Protein Alignment Cap-D3 and Cap-D2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608935.2
• Gene: Cap-D3 / 33778
• FlyBaseID: FBgn0051989
• Length: 1267
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_651709.1
• Gene: Cap-D2 / 43491
• FlyBaseID: FBgn0039680
• Length: 1380
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1349
• Identity: 256/1349 - (18%)
• Similarity: 474/1349 - (35%)
• Gaps: 403/1349 - (29%)

  Fly    36 SVLQQRAEKFWTMAMCLQDGGHQETQLQLLRD---LSAIIRAMRDENQASYSNTHDNWSNLIG-- 95
            :|||...||.|:..:.      :|..:.||.|   .:..:..:|.:|:    :..|....::|
  Fly   179 NVLQCPLEKLWSPPVA------EEDFINLLCDPCYRTIELLPLRMDNK----HVFDTIFQILGTS 233

  Fly    96 ---FSPALGYLTYIYSLVSLVVLPEHVQQAAPQQLNENINMQLALNAATTYLLTLTIPGAKIFGV 157
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  Fly   234 IKRFNQA---MTFPVRILQILRGTEHAAHSV---------------AAGILLLHEEYGISSVFSI 280

  Fly   158 FDEDVIEQVLKVFRLLEMNNNKSLRASMIWMFFLTICDDLKIVFRYVHFKEHL-KTRDRIIRCLL 221
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  Fly   281 ----LIKSIVDALRMDSSDSSVSKHFSNFLAEFSNIAPSLIV--------PHLEKLAEDLLDCQS 333

  Fly   222 EVLYMNFKMGYQNTCAPGLHGKCFELFSEIANEHNGDVYETLHLIMRQTFPMHVYTDSPQMIAYG 286
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  Fly   334 HTL---------RNCVLQIIGD--TVVSELTSE---DLSEELKEV-RNEFLEHLMAHILDISAHV 383

  Fly   287 RRGAMQSGEHISDW------FI---------QLIDKYPDIVNRILHFYIECVVSNPIKAWKSNDE 336
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  Fly   384 RSKVLSIWHHLKTQHAIPLNFLTRVLEEAIGRLEDKSSLVRRAAMHLIKSALESNPYSSKLSIDE 448

  Fly   337 KVAIGYAAKYDRVL--FTKCNKSCADYVLEAVKA------DDAVGIQIRALDLIEKILLQESEVE 393
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  Fly   449 -----LRAKHEHEVQAMEKLNE-----VLEEERKQEEKLNDEFSSLAPELLPFIEENLTEFPDMQ 503

  Fly   394 WSIFRHEVSD---VPREVPLLRE--------VLRCL-------NDRTLTVRRKACQVLILALRQ- 439
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  Fly   504 ---FDKEESDETLMERIIPLMREKNYKDVIVLVRKVDFLAGNQNMSSLLKHEEHC-VYVLALLKT 564

  Fly   440 ------GSPMTKKILQESIRFVQF--DDTDVEAL---AEPS------AQQNELRFEKPGI--VQY 485
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  Fly   565 YHLLAAGFKQSSEEMLQQIKTVQFLKDSIDFAVLMTSAFPKLHEMLMSKTNTDVFEAVDLFTTGY 629

  Fly   486 AFSFQGHE-------QL----ETEVKNLPQTVYQRFLAADNGLARSAGIALLERL---------- 529
            .|...|.|       ||    :.|.::.....|:|.|.:.:...|:..|.:::.|
  Fly   630 MFGIHGTESGMQRMLQLVWSSDKEKRDAVSDAYKRVLFSTDQTGRAHAIKVVQNLSKFLSEIEYG 694

  Fly   530 ------------------------VLVNPLIIYNTNFVKETSLLAVDRL--SSVRKSALETIETL 568
                                    ||.....:.........|.|::..|  :|..||::.:..|.
  Fly   695 HYTALESLMTEWVLGGDIDAAVIQVLFERFTLKLEGTTSNESRLSLQLLIMASQSKSSIVSANTA 759

  Fly   569 L--------------EAYSNCFALIC----------VYCRIWACLMSDEDVA--LQKL------- 600
            :              ..:::|..|:.          .|.|    ..||.:..  :.:|
  Fly   760 IIEDIAVGERVRRDPRIFTSCLQLLVNSIDANNTAKYYKR----QNSDAEFVGKITRLFLDFFFH 820

