Protein Alignment CG11147 and Mdr65

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608954.1
• Gene: CG11147 / 33803
• FlyBaseID: FBgn0031734
• Length: 711
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_476831.1
• Gene: Mdr65 / 38726
• FlyBaseID: FBgn0004513
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 726
• Identity: 152/726 - (20%)
• Similarity: 277/726 - (38%)
• Gaps: 178/726 - (24%)

  Fly     4 VEVRNGYKYYGSKSNPKIVLNQ-LNMNVMRGSIYGLLGASGCGKTTLLSCIVGQRRLNG--GEVV 65
            ||.::.:..|.|:  |:::::: ||:.:..|....|:|:|||||:|.:..:  ||..:.  |.|:
  Fly   405 VEFQDVFFRYPSR--PEVIVHRGLNIRIRAGQTVALVGSSGCGKSTCVQLL--QRFYDPVFGSVL 465

  Fly    66 VLGAKPGEPGSGVPGSRVGFMPQEIALVEEMTVKETIFYFGRIY--------GLTDERIR----- 117
            :       ....:....:.::...||:|.:    |.:.:.|.|.        |.|.:.|.
  Fly   466 L-------DDLDIRKYNIQWLRSNIAVVGQ----EPVLFLGTIAQNISYGKPGATQKEIEAAATQ 519

  Fly   118 ---EKFKLLKELLQLPPA-RQMI----KQCSGGQQRRLSFACAMIHDPELLILDEPTVGLDPMLR 174
               .:|     :..||.: |.||    .|.||||::|::.|.|:|.:|::|:|||.|..||....
  Fly   520 AGAHEF-----ITNLPESYRSMIGERGSQLSGGQKQRIAIARALIQNPKILLLDEATSALDYQSE 579

  Fly   175 EKIWDFLVETTRNSKLAVIITTHYIEEAKQANCIGLMRNGVLLAEDTPTNIMIKFGTQSIEDAFL 239
            :::...|...::..  ..|:.:|.:...:.|:.|..:.:|.:|.|.:..::|      ::|.|:.
  Fly   580 KQVQQALDLASKGR--TTIVVSHRLSAIRGADKIVFIHDGKVLEEGSHDDLM------ALEGAYY 636

  Fly   240 ILSQRQG-----NEDELAQIMDHNKNQALPAAVLPPEVIDTHEPNMP--EKQPIPFEEPL----- 292
            .: .|.|     :|.|....::..|.::|   .|..:..:|...|..  :|..:.||||:
  Fly   637 NM-VRAGDINMPDEVEKEDSIEDTKQKSL---ALFEKSFETSPLNFEKGQKNSVQFEEPIIKALI 697

  Fly   293 -NEN--------RKKIFFTTKGRVKALMTKNFVQLFRQP-SGIIFMLLFPIIQLTC--FYLAIG- 344
             :.|        .|..||.|..|:..|..:.:..|.... |.:....|:|...:..  ||.|:.
  Fly   698 KDTNAQSAEAPPEKPNFFRTFSRILQLAKQEWCYLILGTISAVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALAE 762

  Fly   345 KTPTN------------LEIGVYSGEVENYGECFDENLVTVYK---------------------- 375
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  Fly   763 KDPEDALRRTAVLSWACLGLAFLTGLV-----CFLQTYLFNYAGIWLTTRMRAMTFNAMVNQEVG 822

  Fly   376 --DSDNES--CLFNKLSCRYIRVLG-----------------DDVATRKYYASEADALNDAKRAT 419
              |.:|.|  .|..:||...:.:.|                 ..|:...||..:...|..|....
  Fly   823 WFDDENNSVGALSARLSGEAVDIQGAIGYPLSGMIQALSNFISSVSVAMYYNWKLALLCLANCPI 887

  Fly   420 TVGYLHF-AQNFSDSIL---SVMEDGIHSSDGAVDH--------AELSIHIDMTD--QQVAYFMQ 470
            .||.:.. |:..|::::   .|:|:....:..::.:        .|..:..:.|:  |:|...::
  Fly   888 IVGSVILEAKMMSNAVVREKQVIEEACRIATESITNIRTVAGLRREADVIREYTEEIQRVEVLIR 952

  Fly   471 RKLR--------DKFSTFMRSVVKDCNVSTAIVDLPVQFQEPIFGSTDIEF-QQYCAPGVVMTMV 526
            :|||        .:.|.|....|..|.....:.:..:.||:.|..|..:.: ....|..:..|..
  Fly   953 QKLRWRGVLNSTMQASAFFAYAVALCYGGVLVSEGQLPFQDIIKVSETLLYGSMMLAQSLAFTPA 1017

  Fly   527 FFLATLMTAAVFISERMDGIWDR-TLLAGVSATEMLWAHLLTQLIIMALQSFEVIMYIGLVFDTY 590
            |      :||:....|:..|.|| ..:.....|       :...:...|..||.:.|.|:.|...
  Fly  1018 F------SAALIAGHRLFQILDRKPKIQSPMGT-------IKNTLAKQLNLFEGVRYRGIQFRYP 1069

  Fly   591 NNGDTTTLIGL 601
            ...|...|.||
  Fly  1070 TRPDAKILNGL 1080

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG11147	NP_608954.1	CcmA	4..245	CDD:440746	63/264 (24%)
		ABC2_membrane_3	322..702	CDD:463674	67/363 (18%)
		YadH	513..710	CDD:440604	20/91 (22%)
Mdr65	NP_476831.1	MdlB	118..641	CDD:440747	63/264 (24%)
		MdlB	711..1299	CDD:440747	74/388 (19%)