Protein Alignment GluRIIA and grin2ab

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523484.2
• Gene: GluRIIA / 33788
• FlyBaseID: FBgn0004620
• Length: 907
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073805448.1
• Gene: grin2ab / 570493
• ZFINID: ZDB-GENE-070424-223
• Length: 1445
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 864
• Identity: 195/864 - (22%)
• Similarity: 347/864 - (40%)
• Gaps: 209/864 - (24%)

  Fly    86 CELIS----NGVAAIFGPSSKAASDIVAQIANATGIPHIEYDLKLEATRQEQLNHQMSINVAPSL 146
            |||:|    :|:....|...:|.:.::..:::.|.:|.:........|..|:.:.........||
Zfish    76 CELMSRQRLHGLVYGDGTDQEAVAQMLDFVSSQTSMPILGIHGGSAMTMAEKDSSSSFFQFGASL 140

  Fly   147 ---SVLSRAYFEIIKSNYEWRTFTLIYETPEGLARLQDLMNIQALNSDYVKLRNLADYADDYRIL 208
               ::|..|..|    .|:|..|:::.....|   .|:.:....:..|:..:|
Zfish   141 QQEALLMLAIME----EYDWHVFSVVTTKFPG---FQEFIATVRVTVDHSFVR------------ 186

  Fly   209 WK-----------ETDETFHEQR-------IILDCEPKTLKELLKVSIDFKLQGPFRNWFLTHLD 255
            |.           |.::..|.|.       |:|.|.......:::.:....|.|....|.:..|.
Zfish   187 WDLQSVVTLDGVGEPEDRAHVQLKRIQSPVILLYCSKDEAALVMEEARSLGLTGAGFVWIVPSLT 251

  Fly   256 THNSGLRDIYNEDFKANITSVRLKVVDANPFERKKTRLTKVDQILGNQTMLPILIYDAVVLFASS 320
            |.|  |..| .|.|.|.:.||.....| .|.|   |||                 .|||.:.:|:
Zfish   252 TGN--LEHI-PEAFPAGMISVTYDEWD-YPLE---TRL-----------------QDAVGIISSA 292

  Fly   321 ARNVIAAM-------------------QPFHPPNRHCGSSSPWMLGAFIVNEMKTISED--DVEP 364
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Zfish   293 A----AAMFREEGRIPDGTASCYGQSEKPEVPPS----ALRRYMMGVNLGGKDHSFMDDGYQVNP 349

  Fly   365 H-----FKTENMKLDEYGQRIHFNLEIYKPTVNEPMMVWTPDNGIKKRLLNLELESAGTTQDFSE 424
            .     ..||. :.::.|:..:.:|.:..|       ||...|            |.|   |...
Zfish   350 KLVVIVLNTER-EWEKMGRWENHSLRLKFP-------VWPRYN------------SFG---DMDA 391

  Fly   425 QRKVYTVVTHYEEPYFMMKEDHENFRG-----------------------REKYEGYAVDLISKL 466
            .....::||..|.| |::.:|.:...|                       ::..:|:.:|::.|:
Zfish   392 DENHLSIVTLEERP-FVIVDDVDILTGTCMRNSVPCRKHIKDNTTEGSYVKKCCKGFCIDILKKI 455

  Fly   467 SELMEFDYEFMIVNGNGKYNPETKQ-WDGIIRKLIDHHAQIGVCDLTITQMRRSVVDFTVPFMQL 530
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Zfish   456 ARNVKFTYDLYLVT-NGKHGKKINNVWNGMVGEVVYKKAVMAVGSLTINEERSEAIDFSVPFVET 519

  Fly   531 GISILHYKS--PPEPKNQFAFLEPFAVEVWIYMIFAQLIMT----LAFVFIARLSYREWL----- 584
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Zfish   520 GISVMVSRSNGTVSPS---AFLEPFSASVWVMMFVMLLIVTAIAVFLFEFISPLGFNRNLAQGKD 581

  Fly   585 PPNPAIQDPDELENIWNVNNSTWLMVGSIMQQGCDIL-PRGPHMRILTGMWWFFALMMLSTYTAN 648
            |..|:          :.:..:.||:.|.:......:. |||...:.:..:|.|||::.|::||||
Zfish   582 PHGPS----------FTIGKAVWLLWGLVFNNSVPVQNPRGTTSKFIVSVWAFFAVIFLASYTAN 636

  Fly   649 LAAFLTSNKWQSSIKSLQDLIEQD------KVHFGSMRGGSTSLFFSESNDTDYQRAWNQMKDFN 707
            ||||:...::...:..|.|...|.      ...||::..|||        :.:.::.:..|..:
Zfish   637 LAAFMIQEEFVDQVTGLSDRKFQSPYSYSPPFRFGTVPNGST--------ERNIRKNYPAMHQY- 692

  Fly   708 PSAFTSTNKEGV--ARVRKEKGGY-AFLMETTSLTYNIERN--CDLTQIGEQ--IGEKHYGLAVP 765
               ....::.||  |.|..:.|.. ||:.:...|.|...|:  |.|..||..  .....||:|:.
Zfish   693 ---MVKYHQTGVVDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYMAGRDDGCKLVTIGSGYIFATTGYGIAMQ 754

  Fly   766 LGSDYRTNLSVSILQLSERGELQKMKNKWWKN--HNVTCDSYHEVDGDELSIIELGGVFLVLAGG 828
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Zfish   755 KGSYWKRLVDLAILGIIGDGEMEELEAQWLTGICHN----EKNEVMSSQLDVDNMAGVFYMLAAA 815

  Fly   829 VLIGVILGIFE--FLWNVQ 845
            :.:.:|..::|  |.|.::
Zfish   816 MALSLITFVWEHLFYWRLR 834

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIA	NP_523484.2	PBP1_iGluR_Kainate	33..405	CDD:380605	73/369 (20%)
		PBP2_iGluR_Kainate	426..796	CDD:270432	105/418 (25%)
		Lig_chan	555..828	CDD:459656	75/297 (25%)
grin2ab	XP_073805448.1	None