Protein Alignment ninaC and nmy-3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523503.2
• Gene: ninaC / 34012
• FlyBaseID: FBgn0002938
• Length: 1501
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_501620.2
• Gene: nmy-3 / 177750
• WormBaseID: WBGene00012437
• Length: 1464
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1365
• Identity: 292/1365 - (21%)
• Similarity: 515/1365 - (37%)
• Gaps: 311/1365 - (22%)

  Fly   273 MVEMVEHPFLTELIENEDEMRSDIAEMLELSRDVKTLYKEPELFVDRGYVKRFDEKPEKMYPEDL 337
            ||.:::......|:...||.     ...|..|..||..:.|.|               ..|.|||
 Worm    44 MVTVIDEGLSDLLVGFRDEQ-----GFFEKKRIEKTKCEVPSL---------------NNYSEDL 88

  Fly   338 AALENPVDENIIESLRHRILMGESYSFIGDILLSLN--------SNEIKQEFPQEFHAKYRFKSR 394
            ..|..|....::.:|:.|......::|.|...:.:|        |:|:||          .::.:
 Worm    89 CTLTQPNAATVLNALKIRYTSNVIHTFCGLFCVVINPWRNIPIYSDEVKQ----------LYQLQ 143

  Fly   395 SENQPHIFSVADIAYQDMLHHKEPQHIVLSGESYSGKSTNARLLIKHLCYLGDGNRGATGRVESS 459
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 Worm   144 NDLPPHVYSVAQNAFHGILKGGRNQSILITGESGAGKTENTKKIIDFILSSSVSNNTIGDCVVTS 208

  Fly   460 IKAILMLVNAGTPVNNDSTRCVLQYCLTFGKTGKMSGAVFNMYMLEKLRVATTDGTQHNFHIFY- 523
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 Worm   209 GVLLEAMGNARTTHNSNSSRFGKFIRIEFDENSKLIGAKIECYLLEKSRVVFQSDGDRNFHIFYQ 273

  Fly   524 ----YF----YDFINQQNQLKEYNLKADRNYRYLRVPPEVPPSKLKYRRDDPE--GNVERYREFE 578
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 Worm   274 MLSNYFDNPHKSFLKLSKKVNEY----------------------KYLRNDDSMIDDAETAKMTD 316

  Fly   579 NILRDIDFNHKQLETVRKVLAAILNIGNIRF--RQNGKYAEVENTDIVSRIAELLRVDEKKFMWS 641
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 Worm   317 EAFTRIGLSEEEKIWIFQILSAVLWIGDIKFGERSGLDVSFVESMQEVDNIAELLEMKSSKLVDA 381

  Fly   642 LTN-FIMVKGGIAERRQYTTEEARDARDAVASTLYSRLVDFIINRINMNMSFPRAVFGDTNA--- 702
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 Worm   382 LTQPTIKVHDKLIRKNQNLAKTLSSA-SAMAKILYERLFGWIVKRCNDAFS-----VDDTESTCR 440

  Fly   703 ----IIIHDMFGFECFNRNGLEQLMINTLNEQMQYHYNQRIFISEMLEMEAEDIDTINLNFYDNK 763
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 Worm   441 LSRFIAVLDIAGFEIIEKNSFEQFCINYTNEKLQQFFNHFMFAKEQSDYLEEGIKWTQVNFANHL 505

  Fly   764 TALDNLLTKPDGLFYIIDD-------ASRSCQDQ---DLIMDRVSEKHSQFVKKHTATEISVAHY 818
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 Worm   506 QPTIDLIEKPMGILSFLEEECVVPNGSEKSLLEKLCSNLSNDSSFKKSKQTQKCSTIRHFYVQHY 570

  Fly   819 TGRIIYDTRAFTDINRDFVPPEMIETFRSSLDESIMLMF-----TNQLTKAGNLTMPFEAVQHKD 878
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 Worm   571 AGEVHYNIDGWLDKNRDNVETSVLDILSQSTHPLLKLLFPPVPVNNLKTRRGTITNSTVSFLYKN 635

  Fly   879 ESERKSYALNTLSAGCISQVNNLRTLAANFRFTCLTLLKMLSQNANLGVHFVRCIRADLEYKPRS 943
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 Worm   636 QLQCLLDTLNSSSA-----------------------------------HFIRCVVSNYEKLPGK 665

