|||||||||.|||.:||:
  Rat  1576 PMKATAFPTEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLIDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMAK 1640

  Fly  1830 NHEQNGNLSEAACCHLHIAALMCEYLRLK----GGCTLSWSSTAFGKISTNIPLDEQG-LKLDAG 1889
            .|.:||:.||||.|::|:|||:.|:|..|    .||      :||.||:.||  ||:| :|.|||
  Rat  1641 IHIKNGDFSEAAMCYVHVAALVAEFLHRKKLFPSGC------SAFKKITPNI--DEEGAMKEDAG 1697

  Fly  1890 AQDSQYTEQMLLEQLKLCADFLDRAERFECLGELYKLILPMYERDRSYQDLAHCYEHLTQAYNKI 1954
            ..|..|:|::|||.|:.|.|.|.:|||:|.:.|:.|||:|:||:.|.::.|...|..|..||.||
  Rat  1698 MMDVHYSEEVLLELLEQCVDGLWKAERYEVISEISKLIIPIYEKRREFEKLTQVYRTLHGAYTKI 1762

  Fly  1955 VEVNRSGKRMLGRFYRVVFYGLMYFEEDHAIEFVYKEPKLTSLSEISERLAKQYKEKFGADVVKM 2019
            :||..:.||:||.|:||.|||..:|||:...|::|||||||.|||||.||.|.|.||||.:.:|:
  Rat  1763 LEVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISFRLVKLYGEKFGTENIKI 1827

  Fly  2020 IMDSSPVKVDELDAKLAYIQVTHVIPFFSKDELDQRLNEFEQNHDVDTFMYETPFTKSGAARGSV 2084
            |.||..|...|||.|.|:||||:|.|:|...||.:|..|||:||:::.|::|.|:|.||..:|.:
  Rat  1828 IQDSDKVNAKELDPKFAHIQVTYVKPYFDDKELTERKTEFERNHNINRFVFEAPYTLSGKKQGCI 1892

  Fly  2085 EEQWKRKTVIKTQYSFPYVLKRIPVKSREIIELSPIEVAIDEMQSKVSELEEIILPPADVK--KL 2147
            |||.||:|::.|..|||||.||||:...:.:.|.||:||.||::.|.:||.: :...|||.  :|
  Rat  1893 EEQCKRRTILTTSNSFPYVKKRIPITCEQQVNLKPIDVATDEIKDKTAELHK-LCSSADVDMIQL 1956

  Fly  2148 QLRLQGSVAVTVNAGPLAYAHAFLDAKVVNNFSMDRVGDLKDVFRDFIVVCQKALFLNERIISAD 2212
            ||:|||.|:|.|||||||||.|||:....|.:...:|.:|||:||.||..|..||.||||:|..|
  Rat  1957 QLKLQGCVSVQVNAGPLAYARAFLNESQANKYPPKKVNELKDMFRKFIQACSIALELNERLIKED 2021

  Fly  2213 QKEYHHVLKENYEKLCQALSELLDDESFQPLGDDADSINQRNSMALFNAISGASHN 2268
            |.|||..||.|:..:.:.||:::.::..|.  |...|....|::.:|.||||.|.|
  Rat  2022 QIEYHEGLKSNFRDMVKELSDIIHEQILQE--DTMHSPWMNNTLHVFCAISGTSSN 2075

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ZizNP_001260200.1 DOCK_C-D_N 37..>81 CDD:463380 18/43 (42%)
PH_DOCK-D 278..405 CDD:270087 56/136 (41%)
C2_Dock-D 793..981 CDD:176079 89/192 (46%)
DHR2_DOCK_D 1818..2231 CDD:212567 209/419 (50%)
Dock11NP_001420976.1 DOCK_C-D_N 38..147 CDD:463380 39/230 (17%)
PH_DOCK-D 161..284 CDD:270087 55/133 (41%)
C2_Dock-D 639..828 CDD:176079 89/192 (46%)
DHR2_DOCK11 1628..2040 CDD:212573 210/420 (50%)

Return to query results.
Submit another query.