Protein Alignment ninaC and myo3b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523503.2
• Gene: ninaC / 34012
• FlyBaseID: FBgn0002938
• Length: 1501
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073768512.1
• Gene: myo3b / 564573
• ZFINID: ZDB-GENE-070706-2
• Length: 1333
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1407
• Identity: 421/1407 - (29%)
• Similarity: 696/1407 - (49%)
• Gaps: 207/1407 - (14%)

  Fly     9 LPDPTDKFEIYEEIAQGVNAKVFRAKELDNDRIVALKI-------QHYDEEHQVSIEEEYRTLRD 66
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Zfish    55 LADPSSDWDIVETIGKGTYGKVYKVINKKDGSQAAVKVLDPINNPSHTNRDVDEEIEAEYNILRS 119

  Fly    67 YCDHPNLPEFYGV-YKLSKPNGPDEIWFVMEYCAGGTAVDMVNKLLKLDRRMREEHIAYIIRETC 130
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Zfish   120 LSNHPNVVKFFGMFYKADELSG-GQLWLVLELCNGGSVTDLIKGLLMRGKRLEEPIISYIL---C 180

  Fly   131 RAAI---ELNRNHVLHRDIRGDNILLTKNGRVKLCDFGLSRQVDSTLGKRGTCIGSPCWMAPEVV 192
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Zfish   181 GALLGLQHLHNNRIIHRDVKGNNILLTTDGGVKLVDFGVSAQLTSARLRRNTSVGTPFWMAPEVI 245

  Fly   193 SAMESREPDITVRADVWALGITTIELADGKPPFADMHPTRAMFQIIRNPPPTLMRPTNWSQQIND 257
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Zfish   246 ACEQQYDYSYDARCDVWSLGITAIELADGDPPLAEMHPVKALFKIPRNPSPTLRHPEQWCRSFSH 310

  Fly   258 FISESLEKNAENRPMMVEMVEHPFLTELIENEDEMRSDIAEMLELSRDVKTLYKEPELFVDRGYV 322
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Zfish   311 FIAQCLIKDFETRPSVTHLLEHPFIKQAHGKDTLLRQQLSVLIREQQDVGSRTKTRHERINTRKT 375

  Fly   323 KRFDEKPEKMYPEDLAALENPVDENIIESLRHRILMGESYSFIGDILLSLNSNEIKQEFPQEFHA 387
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Zfish   376 LIIESCPD----DDLVNLELLDEETIIAHLQKRYQDLQIYTYVGDILIALNPFQNLSIYSPQFSK 436

  Fly   388 KYRFKSRSENQPHIFSVADIAYQDMLHHKEPQHIVLSGESYSGKSTNARLLIKHLCYLGDGNRGA 452
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Zfish   437 LYHGMKRSTNPPHIFATADAAYQSMVTLCKDQCIIISGESGAGKTESAHLIVQHLTFLGKANNRT 501

  Fly   453 TGRVESSIKAILMLV----NAGTPVNNDSTRCVLQYCLTFGKTGKMSGAVFNMYMLEKLRVATTD 513
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Zfish   502 ---LREKILQVNPLVEAFGNACTAINDNSSRFGKYLEMKFTPTGAVMGAKISEYLLEKSRVIKQA 563

  Fly   514 GTQHNFHIFYYFYDFINQQNQLKEYNLKADRNYRYL-----RVPPEVPPSKLKYRRDDPEGNVER 573
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Zfish   564 TGEKNFHIFYYIYAGLYHQDNLRKYKLPNKTAPRYIDCVNGKVMQDIISSKL-YK--------EQ 619

  Fly   574 YREFENILRDIDFNHKQLETVRKVLAAILNIGNIRF------RQNGKYAEVENTDIVSRIAELLR 632
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Zfish   620 FDAIQDCFRIIGFTEEEVNSVYRILAAILNTGNIEFASASSQHQSDK-SEVPNSEALDNAAALLS 683

  Fly   633 VDEKKFMWSLTNFIMVKGGIAERRQYTTEEARDARDAVASTLYSRLVDFIINRINMNMSFPRAVF 697
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Zfish   684 IGSEELQEALTSHCVVTRGETIIRTNTVDKATVVRDAMSKALYGRLFSWIVNRINALLQ------ 742

