Protein Alignment GluRIIA and Nmdar1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523484.2
• Gene: GluRIIA / 33788
• FlyBaseID: FBgn0004620
• Length: 907
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_321646.4
• Gene: Nmdar1 / 1281696
• VectorBaseID: AGAMI1_011915
• Length: 966
• Species: Anopheles gambiae
• Alignment Length: 990
• Identity: 205/990 - (20%)
• Similarity: 390/990 - (39%)
• Gaps: 216/990 - (21%)

  Fly    25 GGDDRNEITVGAIFYENEKE-------IELSFDQAFREVNNMKFSELRFVTIKRYMPTNDSFLLQ 82
            |.:..:...:|.:...||.|       ..|:|||                   :|:|...::..:
Mosquito    29 GSESPSYYNIGGVLSNNESESHFATVIAHLNFDQ-------------------QYVPRGTTYYDK 74

  Fly    83 QI------------TCE-LISNGVAAIF------GPSSKAASDIVAQIANATGIPHIEYDLKLEA 128
            .|            .|: |||..|.|:.      |..|.||   |:..:....||.|....: ||
Mosquito    75 TIRIDKNPIKTALNVCKHLISRRVYAVVVSHEPTGDLSPAA---VSYTSGFYQIPVIGISSR-EA 135

  Fly   129 TRQEQLNHQMSINVAPSLSVLSRAYFEIIKSNYEWRTFTLIYET-PEGLARLQDLMNIQALNSDY 192
            ...::..|...:...|.....:..:.||: |::.:....:|:.: .:|.|.|.........|.|.
Mosquito   136 AFSDKNIHVSFLRTVPPYYHQADVWLEIL-SHFGYTKVIIIHSSDTDGRAVLGRFQTTSQTNYDD 199

  Fly   193 VKLRNLADYADDYRILWKETDETFHEQRIILDCEPKTLKELLKVSIDFKLQGPFRNWFLTHLDTH 257
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Mosquito   200 IDVR--------------ATVES------IVEFEPK-------------------------LDSF 219

  Fly   258 NSGLRD--------------------IYNEDFKANITSV-RLKVVDANPFERKKTRLTKVDQILG 301
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Mosquito   220 SSYLMDMKTAQSRVYLLYASQEDAYVIFRDAAIHNMTEYGHIWIVTEQALSANNTPTGIIGLKLN 284

  Fly   302 NQTMLPILIYDAVVLFASSARNVIAAMQPFHPPNRHCGSSSP-WMLGAFIVNEMKTISEDDVEPH 365
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Mosquito   285 NAENETDHIKDAIYILASAIKEMTVNETITEAP-KDCDDSGVIWESGKRLFGYLKTRN-----IR 343

  Fly   366 FKTENMKLDEYGQRIHFNLEIYKPTVNEPMM-VWTPDNGIKKRLLNLELESAGTTQDFSEQRKV- 428
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Mosquito   344 GETGQVAFDDNGDRMYAEYDVINVHENHSFVKVGSFHYDSEKRKMRLKINDSSITWPGNTGKKPE 408

  Fly   429 -------YTVVTHYEEPYFMMKE---------------DHENFRGREKYE----GYAVDLISKLS 467
                   ..|:|..|:|:...::               .|.|.....:.|    ||.:||:..|:
Mosquito   409 GIMIPTHLKVLTIEEKPFVYARKLLDDEIDCADDEVVCPHFNITNGNEQEYCCKGYCIDLLKALA 473

  Fly   468 ELMEFDYEFMIVNGNGKY------NPET-------KQWDGIIRKLIDHHAQIGVCDLTITQMRRS 519
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Mosquito   474 QRINFTYD-LALSPDGQFGHYQLKNHTTGIGTTVKKEWNGLIGELVAERADLIVAPLTINPERAE 537

  Fly   520 VVDFTVPFMQLGISILHYKSPPEPKNQFAFLEPFAVEVWIYMIFAQLIMTLAFVFIARLSYREWL 584
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Mosquito   538 FIEFSKPFKYQGITILE-KKPSRSSTLVSFLQPFSNTLWILVMVSVHVVALVLYLLDRFS----- 596

  Fly   585 PPNP------AIQDPDELENIWNVNNSTWLMVGSIMQQGC-DILPRGPHMRILTGMWWFFALMML 642
               |      :..|..| |:..|::::.|...|.::..|. :..||....|:|..:|..||::::
Mosquito   597 ---PFGRFKLSTTDGTE-EDALNLSSAIWFAWGVLLNSGIGEGTPRSFSARVLGMVWAGFAMIIV 657

  Fly   643 STYTANLAAFLTSNKWQSSIKSLQDL---IEQDKVHFGSMRGGSTSLFFSESNDTDYQRAWNQMK 704
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Mosquito   658 ASYTANLAAFLVLERPKTKLTGINDARLRNTMENLTCATVKGSSVDMYF--RRQVELSNMYRTME 720

  Fly   705 DFNPSAFTSTNKEGVARVRKEKGGYAFLMETTSLTYNIERNCDLTQIGEQIGEKHYGLAVPLGSD 769
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Mosquito   721 ANN----YDTAEQAIQDVKDGK-LMAFIWDSSRLEYEASKDCELVTAGELFGRSGYGVGLQKGSP 780

  Fly   770 YRTNLSVSILQLSERGELQKMKNKWWKNHNV-TCDSYHEVDGDELSIIELGGVFLVLAGGVLIGV 833
            :...::::||...|.|.::.:..:|..:.|| .|:.: |...:.|.:..:.|||:::..|::.|:
Mosquito   781 WTDAVTLAILDFHESGFMESLDKEWIFHGNVQQCEQF-EKTPNTLGLKNMAGVFILVGAGIVGGI 844

  Fly   834 ILGIFEFLWNVQNVAVEERVTPWQAFKAELI-FALKFW----VRKKPMRISSSSDK------SSS 887
            .|.|.|.::....:..::        |.|:. .|...|    .::|.:|.|.:..:      :|.
Mosquito   845 GLIIIEVVYKKHQIKKQK--------KMEIARHAADKWRGTIEKRKTLRASLAMQRQYNVGLNSV 901

  Fly   888 RRSSGSRRSSKEKSR 902
            .:|..|:.:  ||||
Mosquito   902 SKSVQSQNA--EKSR 914

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIA	NP_523484.2	PBP1_iGluR_Kainate	33..405	CDD:380605	75/421 (18%)
		PBP2_iGluR_Kainate	426..796	CDD:270432	98/419 (23%)
		Lig_chan	555..828	CDD:459656	64/283 (23%)
Nmdar1	XP_321646.4	None