DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Pfas and Pfas

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_477212.1 Gene:Pfas / 33847 FlyBaseID:FBgn0000052 Length:1354 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001382026.1 Gene:Pfas / 287420 RGDID:1304926 Length:1337 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1370 Identity:692/1370 - (50%)
Similarity:891/1370 - (65%) Gaps:66/1370 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 ILRYY-DVQAHSAAEEESVLRRLREEDGAVVSVRMERCYHLEYSAQ----AEHSLALDELLVWLV 62
            :|.:| ....|..|....|||||:|:...:.:|..|.||::.::|:    ||..    :.|:||.
  Rat     4 VLHFYVRPSGHEGAASGHVLRRLQEKLPTLQNVETELCYNVHWAAETLPWAEEM----KKLLWLF 64

  Fly    63 KQPLSKGQSLSRQPALQSTGSSQLLLEIGPRFNFSTPYSTNCVNIFQNLGYSEVRRMETSTRYLV 127
            ..||.: ..::|:..| ..||:.||||:|||.|||||.|||.|::.|..|...|.|:||:.||.:
  Rat    65 GCPLLQ-DDVARESWL-VPGSNDLLLEVGPRLNFSTPASTNIVSVCQAAGLRAVDRVETTRRYRL 127

  Fly   128 TFGEGSKAPEAARFVPLLGDRMTQCLYTEENTPKASFDEQ---LPERQANWHFVPVLEEGRAALE 189
            :|.:...|...|..:..|.||||:..|.:   |..||..|   .|.:.:    :.:|.|||.|||
  Rat   128 SFAKQPTAEMEAISLAALHDRMTEQHYPD---PIQSFSPQSIPAPLKDS----INILAEGRPALE 185

  Fly   190 RINQELGLAFNDYDLDYYHDLFAKELGRNPTTVELFDCAQSNSEHSRHWFFRGRMVIDGVEQPKS 254
            :.|||||||.:.:|||:|...| :||.|||:|||:||.|||||||||||||:|::.:||.:..:|
  Rat   186 KANQELGLALDSWDLDFYTKRF-QELQRNPSTVEVFDLAQSNSEHSRHWFFKGQLHVDGKKLARS 249

  Fly   255 LIRMIMDTQAHTNPNNTIKFSDNSSAMVGFDHQTIVPSSVVAPGAVRLQSVQSDLIFTAETHNMP 319
            |...||.||:.:||||.:||.|||||:.|.:.:.:.|.....|...|.|.....::|||||||.|
  Rat   250 LFESIMSTQSSSNPNNVLKFCDNSSAIQGKEVRFLRPEDSTRPSCFRQQRGLRHVVFTAETHNFP 314

  Fly   320 TAVAPFSGATTGTGGRLRDVQGVGRGGVPIAGTAGYCVGALHIPGYKQPYEPLDFKYPATFAPPL 384
            |.||||||||||||||:||||..|||...:|||||||.|.||||||..|:|...|:||..||.||
  Rat   315 TGVAPFSGATTGTGGRIRDVQCTGRGAHVVAGTAGYCFGNLHIPGYNLPWEDPSFQYPGNFARPL 379

  Fly   385 QVLIEASNGASDYGNKFGEPVISGFALSYGLNSAADASQRDEYVKPIMFSGGLGTMPATMREKLP 449
            :|.||||||||||||||||||::|||.|.||.  ....||.|::||||||||:|:|.|....|.|
  Rat   380 EVAIEASNGASDYGNKFGEPVLAGFARSLGLQ--LPDGQRREWIKPIMFSGGIGSMEAKHVGKEP 442

  Fly   450 PARGQLLAKIGGPVYRIGVGGGAASSVEIQGSGDAELDFNAVQRGDAEMENKLNRVVRACLDLGE 514
            |..|..:.|:|||||||||||||||||::||...::|||.||||||.|||.|:|||:|||::...
  Rat   443 PEPGMEVVKVGGPVYRIGVGGGAASSVQVQGDNTSDLDFGAVQRGDPEMEQKMNRVIRACVEAPG 507

  Fly   515 QNPILAIHDQGAGGNGNVLKELVEPGFAGAVIFSKEFQLGDPTITALELWGAEYQENNAILCNAD 579
            .|||.::|||||||||||||||.||  |||||::..|||||||:.|||:|||||||:||:|....
  Rat   508 GNPICSLHDQGAGGNGNVLKELSEP--AGAVIYTSRFQLGDPTLNALEIWGAEYQESNALLLRPS 570

  Fly   580 QRELLEKICRRERCPISFVGVVTGDGRVTLLEKPAPKDLEQALNASNRSEV-----SPFDLELKY 639
            .|:.|.:...|||||..|||.:|||.|:.|::     |.|..:..|.:.:.     :|.||:|.:
  Rat   571 DRDFLSRASARERCPACFVGTITGDKRIVLVD-----DRECLMGKSGQGDAPPTPPTPVDLDLDW 630

  Fly   640 VLGDMPKRTYDLKREQTPLKELSLPKGLLLDEALERVLSLVAVGSKRFLTNKVDRCVGGLIAQQQ 704
            |||.||::.:.|:|:...|:.|:||..|.:.:||||||.|.||.|||:|||||||.||||:||||
  Rat   631 VLGKMPQKEFFLQRKPPVLQPLALPPDLSVGQALERVLRLPAVASKRYLTNKVDRSVGGLVAQQQ 695