  Fly   698 GDTNA--------IIIHDMFGFECFNRNGLEQLMINTLNEQMQYHYNQRIFISEMLEMEAEDIDT 754
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Zfish   743 PDTNICAAESGMNVGILDIFGFENFKKNSFEQLCINIANEQIQFYFNQHIFALEQIEYQSEGVDV 807

  Fly   755 INLNFYDNKTALDNLLTKPDGLFYIIDDASRSCQ--DQDLI---MDRVSEKHSQFVKKHTATEIS 814
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Zfish   808 SLVEYEDNRPILDMFLQKPMGLLSLLDEESRFPQATDQTLVDKFQDNLRNKYF-WIPKRVELCFG 871

  Fly   815 VAHYTGRIIYDTRAFTDINRDFVPPEMIETFRSSLDESIMLMFTNQLTKAGNL------------ 867
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Zfish   872 IQHYAGQVLYNVSGFLEKNRDTLPADIVVVLRTSENRLLQQLFSSPLTKTGNLATSRARVTAASR 936

  Fly   868 TMPFEAVQHKDESERKSYALNTLS-AGCISQVNNLR--TLAANFRFTCLTLL-KMLSQNANLGV- 927
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Zfish   937 SLPPQLNSGRNKSPKYLLKVDTMEMMRHPEETTNMRRQTVASYFRYSLMDLLSKMV-----VGTP 996

  Fly   928 HFVRCIRADLEYKPRSFHSDVVQQQMKALGVLDTVIARQKGFSSRLPFDEFLRRYQFLAFDFDEP 992
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Zfish   997 HFVRCIKPNDDRQALRFNKERVMVQLRYTGILETVNIRRQGYSHRILIQEFVNRYYYLAFRAHQM 1061

  Fly   993 VEMTKDNCRLLFLRLKMEGWALGKTKVFLRYYNDEFLARLYELQVKKVIKVQSMMRALLARKRVK 1057
            .|.:|:|..::..:.|::.|.:|.|||||:||:.|.|..:....:.:|:.:|:..:..|..:|.
Zfish  1062 PEGSKENAIIILQKAKLDYWVVGNTKVFLKYYHVEQLNLMLREVIARVVLMQAYTKGWLGARRY- 1125

  Fly  1058 GGKVFKLGKKGPEHHDVAASKIQKAFRGFRDRVRLPPLVNEKSGQLNENTADFIRPFAKKWREKS 1122
                    ::..|.....|..||.|:||...|..|                    ...|:.||::
Zfish  1126 --------RREREKRRNGAVVIQSAWRGHVARQNL--------------------KLIKREREQA 1162

  Fly  1123 IFQVLLHYRAARFQDFVNLSQQ------------VHIYNQRMV-----AGLNKCTRAVPFERINM 1170
            ..|:...||..|.:.....|:|            .|..::::|     :|:.....:||   ...
Zfish  1163 AVQIQSVYRGYRVRKDYKQSRQWTGQPSSKRSSTNHSPDEKVVSVSADSGIGSSDASVP---KTD 1224

  Fly  1171 REVNSSQLGPLPVPIKKMPFRLDQIPFYDTQYMVDPANSISRQAFPNQLLTQHMEDDEPWDSPLQ 1235
            ::.:|.:..||                             |:|. |...|.||.       ||.:
Zfish  1225 KQSDSRERAPL-----------------------------SKQG-PTLKLHQHR-------SPRR 1252

  Fly  1236 R--NPSMTSC---ALTYNAYKKEQACQTNWDRMGESDNIYNQGYFRDPQQLRRNQMQMNMNAYNN 1295
            |  .|.:.:.   :|.||...:               ::..||..|.|::|.:.::....:.|..
Zfish  1253 RGQQPKLLNSPEDSLYYNHLNR---------------SLDYQGSKRKPRKLGQIKLLDGEDEYYQ 1302

  Fly  1296 AYNSYNSNYNNQNWGVHRSGSRRNSLKGYAAPPPPPPPMPSS 1337
            ..::.            .:....:.|.|.:..|...||..||
Zfish  1303 LLSTI------------EAVPEEDVLTGTSPNPTSTPPTISS 1332

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ninaC	NP_523503.2	STKc_myosinIII_N_like	9..282	CDD:270785	114/283 (40%)
		MYSc_Myo21	346..1022	CDD:276848	236/720 (33%)
myo3b	XP_073768512.1	None