DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Pfas and Pfas

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_477212.1 Gene:Pfas / 33847 FlyBaseID:FBgn0000052 Length:1354 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_320948.3 Gene:Pfas / 1281370 VectorBaseID:AGAMI1_002204 Length:1358 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1375 Identity:787/1375 - (57%)
Similarity:982/1375 - (71%) Gaps:38/1375 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVILRYYDVQAHSAAEEESVLRRLREEDGAVVSVRMERCYHLEYSAQAEHSLALDELLVWLVKQP 65
            |.|:|||...|.|||:..::|..|:..:..|.:::.|:|::::.:...:....:|.:|..::|: 
Mosquito     1 MTIVRYYSAGALSAAKTNALLESLKAVNPRVQTLQTEKCFYVQNNRYEQLPANVDAMLRGILKE- 64

  Fly    66 LSKGQSLSRQPALQSTGSSQLLLEIGPRFNFSTPYSTNCVNIFQNLGYSEVRRMETSTRYLVTFG 130
            |.....||.:..|.: |.||:::||||||||||..|||.|:|..|||...:.|:|.||||||.. 
Mosquito    65 LDAADQLSEKAGLVA-GPSQVVIEIGPRFNFSTAASTNSVSICHNLGLDFIERIEVSTRYLVGL- 127

  Fly   131 EGSKAPEAARFV----PLLGDRMTQCLYTEENTPKASFDEQLPERQANWHFVPVLEEGRAALERI 191
            :|:...:.|..|    |.|.|.||||.|||.|.|...|.|.:...:.:|:|||:||.||.|||.|
Mosquito   128 DGAIGKDGAGIVSALLPTLHDPMTQCQYTERNIPANDFYEMVSRSKEDWYFVPLLELGRRALEEI 192

  Fly   192 NQELGLAFNDYDLDYYHDLFAKELGRNPTTVELFDCAQSNSEHSRHWFFRGRMVIDGVEQPKSLI 256
            |.:.||||:::||:||.:||.|.|.||||.||||||||.||||||||||:|::.:||..:.:|||
Mosquito   193 NVKNGLAFDEWDLEYYTNLFVKVLKRNPTNVELFDCAQCNSEHSRHWFFKGKLTVDGKPKKQSLI 257

  Fly   257 RMIMDTQAHTNPNNTIKFSDNSSAMVGFDHQTIVPSSVVAPGAVRLQSVQSDLIFTAETHNMPTA 321
            .||.|||.|||||||:||||||||:.|:.|..:..|....||....:||||||||||||||||||
Mosquito   258 EMICDTQRHTNPNNTVKFSDNSSAIKGYQHTALRASCFDGPGKFVQRSVQSDLIFTAETHNMPTA 322

  Fly   322 VAPFSGATTGTGGRLRDVQGVGRGGVPIAGTAGYCVGALHIPGYKQPYEPLDFKYPATFAPPLQV 386
            |:|||||||||||||||||.:||||:|||||||||||.|:|||:|.|||. :.:||.:||.||:|
Mosquito   323 VSPFSGATTGTGGRLRDVQSIGRGGLPIAGTAGYCVGMLNIPGHKLPYES-EQEYPGSFARPLKV 386

  Fly   387 LIEASNGASDYGNKFGEPVISGFALSYGLNSAADASQRDEYVKPIMFSGGLGTMPATMREKLPPA 451
            |||||:||||||||||||||.|||:|:|  :.....:|.|||||||||||:|||.:.:.:|..|.
Mosquito   387 LIEASDGASDYGNKFGEPVICGFAISFG--TVQSDGRRKEYVKPIMFSGGVGTMDSDLVDKKDPK 449

  Fly   452 RGQLLAKIGGPVYRIGVGGGAASSVEIQG-SGDAELDFNAVQRGDAEMENKLNRVVRACLDLGEQ 515
            ||.|||||||||||||||||||||||:|| |.::|||||||||||||||||||||||||:::|::
Mosquito   450 RGMLLAKIGGPVYRIGVGGGAASSVEVQGDSTNSELDFNAVQRGDAEMENKLNRVVRACIEMGDR 514

  Fly   516 NPILAIHDQGAGGNGNVLKELVEPGFAGAVIFSKEFQLGDPTITALELWGAEYQENNAILCNADQ 580
            ||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||:.|||||||||||||:|.:|..
Mosquito   515 NPILAIHDQGAGGNCNVLKELVEPGCAGAVIFSKAFQLGDPTISTLELWGAEYQENNAVLLDASD 579

  Fly   581 RELLEKICRRERCPISFVGVVTGDGRVTLLEKPAPKDLEQALNASN-RSEVS--PFDLELKYVLG 642
            |:||::||.|||||:||||.|||.|.|||||:......::..:.|. ..|::  |||:.|.:|||
Mosquito   580 RDLLQRICDRERCPVSFVGQVTGSGYVTLLEQEFDAGADRFADRSKCGKELAHVPFDMHLDHVLG 644

  Fly   643 DMPKRTYDLKREQTPLKELSLPKGLLLDEALERVLSLVAVGSKRFLTNKVDRCVGGLIAQQQCVG 707
            .||::.:.|:.....|.|..|...:.|.|||..|||...|||||:|||||||.|.||:|||||||
Mosquito   645 KMPQKEFKLQHIGERLDEFQLTAKVKLPEALNLVLSAATVGSKRYLTNKVDRSVTGLVAQQQCVG 709

