Protein Alignment ninaC and myo-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523503.2
• Gene: ninaC / 34012
• FlyBaseID: FBgn0002938
• Length: 1501
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_492053.1
• Gene: myo-1 / 172471
• WormBaseID: WBGene00002348
• Length: 1938
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1277
• Identity: 263/1277 - (20%)
• Similarity: 492/1277 - (38%)
• Gaps: 234/1277 - (18%)

  Fly   335 EDLAALENPVDENIIESLRHRILMGESYSFIGDILLSLNSNEIKQEFPQEFHAKYRFKSRSENQP 399
            ||::.|....|.:::.:||.|......|::.|...:.:|..:....:.......:..|.|:|..|
 Worm    87 EDMSNLTFLNDASVLWNLRSRYAAMLIYTYSGLFCVVINPYKRLPIYTDSVARMFMGKRRTEMPP 151

  Fly   400 HIFSVADIAYQDMLHHKEPQHIVLSGESYSGKSTNARLLIKHLCYLGDGNRGATGRVESSIKAIL 464
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 Worm   152 HLFAVSDQAYRYMLQDHENQSMLITGESGAGKTENTKKVICYFATVGASQKAALKEGEKEVTLED 216

  Fly   465 MLV----------NAGTPVNNDSTRCVLQYCLTFGKTGKMSGAVFNMYMLEKLRVATTDGTQHNF 519
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 Worm   217 QIVQTNPVLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFIRIHFNKHGTLASCDIEHYLLEKSRVIRQAPGERCY 281

  Fly   520 HIFYYFY-DFINQQNQLKEYNL--KADRNYRYLRVPPEVPPSKLKYRRDDPEGNVERYREFENIL 581
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 Worm   282 HIFYQIYSDF---KPQLRDELLLNHPISNYWF------VAQAELLI---DGIDDTEEFQLTDEAF 334

  Fly   582 RDIDFNHKQLETVRKVLAAILNIGNIRFRQNGK--YAEVENTDIVSRIAELLRVDEKKFMWSLTN 644
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 Worm   335 DVLKFSPTEKMDCYRLMSAHMHMGNMKFKQRPREEQAEPDGQDEAERACNMYGIDVDQFLKALVS 399

  Fly   645 FIMVKGGIAERRQYTTEEARDARDAVASTLYSRLVDFIINRINMNM---SFPRAVFGDTNAIIIH 706
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 Worm   400 PRVKVGTEWVSKGQNVDQVHWAIGAMAKGLYARVFHWLVKKCNLTLDQKGIDRDYF-----IGVL 459

  Fly   707 DMFGFECFNRNGLEQLMINTLNEQMQYHYNQRIFISEMLEMEAEDIDTINLNFYDNKTALDNLLT 771
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 Worm   460 DIAGFEIFDFNSFEQLWINFVNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYAREGIQWTFIDFGLDLQACIELIE 524

  Fly   772 KPDGLFYIIDDASRSCQDQDL-----IMDRVSEKHSQFVK------KHTATEISVAHYTGRIIYD 825
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 Worm   525 KPLGIISMLDEECIVPKATDMTLAQKLTDQHLGKHPNFEKPKPPKGKQGEAHFAMRHYAGTVRYN 589

  Fly   826 TRAFTDINRDFVPPEMIETFRSSLDESIMLMFTNQLTKAGNLTMPFEAVQHKDESERKSYALNTL 890
            ...:.:.|:|.:...::...::|....:::......|     |....|...|....||.
 Worm   590 VLNWLEKNKDPLNDTVVSVMKASKKNDLLVEIWQDYT-----TQEEAAAAAKAGGGRKG------ 643

  Fly   891 SAGCISQVNNLRTLAANFRFTCLTLLKMLSQNANLGVHFVRCIRADLEYKPRSFHSDVVQQQMKA 955
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 Worm   644 -----GKSGSFMTVSMMYRESLNKLMTMLHKT---HPHFIRCIIPNEKKQSGMIDAALVLNQLTC 700

