Protein Alignment ninaC and ck

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523503.2
• Gene: ninaC / 34012
• FlyBaseID: FBgn0002938
• Length: 1501
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_523571.1
• Gene: ck / 34882
• FlyBaseID: FBgn0000317
• Length: 2167
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1189
• Identity: 272/1189 - (22%)
• Similarity: 494/1189 - (41%)
• Gaps: 217/1189 - (18%)

  Fly   335 EDLAALENPVDENIIESLRHRILMGESYSFIGDILLSLNSNEIKQEFPQEFHAKYRFKSRSENQP 399
            ||:.:|.:..:..|:.:|..|......|::.|.||:::|..:|...:..:....|:.:...|..|
  Fly    66 EDMISLGDLHEAGILRNLLIRYKENLIYTYTGSILVAVNPYQILPIYTGDQIKLYKERKIGELPP 130

  Fly   400 HIFSVADIAYQDMLHHKEPQHIVLSGESYSGKSTNARLLIKHLCYLGDGNRGATGRVESSIKAIL 464
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  Fly   131 HIFAIGDNAYAHMKRYRQDQCIVISGESGAGKTESTKLILQYLAAISGKHSWIEQQILEANPILE 195

  Fly   465 MLVNAGTPVNNDSTRCVLQYCLTFGKTGKMSGAVFNMYMLEKLRVATTDGTQHNFHIFYYFYDFI 529
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  Fly   196 AFGNAKTIRNDNSSRFGKYIDIHFSANGVIEGAKIEQYLLEKSRIVSQNHSERNYHVFYCILAGL 260

  Fly   530 NQQNQLK-EYNLKADRNYRYLRVPPEVPPSKLKYRRDDPEGNVERYREFENILRDIDFNHKQLET 593
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  Fly   261 SADEKSRLDLGMAAD--YKYLTGGNSITCE----GRDD----AAEFSDIRSAMKVLLFSDQEIWE 315

  Fly   594 VRKVLAAILNIGNIRFRQNGKYAEVENTDI--------VSRIAELLRVDEKKFMWSLTNFIMVKG 650
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  Fly   316 IIKLLAALLHCGNIKY----KATVVDNLDATEIPEHINVERVAGLLGLPIQPLIDALTRRTLFAH 376

  Fly   651 GIAERRQYTTEEARDARDAVASTLYSRLVDFIINRINMNMSFPRAVFGDTNAIIIHDMFGFECFN 715
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  Fly   377 GETVVSTLSRDQSVDVRDAFVKGIYGRMFVHIVRKINTAIFKPRGT--SRNAIGVLDIFGFENFD 439

  Fly   716 RNGLEQLMINTLNEQMQYHYNQRIFISEMLEMEAEDIDTINLNFYDNKTALDNLLTKPDGLFYII 780
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  Fly   440 QNSFEQFCINYANENLQQFFVQHIFKLEQEEYNHEAINWQHIEFVDNQDALDLIAIKQLNIMALI 504

  Fly   781 DDASR--SCQDQDLI--MDRVSEKHSQFVKKHT--ATEISVAHYTGRIIYDTRAFTDINRDFVPP 839
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  Fly   505 DEEARFPKGTDQTMLAKLHKTHGSHKNYLKPKSDINTSFGLNHFAGVVFYDTRGFLDKNRDTFSP 569

  Fly   840 EMIETFRSSLDESIMLMFTNQLTKAGNLTMPFEAVQHKDESERKSYALNTLSAGCISQVNNLRTL 904
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  Fly   570 DLLHLVSQSTNKFLRQIFAQDIEMGA-------------ETRKRT-----------------PTL 604

  Fly   905 AANFRFTCLTLLKMLSQNANLGVHFVRCIRADLEYKPRSFHSDVVQQQMKALGVLDTVIARQKGF 969
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  Fly   605 STQFRKSLDALMKTLS---SCQPFFIRCIKPNELKKPMMFDRGLCCRQLRYSGMMETIRIRRAGY 666

