Protein Alignment Ube4A and ufd2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_609060.1
• Gene: Ube4A / 33932
• FlyBaseID: FBgn0028467
• Length: 993
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_593630.1
• Gene: ufd2 / 2542023
• PomBaseID: SPAC20H4.10
• Length: 1010
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1064
• Identity: 277/1064 - (26%)
• Similarity: 463/1064 - (43%)
• Gaps: 186/1064 - (17%)

  Fly     5 EENPFAALLQEGA------NSDGVPHKLVEEVLLFTLNKASSSAVLC---LADVVVETSEEMLSE 60
            |:...:..:..||      :.|...|.:..:.|..||::..||....   ..|:..|.|..:.:|
pombe    57 EQKEISPPVTSGAPKHRLFSKDEWMHFITCQALNITLSETDSSKYYLEGFKKDLEEEGSPLLFNE 121

  Fly    61 DLVAHALFERLMLAETSQYAAGNASEMAMERRAMRYLKGAFTRCGLIQAERKID----------- 114
            :.|..||..||.       ..||        ....||..:::  .|.|.::::.
pombe   122 NNVDSALLSRLS-------TTGN--------NTFSYLLQSWS--FLYQYKKRLPKDENQDFKIHY 169

  Fly   115 CSKILALILNNASTCMRQPDLF----------------APQSFGAQWMEMFEQDEDEHDTSTQEF 163
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pombe   170 LSLLKSLLVSYAGIVVMLPDTFNSETIDLAEVLIGAEGIPLEFLSEFVQRFEHEN---------- 224

  Fly   164 LIRVTCKVMEEVEPIEALGALKAIFYPVLTELQKNIAKLNLITMKKNTFWILGYFVRDKRAAVLG 228
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pombe   225 --------------------LDELFIPVLESLSLKIGLMNVDTVQMNVMQIILQLVSLKPIALLL 269

  Fly   229 ELLIDYTTPNPRASGSEYMDTLLGSLLCISILPKTQTGKYEFFQE------LSINQTDEALWALL 287
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pombe   270 PKLPSW-NPTNNAGEIEY-KTFLGRISSLSVF--TQDVASRYFSNSTERSAQNISSSISSLKLTM 330

  Fly   288 SHHQQSIFLLVKQLLVLSPETKKKTLQWVGNCLDANVPRGHLWSSINASLEQTAHSTSSDAFMTN 352
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pombe   331 STYQDVLFQIFNTLIRTSTSLRESVLDFFAMVVNANHKR--------QSIQVNHFDITSDACMLN 387

  Fly   353 LTAVLVRLCAP-LCMPSLKVLLVDPTYCAVPNKDRQAKGVSMLRAHAETCLLTSEEGEERLTAE- 415
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pombe   388 FSHVLSRLSEPFLDIGCSKIDRVQVEYF------RRNPRVDI---KEETKLNADQKASESFYSKP 443

  Fly   416 ---KYNFVTEIFYMT---HKCFELSNIPCIERFVRVLRELQNTQMAYGEIVNSDPNSEVAKNLFR 474
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pombe   444 AEGSNNFISDIFFLNLAFHHYGVNATFKALEQLVQSIRDSEKLKERLETEQQNMSGSFQATRLTA 508

  Fly   475 MIRDQIQQVLTIKNT--------LAEPTNDMYLLKFFEASAIWLTEIAMLPREIYEQ---CLDKR 528
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pombe   509 QL-SRLDQRLDLDRSFVHCYEIMLTQTSDTSRSFSFLNFVAIWLSRLADGQSSTYPKMPLSLPFN 572

  Fly   529 DFSPQVFRNMELLSDTPPFVAPYMQSVPESIIDNISAFLNAARKLNGEQYINIYFSAHDAFFKMI 593
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pombe   573 ENAPEAFK-----------------CLPEYFIETITDYMLSLFKTSSS---TLTLHSLEPLCEFC 617

  Fly   594 ILFMGSSALVKNPHLRAKLAEALEFLLPSRIMGSHRKTFVSHVFDNHPDRLKVVR---------- 648
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pombe   618 VSFLTQANYIKNPYLRAKLAEILYFGVQTHVGRSEL-------------LLDVVRTSKVATRWLL 669

  Fly   649 -SLLNVFVSIEMTGQSVQFEQKFNYRRPMYAIMEFLWTKPEHVQCFRDLAVEAEQNMDAIEPPIF 712
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pombe   670 PALMAFYIEIESTGQSTQFYDKFNIRFYICEVFRTIWKQPAY---FGKLEQEQKTNL-----PFF 726

  Fly   713 LRFINLLINDAIFLLDESLSNLEQIKQLQQAQDNGEWESLPHTEREQHMTNLQHLGMLARFDNII 777
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pombe   727 VKFVALMLNDATYLLDEALLKLTEIHNLQSLLADAISNSNSNQNVQESQSNLAAAERQASTYCQL 791

  Fly   778 GRDTINLLKLLTSKIKSIFCHNSMVDRMAAMLNYFLLNLVGPKKERFKVKDKKEFEFDPAQTVIE 842
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pombe   792 GNETIFMLKLFTSSIPKAFCAVEIVDRLAAMLNYNLQALCGPKCSNLKVEDPTKYHFN-AKTLLS 855

  Fly   843 -ISHIYINLSSDESFCLAVSQDGRSYSEQLFSYAENILIR--IGGGQLIGDMSEFAVKVARMGAQ 904
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pombe   856 IIFDVYLNLCNEPAFVEAVAHDGRSYSKEIFERATSIMTKHNLKSSFDIEAIKEFVNRVEAFRLQ 920

  Fly   905 YKEEQELLADAPEEYLDPIISTLMTDPVVLPSSKVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNREPLTMDKVK 969
            ...|:|.:.|.|:.:|||::.|:|.||||||.|.:::|||||..|||||.||||||.|||:|.|.
pombe   921 EATEEEDMGDIPDYFLDPLMFTIMKDPVVLPRSGISIDRSTIKAHLLSDATDPFNRTPLTLDDVT 985

  Fly   970 SNEALKQEIESWIQGKREAARSNS 993
            .|:.|::||.::::.||.....||
pombe   986 PNDTLREEINTFLKSKRNKHSRNS 1009

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ube4A	NP_609060.1	Ufd2P_core	251..898	CDD:463080	174/685 (25%)
		RING-Ubox_UBE4A	917..986	CDD:438319	37/68 (54%)
ufd2	NP_593630.1	UFD2	76..1010	CDD:227444	274/1045 (26%)