  Fly   705 CVGPLQAPLADYALTTVSHFSHSGIATSIGTQPLKGLLDPAAMARMCVAEALSNLVFVKISELAD 769
            ||||||.||||.|:..:||....|.||::|.||:|.||||.|.||:.|:|||:||||..:::|.|
  Rat   696 CVGPLQTPLADVAVVALSHQELVGAATALGEQPVKSLLDPKAAARLAVSEALTNLVFALVTDLRD 760

  Fly   770 VKCSGNWMWAAKLPGEGARMFDACKELCQILEELHIAIDGGKDSLSMAAKVGGETIKSPGTLVIS 834
            ||||||||||||||||||.:.|||:.:..::..|.:|:|||||||||||:||.||:.:||:||||
  Rat   761 VKCSGNWMWAAKLPGEGAGLADACEAMVTVMAALGVAVDGGKDSLSMAARVGTETVPAPGSLVIS 825

  Fly   835 TYAPCPDVRLKVTPDLKGPGAGSKTSLLWINLE-NSARLGGSALAQAYAQQGKDTPNLTRSDVLG 898
            .||.|||:...||||||.|  |.|..||::.|. ...||||:||||.::|.|:..|:|...:.|.
  Rat   826 AYAVCPDITATVTPDLKHP--GGKGHLLYVPLSPGQHRLGGTALAQCFSQLGEHPPDLDLPENLV 888

  Fly   899 KAFAVTQSLLGDGLIQAGHDVSDGGLLVCVLEMAIGGLSGLRVDLSEPLAKLKNFDKSVEKLNRP 963
            :||.:||.||.|..:.:|||||||||:.|:||||..|..|:.||:..|              ...
  Rat   889 RAFHITQGLLKDRRLCSGHDVSDGGLVTCLLEMAFAGNCGIEVDVPAP--------------GIH 939

  Fly   964 ELAVLFAEECGWVVEVLDTDLERVRSTYEKAGVPNYYLGVTEGFGLDSRVVLKNGKSELLDQPLR 1028
            .|.||||||.|.|:||.:.|:..|...|:.||:....||.|...|..:.|.:....:.::::|:.
  Rat   940 ALPVLFAEEPGLVLEVQEADVAGVLQRYQSAGLHCLELGHTGEAGPQAMVRVSVNGTVVVEEPVG 1004

  Fly  1029 VLYKKWERTSYELEKLQANPECAEAEYNSLEYRQAPQYRGPQNVQAELTLKRSSAPV-RVAVLRE 1092
            .|...||.||::|:.|||.|.|...|...|:.|..|.|..|..........:...|: |||:|||
  Rat  1005 QLRALWEETSFQLDLLQAEPRCVTEEKQGLKERIGPSYCLPPTFPVASVPCKPGGPIPRVAILRE 1069

  Fly  1093 EGVNSEREMMACLLRANFEVHDVTMSDLLQGTASVSQYRGLIFPGGFSYADTLGSAKGWAANILH 1157
            ||.|.:|||......|.|||.||||.||..|...:..:||:.|.|||||||.|||||||||.:..
  Rat  1070 EGSNGDREMADAFHLAGFEVWDVTMQDLCSGAVRLDTFRGVAFVGGFSYADVLGSAKGWAAAVTF 1134

  Fly  1158 NPRLLPQFEAFKRRQDVFSLGICNGCQLMTLIGFVGSAKSEVGADPD---------VALLHNKSQ 1213
            ||:...:...|:||.|.||||:||||||:.|:|:|||..:|...:||         :.|.||.|.
  Rat  1135 NPQAREELGRFRRRPDTFSLGVCNGCQLLALLGWVGSDPNEDQVEPDHDSQPAQPGLLLRHNLSG 1199

  Fly  1214 RFECRWATVKIPSNRSIMLGSMKDLVLGCWVAHGEGRFAFRDEKLISHLQSEQLVTLQYVDDVGK 1278
            |||.|||||::....::||..|:..||..|.|||||..||...:|.:.::::.||.|.:.||.|.
  Rat  1200 RFESRWATVRVEPGPALMLRGMEGSVLPVWSAHGEGYMAFSSPELQAKIKAKGLVPLHWADDDGN 1264

  Fly  1279 PTELYPLNPNGSPQGIAGLCSSDGRHLALMPHPERCSSMYQWPYVPSSFEVSPTQSESPWQIMFN 1343
            |||.|||||||||.||||:||.|||||||||||||...::||.:.||.|:   ..|.|||..:|.
  Rat  1265 PTEQYPLNPNGSPGGIAGICSPDGRHLALMPHPERAVRLWQWAWRPSPFD---GLSTSPWLQLFI 1326

  Fly  1344 NAYNW 1348
            ||.||
  Rat  1327 NARNW 1331

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PfasNP_477212.1 PLN03206 18..1349 CDD:178745 688/1354 (51%)
PurL_repeat1 223..612 CDD:100034 236/388 (61%)
PurL_repeat2 715..1004 CDD:100035 146/289 (51%)
GATase_5 1085..1349 CDD:290241 143/274 (52%)
PfasNP_001382026.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166346093
Domainoid 1 1.000 282 1.000 Domainoid score I1586
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H5970
Inparanoid 1 1.050 1266 1.000 Inparanoid score I157
OMA 1 1.010 - - QHG55304
OrthoDB 1 1.010 - - D38224at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004359
OrthoInspector 1 1.000 - - oto96391
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101332
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10099
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X3082
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.910

Return to query results.
Submit another query.