Protein Alignment ninaC and myo5ab

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523503.2
• Gene: ninaC / 34012
• FlyBaseID: FBgn0002938
• Length: 1501
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_009296049.3
• Gene: myo5ab / 565267
• ZFINID: ZDB-GENE-050411-72
• Length: 1800
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1186
• Identity: 271/1186 - (22%)
• Similarity: 487/1186 - (41%)
• Gaps: 223/1186 - (18%)

  Fly   262 SLEKNAENRPMMVEMVEHPFLTELIENEDEMRSDIAEMLELSRDVKTLYKEPELFVDRGYVKRFD 326
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Zfish    24 SAELSRDYRP------GDPVLHLLLEDETELE----YKLDLKSGVLPPLRNPDILVGE------- 71

  Fly   327 EKPEKMYPEDLAALENPVDENIIESLRHRILMGE-SYSFIGDILLSLNSNEIKQEFPQEFHAKYR 390
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Zfish    72 --------NDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFTDSKLIYTYCGIILVAINPYESLPIYGSDIINAYS 128

  Fly   391 FKSRSENQPHIFSVADIAYQDMLHHKEPQHIVLSGESYSGKSTNARLLIKHLCYLGDGNRGATGR 455
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Zfish   129 GQNMGDMDPHIFAVSEEAYKQMARDEKNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSESSDDAS-- 191

  Fly   456 VESSIKAILMLV----NAGTPVNNDSTRCVLQYCLTFGKTGKMSGAVFNMYMLEKLRVATTDGTQ 516
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Zfish   192 VEEKVLASNPIMEAFGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDRKHHIIGANMRTYLLEKSRVVFQASEE 256

  Fly   517 HNFHIFYYFYDFINQQNQLKEYNLKADRNYRYLRVPPEVPPSKLKYRRDDPEGNVERYREFENIL 581
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Zfish   257 RNYHIF---------------YQLCACAHL------PEFKPLKLGSADDFPYTN----QGGSPVI 296

  Fly   582 RDIDFNHKQLETVRK-----------------VLAAILNIGNIRFRQNGKYA---EVENTDIVSR 626
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Zfish   297 VGVN-DLKEMQATRKAFSLLGITEAHQMGLFQILSAILHLGNVEVKERGSSSCSISDENGHL-DM 359

  Fly   627 IAELLRVDEKKFMWSLTNFIMVKGGIAERRQYTTEEARDARDAVASTLYSRLVDFIINRINMNMS 691
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Zfish   360 FCDLTEVSNESMAHWLCHKKLKTATETLNKPVTRLEAVNGRDALAKHIYAKLFSWIVSQVNKALS 424

  Fly   692 F---PRAVFGDTNAIIIHDMFGFECFNRNGLEQLMINTLNEQMQYHYNQRIFISEMLEMEAEDID 753
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Zfish   425 TSSKPHSFIG------VLDIYGFETFELNSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIP 483

  Fly   754 TINLNFYDNKTALDNLLTKPDGLFYIIDDASRSCQDQD-----LIMDRVSEKHSQFVKKHTATE- 812
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Zfish   484 WTLIDFYDNQPCI-NLIEAKMGLLDLLDEECTMPKGSDDSWAQKLYNTHLKKSSHFEKPRMSNKA 547

  Fly   813 ISVAHYTGRIIYDTRAFTDINRDFVPPEMIETFRSSLDESIMLMFTNQLTKAG-NLTMPFEAVQH 876
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Zfish   548 FIILHFADKVEYQCDGFLEKNKDTVNEEQINVLKASKFSLLLELFQDEESPAAPNTTA------- 605

  Fly   877 KDESERKSYALNTLSAGCISQVNNLRTLAANFRFTCLTLLKMLSQNANLGVHFVRCIRADLEYKP 941
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Zfish   606 --SSGRAKFGRSTQSFR-----EHKKSVGLQFRNSLHLLMETLNATT---PHYVRCIKPNDVKAP 660

  Fly   942 RSFHSDVVQQQMKALGVLDTVIARQKGFSSRLPFDEFLRRYQFLAFDFDEPVEMTKD-------- 998
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Zfish   661 FMMDPHRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYQVL---------MTKKEILLDRKL 716

  Fly   999 NCRLLFLRL--KMEGWALGKTKVFLRYYNDEFLARLYELQVKKV-IKVQSMMRALLARK------ 1054
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Zfish   717 TCQSVLERLVQNKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRTACIHIQKTIRCWLARKKYLRIR 781

  Fly  1055 -----------------------RVKGGKVFK------LGKKGPEHHDVAASKIQKAFRGFRDRV 1090
                                   |.:...||:      ..::.......||..||:..||:..|:
Zfish   782 QAAITLQKYTRGHQARCLCKTLRRTRAAVVFQKNTRMWAARRQYLRQKTAAVLIQRILRGYTARL 846

  Fly  1091 RLPPLVNEKSGQLNENTADFIRPFAKKWREKSIFQVLLHYRA------ARFQDFVNL---SQQVH 1146
            ....||.|....|.:.   ::|.|..:||.:.|.:.:::.:.      || ::...|   ::.|.
Zfish   847 EYKRLVCEHKALLIQR---WVRGFLARWRYRRIKRAVVYLQCCVRRMLAR-RELKKLKIEARSVE 907

  Fly  1147 IY---NQRMVAGLNKCTRAVPFERINMREVNSSQLGPLP----VPIKKMPFRLD--QIPFYDTQY 1202
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Zfish   908 HYKKLNYGMENKIMQLQRKLDEQHKENREL-SEQIGAIESHSVVELEKLHVQLKTLQEAEEEARH 971

  Fly  1203 MVDPANSISRQAFPNQLLTQHMEDDEPWDSPL-QRNPSMTSCALTYNAYKKEQACQ-------TN 1259
            ..|...|:..:.   :|:.:.:|.::.....| ::|..:.|.....|...:||..|       ||
Zfish   972 REDLVTSLQEEL---ELVRRELEKNKEMVVELNEKNTMLKSEKEEMNRLIQEQEQQIREKSEVTN 1033

  Fly  1260 WDRMGESDNIYNQGYFRDPQQL---------------RRNQMQMNMNAYNNAYNSYNSNYNNQNW 1309
            .|.........|:..||....|               .:...:::....:.|.:.|:|   :|:.
Zfish  1034 EDVTENLQTQLNEERFRYQNLLTEHLKLEERYADLRSEKEAAEISTAGDSRADSGYSS---SQSE 1095

  Fly  1310 GVHRS---GSRRNSLK 1322
            .:|.|   ||..:||:
Zfish  1096 SIHSSMLTGSEVSSLE 1111

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ninaC	NP_523503.2	STKc_myosinIII_N_like	9..282	CDD:270785	5/19 (26%)
		MYSc_Myo21	346..1022	CDD:276848	178/720 (25%)
myo5ab	XP_009296049.3	None