  Fly   956 LGVLDTVIARQKGFSSRLPFDEFLRRYQFLAFDFDEPVEMTKDNCRLLFL-------RLKMEGWA 1013
            .|||:.:...:|||.:|....:|::||..||....:..:..| .|....|       :|..|.:.
 Worm   701 NGVLEGIRICRKGFPNRTQHPDFVQRYAILAAKEAKSSDDMK-TCAGAILQALINQKQLNDEQFR 764

  Fly  1014 LGKTKVF---------------------------LRYYNDEFLARLYELQVKKVIKVQSMMRA-- 1049
            :|.||||                           :|:|.....|.....|:...|.:|..:|:
 Worm   765 IGHTKVFFKAGVVAHIEDLRDDKLNQIITGFQSAIRWYTATADAGARRKQLNSYIILQRNIRSWC 829

  Fly  1050 --------LL---ARKRVKGGKVFKLGKKGPEHHDVAASKIQKAFRGFRDRVRLPPLVNEKSGQL 1103
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 Worm   830 VLRTWDWFLLFGKLRPQLKCGKMAEEMIKMAEEQKVLEAEAKKA----------------ESARK 878

  Fly  1104 NENTADFIRPFAKKWREKS---------------IFQVLLHYRAARFQDFVNLSQQVHIYNQRMV 1153
            ::..|     :||...|:|               |.:.|....:||.:    :.:.::..|.|:.
 Worm   879 SQEEA-----YAKLSAERSKLLEALELTQGGSAAIEEKLTRLNSARQE----VEKSLNDANDRLS 934

  Fly  1154 ------AGLNKCTRAVPFERINMREVNSSQLGPLPVPIKKMPFRLDQIPFYDTQYMVDPANS--- 1209
                  |.|.|..|....|..|:::...:..|.|...:::...:.:||     ..:.|..||
 Worm   935 EHEEKNADLEKQRRKAQQEVENLKKSIEAVDGNLAKSLEEKAAKENQI-----HSLQDEMNSQDE 994

  Fly  1210 -ISRQAFPNQLLTQH---MEDDEPWDSPLQRNPSMTSCALTYNAYKKEQACQTNWDRMGESDNIY 1270
             |.:.....:||.::   :.||...:...|...:.....|.....:.|:|.:.......|::...
 Worm   995 TIGKINKEKKLLEENNRQLVDDLQAEEAKQAQANRLRGKLEQTLDEMEEAVEREKRIRAETEKSK 1059

  Fly  1271 N--QGYFRDPQQLRRNQMQMNMNAYNNAYNSYNSNYNNQNWGVHRSGSRRNSLKGYAAPPPPPPP 1333
            .  :|..:..|:.......:.:..        :::...:...:|..|.|....:..|
 Worm  1060 RKVEGELKGAQETIDELSAIKLET--------DASLKKKEADIHALGVRIEDEQALA-------- 1108

  Fly  1334 MPSSNYYRNNPNQQQRNYQQRSSYPPSDPVRELQNMARNEGDNSEDPPFNFKAMLRKTNYPRGSE 1398
                    |...:|.:...||        :.|:::...:|..:..           |.:..|...
 Worm  1109 --------NRLTRQSKENAQR--------IIEIEDELEHERQSRS-----------KADRARAEL 1146

  Fly  1399 TNTYDFNNRRGSDSGDQHTFQPPKLRSTG------RRYQDDEGYNSSSGNYGVSRKFGQQQRAPT 1457
            ....|..|.|..:...|...|....:...      ||..|::...:......:.||...|..|.|
 Worm  1147 QRELDELNERLDEQNKQLEIQQDNNKKKDSEIIKFRRDLDEKNMANEDQMAMIRRKNNDQISALT 1211

  Fly  1458 -----LRQSPASV-------GRSFEDSNARSFEEAGSYVEEE 1487
                 |::|.|.:       .:..:|.||:..:|..|.||:|
 Worm  1212 NTLDALQKSKAKIEKEKGVLQKELDDINAQVDQETKSRVEQE 1253

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ninaC	NP_523503.2	STKc_myosinIII_N_like	9..282	CDD:270785
		MYSc_Myo21	346..1022	CDD:276848	168/738 (23%)
myo-1	NP_492053.1	Myosin_N	30..73	CDD:460670
		MYSc_class_II	98..773	CDD:276951	168/711 (24%)
		Myosin_tail_1	854..1919	CDD:460256	78/473 (16%)