Protein Alignment GluRIIA and glr-7

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523484.2
• Gene: GluRIIA / 33788
• FlyBaseID: FBgn0004620
• Length: 907
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001337310.1
• Gene: glr-7 / 180547
• WormBaseID: WBGene00001618
• Length: 885
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 868
• Identity: 202/868 - (23%)
• Similarity: 357/868 - (41%)
• Gaps: 157/868 - (18%)

  Fly    67 VTIKRYMPTNDSFLLQQITCELISNGVAAIFGPSSKAASDIVAQIANATGIPHIEYDLKLEATRQ 131
            ::::|| ..|||..:..: |:.:.|....|....|..:..:||::|..:.:|.|:.||...:.
 Worm    12 ISLERY-DFNDSSDINSL-CDQMVNVSFVISVCRSNDSISLVAELARISQVPTIQVDLNYWSL-- 72

  Fly   132 EQLNHQMSINVAPSLSVLSRAYFEIIKSNYEWRTFTLIYE------------TPEGLARLQDLMN 184
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 Worm    73 -----PLNFNGTSVPTISSPSYTTMVLS-------TLVFQNVITDIFADLNITPNSTV-LYDNM- 123

  Fly   185 IQALNSDYVKLRNLADYADDYRILWKETDETFHEQR-------------IILDCEPKTLKELLKV 236
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 Worm   124 ---YPPDFTAWRDAFSVLPGIRFVPMET--TVLRMRAQITQLRMASINSLILVAKTENVERFTLE 183

  Fly   237 SIDFKLQGPFRNWFLTHLDTHNSGLRDIYNEDFKANI-------------TSVRLKVVDANPFER 288
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 Worm   184 AADFIEQRVFNTYVLT---------KDI--TAFKCDSCESAFMFWLRPFPVGKLMEIRDLDDYLF 237

  Fly   289 KKTRLTKVDQILGNQTMLPILIYDAVVLFA-SSARNVIAAMQPFHPPNRHC--GSSSPWMLGAFI 350
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 Worm   238 RNEIGLELDYSINGWDSLNVAFYMNVMGYAFETIRTMNATFDVL--PTFTCQTGPSEP------- 293

  Fly   351 VNEMKTISEDDV--EPHFKTENMKLDEYGQRIHF---NLEIYK---------PTVNEPMMVWTPD 401
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 Worm   294 --NITTTVRDIILNDPAHEYGN--YTEAGLNMFFQDVEVRIYKIDRDRDHEDALFNKEVGVWSPI 354

  Fly   402 NGIKKRLLNLELESAGTTQDFSEQRKVYTVVTHYEEPYFMMKEDHENFRGREKYEGYAVDLISKL 466
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 Worm   355 SKLSVMY--------GTLQVDVRNLNIFRVVTLIQPPFVQRTGDPDT-----PYEGYCIDLINMI 406

  Fly   467 SELMEFDYE-FMIVNGNGKYNPETKQWDGIIRKLIDHHAQIGVCDLTITQMRRSVVDFTVPFMQL 530
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 Worm   407 QVEVNFTYTIYEVEDGSFGTMDDNGNWNGLIGALVSGSADIALAPLSVMAERENDVDFTVPYYDL 471

  Fly   531 -GISILHYKSPPEPKNQFAFLEPFAVEVWIYMIFAQLIMTLAFVFIARLSYREWLPPNPAIQDPD 594
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 Worm   472 VGTTILMKKADVE-YSLFKFMKVLEWPVWLCIVAAYLFTSILLWIFDRFSPYSFTNNKERYQNDI 535

  Fly   595 ELENIWNVNNSTWLMVGSIMQQGCDILPRGPHMRILTGMWWFFALMMLSTYTANLAAFLTSNKWQ 659
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 Worm   536 E-KRQFSLKECLWFCMTSLTPQGGGEAPKNISGRLVAATWWLFGFIIIASYTANLAAFLTVSRLE 599

  Fly   660 SSIKSLQDLIEQDKVHFGSMRGGSTSLFF---SESNDTDYQRAWNQM---KDFNP---------- 708
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 Worm   600 QPISSLDDLAKQYKIEYAPIKGSASETYFRRMAEIEETFY-NMWKEMSLNESMSPRDRAKLAVWD 663

  Fly   709 ----SAFTS-----------TNKE-GVARVRKEKGGYAFLMETTSLTYNIERNCDLTQIGEQIGE 757
                ..||:           .|.: .|.||.....|:||:.:.|.:.|....||:|.|:|.:...
 Worm   664 YPVSDKFTNMWRYMQESKLPVNMDTAVDRVLNSVDGFAFIGDATEIKYAALTNCNLQQVGTEFSR 728

  Fly   758 KHYGLAVPLGSDYRTNLSVSILQLSERGELQKMKNKWWKN--HNVTC-DSYHEVDGDELSIIELG 819
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 Worm   729 KPYAIAVQSGHILKDKISSAILMLLNERRLETLKEKWWTDNPNKVSCPDSSDESDG--ISIQNIG 791

  Fly   820 GVFLVLAGGVLIGVILGIFEFLW 842
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 Worm   792 GVFIVILAGIALSIVTLAFEYYY 814

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIA	NP_523484.2	PBP1_iGluR_Kainate	33..405	CDD:380605	73/392 (19%)
		PBP2_iGluR_Kainate	426..796	CDD:270432	108/403 (27%)
		Lig_chan	555..828	CDD:459656	86/307 (28%)
glr-7	NP_001337310.1	Periplasmic_Binding_Protein_type1	<101..>274	CDD:471960	31/190 (16%)
		PBP2_iGluR_putative	373..767	CDD:270435	108/401 (27%)