  Fly   970 SSRLPFDEFLRRYQFLAFDFDEPVEMTKDNC-----RLLFLRLKMEGWALGKTKVFLRYYNDEFL 1029
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  Fly   667 PIRHGFREFVERYRFL-IPGVPPAHRT--DCQAATSRICAVVLGKSDYQLGHTKVFLKDAHDLFL 728

  Fly  1030 ARLYE-LQVKKVIKVQSMMRALLARKRVKGGKVFKLGKKGPEHHDVAASKIQKAFRGFRDRVRLP 1093
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  Fly   729 EQERDRVLTRKILILQRSIRGWVYRRR-----FLRL--------RAAAITVQRFWKGYAQRKRYR 780

  Fly  1094 PLVNEKSGQLNENTADFIRPFAKKWREKSIFQVLLHYRAARFQDFVNLSQQVHIYNQRMVAGLNK 1158
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  Fly   781 ---NMRVGYMRLQALIRSRVLSHRFR---------HLRG----HIVGLQAHARGYLVRREYG-HK 828

  Fly  1159 CTRAVPFE-----RINMREVNSSQLGPLPVPIKKMPFRLDQIPFYDTQYMVDPANSISRQAFPNQ 1218
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  Fly   829 MWAVIKIQSHVRRMIAMRRYRKLRL--------------------------------EHKQFAEV 861

  Fly  1219 LLTQHMEDDEPWDSPLQRNPSMTSCALTYNAYKKEQACQTNWDRMGESDNIYNQGYFRDPQQL-R 1282
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  Fly   862 LQLRKLEEQE----LLHRG----------NKHAREIAEQHYRDRLHELERREIQ------EQLEN 906

  Fly  1283 RNQMQMNMNAYNNAYNSYNSNYNNQNWGVHRSGSRRNSLKGYAAPPPPPPPMP----SSNYYRNN 1343
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  Fly   907 RRRVEVNMNIINDAARKQEEPVDD--------GKLVEAMFDFLPDSSSDAPTPHGGRETSVFNDL 963

  Fly  1344 PNQQQRNYQQRSSYPPSDPVRELQNMARNEGDNSEDPPFNFKAMLRKTNYPRGSETNTYDFNNRR 1408
            |:.|..|         .|.:....:::.:|.|.||     ||.......|.:|:..:.|.....:
  Fly   964 PHAQNVN---------QDDIIAPIHISEDEEDLSE-----FKFQKFAATYFQGNVNHQYAKKALK 1014

  Fly  1409 G-----SDSGDQHTFQP---PKLRSTG----RRYQDDEGYNSSSGNYGVSRKFGQQQRAPTLRQS 1461
            .     ...|||...|.   ..||.||    .:|...:..:::|                .:.:.
  Fly  1015 HPLLPLHTQGDQLAAQALWITILRFTGDMPEPKYHTMDRMDTTS----------------VMSKV 1063

  Fly  1462 PASVGRSFEDSNARSFEEA 1480
            .|::||:|  ..::.|:||
  Fly  1064 TATLGRNF--IRSKEFQEA 1080

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ninaC	NP_523503.2	STKc_myosinIII_N_like	9..282	CDD:270785
		MYSc_Myo21	346..1022	CDD:276848	182/695 (26%)
ck	NP_523571.1	MYSc_Myo7	77..721	CDD:276832	182/695 (26%)
		MyTH4	<1138..1245	CDD:214535
		FERM1_F1_Myosin-VII	1249..1347	CDD:340612
		B41	1251..1467	CDD:214604
		FERM_C1_MyoVII	1461..1559	CDD:270019
		SH3	1560..1624	CDD:473055
		MyTH4	1701..1849	CDD:214535
		FERM2_F1_Myosin-VII	1854..1951	CDD:340613
		B41	1856..2068	CDD:214604
		FERM_C2_MyoVII	2064..2159	CDD:270020