  Fly   601 -AISSFDRMVLKNIQPLEYSNEAKHFMPWRIISTLLMTQPRAYLQERFAVLL------ERETIVT 658
             ::..||.:.:...:......:|...:..::::.||.....::|.:..|.::      :.||:..
  Fly   821 RSLYDFDALAMSVFEYFYRMCQAPDVIAQQLVTALLKQFNESWLVKEAAAIVPSPDKADTETVPD 885

  Fly   659 PRLVNVIISHLSTSMATDA------WGLLL--FLSSRITNNMDALIG-------IFNGLSSY-NM 707
            .:.:.:..|...|...|.|      .|.|:  :|.||:.    ..||       ||..:..| ||
  Fly   886 SQPLEIPHSQTLTPTQTQADSQSQMQGTLIPVYLVSRLI----FCIGYMTIKEMIFLDMDIYNNM 946

  Fly   708 K-SNQFLALQLITGCLRNFSKPALNQLFQKLLNALRTGSIWLGIISSAVNLLNQIHHLST--SQS 769
            | .::..||:         .:...||......||.|     |.:..||:.:..::..::.  .|.
  Fly   947 KYRDELTALE---------ERKNRNQQAGSSHNAAR-----LTLNMSAMEVRKRLSGVAAEPQQE 997

  Fly   770 PTIASEMPYWQLSLLEDLVEGILSSAQNFQEEYARLQCLLGAYTELIVMVPQDVDNRIVSIVFKY 834
            |.             :|||..  ::..|..||      :.|...::::..|..:.:::...:.
  Fly   998 PD-------------DDLVGA--TAEDNIAEE------IHGICEDMLLYNPDALLSKLAPFII-- 1039

  Fly   835 LQECTKLCESEFDSDNERMTNWMIVIAGRLSLRDNHLANSASKLYITI--LTKNDRPQIINTTLI 897
                 ::|:...:..:..:.....:...||....:....|.....:.|  ||||.|  |...|::
  Fly  1040 -----EICKRPGEFGDPTLQQAATLALARLMTVSSRFCESNMSFLMNILNLTKNIR--IKCNTVV 1097

  Fly   898 ALNDLGKKHPSILE---SNFQAILSKLQSKFAMTRVRTFRCVKDVILSGNIKLKGPILISMLAAL 959
            .|:||..:.|:|:|   .:|.|.|.:..::..:|.|   :.:..:||:..|::||.| ..|...:
  Fly  1098 GLSDLTFRFPNIIEPWTGHFYAQLHESNTELRLTAV---KMLSHLILNEMIRVKGQI-ADMALCI 1158

  Fly   960 VDESAEVAREADAFFTRYKKLYNKM-LFDHCLKECPFDLNDQAILRGVRTNGNYKSPLKGSQMAK 1023
            ||.:.|:......||   |::.||. :..:.|.:....|.|        .|.|...        .
  Fly  1159 VDGNEEIRNITKQFF---KEIANKSNILYNVLPDIISRLGD--------INLNLDE--------D 1204

  Fly  1024 KRRLLYNHIMSSMDENVLLLYFGQLKLLAEKT-------------RDQAF--------------- 1060
            |.|::.::|:..:.::      .|::.|.||.             ||.|:
  Fly  1205 KYRIIMSYILGLIQKD------RQIETLVEKLCLRFPVTRVERQWRDIAYCLGLLTYNERAVKKL 1263

  Fly  1061 -----------------------INN------PDALIVVQDMLFIMRRICYCTKGMGKEKNSRGE 1096
                                   |:|      |:...||.:   ...|:..|.: :..:..::|:
  Fly  1264 MDNMQHYRDKVQVDEVYQSFKLIISNTNKLAKPELKAVVTE---FENRLNECLQ-VNPDTAAQGD 1324

  Fly  1097 GDNIDEGEDASSEPATPPT-----RPEAG-EATSRGRGRKA---DMSEE 1136
            .::..||: .:...|.|.|     :|.|. ..|.|||||:|   ..|||
  Fly  1325 QESTPEGQ-GNRTRAAPRTKKGGRKPAANRNNTVRGRGRRARRDSTSEE 1372

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cap-D3	NP_608935.2	COG5098	<829..984	CDD:227429	37/159 (23%)
Cap-D2	NP_651709.1	COG5098	85..1269	CDD:227429	231/1239 (19%)