Protein Alignment GluRIIA and GRIA3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523484.2
• Gene: GluRIIA / 33788
• FlyBaseID: FBgn0004620
• Length: 907
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_000819.4
• Gene: GRIA3 / 2892
• HGNCID: 4573
• Length: 894
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 902
• Identity: 281/902 - (31%)
• Similarity: 449/902 - (49%)
• Gaps: 118/902 - (13%)

  Fly    11 FIIIIGFLEGIIALG---GDDRNEITVGAIFYENEKEIELSFDQAFREVN-NMKFSELRFVTIKR 71
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Human    16 FFLVLGL------LGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNTNQNTTEKPFHLNYH 74

  Fly    72 --YMPTNDSFLLQQITCELISNGVAAIFGPSSKAASDIVAQIANATGIPHIEYDLKLEATRQEQL 134
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Human    75 VDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGALHTSFVTPSFPTDA------ 133

  Fly   135 NHQMSINVAPSL--SVLSRAYFEIIKSNYEWRTFTLIYETPEGLARLQDLMNIQALNSDYVKLRN 197
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Human   134 DVQFVIQMRPALKGAILS------LLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEAAVQNNWQVTARS 192

  Fly   198 LADYAD--DYRILWKETDETFHEQRIILDCEPKTLKELLKVSIDFKLQGPFRNWFLTHLDTHNSG 260
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Human   193 VGNIKDVQEFRRIIEEMDRR-QEKRYLIDCEVERINTILEQVV---ILGKHSRGY--HYMLANLG 251

  Fly   261 LRDIYNEDFK---ANITSVRLKVVDANP----FERKKTRLTKVDQILGNQTML---PILIYDAVV 315
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Human   252 FTDILLERVMHGGANITGFQI-VNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKNAPLKYTSALTHDAIL 315

  Fly   316 LFASSARNVIAAMQPFHPPNRHCGSSS--------PWMLGAFIVNEMKTISEDDVEPHFKTENMK 372
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Human   316 VIAEAFRYL--RRQRVDVSRR--GSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKMVQVQGM-----TGNIQ 371

  Fly   373 LDEYGQRIHFNLEIYKPTVNEPMMVWTPDNGIKK--------RLLNLELESAGTTQDFSEQRKVY 429
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Human   372 FDTYGRRTNYTIDVYEMKV----------SGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASSENRTI- 425

  Fly   430 TVVTHYEEPYFMMKEDHENFRGREKYEGYAVDLISKLSELMEFDYEFMIVNGNGKY---NPETKQ 491
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Human   426 VVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIV-GDGKYGARDPETKI 489

  Fly   492 WDGIIRKLIDHHAQIGVCDLTITQMRRSVVDFTVPFMQLGISILHYKSPPEPKNQFAFLEPFAVE 556
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Human   490 WNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYE 554

  Fly   557 VWIYMIFAQLIMTLAFVFIARLSYREW-------LPPNPAIQDPDELENIWNVNNSTWLMVGSIM 614
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Human   555 IWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDP--QSPPDPPNEFGIFNSLWFSLGAFM 617

  Fly   615 QQGCDILPRGPHMRILTGMWWFFALMMLSTYTANLAAFLTSNKWQSSIKSLQDLIEQDKVHFGSM 679
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Human   618 QQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTL 682

  Fly   680 RGGSTSLFFSESNDTDYQRAWNQMKDFNPSAFTSTNKEGVARVRKEKGGYAFLMETTSLTYNIER 744
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Human   683 DSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQR 747

  Fly   745 N-CDLTQIGEQIGEKHYGLAVPLGSDYRTNLSVSILQLSERGELQKMKNKWWKNHNVTCDSYHEV 808
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Human   748 KPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKG-ECGS---G 808

  Fly   809 DGDE------LSIIELGGVFLVLAGGVLIGVILGIFEFLW-------------NVQN 846
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Human   809 GGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQN 865

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIA	NP_523484.2	PBP1_iGluR_Kainate	33..405	CDD:380605	90/396 (23%)
		PBP2_iGluR_Kainate	426..796	CDD:270432	162/380 (43%)
		Lig_chan	555..828	CDD:459656	115/286 (40%)
GRIA3	NP_000819.4	PBP1_iGluR_AMPA_GluR3	35..409	CDD:380610	92/411 (22%)
		PBP2_iGluR_AMPA	422..805	CDD:270433	163/387 (42%)