Protein Alignment GluRIIA and GRID2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523484.2
• Gene: GluRIIA / 33788
• FlyBaseID: FBgn0004620
• Length: 907
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_011530195.2
• Gene: GRID2 / 2895
• HGNCID: 4576
• Length: 1035
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 867
• Identity: 222/867 - (25%)
• Similarity: 380/867 - (43%)
• Gaps: 138/867 - (15%)

  Fly    67 VTIKRYMPTND----------SFLLQQITCELISNGVAAIFGPSSKAASDIVAQIANATGIPHIE 121
            ||....||..:          :..|.|.||||::.|:.|:.......::..:..:|:|..|||:.
Human    66 VTAATRMPLRETRGTNTTASPATALPQKTCELMNQGILALVSSIGCTSAGSLQSLADAMHIPHLF 130

  Fly   122 YDLKLEAT-------RQEQLNHQMSINVAPSL---SVLSRAYFEIIKSNYEWRTFTLIYETPEGL 176
            .......|       .:...|...:::|.|.:   .|:.|     :.:.|.|:.|.:.|::...:
Human   131 IQRSTAGTPRSGCGLTRSNRNDDYTLSVRPPVYLHDVILR-----VVTEYAWQKFIIFYDSEYDI 190

  Fly   177 ARLQDLM-----------------NIQALNS---DYVKLRNLADYADDYRILWKETDETFHEQRI 221
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Human   191 RGIQEFLDKVSQQGMDVALQKVENNINKMITTLFDTMRIEELNRYRDTLR-------------RA 242

  Fly   222 ILDCEPKTLKELLKVSIDFKLQGPFRNWFLTHLDTHNSGLRDIYNEDFKANITSVRLKV-VDANP 285
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Human   243 ILVMNPATAKSFITEVVETNLVAFDCHWIIINEEINDVDVQELVRRSI-GRLTIIRQTFPVPQNI 306

  Fly   286 FER--------KKTRLTKVDQILGNQTMLPILIYDAVVLFASSARNVIAAMQPFHPPNRHC--GS 340
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Human   307 SQRCFRGNHRISSTLCDPKDPFAQNMEISNLYIYDTVLLLANAFHKKLEDRKWHSMASLSCIRKN 371

  Fly   341 SSPWMLGAFIVNEMK-----------TISEDDVEP--HFKTENMKL-DEYGQRIHFNLEIYKPTV 391
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Human   372 SKPWQGGRSMLETIKKGGVSGLTGELEFGENGGNPNVHFEILGTNYGEELGRGVRKN-ERIRPQG 435

  Fly   392 NE----PMM-VWTPDNGIKKRLLNLELESAGTTQDFSEQRKVYTVVTHYEEPYFMMKEDHENFRG 451
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Human   436 STGKIWPQLGCWNPVTGLNGSLTDKKLEN-------NMRGVVLRVVTVLEEPFVMVS---ENVLG 490

  Fly   452 R-EKYEGYAVDLISKLSELMEFDYEFMIVNGNGKYNP-ETKQWDGIIRKLIDHHAQIGVCDLTIT 514
            : :||:|:::|::..||..:.|:||..:...:...:| |...|:|::.:|:...|.||:..||||
Human   491 KPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTIT 555

  Fly   515 QMRRSVVDFTVPFMQLGISILHYKSPPEPKNQFAFLEPFAVEVWIYMIFAQLIMTLAFVFIARLS 579
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Human   556 PDRENVVDFTTRYMDYSVGVL-LRRAEKTVDMFACLAPFDLSLWACIAGTVLLVGLLVYLL---- 615

  Fly   580 YREWLPPNPAIQDPDELENIWNVNNSTWLMVGSIMQQGCDILPRGPHMRILTGMWWFFALMMLST 644
              .||.| |.:|.......  .:.||.|.:.||.:|||.::.......|::.|.||.|||:::|:
Human   616 --NWLNP-PRLQMGSMTST--TLYNSMWFVYGSFVQQGGEVPYTTLATRMMMGAWWLFALIVISS 675

  Fly   645 YTANLAAFLTSNKWQSSIKSLQDLIEQDKVHFGS-----------MRGGSTSLFFSESNDTDYQR 698
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Human   676 YTANLAAFLTITRIESSIQSLQDLSKQTEIPYGTVLDSAVYEHVRMKGLNPF-----ERDSMYSQ 735

  Fly   699 AWNQMKDFNPSAFTSTNKEGVARVRKEK-GGYAFLMETTSLTYNI--ERNCDLTQIGEQIGEKHY 760
            .|..:...|.|  .:...|..|.::|.| |.|||:.:...|.|..  :.:|....||..:.::.|
Human   736 MWRMINRSNGS--ENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTIGNTVADRGY 798

  Fly   761 GLAVPLGSDYRTNLSVSILQLSERGELQKMKNKWWKNHNVTCDSYHEVD----GDELSIIELGGV 821
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Human   799 GIALQHGSPYRDVFSQRILELQQNGDMDILKHKWWPK-NGQCDLYSSVDTKQKGGALDIKSFAGV 862

  Fly   822 FLVLAGGVLIGVILGIFEFLWN 843
            |.:||.|:::...:.:.|..||
Human   863 FCILAAGIVLSCFIAMLETWWN 884

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIA	NP_523484.2	PBP1_iGluR_Kainate	33..405	CDD:380605	76/407 (19%)
		PBP2_iGluR_Kainate	426..796	CDD:270432	124/385 (32%)
		Lig_chan	555..828	CDD:459656	94/290 (32%)
GRID2	XP_011530195.2	Periplasmic_Binding_Protein_type1	92..457	CDD:471960	71/384 (18%)
		PBP2_iGluR_delta_2	468..834	CDD:270449	124/385 (32%)