  Fly   944 FHSDVVQQQMKALGVLDTVIARQKGFSSRLPFDEFLRRYQFLAFDFDEPVEMT-KDNCRLLF--L 1005
            ..:.:|..|:|..|||:.:...::|:.|||...||:.||..|..:.::....: |:.|.|:.  .
 Worm   666 IDAPLVLAQLKCNGVLEGIRICREGYPSRLSHSEFIERYSLLMKNKEQSKGASEKEKCTLICQDA 730

  Fly  1006 RLKMEGWALGKTKVFLRYYNDEFLARLYELQVKK-------VIKVQSMMRAL-----LARKRVKG 1058
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 Worm   731 QVRKERYAVGKTKLFCK------VGVISELETKRNNYISSFIILIQANIRYLNIQKDLIERRKKL 789

  Fly  1059 GKVFKLGKKGPEHHDVAA---SKIQKAFRGF----RDRVRLPPLVNEK----------------- 1099
            ..|..:.....:..:::.   .:|....||.    ||:.|:..|.|||
 Worm   790 EAVVTIQDNVRQFAELSQWPWYRIYHLTRGLIPRNRDKERIEELENEKLKLEEEIQEMEIKNEEA 854

  Fly  1100 ----------------------------SGQLNENTADFIRPFAKKWRE----KSIFQVLLHYRA 1132
                                        ..|..|...:..|.|.|...|    :.||.||.....
 Worm   855 LKENLKLSMLLDREKSEKVKVQKELEEVEKQGREKLLEKEREFRKTMEEMEQNEEIFNVLERKYN 919

  Fly  1133 ARFQDFVNLSQQVHIYNQRMVAGLNKCTRAVPFERINMREVNSSQLGPLPVPIKKMPFRLDQIPF 1197
            .:.:..:.::..:..| :|.:..||.....:..|...:||..:.|
 Worm   920 EQHKKVMKMNDVLREY-ERKIEQLNMEKTDLENENQKLRETQNRQ-------------------- 963

  Fly  1198 YDTQYMVDPANSISRQAFPNQLLTQHMED------DEPWDSPLQRNPSMTSCALTYNAYKKEQAC 1256
             |:.|     :::.::......|...:::      ||       .|....:.|....|.:.|:|
 Worm   964 -DSHY-----SNLEKEVMEKSSLIDELQNQIQKLSDE-------NNEQRLTIAKLETALEDEKA- 1014

  Fly  1257 QTNWDRMGESDNIYNQGYFRDPQQLRRNQMQMNMNAYNN-AYNSYNSNYN--------NQNWG-- 1310
                 |....:|...     |.|:| .:::...:..::| |.|..||...        |:...
 Worm  1015 -----RFARQNNTIG-----DMQKL-ISELNEKIARFDNIALNERNSTRKIEREKEKLNEELTTA 1068

  Fly  1311 ---VHRSGSRRNSLKGYAAPPPPPPPMPSSNYYRNNPNQQQRNYQQRSSYPPSDPVRELQNMARN 1372
               :.:...:.:.||            ......:|..::.:|..:.:.:. .:|.|:||::..:.
 Worm  1069 KEIIQKQAKKIDELK------------EECRKRKNEASRLERKLEDKEAM-MADCVKELKDSHKE 1120

  Fly  1373 EGDNSEDPPFNFK---AMLRKTNYPRGSETNTYDFNNRRGSDSGDQHTFQPPKLRSTGRRYQ-DD 1433
            .....|....:.|   :.|...|..:.|:..|:   .|..|...|.......:|.:.||:|. ..
 Worm  1121 RLKEMEQKVEDVKRKNSKLENENSTQKSQIETF---QRESSVDSDYGRSSSGRLSTLGRQYSLTS 1182

  Fly  1434 EGYNSSSGNYGV-SRK----------FGQQQRAPTLRQSPASVGRSFEDSNARSFEEAGSYVEEE 1487
            .|..||....|: |||          :..::|..|...:.:::|.....|.::..|:....:|.|
 Worm  1183 IGSFSSIRTVGLGSRKDSISDMTSSMYSLRRRDSTYDMTSSTIGLQRSPSTSQVMEKERRILELE 1247

  Fly  1488  1487
             Worm  1248  1247

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ninaC	NP_523503.2	STKc_myosinIII_N_like	9..282	CDD:270785	2/8 (25%)
		MYSc_Myo21	346..1022	CDD:276848	180/722 (25%)
nmy-3	NP_501620.2	MYSc_class_II	97..747	CDD:276951	180/722 (25%)
		SMC_prok_B	848..>1463	CDD:274008	74/462 (16%)