  Fly   708 PLQAPLADYALTTVSHFSHSGIATSIGTQPLKGLLDPAAMARMCVAEALSNLVFVKISELADVKC 772
            ||..||||:.|..||||:..|:|||||.||:|||:|||..|||.|||||||||||.|||||||||
Mosquito   710 PLHTPLADFGLVAVSHFAREGVATSIGAQPIKGLVDPAKAARMTVAEALSNLVFVGISELADVKC 774

  Fly   773 SGNWMWAAKLPGEGARMFDACKELCQILEELHIAIDGGKDSLSMAAKVGGETIKSPGTLVISTYA 837
            |||||||||:.||||::.|||:.:|:::.:|.||||||||||||||:|.|||:.||||||:||||
Mosquito   775 SGNWMWAAKVAGEGAKLVDACEAMCELMGQLSIAIDGGKDSLSMAARVNGETVVSPGTLVVSTYA 839

  Fly   838 PCPDVRLKVTPDLKGPGAGSKTSLLWINLENSA-RLGGSALAQAYAQQGKDTPNLTRSDVLGKAF 901
            |||||.:|||||||....|:.|:||::.:|... |||||.|||.|.:.|.|.|::..:..|..||
Mosquito   840 PCPDVTVKVTPDLKAAALGTDTALLYVAIEGQRFRLGGSVLAQCYGRLGGDCPDVGNAQCLKSAF 904

  Fly   902 AVTQSLLGDGLIQAGHDVSDGGLLVCVLEMAIGGLSGLRVDLSEPLAKLKNFDKSVEKLNRPELA 966
            .|||.||..|::.:|||.|||||:..|||||..||:.:.::|.:.||      .|....::.|.|
Mosquito   905 NVTQQLLRQGMLLSGHDCSDGGLITTVLEMAFAGLTAVEINLEQLLA------SSGGACSQEEAA 963

  Fly   967 V--LFAEECGWVVEVLDTDLERVRSTYEKAGVPNYYLG----VTEGFGLDSRVVLKNGKSELLDQ 1025
            :  |||||||||:||...::..|...:.||.||.:.:|    |.:.....|..|....|..||..
Mosquito   964 IRALFAEECGWVLEVQQANVAAVTDAFRKAAVPCFTVGRGVAVADLHSRQSVSVRAGAKVVLLQD 1028

  Fly  1026 PLRVLYKKWERTSYELEKLQANPECAEAEYNSLEYRQAPQYR---GPQNVQAELTLKRSSAPVRV 1087
            .|..|:.:||.||:|:||||.....|..||..:|.|..|.|.   .|..|.|:  ||...|..:|
Mosquito  1029 SLFNLFNRWESTSFEIEKLQKAKASAIEEYTGMERRTGPHYTVSFNPDAVYAD--LKLGPAGPQV 1091

  Fly  1088 AVLREEGVNSEREMMACLLRANFEVHDVTMSDLLQGTASVSQYRGLIFPGGFSYADTLGSAKGWA 1152
            |::||||.|.:|||.|.|..|.||||||.|:|||||..::.:|||::||||||||||||||||||
Mosquito  1092 ALIREEGTNGDREMAAALFSAGFEVHDVVMNDLLQGRTTLDRYRGIVFPGGFSYADTLGSAKGWA 1156

  Fly  1153 ANILHNPRLLPQFEAFKRRQDVFSLGICNGCQLMTLIGFVGSAKSEVGAD---PDVALLHNKSQR 1214
            |.|.:|..:.||||.|::|:|.||||:|||||||.|||:|.:..:...|.   |:|.|:.|:|::
Mosquito  1157 ACIQYNGTIAPQFEHFRQREDTFSLGVCNGCQLMGLIGWVETGLAPTAATPTVPEVVLVGNRSEK 1221

  Fly  1215 FECRWATVKIPSNRSIMLGSMKDLVLGCWVAHGEGRFAFRDEKLISHLQSEQLVTLQYVDDVGKP 1279
            ||.||.|:::|::|||||..:...|||||||||||||:||.:.....|...|.||:|||||...|
Mosquito  1222 FESRWVTLRVPASRSIMLRRLAGSVLGCWVAHGEGRFSFRTDASRDRLLMSQCVTMQYVDDASNP 1286

  Fly  1280 TELYPLNPNGSPQGIAGLCSSDGRHLALMPHPERCSSMYQWPYVPSSFEVSPTQSESPWQIMFNN 1344
            ||.||:||||||.||||:||.||||||:|||||||..|:|||||.:.|   |.::.:||..||..
Mosquito  1287 TEQYPMNPNGSPLGIAGVCSPDGRHLAIMPHPERCVQMWQWPYVTADF---PCKNAAPWMSMFQE 1348

  Fly  1345 AYNWCVKSNQ 1354
            ||.||....|
Mosquito  1349 AYLWCSGQQQ 1358

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PfasNP_477212.1 PLN03206 18..1349 CDD:178745 775/1351 (57%)
PfasXP_320948.3 None

Return to query results.
Submit another query.